Home |  Text search
8 genomes BUD1121 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2877

HVO_0013

Hbo1497

Hmu3171

Hut2846

hla0589

NP0490A

HQ1007A

Pairwise sequence scores
Consensus score1170 hla0589 Hut2846 HQ1007A rrnAC2877 Hbo1497 HVO_0013 NP0490A Hmu3171
683hla0589 1447 520 453 536 567 504 511 539
654Hut2846 520 1323 419 537 559 472 519 581
694HQ1007A 453 419 1197 486 635 621 581 564
781rrnAC2877 536 537 486 1293 637 605 630 691
872Hbo1497 567 559 635 637 1174 751 632 699
850HVO_0013 504 472 621 605 751 1184 652 721
806NP0490A 511 519 581 630 632 652 1207 731
844Hmu3171 539 581 564 691 699 721 731 1200

206 symbols
consensus       -------------------MRLVEGTATID-----DVDAFVEALDAIGDETGATVQAFDA
#oth            11111111111111111111322214241311111.124124512422432.121.1...
hla0589         MSDADAESDGALPDPPAPPYQ::T:::I::::::::L:::LS:::E:AA::::V::::::
Hut2846         ::::::::::::::::::::EVL::ELR::::::::L:GVL:R:::::::H:VA::::::
HQ1007A         ::::::::::::::::::::K::C:KV::E::::::::E::SIV:K:EKG::::I:::::
rrnAC2877       :::::::::::::::::::::V:::::E:::::::::GT:::T:S::::RY:V:::::::
Hbo1497         ::::::::::::::::::::KFI::V::VE:::::::N:::TDVG::A::::::::V:::
HVO_0013        ::::::::::::::::::::::L:AE::VS::::::L:S:IA:VGDVA::::::::::::
NP0490A         :::::::::::::::::::::V:::I:D:GGETAP::GS::QF::EV:TDH:V:::::::
Hmu3171         ::::::::::::::::::::Q:I:::::V:::::::::E:::R:GSL:EDH:VV::::::

consensus       RYVVDRRHLRRAVELADRAIARGEAIARDRGVEILLYAAGRRQINRALEMGVSEGETPAV
#oth            1211334.132.321.2.135.2341.1.221.11...1.....32.122.113.5423.
hla0589         DF::SAA:::E:TR::A:::::DD:V:::P::::::::::::::D:::AL:L::::QR::
Hut2846         :::AG:E:::::CA:::::HV:D:M::::P::::::::::::::QD:::::::P:Q::::
HQ1007A         ::I:NQK:IK::I:C::::RR:NNN:::::SI:M::::::::::TE:::I:::S:LNRI:
rrnAC2877       ::::::P::QL:::::T::HD::D:::E:F::::::::::::::::::T::::::AC:V:
Hbo1497         ::::SEK:::::::::::::E:::NV::::A::M::::::::::DD::A:::::::::V:
HVO_0013        ::::::E::E:::::::::::::NE:::::A:::::::S::::::::F:I:::::TL:V:
NP0490A         :CI:S::::E::::::::ERS::A::::::::::M:::::::::D::::I:::::::ST:
Hmu3171         :::::::::E:::::::::FD:::S:::::A:::::::::::::::::A:::GD:SQ:::

consensus       VVV-------------DGGDEAAAAAAVRDL--LTPA-ETLGDYDP----DRVREFFDIT
#oth            22242432322332224434333.134253534423433221521311114312321.12
hla0589         :L:TDFGRVPGADR::PDA:LD::::S::::LVS:AGSADTEEFE:AFDSEQ:Q::Y::G
Hut2846         I:CHAVGDRPGEAGAERATERER::CE:IETMACLDLTA:REAA::::::QLIA::::::
HQ1007A         :AI::::::::::::::::N:IE::KSIESNTLD:::D:V::S::::::::L:QPY::::
rrnAC2877       A:IVDHERTDTHVGKSEQNGIE::EDD::EE::::AM:S:::E:::::::::I:S:::V:
Hbo1497         AL::::::::::::::::::::K:::QL:::::F:ER:Q:::R::D::::E:::D:::V:
HVO_0013        :L::::::::::::::::::::::E::LF:RLDFE::::::::::E::::SL::DV::VG
NP0490A         :::S::::::::::::GD:::::::D::A:S:::L:::::::N::R::::::::S:Y::G
Hmu3171         :::HDPT:::::::::GE:S:::::D::SA::::E:G::::::::E::::GV::::::VS

consensus       DAELAATDGDLEALVRERVALLAVER
#oth            33.23115132332.3....1.5.11
hla0589         :R:I:::I:GVAEI::::::::D::K
Hut2846         :::R::::AT:SE::C::::M:V::K
HQ1007A         AN:IDVVN::T:S::L::::::::::
rrnAC2877       :T:::::A:::PDA::::::::P::K
Hbo1497         ::::::V:::::S::C::::::N::K
HVO_0013        ET::HVV::::P::::::::::::D:
NP0490A         V:::E::TAS:::::L::::::V:::
Hmu3171         E::::::S:T:SD::A::::::T:::