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8 genomes BUD1078 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0303

HVO_2628

Hbo2214

Hmu2525

Hut0010

hla1214

NP4930A

HQ3191A

Pairwise sequence scores
Consensus score2443 Hut0010 HQ3191A rrnAC0303 Hmu2525 NP4930A hla1214 HVO_2628 Hbo2214
1641Hut0010 2441 1239 1476 1366 1377 1272 1293 1317
1707HQ3191A 1239 2548 1374 1311 1328 1483 1531 1537
1811rrnAC0303 1476 1374 2456 1663 1434 1394 1459 1485
1688Hmu2525 1366 1311 1663 2474 1513 1367 1431 1431
1740NP4930A 1377 1328 1434 1513 2435 1489 1464 1459
1829hla1214 1272 1483 1394 1367 1489 2497 1605 1594
1864HVO_2628 1293 1531 1459 1431 1464 1605 2385 1722
1854Hbo2214 1317 1537 1485 1431 1459 1594 1722 2457

340 symbols
consensus       ----MVRVSTGARLHFGFQNLSLAHERLYGGVGLALDEPRLVVDAEPADEI---------
#oth            1123131.2221.2.2..3..1.122....12.2222..332141212233111122121
Hut0010         :::::T:::I:::::A::::::::RD:::::I:W:I::::::::V:R:E:L:::::::::
HQ3191A         MSLGR:::T:SG:I::::V::::::D:::::I::SVC::TTS:I:::I:NS::::CNPPT
rrnAC0303       :::::PT:T:A::::::::::::::::::::::::::::::T:E:TR::TV:::::::::
Hmu2525         ::::::T:T:A::::::::::A::N::::::::V:::::L::L::Q::::::::::::::
NP4930A         :::MR:::E::G:V:I:::::::::::::::::::I::::A::E::::STV:::::::::
hla1214         :::::A:::A::::::::C::::S::::::AL::G:A:::V::::::DS::TVAVETPTT
HVO_2628        :::::::::::::I::::L:::::RD:::::::V::::::V::A::::S:V:::::::::
Hbo2214         ::MSR:::::::::::::L::::::Q:::::L:VG::::KT::T:T:::G::::::::::

consensus       -RCDDPAAREYAERAVELLDVPGAAVSVEERLPRHAGLGSGTQLALATLTAVARAYDREA
#oth            2514254333.1421444.11311412.432111.1.1....1.11.2151123131343
Hut0010         :V:P:E:VEP::R::I:V:::::::IT::Q:FE:::::::::R::::::M:T:DV::VAL
HQ3191A         V::SH:S:::::A::LNT::LDSVS::::SA::Q:::::::::::::::::::N:::QPP
rrnAC0303       :Q:::::TEP:VQ:V:DV:::::::::::::F:::V::::::::S::::I::V:::::T:
Hmu2525         :D:::GE:KS:VR:::AT:G:E::R:::R::::::V:F:::::::::AAV:::::::::V
NP4930A         :E:::AVVAT:::::CSE:G:N::R:E:C::::::V:::::::::::::::::::H:VAL
hla1214         DSATRNDI::::TT:TD::G:D::QIT:H:T::::::::::::::A:::A:::A:HGKDP
HVO_2628        :::RH::::::::Q:::::G:E:VD::::RT::::::::::::::::V:RS::A:T::::
Hbo2214         :D:SHRD::P:V:T:::I::::::D:T:SSA::::::::::::::::V:V::G::N:::V

