|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3002 | Hbo3312 | Hmu3372 | Hbo3393 | Hbo3968 | HVO_B0198 | Hbo2048 | VNG2562 | HVO_2094 | HVO_A0541 | HVO_A0557 | hla0004 | HVO_2038 | HVO_B0150 | pNG7039 | Hbo0280 | HVO_1991 | pNG7277 | Hut2909 | Hbo3443 | HVO_A0558 | Hbo2912 | pNG7190 | VNG1720 | Hbo0846 | Hmu0264 | Hmu1422 | Hbo2774 | Hmu1150 | rrnB0275 | HVO_B0144 | VNG2549 | rrnAC0299 | Hbo3952 | Hmu3344 | pNG7041 | Hmu3301 | Hbo3597 | Hmu0262 | HVO_B0047 | rrnAC0899 | Hbo3224 | Hut2908 | Hbo3275 | Hbo1611 | pNG7040 | HVO_1464 |
1276 | Hbo3312 | 3254 | 1406 | 890 | 837 | 753 | 827 | 692 | 822 | 766 | 1003 | 920 | 852 | 871 | 907 | 878 | 946 | 976 | 908 | 848 | 863 | 890 | 884 | 830 | 815 | 759 | 901 | 1123 | 1002 | 873 | 860 | 769 | 911 | 770 | 818 | 783 | 837 | 623 | 932 | 897 | 848 | 955 | 951 | 1001 | 948 | 832 | 952 |
1197 | Hmu3372 | 1406 | 3278 | 716 | 638 | 605 | 649 | 587 | 802 | 826 | 932 | 893 | 822 | 898 | 882 | 922 | 952 | 938 | 963 | 859 | 852 | 922 | 670 | 779 | 741 | 751 | 825 | 1003 | 931 | 833 | 774 | 691 | 875 | 753 | 776 | 756 | 879 | 531 | 836 | 781 | 732 | 906 | 994 | 926 | 1059 | 787 | 982 |
1179 | Hbo3393 | 890 | 716 | 3072 | 1910 | 1364 | 1522 | 1447 | 660 | 767 | 894 | 837 | 745 | 798 | 845 | 886 | 822 | 955 | 954 | 801 | 869 | 789 | 821 | 813 | 765 | 708 | 793 | 853 | 765 | 892 | 850 | 687 | 886 | 728 | 889 | 798 | 902 | 644 | 891 | 952 | 896 | 922 | 977 | 950 | 1001 | 787 | 1004 |
1141 | Hbo3968 | 837 | 638 | 1910 | 3039 | 1243 | 1406 | 1259 | 679 | 756 | 902 | 828 | 676 | 843 | 830 | 909 | 764 | 814 | 836 | 727 | 821 | 819 | 788 | 677 | 754 | 695 | 790 | 895 | 805 | 855 | 843 | 630 | 861 | 726 | 838 | 884 | 925 | 622 | 833 | 824 | 884 | 995 | 905 | 924 | 955 | 804 | 943 |
1184 | HVO_B0198 | 753 | 605 | 1364 | 1243 | 3032 | 1766 | 1803 | 682 | 670 | 773 | 745 | 732 | 655 | 734 | 832 | 795 | 813 | 804 | 685 | 755 | 753 | 775 | 751 | 779 | 715 | 708 | 804 | 772 | 842 | 731 | 780 | 828 | 805 | 820 | 764 | 913 | 589 | 949 | 880 | 951 | 863 | 929 | 895 | 929 | 741 | 1018 |
1146 | Hbo2048 | 827 | 649 | 1522 | 1406 | 1766 | 2924 | 1986 | 619 | 653 | 838 | 737 | 733 | 687 | 741 | 871 | 769 | 801 | 834 | 734 | 777 | 810 | 776 | 721 | 786 | 743 | 783 | 862 | 823 | 947 | 822 | 726 | 875 | 833 | 842 | 822 | 929 | 590 | 947 | 905 | 978 | 959 | 928 | 917 | 981 | 843 | 981 |
