8 genomes BUD1087 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC1269 HVO_1303 Hbo0239 Hmu1705 Hut0502 hla2433 NP2752A HQ3354A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1015	Hut0502	hla2433	Hmu1705	rrnAC1269	NP2752A	HQ3354A	HVO_1303	Hbo0239
797	Hut0502	1023	722	714	753	736	748	743	767
838	hla2433	722	1027	766	778	787	769	798	808
842	Hmu1705	714	766	1018	827	777	784	791	795
847	rrnAC1269	753	778	827	1025	787	772	810	826
883	NP2752A	736	787	777	787	1082	816	819	831
889	HQ3354A	748	769	784	772	816	1020	836	847
912	HVO_1303	743	798	791	810	819	836	1021	882
931	Hbo0239	767	808	795	826	831	847	882	1018

148 symbols
consensus       ------MSATSTEGRILAVLEDDAQASYAEIADRADVSKPTVRKYIRKLEEEGVIVGYSA
#oth            11111112342..3...21..2..1..1.1..2112..........421.32...1....
Hut0502         :::::::::EA::E:::D:::E:::::::::::QVG::::::::::EQ::A:::::::::
hla2433         ::::::::TV:::E:::S:::E:::::C::::::::::::::::::DR:::K::::::::
Hmu1705         ::::::::VD:::R:::S::::::::::::::E:::::::::::::N:::D:::::::::
rrnAC1269       :::::::::E:::R:::S:::Q::::::::::E::E::::::::::Q:::::::::::::
NP2752A         MDGKQYHMNAE::H::::I:::::::::::::::::::::::::::D:::S:::::::::
HQ3354A         :::::::EV::::::::D::::::::::::::K:::::::::::::::M:::::::::::
HVO_1303        :::::::ET::::::::::::E::K::::Q::::::::::::::::::::DD:::I::::
Hbo0239         :::::::E:::::::::::::Q::::::::::::::::::::::::Q:::SD::::::::

consensus       DVDPKKLSGQSIALVGIDVASERYVEVTRALKDLDEVESLYTSSGDHMLMAEVRAADGDA
#oth            111....2221..3..3.23.23..211.5.23233312..1.....1.1..1..5..12
Hut0502         :::::::P:ET::I::V::E::A::D:S:::::VAAI:A::::::::T::::M::P::::
hla2433         E:::::::S::::M::M::D:GQ::GA::K:::::::QA::::::::::::::::S:::E
Hmu1705         ::N:::::S:::::::M::::DC::::::::SSI:A::::::::::::::::::::::GE
rrnAC1269       :::::::A::::::::::I::DC:::A::N::EIP:M:E::::::::::::::::M:::S
NP2752A         :I:::::::T:::M:::::::::::::::E::N:::L:::::::::::::::::::::::
HQ3354A         ::::::::ET:::V::L::::::::::::T:RN:ESI::::::::::::I:::::P::::
HVO_1303        :I:::::A:::::M::::AT:::::::::I::E::S::A::::::::::::::::V:::S
Hbo0239         ::::::::::::::::::::::::::A:::::::EP:::::S:::::::::::::T::::

consensus       LGDVISEEILSIDGVTAAHPSFLQERLK
#oth            1111.41221431..2.1..........
Hut0502         :::::N:::G:L:::A:V::::::::::
hla2433         :::::::KL:GV::::::::::::::::
Hmu1705         V:EI:ED::::TE:::::::::::::::
rrnAC1269       :A:::EDK::AL::::::::::::::::
NP2752A         V::::H:K::T::::E::::::::::::
HQ3354A         :::::::SV:DV::::::::::::::::
HVO_1303        ::::::D:::::::::::::::::::::
Hbo0239         :::::A::::G:E:::::::::::::::