consensus       DVRERAPALGRGGRSGVGVATFEAGGFVVDAGHPTARFTTDRPADGDWTVPPVAARHAVP
#oth            42.63..41.......1.112114..222.1..111...321.24.3.21.3.421242.
Hut0010         :::D:::D::::::::::I::VLD::::::G::LVE:::HSP:ET:A::T:::V::::I:
HQ3191A         QP::N::::::::::::::G:::I::::I:G::::::::::::T::S::::::MTHKQI:
rrnAC0303       :A:TY::Q::::::::::::A::S:::I::G::::E:::AEP::E:::D::::L:H:D::
Hmu2525         QP:SL::E::::::::::::A::S::::::G::::E:::SEP::N::::::::I:::EL:
NP4930A         T::K:::::::::::::::::::::::::::::::E:::::P::A:S::::E:V::RR::
hla1214         R:::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::::::E:::::::::::::
HVO_2628        :::RL::EM:::::::::::::::::A:L::::::::::::::E::S:S::T:::::E::
Hbo2214         S::QL::R::::::::I:::S::T::VL:::::::::::::::::::::::S::V:::::

consensus       DDWRFLLVVPDADPGRSGDAEDASMRSVVERADPGIADRIAGILTRRLLPAIAEGDAERF
#oth            14..11113..222.32.32.1521.32.14.21231.2223313121...3.423334.
Hut0010         :S:::V::T::VET:KH:SD:::::::I::G:::::::E::PL::Q:::::::G::RRT:
HQ3191A         :N:::::LT::VE:::::TE:E:::::::TQ:A:D::::VS:TVM:Q::::::NEN::Q:
rrnAC0303       AH:::VI::::T:::Q::S:::Q:::QA::::::::::E:STL::::V:::::TR:HDD:
Hmu2525         :::::V::::::E::A::AE::RH::QA::::::::::DV:AT:::T::::A::::HRQ:
NP4930A         ::::L:::L:::A::::::D::E:I:A:::D::::V::EL::V:V::::::V:::RLDA:
hla1214         ::::::::R:::::::::::::DA::TA::::E::L::::G::V:::V:::::T:N::::
HVO_2628        :R::::::::::::::N:A::ES::::::::::AQTG::::::V:::::::L:::S::::
Hbo2214         :::::::::::::A::N::E::E:::::::H:::D:::::S:V:S::::::V:D:S:S::

consensus       GDAVARIGRLNGAWYADEQGGVYRPPAGRLVASLSDAPAVYGAGQSSWGPTVYGITDAEH
#oth            .5.2443.....2..1.1........1.3213113452425.2.......1.112.2345
Hut0010         :::IT:L:::::::::::::::::::::::IE:::SVSG:D:V::::::::::A::GV:T
HQ3191A         :T:IET::::::R::T::::::::::::E:::::DASSSC:::::::::::::::::I::
rrnAC0303       :Q:A::L:::::::::::::::::::::A::D::AS::VIS:::::::::::W:L:T:DY
Hmu2525         :T:A:::::::::::::::::::::::::I:ER:AQQ:TIA:::::::::A:W:L:TRGD
NP4930A         ::::GAF::::::::::Q:::::::::::IIDR:::C:::R:L:::::::A:::V:::SM
hla1214         :A:::E::::::::::::::::::::V:DV:::::::A::F:::::::::::::::::AN
HVO_2628        :E::ESV:::::T:::::::::::::V:A::S:::ES:V:::::::::::::::V:::D:
Hbo2214         :K::SE::::::::::::::::::::V:E::::VE:N::C::::::::::A::A::::::

consensus       ADAARDAGEAALDAADVDGTVRVVAPRNEGARVEDL----
#oth            2431352235..33221214.311423.5.2323653111
Hut0010         ::IV:E:A:D::TRN::E:D::::::D:::Y:LL:S::::
HQ3191A         :::::R::QY::::::::::::I:QAQ:H:VT::Q:E:::
rrnAC0303       ESE:::::VL::::::::::::::::::T::SLTE-::::
Hmu2525         VE:::TGV:M::SDLS::AD:L:AS:::V::T:::GPTLG
NP4930A         :AD:TADAR:::SELG::AR:Q::E:::::::::T:::::
hla1214         :T::AS:::R:::E:G:::S:S::EAA:G::::TGRE:::
HVO_2628        V:E:VE::R:::SD::IE:::S:ARG::R::S::--::::
Hbo2214         ::E:::::::::A::::A:E::::RG::T::DIRRND:::