8 genomes BUD1114 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC0695 HVO_0722 Hbo0813 Hmu0904 Hut0125 hla2397 NP0820A HQ1239A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1206	Hut0125	NP0820A	hla2397	rrnAC0695	Hmu0904	HQ1239A	HVO_0722	Hbo0813
790	Hut0125	1209	675	624	719	745	551	544	548
914	NP0820A	675	1195	808	783	807	735	708	724
894	hla2397	624	808	1234	769	809	734	775	780
939	rrnAC0695	719	783	769	1271	983	633	694	669
1028	Hmu0904	745	807	809	983	1224	685	684	693
771	HQ1239A	551	735	734	633	685	1424	808	850
808	HVO_0722	544	708	775	694	684	808	1283	901
810	Hbo0813	548	724	780	669	693	850	901	1309

200 symbols
consensus       MNKRGHVLNAALLAIGLGYVLE--------------------PSGDVETFRT--------
#oth            ...3.....131.22...311311111111111111111111.44446155322221333
Hut0125         ::::::::::L::S:::::::::::::::::::::::::::::::::V::EM::::::::
NP0820A         :::E::::::VV:GV:::F::::::::::::::::::::::::A:SM::L::::::::::
hla2397         ::::::::::L:::L:::F:I::::::::::::::::::::::GL:MA:A::::::::::
rrnAC0695       ::::::::::V::S:::::::D:::::::::::::::::::::::::T::A:::::::::
Hmu0904         :::::::::::::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::
HQ1239A         :::D::::::::::::::LI:TVDIAISAERLFTAGVTAKPS::DEIQ:SID:::FAAQL
HVO_0722        :::K::::::I:::L:::VI:TVD:::::::::::::::::::QSFEP:MDSAFLLAQKI
Hbo0813         :::E:::::G::::L:::LI:AVD:::::::::::::::::::TAGPLITESSSALALEA

consensus       ---VAEVSLPIVLGALFPDVDTAFGRHRKTLHNLPVLAIFLAFPIVFG-NLQYVWIGVLT
#oth            112232331.11...11..1.....1......1.111421312.42121..22..2..21
Hut0125         :::I:A:IV:V::::MV::I::::::::::::::F:PLVVG:Y:YYH::::E:::::::S
NP0820A         ::::VA:TV:V::::::::::::::K:::::::::I:GL:V:::F::::::S::::::::
hla2397         ::::::ITV:::::::::::::::::::::::S::::G::::Y:::::::::::::::::
rrnAC0695       :::I:::F:::::::::::::::::K:::::::::::I::::H:LYH:G:::W::L::::
Hmu0904         :::I::::V:::::::::::::::::::::::::::::V:::Y::Y:S::::W::L::V:
HQ1239A         GRS:LAF::::I:::::::::::::::::::::::::LL:IL::P:::::::F:::::A:
HVO_0722        G::--QL:::V::::::::::::::K:::::::::::V::::::L::D::::F:::::A:
Hbo0813         GRR:V:L:::VI:::::::::::::K::::::::::::::::::PI:::::::::V::A:

consensus       HYVLDYVGSRRGIALFYPLSDQEYGLPTGVTTSSKRAEAVTVVVTAFELAVAAAIVHVLP
#oth            .12..33..1..1..11.1133.122.2..211.2413411221.23.142355211333
Hut0125         :FA::LL:::::L::L:::T:E:FN::I::PVD::Y:::MMLA::G::::L::M::YEI:
NP0820A         ::::::L:::::::::::::ST:::S:F::::::RF:N:::LI::GV:::::V:::::::
hla2397         ::A::VI:::::::::H::::T:::M:::::::::Y:DL:::I:::V::::FW:L-:TYV
rrnAC0695       ::::::F:::::::::::F::T:::S::::::::D::::::::I:::::LAV:LL:::::
Hmu0904         ::A:::F::::::::::::::::::S::::::::D:::I:::::::::VV::IVL:::::
HQ1239A         ::L::V:::K::::::::::AS::D::I::A:::RWTAS::LI:::G::::LFI:-:TYI
HVO_0722        :::::M:::K::::::::::P:::D:::::A::::H:D:::::::VA::G:L:GV-:YFL
Hbo0813         :::::M:::K::::::::::S:::D:::::A::::W:NP::F::::V::I:LG:V-:YYV

consensus       QYLDTAALTAAGLAAA----
#oth            43225474633645533232
Hut0125         ::AFE:G:K:V::S--::::
NP0820A         A:V:I:E:::QLPV--::::
hla2397         VT::LDISA::SE:::GLGI
rrnAC0695       :::PPTVR:FVVENS:FLV:
Hmu0904         ::VP:E:MQIV:::::::::
HQ1239A         IA::::PMVVNETVVSVLMS
HVO_0722        FS::VSLAD::ASFT:VV::
Hbo0813         FA:::TFSE::T:LGLF:::