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8 genomes BUD1112 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0437

HVO_1555

Hbo3496

Hmu1112

Hut1128

hla2460

NP2704A

HQ2667A

Pairwise sequence scores
Consensus score1549 Hut1128 NP2704A rrnAC0437 hla2460 Hmu1112 HQ2667A HVO_1555 Hbo3496
919Hut1128 1556 805 804 745 839 763 736 819
1015NP2704A 805 1584 828 799 854 785 888 897
993rrnAC0437 804 828 1645 727 907 725 799 854
1063hla2460 745 799 727 1652 773 854 906 937
1068Hmu1112 839 854 907 773 1564 835 836 925
1091HQ2667A 763 785 725 854 835 1629 936 1016
1110HVO_1555 736 888 799 906 836 936 1485 1042
1250Hbo3496 819 897 854 937 925 1016 1042 1547

240 symbols
consensus       ------------MRTIANLSFSRRELRDLLVAWLALGLAFAIF-FAGGGRRAIQGILGG-
#oth            11222233233454556422..43.12..32.121.11..22.12345363645553331
Hut1128         :::::::::::::IELRSIR:::K::L::FA:::I:SV::TL::LNPRLLERWSYAPDP:
NP2704A         :::::::::::MTVDV:EIR::EV:::::AI::V:::V::S::I:VAT::DVFPD:T:A:
rrnAC0437       ::MAGRRRRPTTD:::GG::::Q:::::::::::::::::TF::LEREF::IVF:QF:::
hla2460         ::::::MSGTLQG:R::G:Y::GT:I:::::::::::V::TF:::V-N:TAGFDRL:AA:
Hmu1112         ::::::::::::----M:VR::E:::K:::I:::::::::::::IN---YDMV::M:A:R
HQ2667A         MPLDIGLYRMAHS:SSPEV::::::::::GI:LI::SV:::::::::::A::LS:::DR:
HVO_1555        ::::::::::::----V:V:::S::::::::::V:::::::::::::::N:T::LLTN::
Hbo3496         :::::::::::::S:NTT::::S::::::A:::V:::::::::::::::M:::ANVF:::

consensus       -----GFVGPLLVSLLTAGVGFLLHELAHKVVAVRFGQIAEFRADYGMLFLAVMSALAGF
#oth            24442433642221.2.1.21.1...2....1.1112.3.1.2..14..221232222..
Hut1128         TAVIAA:GES::T::::V::::M::::::::::I::::::A:Q:::::::::LV::M:::
NP2704A         :ILSPQ:ATVFVL::V:V:::::::::::::::I::::A:A:::::P::A:C:GA:F:::
rrnAC0437       :LSGAEIASTFA:::::V::::::::::::::::::::::A:K:::R::GF::LGG:V::
hla2460         ::::::I:P::::G::::::A:::::I:::::::HYD:V::::::NS::::::::S:L::
Hmu1112         PPNPAAV::A:A:::F:::I::::::::::::::::::::::::::N::::::V::::::
HQ2667A         ::::::VII:I::::::::L::::::I::::I::::::L:::::::::::::IV:S::::
HVO_1555        :::::S:GLA:V::::::::::::::V:::::::::N:V::::::::::AV:I::::V::
Hbo3496         ::::::L:::F::::::::I::::::::::::::::::V::::::::::::::::S::::

consensus       IFAAPGAVHHRGRLTPREHGLIALAGPVTNLALAVVFLPPLLL---GLLGGS-FIGLVGS
#oth            1.......2.2.2214112.1.11....1.33.333.21542322225622133263224
Hut1128         L:::::::V::::I::::S:::::::::::::::AA:A:FA:::::--A:P-:T:SS:A:
NP2704A         L::::::::::::I::::N:::SV::::::IV:VG::::LVFV:::---::-::V:A::Q
rrnAC0437       L:::::::V::::::AKQ:::::V::::::::::::::V:FF:TASMGI::-::LRELTE
hla2460         ::::::::::::::::::::H:::::::V::L:TL::::A:::::::PVV::PV:T:I::
Hmu1112         L::::::::::::ISE::N:::::::::::V:::L::VV::VVAWF::F::-:LLFELAA
HQ2667A         ::::::::::Q::V:S:Q::::::::::::AI:T:I:V:IY:A:::::TLD:SL:I:I::
HVO_1555        ::::::::Y:H:V::E:::::::::::::::L:L:A:A:V:VV::::V:V::DV:Q::::
Hbo3496         ::::::::Y:::M::D::::::::::::::::::AL:::V::I::::A::::D:V::::F

consensus       RGVIINLLLAAFNMIPFGPLDGKTVLAWSKPVFAAVFVPSILLTVGLL-FVGF-GF----
#oth            3.25..21.11..11.2.2...12.44.132.2221232221.22242123143331111
Hut1128         F::T::::::G:::::Y:::::R:::E:NRG:YL::A::::V:AIAG:::-:::::::::
NP2704A         L:::::AF:::::::::::::::S:::::::::G:::TA:V::A::SFL::::PSI::::
rrnAC0437       M:LQ::::::G:::L:::::::R::RE::T:::L::A::::::G::A::::L-:--::::
hla2460         ::IA::VF:::::L::Y:::::::::D:::G:W:GF::L:VV::I::V::::GL::GGPF
Hmu1112         L::S::::::G::::::::::::K::::::::Y:V:AA:ML::G:FV::LA:VP:L::::
HQ2667A         ::LM:::::V::::L:::A:::R::YQ:NPV:::V::I:AL:::I:AF:II:::::::::
HVO_1555        ::L:::AF::::::L:L:S::::::K:::T::::G:L:L::::::::FL:::::--::::
Hbo3496         :::T:::F::::::L:::A::::::IS:::G:::V::I::L:::LA:V::-:ITP:::::