|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3541 | hla2381 | HQ1120A | Hmu0273 | pNG7136 | HVO_A0618 | Hbo1708 | Hut2125 | NP2052A |
2574 | hla2381 | 3558 | 1930 | 2299 | 2313 | 2221 | 2213 | 1809 | 1604 |
2523 | HQ1120A | 1930 | 3542 | 2200 | 2201 | 2199 | 2399 | 1612 | 1670 |
2829 | Hmu0273 | 2299 | 2200 | 3647 | 2428 | 2369 | 2463 | 1813 | 1712 |
2746 | pNG7136 | 2313 | 2201 | 2428 | 3561 | 2337 | 2406 | 1785 | 1667 |
2820 | HVO_A0618 | 2221 | 2199 | 2369 | 2337 | 3560 | 2590 | 1764 | 1734 |
2871 | Hbo1708 | 2213 | 2399 | 2463 | 2406 | 2590 | 3552 | 1739 | 1736 |
2060 | Hut2125 | 1809 | 1612 | 1813 | 1785 | 1764 | 1739 | 3343 | 1733 |
1963 | NP2052A | 1604 | 1670 | 1712 | 1667 | 1734 | 1736 | 1733 | 3508 |
493 symbols consensus --------MSDPFVVIGGDAAGLSAASKFRREDPDRDVVVFEKGRWVSYAHCGTPYFVKG #oth 111111122322.111.1....1.....32.241212.2.1.214.1..22..2..111. hla2381 :::::::::::::::V:A::::::::::::::A:::E:::::::::I:::Y::M:::IE: HQ1120A :::::::::T::::::::::::::::::Y:::S:A:::::::Q:S::::::::::::I:: Hmu0273 VVAVEART:T::::A:::::::::::::CK::Q:E:::I:::::S::::S:::M:::::: pNG7136 :::::::::T:::::::::::::::::::A::A:::::I:::::K:::::::::::Y::: HVO_A0618 :::::::MPAE::::V:::::::::::::A:A:T::E::::::::::::::::::::::: Hbo1708 :::::::::::::::V::::::::::::C:::::E:A:L::::::::::::::::::::: Hut2125 ::::::::::ER:L::::::::M:::::AK::::::E:::L:RSE::::GA::L::Y::: NP2052A ::::::::-MST::::::::::M:::::AK:DT::L::::::::A::::GA::L::YI:: consensus EVDRLTDLLSLSPEDI-EERGIDLRRGHEVVAIDTDARTVTVEGDAG-TFEQPYGDLLIA #oth 3123141131221443121.2....13..1221.3254221133442243422.221.11 hla2381 R:E:MSN::::::SEV::::::::::D:::I:V:S:TK::A::TAE:E:I::G:D:::V: HQ1120A D:EH:R::Q::::R::::::::::::D:::T::::KSDVI::VNNGE:S::Y::EE:::: Hmu0273 :::::D:::::::AE::R::::::::::::::::S:::VL:::TS::DRL:::::::::G pNG7136 T:E:::::::::::QA:A::::::::N::::GV::::E::A:AH:SE:::S:::::::V: HVO_A0618 :::T:::M::::::AA:AD:::::::E:::::V:::E:V:::::PD::::::::::::V: Hbo1708 :::S:::::::::A::::D:::::::E:::::V::::Q::::R:PDS:K:T:S:::::V: Hut2125 :I:S:D::IAIPADRFR:::N::::T:::AIG::RSRKE::::T:::EEYGIG:D:M::: NP2052A :IQT:E::V:VT::QFR:::D::::T:::::D::P:D::::AR::GE:ELV:::DS:::: consensus TGARAVTAPIEGADLDGAFTLHGLDDAAALRAFLADPAEFAVADLGGGEAVDRALAERYG #oth ..13.44421317322212.1231331332234344243543353336453335433332 hla2381 ::G::E:GSFNVRG::::::::DMNA:::ID:YI:E:DAYDP:R-ADVS::::ERVD:NA HQ1120A :::::IS:::::::::TV::::::P::T:::S::TP::::DS:N::::A:LTTSV::Q:: Hmu0273 :::::::T::::S::A:VH:M::::S:::V::H:L:::VD::::V::E:F:::E:V::HA pNG7136 :::::M:G::P:TE::::::M::::S::SV::A:SE:G::::DT--SI:Y::T::V:K:T HVO_A0618 :::::LRE::D:I::::::::::::::::I:S::T::D:AS:::::::GS::E:R:A:F: Hbo1708 ::GS::S:::::FH::::::M::::H:::V:::::::G::S:G::::ATD:::DM:A::: Hut2125 :::G:LEP::D:L:AENV:::QEMNAGRT:K-----------------::IETGAYD:F: NP2052A :::A::VPD:::V:RE::Y::GSMT:GKE::E:V:RAR:EGP:EQPDSGPACQQ:ENCN: consensus AMEPPETVAIVGGGYVGVEMAEAFSAHDLDVHLFQRSGHLLPPFGEAVGERVADELEAQG #oth 33421233211...11.1.....1413332111.113311.32.14222231143.3441 hla2381 ::PA:::A:::::::::::::::L:GRG::::::::::::::::::::::::::::::E: HQ1120A ::Q::::I::::::::::::::::::W:CA::::::PER:::A::T:::DAI:ST:KKA: Hmu0273 :F:::::::::::::::::::::::::G::::::::GE:V::::::::A:V:EG::A:E: pNG7136 DW::::R:::::::::::::::::Q::NIET::::::::::::::::::::::RQ:RE:: HVO_A0618 ::D::DS:::::::F:::::::::T::::::::::::::V:GT::D::::::EEH:::H: Hbo1708 :::::::::V::::::::::::::::::::::V:::PNR::S::::::::::::H:RE:: Hut2125 ---------:I::::I:I::::::RGRSI::T::EMRD:V:::::ASAA:T::G:::DN: NP2052A P------:GV:::::I:I:::::LA:N:FE:::::::DRV:KA:APETSAA:::H::S:S consensus VTLHLGEEVQALRGD--DRVEAVVCDGGA--LAVDAALVGIGIRPNTDLLADTGIELGET #oth .4122334.33141422332242143214412411212212.22.112.33413111.53 hla2381 :AV:R:TP:KS:V::::::I:G:AL::A:DSV:A:L:I::V::::::E::DG::V:T::G HQ1120A :::::N:::ER:TET:DGQLDDI:YG::NR::N:::V:I:::::::VE::TE:S::::T: Hmu0273 ::::::::::R:D:::DG:::RL::A:::S:::::L:::::::::::::::::P::T:VA pNG7136 :I:::DTA:EEIV:NRDE::T::AH:::T::TD::L:::::::::::A:::::PVD::YS HVO_A0618 ::::::AS:ER::::DA::I:::::ED:D::::::::M::::L:::V::V::A-VD:::: Hbo1708 :::::::::A::::E::GQ::T:::GS:TK:::::::::::::Q:::A:IEE:PV:::DS Hut2125 :DVRTSTR::::E:K::NA::RI:T:D::::VE:::V::AA:VD::VE:AEQA::D::P: NP2052A :S:Y::S:::::D:::::G:::I:TGD:ER:VP:EM::L:A:V::R:::A:AA:::::P: consensus GAIATDEYGRTSVDNVYAAGDCAEMRHAVTGEPTWVPLGLTANRAGRAIGATVAGDPTPV #oth 1.111.2213.2435......1.14512..1132241.1.1...1...1.2.11.2.232 hla2381 :::R::::::::LPD::::::::TAV::::::EA:M::::::::::::V:::I::::S:: HQ1120A ::V:V::::Q:N:E:::::::V::LKQI::::T::S::::P::::::::::::G:S::Q: Hmu0273 D:V:V:D::::N::G::::::::T::::::::RD:::::::::::::::::::::::::: pNG7136 ::::V::::A:::NR:::::::::D::::::::D::::::::::::::::Q::::::SL: HVO_A0618 ::::V:DH::::AES:::::::::ID:V:::::::NT:::P:::::::::Q::::::E:I Hbo1708 :::::::F:::T:E:::::::V:::::V::DD:::D::::P:::::::::S::::T:E:: Hut2125 ::::::A:::::D:A::::::::::T::::D::AH:::A:::::::::V::::G:::::: NP2052A ::::::A:RE:NI:D:::::::::AE:V::::::Y:::A:::::H:::::Q::::T::KG consensus GDIAGTAVVKAFDLECGRTGLLDHERARAAGFDPVSETITAGSRSGYYPGGAETTVTLVA #oth .41.2.121...12221.2.422315133...1.123.1112..11....24322...21 hla2381 :E:::::::::::M:A::A::VEE:T::E::::::R::V:::::::::::A:P:D::::: HQ1120A :HV:E::ML:::E:G:::::V:E:D::E::::::ITK:::::::::::::AE::::::T: Hmu0273 ::::::::::::EQ:::::::V:::A:SD:::::::::::::::::::::::::::::I: pNG7136 ::::::::::::::::::V::::::Q:S::::::::T:V::::::::::::DD:D::::: HVO_A0618 :TV:N:S:::::::::::A:VT:FDE::D:::::::::::::::::::::S::::::::: Hbo1708 :GV:::::::::E:::::A:I::Y::::T::::::::::::::::::::::S::::::T: Hut2125 ::::::::L:::::AVA:::M::E:EL:D:::::::V:::SA::AH:::::S:IE::::G NP2052A :GV::::A::::EM:AA:::-:S:DD:A::::E::T:::E:K::A::::::GTV::::T: consensus DRDSGRLLGGSIVGA--DRAAIRIDTIATALEADMTVAELERLDLAYAPPFSPVWDPILT #oth .341.111.1211141111113.123212.24333.2511133.12.....211...1.1 hla2381 :::T:::I::::::P:::::::::::L::::::::::P:V:::::::::::::::::::V HQ1120A :QK::Q:::::L:::::::::V::N::::::G:G:::G:::QQ::G:::::::::::V:V Hmu0273 ::::::::::T:::T::::::::::IV:M:::Q:A::G::::S::::::::::::::V:: pNG7136 ::N:::::::AL::E:::::::::::L:::I:::::ID:::::::::::::::::::V:V HVO_A0618 :::T::::::T::::::::::V::::V::::A:EL::::V:::::G:::::::::::::: Hbo1708 ::S::::::::::::::::::::::::::::GSK::::::::Q::::::::::::::::V Hut2125 :AE:::V::A::::H::EGV:K:::P::::IQS:L::EDV:Y:::S:::::G:T:::::: NP2052A :SET::::::TLHSEYGEG:VH:SHGLVG:VTEGV:LS::SNY:F::::::NTT:::::: consensus AAKVLNGKL---- #oth .....31413121 hla2381 :::::::T:DEE: HQ1120A ::::::::::::: Hmu0273 :::::GSSVQERY pNG7136 :::::::Q:E::: HVO_A0618 :::::R:S::::: Hbo1708 :::::G:R::::: Hut2125 :::::::::D::: NP2052A :::::D:T:::::