Home |  Text search
7 genomes BUD1152 46 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1720

VNG2549

VNG2562

pNG7039

pNG7040

pNG7041

pNG7190

pNG7277

rrnAC0299

rrnAC0899

rrnB0275

HVO_1464

HVO_1991

HVO_2038

HVO_2094

HVO_A0541

HVO_A0557

HVO_A0558

HVO_B0047

HVO_B0144

HVO_B0150

HVO_B0198

Hbo0280

Hbo0846

Hbo1611

Hbo2048

Hbo2774

Hbo2912

Hbo3224

Hbo3275

Hbo3312

Hbo3393

Hbo3443

Hbo3597

Hbo3952

Hbo3968

Hmu0262

Hmu0264

Hmu1150

Hmu1422

Hmu3301

Hmu3344

Hmu3372

Hut2908

Hut2909

hla0004

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score3002 Hbo3312 Hmu3372 Hbo3393 Hbo3968 HVO_B0198 Hbo2048 VNG2562 HVO_2094 HVO_A0541 HVO_A0557 hla0004 HVO_2038 HVO_B0150 pNG7039 Hbo0280 HVO_1991 pNG7277 Hut2909 Hbo3443 HVO_A0558 Hbo2912 pNG7190 VNG1720 Hbo0846 Hmu0264 Hmu1422 Hbo2774 Hmu1150 rrnB0275 HVO_B0144 VNG2549 rrnAC0299 Hbo3952 Hmu3344 pNG7041 Hmu3301 Hbo3597 Hmu0262 HVO_B0047 rrnAC0899 Hbo3224 Hut2908 Hbo3275 Hbo1611 pNG7040 HVO_1464
1276Hbo3312 3254 1406 890 837 753 827 692 822 766 1003 920 852 871 907 878 946 976 908 848 863 890 884 830 815 759 901 1123 1002 873 860 769 911 770 818 783 837 623 932 897 848 955 951 1001 948 832 952
1197Hmu3372 1406 3278 716 638 605 649 587 802 826 932 893 822 898 882 922 952 938 963 859 852 922 670 779 741 751 825 1003 931 833 774 691 875 753 776 756 879 531 836 781 732 906 994 926 1059 787 982
1179Hbo3393 890 716 3072 1910 1364 1522 1447 660 767 894 837 745 798 845 886 822 955 954 801 869 789 821 813 765 708 793 853 765 892 850 687 886 728 889 798 902 644 891 952 896 922 977 950 1001 787 1004
1141Hbo3968 837 638 1910 3039 1243 1406 1259 679 756 902 828 676 843 830 909 764 814 836 727 821 819 788 677 754 695 790 895 805 855 843 630 861 726 838 884 925 622 833 824 884 995 905 924 955 804 943
1184HVO_B0198 753 605 1364 1243 3032 1766 1803 682 670 773 745 732 655 734 832 795 813 804 685 755 753 775 751 779 715 708 804 772 842 731 780 828 805 820 764 913 589 949 880 951 863 929 895 929 741 1018
1146Hbo2048 827 649 1522 1406 1766 2924 1986 619 653 838 737 733 687 741 871 769 801 834 734 777 810 776 721 786 743 783 862 823 947 822 726 875 833 842 822 929 590 947 905 978 959 928 917 981 843 981
1109VNG2562 692 587 1447 1259 1803 1986 2957 650 692 820 738 752 587 735 769 747 806 806 705 722 786 776 809 726 749 619 835 761 836 729 746 805 707 753 733 878 535 934 888 962 861 866 939 934 735 945
1442HVO_2094 822 802 660 679 682 619 650 3276 1281 1444 1376 1252 1350 1396 1432 1480 1469 1490 1457 1398 1471 1473 1379 1438 1510 833 888 826 812 864 687 858 829 903 846 951 608 801 852 819 1026 966 945 959 737 939
1424HVO_A0541 766 826 767 756 670 653 692 1281 3305 1536 1575 1183 1258 1257 1254 1275 1283 1228 1212 1247 1443 1277 1294 1387 1339 762 861 787 831 901 689 903 760 941 803 939 554 745 921 743 1031 1017 1045 1061 833 1099
