| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2585 | NP2598A | Hut0416 | rrnAC0285 | Hmu1386 | HQ2725A | hla1722 | HVO_2685 | Hbo2408 |
| 1517 | NP2598A | 2584 | 1329 | 1273 | 1303 | 1137 | 1111 | 1171 | 1140 |
| 1751 | Hut0416 | 1329 | 2596 | 1521 | 1566 | 1190 | 1165 | 1221 | 1198 |
| 1815 | rrnAC0285 | 1273 | 1521 | 2640 | 1668 | 1252 | 1180 | 1266 | 1275 |
| 1860 | Hmu1386 | 1303 | 1566 | 1668 | 2514 | 1157 | 1195 | 1284 | 1302 |
| 1501 | HQ2725A | 1137 | 1190 | 1252 | 1157 | 2828 | 1158 | 1423 | 1358 |
| 1566 | hla1722 | 1111 | 1165 | 1180 | 1195 | 1158 | 2704 | 1357 | 1201 |
| 1666 | HVO_2685 | 1171 | 1221 | 1266 | 1284 | 1423 | 1357 | 2809 | 1407 |
| 1719 | Hbo2408 | 1140 | 1198 | 1275 | 1302 | 1358 | 1201 | 1407 | 2694 |
417 symbols consensus ----MQPG------------AVGGADSGTATTTAAATG---VATPPAT--GGWL--PA-- #oth 111125422222222222124345445552342435621114446433464365232416 NP2598A ::::----::::::::::::-------MDP::::LQQ::::LPR:---::-::::::E:T Hut0416 :::::::V:::::::::::::::WI:VLG::::E::NP::::QAL---::-E:V:::::W rrnAC0285 :::::RF:::::::::::::P:WPLQTP:P:P:E:::E::::::EV::DI::L::::F:E Hmu1386 :::::TT:::::::::::::G:S::Q:::::P::SP:::::TLES:V-:PY:MF:::G:: HQ2725A MVSVVV::KDIFEYLLLLESP:FMSP:SILLL:QILLP::::Q:QTP:PS:SSNTS::NV hla1722 ::::----::::::::::::------MARPEALVSIG::::RL:RF:DVL::IA::--:: HVO_2685 ::::-MH:::::::::::::VE:V::ASA:VGGVS:A::::SHLAV:PLQSTA:TP:::F Hbo2408 ::::::T:TGTAGPSAGTET:A::STV::::::G:SS:GAST::::P:PTE:VQAAR::L consensus IPDWIL--G-RLGAALVV---VALAYVLSRFLVRLLGRRVARRFRRQSVAQTALRGIRAG #oth 3143551113443522321112312353.33332131.21.1113.1.121242.31133 NP2598A ::L:AY::-:::VM:V:F:::LTV::Y::Q:AR:::A::I::::E:P::G::V::S:Q:V Hut0416 ::::T:::-:DVVSVVI::::LG::WAA::::IG:::::I::::::P:LTRAFI:::::: rrnAC0285 ::M::A::-:NI:KS:I::::IG::I:V::V::::::::::QQ:::P:LTR::::::::: Hmu1386 V:::::::-:D:::VV:::::L:V::FA::LV:LVF:::I::::Q:P:LTR::I::::GA HQ2725A ::Q::QFP:W:WVV::A:::::IVGI:I::YIT::I::Q:::::Q::::::::::LV:LS hla1722 ------:::SA::GV:L:GLS::VGVLV:K:::::I::P::::VS:::::::IV::V:V: HVO_2685 V::HF:FP:W:IAV:::I::::::SVG::KYA::::::P:::Q:::::::::I::IV:LA Hbo2408 L::FLFFP:AEYI::T:I::::I:G::::GYV:::V::P::::::::::::VM::IV:L: consensus VFLIALLVALRIFGLRLGDIALSVTVFSAVVGIVLAPIVGSIINGVFILADQPYEIGDMI #oth 2343313322535.24221232112.....3.111..23.2311.2.2.11..1.1...1 NP2598A IVFV:VMT::GF::IG::NVV:::G:::::A::I::::I:NL:::::::SE::::::::: Hut0416 ::GL::::I::::::E::::::::::::::I:VI:::::::V:S:I:L:::::::::::V rrnAC0285 :YIF:::TI:G:Y::Q::::::::::::::::V:::::L:GL:S:::L:::::::::::: Hmu1386 :::::::SI:::Y::K:S::S:::A:::::::V:I::V::::VS:::L:::::::::::: HQ2725A IV:FTVA::AS:V::QV:::V:::::::::L:::::::A:::V::L:::::::::::::: hla1722 TITLS:::G:WAI:F:FT:LLVGTA:::::I::I:::L::NF:::::::::::F:::::: HVO_2685 IV:VGVG:GANVL::E::::V:::::::::L::::::::::::::::V:S:::F:::::: Hbo2408 :::::V:M:GVVA:::F::V:I::G::::::::::::::::::::L:::::::::V:::: consensus ELDDTGTRGFVEDITLRYTKIFTLDNTFLVIPNGTIRERDVINYSAEDERTRLSLDVLVT #oth ..311122..111..121..2.......1.31.131.311.2.1....3.2.3222251. NP2598A ::E::D:K::::::::F:::V:::::::I:L:::SM::::::::::::A:V::TA::G:: Hut0416 ::A:::Q:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:V:E:I::V:: rrnAC0285 ::A:::Q::::::::::H::V:::::::::::::E::Q:::V::::::S::::::::M:: Hmu1386 ::S::D::::::::::::::::::::::I::::::::::::V::::::P::::R::IT:: HQ2725A ::::-:R:::ID:::I::::::::::::::V::SS:::QL:T:F::::::V:QT::IA:: hla1722 ::EN-::T:::::::I::::::::::::::V::::M:::::T::::::::::RTIE:::: HVO_2685 ::::-::K::IDE:::S:::::::::::::MS:SN::D:::::::::::::::::::::: Hbo2408 ::::-:R::::DE::I::::M::::::::::::S:::N:L:T:F::::::L::::GF:A: consensus YESDIEEARELIERAARDVDAVIEGGPDIRVGAARYPASPTCYINEFADHGVLLRLRYWV #oth ..1.245..333321.233.4.14......1.3...1.3.22314211.311411..1.2 NP2598A ::::::T:::QLRA::::::G::K::::::I:S:::::A:VVH:L::G:SE:A::::F:: Hut0416 ::G:L:T::DRFIQ:::S::G::G::::::::::::::::V:H:G::G:::IR:T::::I rrnAC0285 :::::AV::S:::A:::E::N::S:::::::::::::::::V:::N::::::::T::::: Hmu1386 ::G:LD:::RIV::S::Q::::::::::::::::::::A::::::S::::::Q:T::::: HQ2725A ::::L:R:::::Q:::ASI:D:::::::::::N:::::R::VFLDS:G:D:IV::::::: hla1722 ::::VS:::R::::::::C::::D::::::::V:::V:::D:RLH::G:D:::::::::: HVO_2685 :::::DA::D:V::::::C:::V:::::::I:S:::::K::A:::SY::N:::::::::A Hbo2408 :::::PK::::L::::S:S:M:::::::::I:S:::::R::A::D:Y::S:I:IT::::A consensus KEPYKLLAVRSDVQTNIWERLED--ADVEIAYPHSHLVFDDTSGSLRVAVDEG------- #oth 63..233332.51312323233123342.31...3.12..2...3242366444442322 NP2598A R:::TQAT:::A:L::V:::FD:::H:I::P:::::::::::::E:QT:IRRRGQQAAAR Hut0416 EV::RMQ:I::QI::A:::AID:::L::::::::::::::::::Q:::SH:::::::::: rrnAC0285 T:::::::A::R::::V:R:::::::N::::::::::Y::::::EMN:SLTN:LGG:::: Hmu1386 D:::::::T::K::::V:AA:::::::::::::::::H::::::QM:::ME::::::::: HQ2725A VR::R:Q:TE:::ADA::S:FHEDA:EL:F::::R:::::H:::::DAT:KT:P:::::: hla1722 :K::::AK:Q:::N:R:R::VT:::::::M::::R:::::::::IA::GGP:SGRPAGER HVO_2685 LK:::IGRIQ:E:::RL:SLV:ESD:T::F::::T:::::E:::::H:TS::AANRRHAT Hbo2408 :K:::::T:::E::::FS:L::::EPA::A::::Q:H::::::::::A::---::::::: consensus ------------SDGRDGSASPAGAAEADPRDDEDRDGAE----------------- #oth 223211111111543654673445434446435344635532322221111111111 NP2598A QGGA::::::::TTRNEEQEA::SEPGTETEPTD:AG:SR::::::::::::::::: Hut0416 ::::::::::::VSESP:RQ::SRD:VV:DEQY:H::R::::::::::::::::::: rrnAC0285 ::::::::::::L::V:R:HTAT:D:PVP::Q:P:EL:D:::::::::::::::::: Hmu1386 ::::::::::::-------------:PD::SP:P::::PV::::::::::::::::: HQ2725A ::::::::::::AS:KSPTT:ETNTD:SEND:MNSNVDTSTDTQAE::::::::::: hla1722 AGDKPG:::::::E::G:NG::D:::::TLT:S:PST::DAAAQTDLSGGDESGDNR HVO_2685 ASPAPGAPVQSV:::EG:E::VDA:DS::AT:AP:SA:::SADTAEN:::::::::: Hbo2408 ::::::::::::T::::E:WTE:::RVDSS:RS:EEQ---:::::::::::::::::