1109 | VNG2562 | 692 | 587 | 1447 | 1259 | 1803 | 1986 | 2957 | 650 | 692 | 820 | 738 | 752 | 587 | 735 | 769 | 747 | 806 | 806 | 705 | 722 | 786 | 776 | 809 | 726 | 749 | 619 | 835 | 761 | 836 | 729 | 746 | 805 | 707 | 753 | 733 | 878 | 535 | 934 | 888 | 962 | 861 | 866 | 939 | 934 | 735 | 945 |
1442 | HVO_2094 | 822 | 802 | 660 | 679 | 682 | 619 | 650 | 3276 | 1281 | 1444 | 1376 | 1252 | 1350 | 1396 | 1432 | 1480 | 1469 | 1490 | 1457 | 1398 | 1471 | 1473 | 1379 | 1438 | 1510 | 833 | 888 | 826 | 812 | 864 | 687 | 858 | 829 | 903 | 846 | 951 | 608 | 801 | 852 | 819 | 1026 | 966 | 945 | 959 | 737 | 939 |
1424 | HVO_A0541 | 766 | 826 | 767 | 756 | 670 | 653 | 692 | 1281 | 3305 | 1536 | 1575 | 1183 | 1258 | 1257 | 1254 | 1275 | 1283 | 1228 | 1212 | 1247 | 1443 | 1277 | 1294 | 1387 | 1339 | 762 | 861 | 787 | 831 | 901 | 689 | 903 | 760 | 941 | 803 | 939 | 554 | 745 | 921 | 743 | 1031 | 1017 | 1045 | 1061 | 833 | 1099 |
1628 | HVO_A0557 | 1003 | 932 | 894 | 902 | 773 | 838 | 820 | 1444 | 1536 | 3141 | 2067 | 1276 | 1411 | 1297 | 1423 | 1404 | 1423 | 1476 | 1383 | 1393 | 1487 | 1438 | 1399 | 1496 | 1428 | 832 | 1022 | 905 | 942 | 1057 | 863 | 1045 | 963 | 1062 | 1082 | 1113 | 749 | 891 | 1032 | 943 | 1152 | 1095 | 1120 | 1175 | 994 | 1158 |
1533 | hla0004 | 920 | 893 | 837 | 828 | 745 | 737 | 738 | 1376 | 1575 | 2067 | 3329 | 1222 | 1295 | 1207 | 1282 | 1255 | 1349 | 1308 | 1324 | 1349 | 1320 | 1358 | 1299 | 1399 | 1336 | 837 | 911 | 852 | 925 | 923 | 803 | 921 | 924 | 963 | 994 | 1021 | 688 | 871 | 919 | 777 | 1020 | 1083 | 1088 | 1128 | 960 | 1201 |
1510 | HVO_2038 | 852 | 822 | 745 | 676 | 732 | 733 | 752 | 1252 | 1183 | 1276 | 1222 | 3073 | 1737 | 1460 | 1477 | 1466 | 1546 | 1536 | 1443 | 1478 | 1505 | 1229 | 1232 | 1351 | 1299 | 792 | 873 | 767 | 826 | 875 | 770 | 836 | 791 | 908 | 872 | 968 | 672 | 771 | 893 | 786 | 956 | 1014 | 1017 | 973 | 873 | 1061 |
1517 | HVO_B0150 | 871 | 898 | 798 | 843 | 655 | 687 | 587 | 1350 | 1258 | 1411 | 1295 | 1737 | 3159 | 1679 | 1604 | 1591 | 1631 | 1626 | 1490 | 1600 | 1514 | 1271 | 1256 | 1419 | 1319 | 803 | 985 | 863 | 812 | 877 | 794 | 858 | 875 | 964 | 972 | 1122 | 641 | 821 | 937 | 794 | 998 | 954 | 950 | 949 | 781 | 1028 |
1664 | pNG7039 | 907 | 882 | 845 | 830 | 734 | 741 | 735 | 1396 | 1257 | 1297 | 1207 | 1460 | 1679 | 3203 | 2129 | 1634 | 1699 | 1651 | 1696 | 1745 | 1615 | 1429 | 1304 | 1493 | 1449 | 864 | 954 | 802 | 863 | 904 | 787 | 911 | 808 | 1003 | 1030 | 1179 | 609 | 851 | 933 | 866 | 1068 | 1038 | 1011 | 1000 | 846 | 1053 |
