Home |  Text search
8 genomes BUD1122 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2675

HVO_0043

Hbo1450

Hmu3086

Hut2202

hla0675

NP5264A

HQ3717A

Pairwise sequence scores
Consensus score2804 hla0675 NP5264A HQ3717A HVO_0043 Hbo1450 Hut2202 rrnAC2675 Hmu3086
2237hla0675 2824 2191 1916 1914 1878 2021 1918 1930
2180NP5264A 2191 2831 1904 1910 1875 1935 1991 1942
2262HQ3717A 1916 1904 2830 2213 2310 1999 1891 1830
2306HVO_0043 1914 1910 2213 2814 2330 2024 1937 1898
2286Hbo1450 1878 1875 2310 2330 2824 2022 1890 1868
2323Hut2202 2021 1935 1999 2024 2022 2805 2170 2123
2277rrnAC2675 1918 1991 1891 1937 1890 2170 2819 2231
2225Hmu3086 1930 1942 1830 1898 1868 2123 2231 2831

380 symbols
consensus       MSG-FVFNEKPIQIESGDGAYLYDDDGTEYLDFGASYACAPLGHAHPAVTSAVQEQAEKL
#oth            .1.1...1....4.13.1.2312234.11...1.....1222..4.12.34.334.3231
hla0675         :::::::S::::E:A::::VT:T:TN:::::::::::::T:V::C::E:VD:ATS:I:E:
NP5264A         :::::::S::::G::R:E:V::::TK:N:::::::::::T:V::C::D:VA:TT::L:R:
HQ3717A         :T:G:::S::::E::::E:::::GS:::S:::::::::V:SI::::::::E:::Q::AD:
HVO_0043        ::::::::::::A::::E:S:::S::::::::::::::V:A:::S:::::::I::::A::
Hbo1450         ::::::::::::N::::E:::::GS:::::::::::::V:A:::::::::D:::K:::::
Hut2202         :::::::S:::::::N::::VV::EA::::::M::::::V::::S:A::D:::KD:VDD:
rrnAC2675       :::::::::::::::R:::::V:::S::::::M::::::V::::K::::H:::S::L::I
Hmu3086         :::::::::::::::E:::VW:S::A:N::::M::::::V::::R::::DQ:AKS:IDR:

consensus       TYVQASYPVAARTALYEKLATAAPGDIDNVWLCNSGTEANEAALKFARSATGRSKIVATM
#oth            1.......224..2..23.1531.122211.............1....2..132.11..2
hla0675         M:::::::H::::::::Q:SE:G:::V:::::::::::::::::::::H::::E:::::T
NP5264A         M:::::::N:P::::::Q:::V::::::::::::::::::::::::::H::::E::::::
HQ3717A         :::::::::ET::E::Q::::L:::::E:::::::::::::::M:::::::::::::::K
HVO_0043        :::::::::EV::E:::::::L:::::S:::::::::::::::M:::::::::Q:::::K
Hbo1450         :::::::::DV::E::::::AV::DGLE:::::::::::::::M:::::::D::::I::K
Hut2202         :::::::::ET::R::DT::V:::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::
rrnAC2675       ::::::::N:E:::::DL::KT::DP::KT::::::::::::::::::::::N:::::::
Hmu3086         ::::::::N::::R:::T::DT::DP::K:::::::::::::::::::A:::E::L::::

consensus       QGFHGRTMGALATTWKDKYKKPFEPLAGDVEFVPYGDAEALAEAVDEETAAVILEPVQGE
#oth            11.....1.2..3...3..1311..11.121..3.1.421132.1.11..1112..2...
hla0675         ::::::::::::::::Q:::QG::::::G::::E::::D:MR::I:D:::::::::L:::
NP5264A         :::::::::T::A::::::RDG::::::GF::::::::::M:D::::D:::::V::::::
HQ3717A         R:::::::::::M:::N:::A:::::::GID::::::Q:::TA:::::::::F:::::::
HVO_0043        RA:::::L:S::L:::Q:::::Y::V::G::::S:::EAE::::::D:::::F:::I:::
Hbo1450         R:::::::::::M::::::::::::::::::::T:::EAE::::I:::::::F:::::::
Hut2202         ::::::::::::::::::::::Y:::I::::::::D:S::::::::D::::::M::I:::
rrnAC2675       ::::::::::::::::N:::::Y:::I::::::::D:S:::E:::::D:::F:V::::::
Hmu3086         :::::::::S::::::S:::::Y::::::::::::D:P::MRD:::::::G::V::I:::

