8 genomes BUD1098 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC2255 HVO_0340 Hbo1139 Hmu0138 Hut0900 hla0204 NP0022A HQ3055A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1091	Hut0900	rrnAC2255	Hmu0138	NP0022A	hla0204	HQ3055A	HVO_0340	Hbo1139
450	Hut0900	1151	364	344	354	369	380	353	348
701	rrnAC2255	364	1078	661	616	597	541	554	604
749	Hmu0138	344	661	1098	631	593	633	587	606
822	NP0022A	354	616	631	1108	668	673	593	662
782	hla0204	369	597	593	668	1173	634	641	612
803	HQ3055A	380	541	633	673	634	1088	639	697
763	HVO_0340	353	554	587	593	641	639	1044	733
795	Hbo1139	348	604	606	662	612	697	733	1089

170 symbols
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Hut0900         ::::::::MRRSNGD:AG:E:::::::::::::::::::A::L:::V:GQF:DSFQDETV
rrnAC2255       :::::::::::MSDSL:R:E:::::::::::::::::::C:::::STI:::E:T:Q:::V
Hmu0138         :::::::::::MFVEL:R::::::::::::::::::::::::::::TI::L::TMT:S:I
NP0022A         :::::::::MRQ:::L:::N:G:::::V:::::::::::::::::::::::S::::::::
hla0204         MPHSKRDERTA:D:S:CS:R:::::::V:::::::::::::::::G:IGD::::::A:::
HQ3055A         ::::::::MFE:I:::VD:::::::::::::::::::::T::::L:::::VQ:::G::::
HVO_0340        :::::::::::---M:RS:T:::::::V:::V::::::::M:::L:::::VQ::::TS::
Hbo1139         ::::::::MLDE::Q:A::::::::::::::::::::::T::::L:::::VQ::::::::

consensus       DVQPSPEVVTPGEQDVDVTVVDPDGNPVEGATVVVKSGSATIDGVATATTDSDGNATLNI
#oth            11414311332.2333534.1222.52.22.2.2223.114322151332353.522132
Hut0900         T:EF:D:L:NV::ST-N:S::TSE:E:::::Y:L:R:::L:VSNAPVELNTT::Y:E:::
rrnAC2255       ::E:H:::TN::T:::V:::::SK:S::S:::::A:::T::LSS:T:GE:G:A::V::SL
Hmu0138         ::D::K:::GE::T::TL:::::::Q::SD:::::TG:T::M::AV::::::R::::VT:
NP0022A         ::R:D:::::::DHT::IE:::::::S:AD::::ARG:::RL:::E:::::A::HTQ:DL
hla0204         :A::Q:::T:::::SL::A:L::::SR:AD:::I:R::::Q::::::G::G:::T::VDV
HQ3055A         :::::E::LS:::HTIEL:::E:::A:::A:I:II:A:::R::::I::::GP::S:::::
HVO_0340        ::K:T:D::G::::AL:F::::HE:::::::::I::::T:E:::::::KS:DG:S::V:V
Hbo1139         ::K:D:D:M::::::ISIL::::::D::::::::::D:T:D:ES:V:NK:REG:M::VTV

consensus       ---------DPELRPNQQDGTLTIDVKPPAGSDYVDRRENTDILVVDE--
#oth            1111111114262121143.12331111.1325131313..63.1.4321
Hut0900         KNSNQNNPI:VDF:SD:KR:DIELE:IS:SD:::STT-:::PK:::YR::
rrnAC2255       :::::::::S:S:G:::::::V:FE:::::::N:E:A:S:::L:::ESP:
Hmu0138         :::::::::T:Q:G::::E::V::::::::SGG:S:::R::R:::::DGG
NP0022A         :::::::::S:T:::::R:::VEF:I::::::E:A:E::::AL:::::::
hla0204         :::::::::::::G:::P:::::VE:::::EG::::E:R::EV:::A:::
HQ3055A         :::::::::N:RI:A:::T:::R::I::::SGS:A:::A:::::I:::::
HVO_0340        ::::::::::A::GA:RE::::VV:::::::ESF:::::::NV:::QD::
Hbo1139         :::::::::A:K::S::E::::V:::::::::QF:::::::K::::ES::