1738 | Hbo0280 | 878 | 922 | 886 | 909 | 832 | 871 | 769 | 1432 | 1254 | 1423 | 1282 | 1477 | 1604 | 2129 | 3136 | 1696 | 1764 | 1758 | 1736 | 1731 | 1630 | 1434 | 1349 | 1545 | 1417 | 929 | 1042 | 950 | 880 | 957 | 853 | 990 | 915 | 999 | 1024 | 1114 | 727 | 920 | 1031 | 894 | 1104 | 1124 | 1018 | 1075 | 909 | 1170 |
1814 | HVO_1991 | 946 | 952 | 822 | 764 | 795 | 769 | 747 | 1480 | 1275 | 1404 | 1255 | 1466 | 1591 | 1634 | 1696 | 3186 | 2011 | 1892 | 1845 | 1969 | 1574 | 1465 | 1203 | 1515 | 1352 | 938 | 1101 | 976 | 951 | 998 | 829 | 1056 | 914 | 1010 | 1006 | 1125 | 763 | 958 | 1080 | 913 | 1181 | 1169 | 1074 | 1156 | 874 | 1269 |
1789 | pNG7277 | 976 | 938 | 955 | 814 | 813 | 801 | 806 | 1469 | 1283 | 1423 | 1349 | 1546 | 1631 | 1699 | 1764 | 2011 | 3145 | 2342 | 1966 | 2042 | 1612 | 1446 | 1386 | 1548 | 1444 | 941 | 1100 | 962 | 987 | 1004 | 795 | 969 | 904 | 1008 | 917 | 1087 | 751 | 899 | 1041 | 986 | 1128 | 1088 | 1078 | 1124 | 888 | 1148 |
1713 | Hut2909 | 908 | 963 | 954 | 836 | 804 | 834 | 806 | 1490 | 1228 | 1476 | 1308 | 1536 | 1626 | 1651 | 1758 | 1892 | 2342 | 3345 | 1984 | 1960 | 1532 | 1388 | 1433 | 1534 | 1448 | 893 | 1061 | 890 | 922 | 966 | 807 | 957 | 875 | 905 | 861 | 994 | 685 | 818 | 936 | 864 | 1085 | 1166 | 960 | 1033 | 825 | 1050 |
1701 | Hbo3443 | 848 | 859 | 801 | 727 | 685 | 734 | 705 | 1457 | 1212 | 1383 | 1324 | 1443 | 1490 | 1696 | 1736 | 1845 | 1966 | 1984 | 3201 | 2185 | 1644 | 1438 | 1325 | 1448 | 1437 | 870 | 983 | 892 | 891 | 997 | 762 | 934 | 825 | 901 | 897 | 993 | 668 | 776 | 922 | 776 | 1026 | 1101 | 946 | 1089 | 825 | 1058 |
1731 | HVO_A0558 | 863 | 852 | 869 | 821 | 755 | 777 | 722 | 1398 | 1247 | 1393 | 1349 | 1478 | 1600 | 1745 | 1731 | 1969 | 2042 | 1960 | 2185 | 3166 | 1641 | 1385 | 1378 | 1482 | 1470 | 886 | 1032 | 909 | 946 | 998 | 767 | 946 | 833 | 943 | 978 | 1064 | 729 | 748 | 1008 | 903 | 1054 | 1046 | 940 | 1044 | 823 | 1080 |
1659 | Hbo2912 | 890 | 922 | 789 | 819 | 753 | 810 | 786 | 1471 | 1443 | 1487 | 1320 | 1505 | 1514 | 1615 | 1630 | 1574 | 1612 | 1532 | 1644 | 1641 | 3191 | 1568 | 1427 | 1635 | 1613 | 815 | 1035 | 888 | 900 | 925 | 872 | 959 | 933 | 1088 | 1076 | 1238 | 716 | 894 | 1019 | 905 | 1121 | 1148 | 1147 | 1170 | 932 | 1188 |