1628HVO_A0557 1003 932 894 902 773 838 820 1444 1536 3141 2067 1276 1411 1297 1423 1404 1423 1476 1383 1393 1487 1438 1399 1496 1428 832 1022 905 942 1057 863 1045 963 1062 1082 1113 749 891 1032 943 1152 1095 1120 1175 994 1158
1533hla0004 920 893 837 828 745 737 738 1376 1575 2067 3329 1222 1295 1207 1282 1255 1349 1308 1324 1349 1320 1358 1299 1399 1336 837 911 852 925 923 803 921 924 963 994 1021 688 871 919 777 1020 1083 1088 1128 960 1201
1510HVO_2038 852 822 745 676 732 733 752 1252 1183 1276 1222 3073 1737 1460 1477 1466 1546 1536 1443 1478 1505 1229 1232 1351 1299 792 873 767 826 875 770 836 791 908 872 968 672 771 893 786 956 1014 1017 973 873 1061
1517HVO_B0150 871 898 798 843 655 687 587 1350 1258 1411 1295 1737 3159 1679 1604 1591 1631 1626 1490 1600 1514 1271 1256 1419 1319 803 985 863 812 877 794 858 875 964 972 1122 641 821 937 794 998 954 950 949 781 1028
1664pNG7039 907 882 845 830 734 741 735 1396 1257 1297 1207 1460 1679 3203 2129 1634 1699 1651 1696 1745 1615 1429 1304 1493 1449 864 954 802 863 904 787 911 808 1003 1030 1179 609 851 933 866 1068 1038 1011 1000 846 1053
1738Hbo0280 878 922 886 909 832 871 769 1432 1254 1423 1282 1477 1604 2129 3136 1696 1764 1758 1736 1731 1630 1434 1349 1545 1417 929 1042 950 880 957 853 990 915 999 1024 1114 727 920 1031 894 1104 1124 1018 1075 909 1170
1814HVO_1991 946 952 822 764 795 769 747 1480 1275 1404 1255 1466 1591 1634 1696 3186 2011 1892 1845 1969 1574 1465 1203 1515 1352 938 1101 976 951 998 829 1056 914 1010 1006 1125 763 958 1080 913 1181 1169 1074 1156 874 1269
1789pNG7277 976 938 955 814 813 801 806 1469 1283 1423 1349 1546 1631 1699 1764 2011 3145 2342 1966 2042 1612 1446 1386 1548 1444 941 1100 962 987 1004 795 969 904 1008 917 1087 751 899 1041 986 1128 1088 1078 1124 888 1148
1713Hut2909 908 963 954 836 804 834 806 1490 1228 1476 1308 1536 1626 1651 1758 1892 2342 3345 1984 1960 1532 1388 1433 1534 1448 893 1061 890 922 966 807 957 875 905 861 994 685 818 936 864 1085 1166 960 1033 825 1050
1701Hbo3443 848 859 801 727 685 734 705 1457 1212 1383 1324 1443 1490 1696 1736 1845 1966 1984 3201 2185 1644 1438 1325 1448 1437 870 983 892 891 997 762 934 825 901 897 993 668 776 922 776 1026 1101 946 1089 825 1058
1731HVO_A0558 863 852 869 821 755 777 722 1398 1247 1393 1349 1478 1600 1745 1731 1969 2042 1960 2185 3166 1641 1385 1378 1482 1470 886 1032 909 946 998 767 946 833 943 978 1064 729 748 1008 903 1054 1046 940 1044 823 1080
1659Hbo2912 890 922 789 819 753 810 786 1471 1443 1487 1320 1505 1514 1615 1630 1574 1612 1532 1644 1641 3191 1568 1427 1635 1613 815 1035 888 900 925 872 959 933 1088 1076 1238 716 894 1019 905 1121 1148 1147 1170 932 1188
