|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1549 | Hut1128 | NP2704A | rrnAC0437 | hla2460 | Hmu1112 | HQ2667A | HVO_1555 | Hbo3496 |
919 | Hut1128 | 1556 | 805 | 804 | 745 | 839 | 763 | 736 | 819 |
1015 | NP2704A | 805 | 1584 | 828 | 799 | 854 | 785 | 888 | 897 |
993 | rrnAC0437 | 804 | 828 | 1645 | 727 | 907 | 725 | 799 | 854 |
1063 | hla2460 | 745 | 799 | 727 | 1652 | 773 | 854 | 906 | 937 |
1068 | Hmu1112 | 839 | 854 | 907 | 773 | 1564 | 835 | 836 | 925 |
1091 | HQ2667A | 763 | 785 | 725 | 854 | 835 | 1629 | 936 | 1016 |
1110 | HVO_1555 | 736 | 888 | 799 | 906 | 836 | 936 | 1485 | 1042 |
1250 | Hbo3496 | 819 | 897 | 854 | 937 | 925 | 1016 | 1042 | 1547 |
240 symbols consensus ------------MRTIANLSFSRRELRDLLVAWLALGLAFAIF-FAGGGRRAIQGILGG- #oth 11222233233454556422..43.12..32.121.11..22.12345363645553331 Hut1128 :::::::::::::IELRSIR:::K::L::FA:::I:SV::TL::LNPRLLERWSYAPDP: NP2704A :::::::::::MTVDV:EIR::EV:::::AI::V:::V::S::I:VAT::DVFPD:T:A: rrnAC0437 ::MAGRRRRPTTD:::GG::::Q:::::::::::::::::TF::LEREF::IVF:QF::: hla2460 ::::::MSGTLQG:R::G:Y::GT:I:::::::::::V::TF:::V-N:TAGFDRL:AA: Hmu1112 ::::::::::::----M:VR::E:::K:::I:::::::::::::IN---YDMV::M:A:R HQ2667A MPLDIGLYRMAHS:SSPEV::::::::::GI:LI::SV:::::::::::A::LS:::DR: HVO_1555 ::::::::::::----V:V:::S::::::::::V:::::::::::::::N:T::LLTN:: Hbo3496 :::::::::::::S:NTT::::S::::::A:::V:::::::::::::::M:::ANVF::: consensus -----GFVGPLLVSLLTAGVGFLLHELAHKVVAVRFGQIAEFRADYGMLFLAVMSALAGF #oth 24442433642221.2.1.21.1...2....1.1112.3.1.2..14..221232222.. Hut1128 TAVIAA:GES::T::::V::::M::::::::::I::::::A:Q:::::::::LV::M::: NP2704A :ILSPQ:ATVFVL::V:V:::::::::::::::I::::A:A:::::P::A:C:GA:F::: rrnAC0437 :LSGAEIASTFA:::::V::::::::::::::::::::::A:K:::R::GF::LGG:V:: hla2460 ::::::I:P::::G::::::A:::::I:::::::HYD:V::::::NS::::::::S:L:: Hmu1112 PPNPAAV::A:A:::F:::I::::::::::::::::::::::::::N::::::V:::::: HQ2667A ::::::VII:I::::::::L::::::I::::I::::::L:::::::::::::IV:S:::: HVO_1555 :::::S:GLA:V::::::::::::::V:::::::::N:V::::::::::AV:I::::V:: Hbo3496 ::::::L:::F::::::::I::::::::::::::::::V::::::::::::::::S:::: consensus IFAAPGAVHHRGRLTPREHGLIALAGPVTNLALAVVFLPPLLL---GLLGGS-FIGLVGS #oth 1.......2.2.2214112.1.11....1.33.333.21542322225622133263224 Hut1128 L:::::::V::::I::::S:::::::::::::::AA:A:FA:::::--A:P-:T:SS:A: NP2704A L::::::::::::I::::N:::SV::::::IV:VG::::LVFV:::---::-::V:A::Q rrnAC0437 L:::::::V::::::AKQ:::::V::::::::::::::V:FF:TASMGI::-::LRELTE hla2460 ::::::::::::::::::::H:::::::V::L:TL::::A:::::::PVV::PV:T:I:: Hmu1112 L::::::::::::ISE::N:::::::::::V:::L::VV::VVAWF::F::-:LLFELAA HQ2667A ::::::::::Q::V:S:Q::::::::::::AI:T:I:V:IY:A:::::TLD:SL:I:I:: HVO_1555 ::::::::Y:H:V::E:::::::::::::::L:L:A:A:V:VV::::V:V::DV:Q:::: Hbo3496 ::::::::Y:::M::D::::::::::::::::::AL:::V::I::::A::::D:V::::F consensus RGVIINLLLAAFNMIPFGPLDGKTVLAWSKPVFAAVFVPSILLTVGLL-FVGF-GF---- #oth 3.25..21.11..11.2.2...12.44.132.2221232221.22242123143331111 Hut1128 F::T::::::G:::::Y:::::R:::E:NRG:YL::A::::V:AIAG:::-::::::::: NP2704A L:::::AF:::::::::::::::S:::::::::G:::TA:V::A::SFL::::PSI:::: rrnAC0437 M:LQ::::::G:::L:::::::R::RE::T:::L::A::::::G::A::::L-:--:::: hla2460 ::IA::VF:::::L::Y:::::::::D:::G:W:GF::L:VV::I::V::::GL::GGPF Hmu1112 L::S::::::G::::::::::::K::::::::Y:V:AA:ML::G:FV::LA:VP:L:::: HQ2667A ::LM:::::V::::L:::A:::R::YQ:NPV:::V::I:AL:::I:AF:II::::::::: HVO_1555 ::L:::AF::::::L:L:S::::::K:::T::::G:L:L::::::::FL:::::--:::: Hbo3496 :::T:::F::::::L:::A::::::IS:::G:::V::I::L:::LA:V::-:ITP:::::