8 genomes BUD1118 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC0207 HVO_1101 Hbo0606 Hmu0690 Hut1674 hla2634 NP1490A HQ1507A

Pairwise sequence scores
Consensus score	2266	NP1490A	hla2634	Hut1674	rrnAC0207	Hmu0690	HQ1507A	HVO_1101	Hbo0606
1677	NP1490A	2198	1464	1459	1530	1544	1464	1403	1462
1693	hla2634	1464	2494	1583	1558	1562	1385	1497	1487
1696	Hut1674	1459	1583	2296	1629	1635	1389	1512	1486
1970	rrnAC0207	1530	1558	1629	2308	1924	1480	1649	1595
1946	Hmu0690	1544	1562	1635	1924	2314	1523	1578	1570
1657	HQ1507A	1464	1385	1389	1480	1523	2291	1529	1618
1779	HVO_1101	1403	1497	1512	1649	1578	1529	2275	1697
1782	Hbo0606	1462	1487	1486	1595	1570	1618	1697	2286

341 symbols
consensus       -------------------MTDIDFTGVFPAMTTPFHDDG--SIDHETLRADARRLEAAG
#oth            11111111111111111122154313..1..12...43121121.1121232211..4..
NP1490A         :::::::::::::::::::::HDT::::::::::::D:EE::R:::::::DH:Q::::::
hla2634         MTDTTTTTPYATQDETDRET::EP:E::Y:::::::T::D::EV:::Q:A:N::Y::R::
Hut1674         ::::::::::::::::::MPPQPL:E::Y:::::::E::E::R::FDQ:::N::::::::
rrnAC0207       :::::::::::::::::::::A:::H::::::C::::Q:::::::F::::D::Q:::S::
Hmu0690         :::::::::::::::::::::H::L::::::IP::::::DDR:::F::::R::Q::::::
HQ1507A         ::::::::::::::::::::::::L:::::::::::TP::::R:::DI:AQN:Q:::T::
HVO_1101        :::::::::::::::::::::SF::C::Y::::::::E:::::::F:QFQ::V::::E::
Hbo0606         :::::::::::::::::::::NF:L:::Y:::::::AP:::::::::::AD:T::::R::

consensus       VDGLVPVGSTGESATLSHDEHIEVVEAVVDAVDDVPVIAGSGSNNTREALELSRRAADAG
#oth            .1.1..1.1......11....11.1.11321231...1..1...1.2...2..2.1111.
NP1490A         ::::::::T::::::M::::::::::T::::::::::::::::::::::::::E::::::
hla2634         :::V:::::::::::M:::::VD:I:T:R::LE::::V::T:::::A:::S::E::::::
Hut1674         :::V:::::::::::::::::V::I:::AG:LK:::::::T:::::::::S:::::R:::
rrnAC0207       ::::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::K::::::::S:E::
Hmu0690         ::::::A::::::::MT:::::::::::::::::::::::T:::::::::S::Q::::::
HQ1507A         :S::::A:::::::::T:::::D:I:T:I:S:N:::::::::::S:::::N::E::::::
HVO_1101        :::V::::::::::::T::::V:::::A:E::EE::::::::::S::::::::::S::::
Hbo0606         ::::::::::::::::T:::::::::T::E:AE:::::::::::S::::::::::S::V:

consensus       ADALLLISPYYNKPEQAGLIEHYRTIADAVDLPQIVYNVPSRTGQNIEPDTAAELAEHEN
#oth            ..1.........1..13.252..3.2..11.3...1....1...31.4221213..2.2.
NP1490A         ::G:::::::::I::PE:MET::::V:::::::::I::::G:::R::AVE::VS::::::
hla2634         ::G::::::::::::PQ:FL::::::::E::::::::::::::::S:PI:VTV:::::P:
Hut1674         ::::::::::::::::R::R:::L::::EI::::::::::::::R::D::::VA::D:::
rrnAC0207       ::::::::::::::::Q:F:D::T:L::::::::::::::::::::::::::::::S:P:
Hmu0690         ::::::::::::::::R::V:::::::::::C::::::::::::::::::::V:::S:::
HQ1507A         ::::::::::::I::::::KD::::::::I:I::::::::G:::T::::E:V:T::S:R:
HVO_1101        :::::::::::::::::::VD:::::::EI::::::::::G:::S::L:E:::T::::P:
Hbo0606         ::G::::::::::::::::::::Q::::E::V::::::::::::S::::A:V:T::D:::