1569pNG7190 884 670 821 788 775 776 776 1473 1277 1438 1358 1229 1271 1429 1434 1465 1446 1388 1438 1385 1568 3225 1813 1937 1903 689 863 821 848 851 807 918 925 1072 1016 1042 657 890 863 820 1098 962 1003 1048 858 1086
1412VNG1720 830 779 813 677 751 721 809 1379 1294 1399 1299 1232 1256 1304 1349 1203 1386 1433 1325 1378 1427 1813 3068 1905 1909 638 857 783 860 898 816 845 818 928 845 934 668 759 871 848 909 874 939 987 842 961
1591Hbo0846 815 741 765 754 779 786 726 1438 1387 1496 1399 1351 1419 1493 1545 1515 1548 1534 1448 1482 1635 1937 1905 3180 2093 756 928 837 889 946 790 921 890 981 988 1037 672 878 943 920 1039 1014 1062 1035 870 1129
1445Hmu0264 759 751 708 695 715 743 749 1510 1339 1428 1336 1299 1319 1449 1417 1352 1444 1448 1437 1470 1613 1903 1909 2093 3223 680 912 804 807 910 775 925 869 974 989 1060 656 787 882 795 1055 995 1011 1027 856 1002
1200Hmu1422 901 825 793 790 708 783 619 833 762 832 837 792 803 864 929 938 941 893 870 886 815 689 638 756 680 3146 1185 1072 813 882 651 877 720 800 848 959 661 917 997 870 1001 965 977 1002 888 1046
1557Hbo2774 1123 1003 853 895 804 862 835 888 861 1022 911 873 985 954 1042 1101 1100 1061 983 1032 1035 863 857 928 912 1185 3041 2417 1031 1012 888 1159 856 981 1004 1153 886 1112 1119 1080 1118 1212 1178 1217 1019 1226
1432Hmu1150 1002 931 765 805 772 823 761 826 787 905 852 767 863 802 950 976 962 890 892 909 888 821 783 837 804 1072 2417 2881 976 931 771 1054 816 922 932 1036 886 1103 1004 1028 1074 1141 1109 1143 1063 1135
1411rrnB0275 873 833 892 855 842 947 836 812 831 942 925 826 812 863 880 951 987 922 891 946 900 848 860 889 807 813 1031 976 2766 1506 1020 1229 1175 1213 1143 1198 973 1239 1265 1307 1309 1263 1417 1370 1236 1386
1402HVO_B0144 860 774 850 843 731 822 729 864 901 1057 923 875 877 904 957 998 1004 966 997 998 925 851 898 946 910 882 1012 931 1506 3104 972 1250 1086 1155 1092 1229 834 1133 1238 1119 1292 1361 1390 1367 1210 1448
1383VNG2549 769 691 687 630 780 726 746 687 689 863 803 770 794 787 853 829 795 807 762 767 872 807 816 790 775 651 888 771 1020 972 2841 1104 1520 1435 1273 1397 766 1247 1243 1284 1446 1355 1343 1389 1225 1441
1560rrnAC0299 911 875 886 861 828 875 805 858 903 1045 921 836 858 911 990 1056 969 957 934 946 959 918 845 921 925 877 1159 1054 1229 1250 1104 3088 1195 1205 1152 1332 948 1436 1502 1452 1384 1368 1403 1475 1166 1472
1571Hbo3952 770 753 728 726 805 833 707 829 760 963 924 791 875 808 915 914 904 875 825 833 933 925 818 890 869 720 856 816 1175 1086 1520 1195 2962 1758 1545 1703 918 1296 1316 1258 1571 1470 1472 1595 1373 1568
1659Hmu3344 818 776 889 838 820 842 753 903 941 1062 963 908 964 1003 999 1010 1008 905 901 943 1088 1072 928 981 974 800 981 922 1213 1155 1435 1205 1758 3002 1776 2013 969 1372 1412 1350 1594 1507 1494 1568 1380 1555