1569 | pNG7190 | 884 | 670 | 821 | 788 | 775 | 776 | 776 | 1473 | 1277 | 1438 | 1358 | 1229 | 1271 | 1429 | 1434 | 1465 | 1446 | 1388 | 1438 | 1385 | 1568 | 3225 | 1813 | 1937 | 1903 | 689 | 863 | 821 | 848 | 851 | 807 | 918 | 925 | 1072 | 1016 | 1042 | 657 | 890 | 863 | 820 | 1098 | 962 | 1003 | 1048 | 858 | 1086 |
1412 | VNG1720 | 830 | 779 | 813 | 677 | 751 | 721 | 809 | 1379 | 1294 | 1399 | 1299 | 1232 | 1256 | 1304 | 1349 | 1203 | 1386 | 1433 | 1325 | 1378 | 1427 | 1813 | 3068 | 1905 | 1909 | 638 | 857 | 783 | 860 | 898 | 816 | 845 | 818 | 928 | 845 | 934 | 668 | 759 | 871 | 848 | 909 | 874 | 939 | 987 | 842 | 961 |
1591 | Hbo0846 | 815 | 741 | 765 | 754 | 779 | 786 | 726 | 1438 | 1387 | 1496 | 1399 | 1351 | 1419 | 1493 | 1545 | 1515 | 1548 | 1534 | 1448 | 1482 | 1635 | 1937 | 1905 | 3180 | 2093 | 756 | 928 | 837 | 889 | 946 | 790 | 921 | 890 | 981 | 988 | 1037 | 672 | 878 | 943 | 920 | 1039 | 1014 | 1062 | 1035 | 870 | 1129 |
1445 | Hmu0264 | 759 | 751 | 708 | 695 | 715 | 743 | 749 | 1510 | 1339 | 1428 | 1336 | 1299 | 1319 | 1449 | 1417 | 1352 | 1444 | 1448 | 1437 | 1470 | 1613 | 1903 | 1909 | 2093 | 3223 | 680 | 912 | 804 | 807 | 910 | 775 | 925 | 869 | 974 | 989 | 1060 | 656 | 787 | 882 | 795 | 1055 | 995 | 1011 | 1027 | 856 | 1002 |
1200 | Hmu1422 | 901 | 825 | 793 | 790 | 708 | 783 | 619 | 833 | 762 | 832 | 837 | 792 | 803 | 864 | 929 | 938 | 941 | 893 | 870 | 886 | 815 | 689 | 638 | 756 | 680 | 3146 | 1185 | 1072 | 813 | 882 | 651 | 877 | 720 | 800 | 848 | 959 | 661 | 917 | 997 | 870 | 1001 | 965 | 977 | 1002 | 888 | 1046 |
1557 | Hbo2774 | 1123 | 1003 | 853 | 895 | 804 | 862 | 835 | 888 | 861 | 1022 | 911 | 873 | 985 | 954 | 1042 | 1101 | 1100 | 1061 | 983 | 1032 | 1035 | 863 | 857 | 928 | 912 | 1185 | 3041 | 2417 | 1031 | 1012 | 888 | 1159 | 856 | 981 | 1004 | 1153 | 886 | 1112 | 1119 | 1080 | 1118 | 1212 | 1178 | 1217 | 1019 | 1226 |
1432 | Hmu1150 | 1002 | 931 | 765 | 805 | 772 | 823 | 761 | 826 | 787 | 905 | 852 | 767 | 863 | 802 | 950 | 976 | 962 | 890 | 892 | 909 | 888 | 821 | 783 | 837 | 804 | 1072 | 2417 | 2881 | 976 | 931 | 771 | 1054 | 816 | 922 | 932 | 1036 | 886 | 1103 | 1004 | 1028 | 1074 | 1141 | 1109 | 1143 | 1063 | 1135 |
1411 | rrnB0275 | 873 | 833 | 892 | 855 | 842 | 947 | 836 | 812 | 831 | 942 | 925 | 826 | 812 | 863 | 880 | 951 | 987 | 922 | 891 | 946 | 900 | 848 | 860 | 889 | 807 | 813 | 1031 | 976 | 2766 | 1506 | 1020 | 1229 | 1175 | 1213 | 1143 | 1198 | 973 | 1239 | 1265 | 1307 | 1309 | 1263 | 1417 | 1370 | 1236 | 1386 |
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