|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1170 | hla0589 | Hut2846 | HQ1007A | rrnAC2877 | Hbo1497 | HVO_0013 | NP0490A | Hmu3171 |
683 | hla0589 | 1447 | 520 | 453 | 536 | 567 | 504 | 511 | 539 |
654 | Hut2846 | 520 | 1323 | 419 | 537 | 559 | 472 | 519 | 581 |
694 | HQ1007A | 453 | 419 | 1197 | 486 | 635 | 621 | 581 | 564 |
781 | rrnAC2877 | 536 | 537 | 486 | 1293 | 637 | 605 | 630 | 691 |
872 | Hbo1497 | 567 | 559 | 635 | 637 | 1174 | 751 | 632 | 699 |
850 | HVO_0013 | 504 | 472 | 621 | 605 | 751 | 1184 | 652 | 721 |
806 | NP0490A | 511 | 519 | 581 | 630 | 632 | 652 | 1207 | 731 |
844 | Hmu3171 | 539 | 581 | 564 | 691 | 699 | 721 | 731 | 1200 |
206 symbols consensus -------------------MRLVEGTATID-----DVDAFVEALDAIGDETGATVQAFDA #oth 11111111111111111111322214241311111.124124512422432.121.1... hla0589 MSDADAESDGALPDPPAPPYQ::T:::I::::::::L:::LS:::E:AA::::V:::::: Hut2846 ::::::::::::::::::::EVL::ELR::::::::L:GVL:R:::::::H:VA:::::: HQ1007A ::::::::::::::::::::K::C:KV::E::::::::E::SIV:K:EKG::::I::::: rrnAC2877 :::::::::::::::::::::V:::::E:::::::::GT:::T:S::::RY:V::::::: Hbo1497 ::::::::::::::::::::KFI::V::VE:::::::N:::TDVG::A::::::::V::: HVO_0013 ::::::::::::::::::::::L:AE::VS::::::L:S:IA:VGDVA:::::::::::: NP0490A :::::::::::::::::::::V:::I:D:GGETAP::GS::QF::EV:TDH:V::::::: Hmu3171 ::::::::::::::::::::Q:I:::::V:::::::::E:::R:GSL:EDH:VV:::::: consensus RYVVDRRHLRRAVELADRAIARGEAIARDRGVEILLYAAGRRQINRALEMGVSEGETPAV #oth 1211334.132.321.2.135.2341.1.221.11...1.....32.122.113.5423. hla0589 DF::SAA:::E:TR::A:::::DD:V:::P::::::::::::::D:::AL:L::::QR:: Hut2846 :::AG:E:::::CA:::::HV:D:M::::P::::::::::::::QD:::::::P:Q:::: HQ1007A ::I:NQK:IK::I:C::::RR:NNN:::::SI:M::::::::::TE:::I:::S:LNRI: rrnAC2877 ::::::P::QL:::::T::HD::D:::E:F::::::::::::::::::T::::::AC:V: Hbo1497 ::::SEK:::::::::::::E:::NV::::A::M::::::::::DD::A:::::::::V: HVO_0013 ::::::E::E:::::::::::::NE:::::A:::::::S::::::::F:I:::::TL:V: NP0490A :CI:S::::E::::::::ERS::A::::::::::M:::::::::D::::I:::::::ST: Hmu3171 :::::::::E:::::::::FD:::S:::::A:::::::::::::::::A:::GD:SQ::: consensus VVV-------------DGGDEAAAAAAVRDL--LTPA-ETLGDYDP----DRVREFFDIT #oth 22242432322332224434333.134253534423433221521311114312321.12 hla0589 :L:TDFGRVPGADR::PDA:LD::::S::::LVS:AGSADTEEFE:AFDSEQ:Q::Y::G Hut2846 I:CHAVGDRPGEAGAERATERER::CE:IETMACLDLTA:REAA::::::QLIA:::::: HQ1007A :AI::::::::::::::::N:IE::KSIESNTLD:::D:V::S::::::::L:QPY:::: rrnAC2877 A:IVDHERTDTHVGKSEQNGIE::EDD::EE::::AM:S:::E:::::::::I:S:::V: Hbo1497 AL::::::::::::::::::::K:::QL:::::F:ER:Q:::R::D::::E:::D:::V: HVO_0013 :L::::::::::::::::::::::E::LF:RLDFE::::::::::E::::SL::DV::VG NP0490A :::S::::::::::::GD:::::::D::A:S:::L:::::::N::R::::::::S:Y::G Hmu3171 :::HDPT:::::::::GE:S:::::D::SA::::E:G::::::::E::::GV::::::VS consensus DAELAATDGDLEALVRERVALLAVER #oth 33.23115132332.3....1.5.11 hla0589 :R:I:::I:GVAEI::::::::D::K Hut2846 :::R::::AT:SE::C::::M:V::K HQ1007A AN:IDVVN::T:S::L:::::::::: rrnAC2877 :T:::::A:::PDA::::::::P::K Hbo1497 ::::::V:::::S::C::::::N::K HVO_0013 ET::HVV::::P::::::::::::D: NP0490A V:::E::TAS:::::L::::::V::: Hmu3171 E::::::S:T:SD::A::::::T:::