consensus       IAGYKAASGDLNQISEVVERTRDEEFAVLSGDDALTLPMLSIGGTGCISVSANVEPERTC
#oth            1411......31212111.1..224.41.....21...3223.15.3...41.1..2124
NP1490A         :V::::::::::RVG::I::::E:N:E:::::::::::IIAQ:::::::::::::::::V
hla2634         :Q::::::::::L::::I::::::::S::::::G::::V:::::::T:::VG::::::S:
Hut1674         :QAF:::::::G::T:I:::::EKD:T::::::::::::::::AR:A:::V:::::V:::
rrnAC0207       :RA:::::::M:::::II::::::D::::::::GM::::::V:::::::::::I::::::
Hmu0690         V::F::::::M:::::I:::::::::S::::::GM::::::::AD:::::A:::::::::
HQ1507A         :V::::::::VG:::S:::Q::S:A:YI:::::I::::ICGL::S:V:::G::I::AQ:T
HVO_1101        :T:::::::::G::::::::::::Q:::::::::::::T::V::V:A:::T:::::A:VG
Hbo0606         ::::::::::IG::::::::::EQ:::I::::::::::VI:V::H:V:::TG:I:::::A

consensus       AMVGAALSGDFERARALHHELGPLFRALFVETNPIPVKEAMEIRGYGPATLRSPLTRLSD
#oth            .2.11.24..121.131112.21.4141.3......111..42.1322342.2..23.43
NP1490A         :L:::::E:::T:::E:QY:::D:::T::I::::::IN:::DM:DIHSS:M::::NP:QP
hla2634         ::::::::::YD:::::::::S::V:E::A:::::::::::H:::R:GPSV::::S:::E
Hut1674         :::::::A:::::::E::::::::A::::::::::::::::A:::H:SPE::::::::AE
rrnAC0207       ::::::::::::::Q:I::::::::::M:::::::::::::R:::::::H::::::::::
Hmu0690         ::::::IA::Y:::::I::::::::::::::::::::::::R:::::::HM:Q::S::AS
HQ1507A         ::::::V:::YD:::N::YQ:A:::EH:::::::::::A:::Y:D:::G:::P:::D:::
HVO_1101        :I:HS::Q::Y::::DI::D:A::N:H::S:::::::::::::::::::R::P:::::TE
Hbo0606         :::H:::D:::DS::E::::::::S:Q::I::::::::A:::::::A:G:::P:::E:R:

consensus       EHRERLRAVLAD--------LEAED-----LEPEAGAAE--
#oth            22435.243.3311111111124441111143464353221
NP1490A         ::::Q::E::::::::::::::R--:::::---------::
hla2634         DR::I:QEL::EYDGGAPGAVDP:A:::::V::T::D::::
Hut1674         :::AH::D::DE:::::::::DPI::::::V:TPVETTDR:
rrnAC0207       ::LDH::D:::T::::::::::T:::::::::D:YAE::R:
Hmu0690         ::VD::E::::::::::::::AD:::::::::A:YAE::R:
HQ1507A         K::K::ESI:D::::::::::D:DR:::::EMAL::QT:VI
HVO_1101        :NT:E::RL:S:::::::::::::Q:::::AI:DG::G:::
Hbo0606         ::Y:M:E:T:EQ:::::::::::TREASLG:::AG::--::