consensus       GGINPASTEYLQAAREATEEAGAALVFDEIQTGMGRTGSLWACEEAGVVPDILTTAKGLA
#oth            ...1.14311.242.23.22....121..1...3....2..13243212..21.2...11
hla0675         ::::::A::::::V::::::::::M:L::::::L::::::::T:KHDI:::V::::::::
NP5264A         ::::::PNG:::SV::T::S::::M:L::::::L::::T:::A::Y:::::::::::::G
HQ3717A         :::H::D::::RC:::::Q::::::::::::::V::::::::SDG:::T:::::::::I:
HVO_0043        ::::::AA::::T::DL:DD:::::::::::::I::::A:::::N:::::::::S:::I:
Hbo1450         :::H::G:::::T::KL::::::::A:::::::I::::T:::::G:::T:::::S:::I:
Hut2202         :::H:::::::ES:::I:D::::::I:::V::::::::T:::::K::::::M::::::::
rrnAC2675       :::::T:DG::ED:::I::D:::::I:::V::::::::A::NSQR:A:A::MI:A::::G
Hmu3086         :::::::::F:E:T:::::D:::::I:::V::::::::::::AQ:S:::::MI:A::::G

consensus       NGLPIGATLCRDWIAEDYGSHGSTFSGGPVVSAAANATLDTIVEEDLPGHAAAVGDYLRA
#oth            1.2.2....111.1.23412.1.....1.122...3..121132123.31.143.31153
hla0675         S::::::::::::V:::A:N:::::::::::::::G::::V:EH::::A::DEM:A:I:G
NP5264A         S::::::::V:::V:A:C:N::::::::::TT:::G::::V:TD::::S:::EL:T::VE
HQ3717A         ::::L::::V::::::ES:D:::::::T:I:C:::::::E::::::I::N::MI:EH:Q:
HVO_0043        ::::L:::::A::::DGAA::::::::::::C::::::::::::::::::::::::::TT
Hbo1450         ::::L::::VA:::::NP:N:::::::::::C::::::::::::::Y:S::::::E::K:
Hut2202         ::F:M:::::A::::::::::A:::::::::::::E::VS:L:::EI:Q:::D::E:::G
rrnAC2675       :::::::::::::::::::::A::::::::I::::G::VS::I:DSV::N::VI::::LT
Hmu3086         ::Y::::::::E:::DE::::A::::::::I::::D::VS::::::V:SN::::::::::

consensus       ELEAALGDH---VRDVRGEGLMIGVEVKRGANRVLKNLALNEQVLALPAGRTVVRLLPPL
#oth            2122331141111.11..3...2.1111..1135.15..21122.......1.2.1....
hla0675         QIDER:::G:::::::::D:::::I:::::S::L:RD::I:H:::::::::::L::::::
NP5264A         A::::I::E:::::E:::N:::V:::::::::PI::E::::HDI:::::::S::::::::
HQ3717A         AITD:VE::DLP::EI::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::::
HVO_0043        :::::VEE:DLP::E:::D:::V::::::::::T::H:::S::L:::::::::::F::::
Hbo1450         :::::AEE:DLP::::::Q:::L::Q:::::::::::::IS:::::::::::::::::::
Hut2202         Q::DE::EA:::A:E:::::::::::I:::::::::D::::H::::::::::::::::::
rrnAC2675       :::::I::D::::::I:::::::::::G::::AA::K::::H:::::::::::I::::::
Hmu3086         ::::T:::E::::::I::::::::I::G:::MGH::Q::MS:G:::::::::::::::::

consensus       TIDEEHADAVVDALAEVIG-
#oth            222332..421212332351
hla0675         ::ER::::::I:::::::::
NP5264A         V::RGD::::::::EAI:::
HQ3717A         :::TA:::TFIESFV::L::
HVO_0043        V:E:::::RA:::MTN:LS:
Hbo1450         VVT:G:::EF:ESFV::TK:
Hut2202         IVE:AQ:::::A::::A:D:
rrnAC2675       :::KD::::::::M:::VE:
Hmu3086         :LT::D::H:::::ES::VE