|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2804 | hla0675 | NP5264A | HQ3717A | HVO_0043 | Hbo1450 | Hut2202 | rrnAC2675 | Hmu3086 |
2237 | hla0675 | 2824 | 2191 | 1916 | 1914 | 1878 | 2021 | 1918 | 1930 |
2180 | NP5264A | 2191 | 2831 | 1904 | 1910 | 1875 | 1935 | 1991 | 1942 |
2262 | HQ3717A | 1916 | 1904 | 2830 | 2213 | 2310 | 1999 | 1891 | 1830 |
2306 | HVO_0043 | 1914 | 1910 | 2213 | 2814 | 2330 | 2024 | 1937 | 1898 |
2286 | Hbo1450 | 1878 | 1875 | 2310 | 2330 | 2824 | 2022 | 1890 | 1868 |
2323 | Hut2202 | 2021 | 1935 | 1999 | 2024 | 2022 | 2805 | 2170 | 2123 |
2277 | rrnAC2675 | 1918 | 1991 | 1891 | 1937 | 1890 | 2170 | 2819 | 2231 |
2225 | Hmu3086 | 1930 | 1942 | 1830 | 1898 | 1868 | 2123 | 2231 | 2831 |
380 symbols consensus MSG-FVFNEKPIQIESGDGAYLYDDDGTEYLDFGASYACAPLGHAHPAVTSAVQEQAEKL #oth .1.1...1....4.13.1.2312234.11...1.....1222..4.12.34.334.3231 hla0675 :::::::S::::E:A::::VT:T:TN:::::::::::::T:V::C::E:VD:ATS:I:E: NP5264A :::::::S::::G::R:E:V::::TK:N:::::::::::T:V::C::D:VA:TT::L:R: HQ3717A :T:G:::S::::E::::E:::::GS:::S:::::::::V:SI::::::::E:::Q::AD: HVO_0043 ::::::::::::A::::E:S:::S::::::::::::::V:A:::S:::::::I::::A:: Hbo1450 ::::::::::::N::::E:::::GS:::::::::::::V:A:::::::::D:::K::::: Hut2202 :::::::S:::::::N::::VV::EA::::::M::::::V::::S:A::D:::KD:VDD: rrnAC2675 :::::::::::::::R:::::V:::S::::::M::::::V::::K::::H:::S::L::I Hmu3086 :::::::::::::::E:::VW:S::A:N::::M::::::V::::R::::DQ:AKS:IDR: consensus TYVQASYPVAARTALYEKLATAAPGDIDNVWLCNSGTEANEAALKFARSATGRSKIVATM #oth 1.......224..2..23.1531.122211.............1....2..132.11..2 hla0675 M:::::::H::::::::Q:SE:G:::V:::::::::::::::::::::H::::E:::::T NP5264A M:::::::N:P::::::Q:::V::::::::::::::::::::::::::H::::E:::::: HQ3717A :::::::::ET::E::Q::::L:::::E:::::::::::::::M:::::::::::::::K HVO_0043 :::::::::EV::E:::::::L:::::S:::::::::::::::M:::::::::Q:::::K Hbo1450 :::::::::DV::E::::::AV::DGLE:::::::::::::::M:::::::D::::I::K Hut2202 :::::::::ET::R::DT::V:::::::::::::::::::::::::::::::D::::::: rrnAC2675 ::::::::N:E:::::DL::KT::DP::KT::::::::::::::::::::::N::::::: Hmu3086 ::::::::N::::R:::T::DT::DP::K:::::::::::::::::::A:::E::L:::: consensus QGFHGRTMGALATTWKDKYKKPFEPLAGDVEFVPYGDAEALAEAVDEETAAVILEPVQGE #oth 11.....1.2..3...3..1311..11.121..3.1.421132.1.11..1112..2... hla0675 ::::::::::::::::Q:::QG::::::G::::E::::D:MR::I:D:::::::::L::: NP5264A :::::::::T::A::::::RDG::::::GF::::::::::M:D::::D:::::V:::::: HQ3717A R:::::::::::M:::N:::A:::::::GID::::::Q:::TA:::::::::F::::::: HVO_0043 RA:::::L:S::L:::Q:::::Y::V::G::::S:::EAE::::::D:::::F:::I::: Hbo1450 R:::::::::::M::::::::::::::::::::T:::EAE::::I:::::::F::::::: Hut2202 ::::::::::::::::::::::Y:::I::::::::D:S::::::::D::::::M::I::: rrnAC2675 ::::::::::::::::N:::::Y:::I::::::::D:S:::E:::::D:::F:V:::::: Hmu3086 :::::::::S::::::S:::::Y::::::::::::D:P::MRD:::::::G::V::I::: consensus GGINPASTEYLQAAREATEEAGAALVFDEIQTGMGRTGSLWACEEAGVVPDILTTAKGLA #oth ...1.14311.242.23.22....121..1...3....2..13243212..21.2...11 hla0675 ::::::A::::::V::::::::::M:L::::::L::::::::T:KHDI:::V:::::::: NP5264A ::::::PNG:::SV::T::S::::M:L::::::L::::T:::A::Y:::::::::::::G HQ3717A :::H::D::::RC:::::Q::::::::::::::V::::::::SDG:::T:::::::::I: HVO_0043 ::::::AA::::T::DL:DD:::::::::::::I::::A:::::N:::::::::S:::I: Hbo1450 :::H::G:::::T::KL::::::::A:::::::I::::T:::::G:::T:::::S:::I: Hut2202 :::H:::::::ES:::I:D::::::I:::V::::::::T:::::K::::::M:::::::: rrnAC2675 :::::T:DG::ED:::I::D:::::I:::V::::::::A::NSQR:A:A::MI:A::::G Hmu3086 :::::::::F:E:T:::::D:::::I:::V::::::::::::AQ:S:::::MI:A::::G consensus NGLPIGATLCRDWIAEDYGSHGSTFSGGPVVSAAANATLDTIVEEDLPGHAAAVGDYLRA #oth 1.2.2....111.1.23412.1.....1.122...3..121132123.31.143.31153 hla0675 S::::::::::::V:::A:N:::::::::::::::G::::V:EH::::A::DEM:A:I:G NP5264A S::::::::V:::V:A:C:N::::::::::TT:::G::::V:TD::::S:::EL:T::VE HQ3717A ::::L::::V::::::ES:D:::::::T:I:C:::::::E::::::I::N::MI:EH:Q: HVO_0043 ::::L:::::A::::DGAA::::::::::::C::::::::::::::::::::::::::TT Hbo1450 ::::L::::VA:::::NP:N:::::::::::C::::::::::::::Y:S::::::E::K: Hut2202 ::F:M:::::A::::::::::A:::::::::::::E::VS:L:::EI:Q:::D::E:::G rrnAC2675 :::::::::::::::::::::A::::::::I::::G::VS::I:DSV::N::VI::::LT Hmu3086 ::Y::::::::E:::DE::::A::::::::I::::D::VS::::::V:SN:::::::::: consensus ELEAALGDH---VRDVRGEGLMIGVEVKRGANRVLKNLALNEQVLALPAGRTVVRLLPPL #oth 2122331141111.11..3...2.1111..1135.15..21122.......1.2.1.... hla0675 QIDER:::G:::::::::D:::::I:::::S::L:RD::I:H:::::::::::L:::::: NP5264A A::::I::E:::::E:::N:::V:::::::::PI::E::::HDI:::::::S:::::::: HQ3717A AITD:VE::DLP::EI::::::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::: HVO_0043 :::::VEE:DLP::E:::D:::V::::::::::T::H:::S::L:::::::::::F:::: Hbo1450 :::::AEE:DLP::::::Q:::L::Q:::::::::::::IS::::::::::::::::::: Hut2202 Q::DE::EA:::A:E:::::::::::I:::::::::D::::H:::::::::::::::::: rrnAC2675 :::::I::D::::::I:::::::::::G::::AA::K::::H:::::::::::I:::::: Hmu3086 ::::T:::E::::::I::::::::I::G:::MGH::Q::MS:G::::::::::::::::: consensus TIDEEHADAVVDALAEVIG- #oth 222332..421212332351 hla0675 ::ER::::::I::::::::: NP5264A V::RGD::::::::EAI::: HQ3717A :::TA:::TFIESFV::L:: HVO_0043 V:E:::::RA:::MTN:LS: Hbo1450 VVT:G:::EF:ESFV::TK: Hut2202 IVE:AQ:::::A::::A:D: rrnAC2675 :::KD::::::::M:::VE: Hmu3086 :LT::D::H:::::ES::VE