1562pNG7041 783 756 798 884 764 822 733 846 803 1082 994 872 972 1030 1024 1006 917 861 897 978 1076 1016 845 988 989 848 1004 932 1143 1092 1273 1152 1545 1776 3106 2168 922 1225 1218 1260 1492 1397 1414 1379 1248 1398
1728Hmu3301 837 879 902 925 913 929 878 951 939 1113 1021 968 1122 1179 1114 1125 1087 994 993 1064 1238 1042 934 1037 1060 959 1153 1036 1198 1229 1397 1332 1703 2013 2168 3069 999 1378 1429 1328 1639 1664 1624 1632 1363 1629
1057Hbo3597 623 531 644 622 589 590 535 608 554 749 688 672 641 609 727 763 751 685 668 729 716 657 668 672 656 661 886 886 973 834 766 948 918 969 922 999 1942 1013 994 958 1013 946 1012 1030 1023 1065
1519Hmu0262 932 836 891 833 949 947 934 801 745 891 871 771 821 851 920 958 899 818 776 748 894 890 759 878 787 917 1112 1103 1239 1133 1247 1436 1296 1372 1225 1378 1013 2959 1829 1901 1525 1453 1500 1538 1376 1590
1711HVO_B0047 897 781 952 824 880 905 888 852 921 1032 919 893 937 933 1031 1080 1041 936 922 1008 1019 863 871 943 882 997 1119 1004 1265 1238 1243 1502 1316 1412 1218 1429 994 1829 3055 1984 1580 1562 1592 1580 1276 1639
1504rrnAC0899 848 732 896 884 951 978 962 819 743 943 777 786 794 866 894 913 986 864 776 903 905 820 848 920 795 870 1080 1028 1307 1119 1284 1452 1258 1350 1260 1328 958 1901 1984 2967 1483 1404 1454 1530 1311 1512
1802Hbo3224 955 906 922 995 863 959 861 1026 1031 1152 1020 956 998 1068 1104 1181 1128 1085 1026 1054 1121 1098 909 1039 1055 1001 1118 1074 1309 1292 1446 1384 1571 1594 1492 1639 1013 1525 1580 1483 3075 1632 1737 1728 1521 1757
1874Hut2908 951 994 977 905 929 928 866 966 1017 1095 1083 1014 954 1038 1124 1169 1088 1166 1101 1046 1148 962 874 1014 995 965 1212 1141 1263 1361 1355 1368 1470 1507 1397 1664 946 1453 1562 1404 1632 3212 2077 2083 1925 2242
1857Hbo3275 1001 926 950 924 895 917 939 945 1045 1120 1088 1017 950 1011 1018 1074 1078 960 946 940 1147 1003 939 1062 1011 977 1178 1109 1417 1390 1343 1403 1472 1494 1414 1624 1012 1500 1592 1454 1737 2077 3115 2027 1935 2193
1904Hbo1611 948 1059 1001 955 929 981 934 959 1061 1175 1128 973 949 1000 1075 1156 1124 1033 1089 1044 1170 1048 987 1035 1027 1002 1217 1143 1370 1367 1389 1475 1595 1568 1379 1632 1030 1538 1580 1530 1728 2083 2027 3057 1991 2170
1578pNG7040 832 787 787 804 741 843 735 737 833 994 960 873 781 846 909 874 888 825 825 823 932 858 842 870 856 888 1019 1063 1236 1210 1225 1166 1373 1380 1248 1363 1023 1376 1276 1311 1521 1925 1935 1991 2591 2076
1950HVO_1464 952 982 1004 943 1018 981 945 939 1099 1158 1201 1061 1028 1053 1170 1269 1148 1050 1058 1080 1188 1086 961 1129 1002 1046 1226 1135 1386 1448 1441 1472 1568 1555 1398 1629 1065 1590 1639 1512 1757 2242 2193 2170 2076 3123

491 symbols
consensus       -MA-D-------------PTRRDYLKYGGAVLGGGLLAGCTG------SGSESTTTTTAT
#oth            15;;;::=:22222229:6411994884847795482211752225589:899:96:9::
Hbo3312         ::LR-:::::::::::ETS::::V::G:S:LI:S:F:::::S:::::SGQ:TPPSDS:SS
Hmu3372         ::VE::::::::::::ETS::::AI:::FT:ATS:::::::D:::::QES:G:DV:E:::
Hbo3393         :::AETDVH:::::::EI::::EMIQG:STI::::::::::S::::::-DGGDP:PAD:A
Hbo3968         ::QDRDISY:::::::GV:R:::V::A:CSI::::V::::L:::::::NDDA:SADS::A
HVO_B0198       ::V:-:::::::::::::--::RQILA:S:G:FASA:::::A::::::G::ADSES:A:A
Hbo2048         :--:-:::::::::::::---------------V:-V:::SS:::::STTET:PADDES:
VNG2562         :--:-:::::::::::::MA::RQILA:::S:IAAS:::::S::::::---------SQS
HVO_2094        ::LD:ADEN:::::::AE::::::::::::LF:::A::::A::::::Q::DGA:::A:E:
HVO_A0541       :::DNDDCR:::::::SG::::::V:F::T::::::::::A:::::::G::DA::::SDA
HVO_A0557       ::DQ:LTDR:::::::AT::::AC::G:::L:A:::::::A::::::QNDA::S:DA:E:
hla0004         ::GKHADR::::::::SA::::TVIRF::::A:A:S::::L::::GGSG::G:DGDSDGA
HVO_2038        ::VNKY::::::::::KRL:::::V:::A:AATAA-::::G:::::::QSASDPP::E:N
HVO_B0150       ::PDGSSDH:::::::ET:::::AI::::::I::::::::I::::::Q:N:A:PL:E:TA
pNG7039         ::SRYDMNR:::::::EG::::::M::S:::V::S:::::A::::::Q::::AAP:Q:G:
Hbo0280         :--:-:::::::::::::------V::::T::T:::::::M::::::DTDAS::P::N:S
HVO_1991        ::EH:ETPR:::::::TGL:::::V:::::AV::::::::::::::::E:GSES::DAE:
pNG7277         :::D:TTDT:::::::ET::::E:V::::T::SA:::::::S:::::DAEQGVG::R:ES
Hut2909         ::GD:SSSTSGESVAPET::::EAI:::::A:V:::::::SSSATDDEGDPD:E:A::SV
Hbo3443         :::K:ANET:::::::DA::::E:V:::-:::T::::S::A::::::NAPTD:ES:::E:
HVO_A0558       ::TDS:::::::::::DG::::KF:T:::S:AA::::::::::::::S:E:DA:A:DA:A
Hbo2912         MEQD:VERPPESRRGSGG::::E:V:::SS::C:::::::A::::::EN::Q:VPAG:PS
pNG7190         ::DKADDS::::::::NGL::::::SG:SVL::TSIV:::S:::::::D:G::PS:A:SR
VNG1720         ::::-:::::::::::GEA:::RC:--:HVAA:AA::::::S::::::------------
Hbo0846         ::-:-:::::::::::::-----:::RT::LI:A:VV:::S:::::::D:DS:AA::ES:
Hmu0264         :::D::::::::::::RSS:::RFV--ASSIAA:TA::::A::::::SDAT:ADESDGS:
Hmu1422         :--:-:::::::::::::------V::::::I:::::::::::::NSAD:DNAD:DSPKI
Hbo2774         ::-:-:::::::::::::-------::::::V::::::::SS:::::Q:ST::AP:D:SG
Hmu1150         :LT:-:::::::::::::------------------------::::::--PAL:S:E:E:
rrnB0275        ::::-:::::::::::::---------------S::::::SS::::::-----------G
HVO_B0144       ::VD:SENS:::::::KTL:::GC:::::TIA:S::::::S::::::T:EPS:SSPKSR:
VNG2549         ::Q:-:::::::::::::--::AF::A:S:ATLA::::::SS::::::--PD:DA:S::A
rrnAC0299       ::SSNSNDQ:::::::SEL:::E:VTC::T::A::::S:::::::::S:::DPSDSE:::
Hbo3952         ::D:-:::::::::::::IN::QFIGV:ASA:AA:-::::SS:::::SG:EGN:E:N:S:
Hmu3344         :::L:DTTH:::::::RV::::E:I:G:TTL::V::::::SE:::::::E:::IS:EQP:
pNG7041         MTDP:RAAC:::::::EW:::::IVRSS::LAF::F::::S::::::E::Q::SV:EGSD
Hmu3301         ::DD:ETQS:::::::DV::::E:M:::S::VA:::::::SE:::::Q::::A:P:QSS:
Hbo3597         :--:-:::::::::::::------------------------::::::------------
Hmu0262         :VLKT:::::::::::::----------::T:SVAA:::::E:::STSG:DADESAS:T:
HVO_B0047       :::N:GQSG:::::::RES:::E::Q:::::IA::::::::::::::G::::T:::ASEP
rrnAC0899       ::N:-:::::::::::::--::E:IVAA:VG:-A:TV:::S::::::Q:EAG:GSDGG:D
Hbo3224         :::N:GIKR:::::::NGA:::::::::::I::S:IV::::::::::E:D::A:E:S:S:
Hut2908         ::SD:AGSR:::::::TT::::E:::::L::GT:::::::S:GERTETAQPADQE:A:::
Hbo3275         ::SE:SGGH:::::::KA::::::M::::::I:SSA::::A:::::::LFAPDD:GG:E:
Hbo1611         :::KNDTEC:::::::GKS:::EWIT::::::A:::::::::::::::ESEGN:SP:AD:
pNG7040         :--:-:::::::::::::------------------------::::::------------
HVO_1464        ::EEKSTGQ:::::::EGL:::N:IR:::TA::A:M::::AS::::::DS:G:DEA:::A

consensus       ETTTATETETATE-----------------SYTVTMEPVGEVTFESVPETVFTYLGHYAD
#oth            =6:99999789987959567574432321172725461536752493168697=<9>882
Hbo3312         DSSRG:S:D:::TEQ:::::::::::::::::S:SLD:::TIP::QP::::VSGW:FVG:
Hmu3372         P:PEP:A:ASKEDTPTPEQ::::::::::::::A::P::::::L:EP:SSWIGG::FT::
Hbo3393         D:A:NSP:D:P:-:::::::::::::::::::E:AI::A:RH:::E::::YASIP:AWM:
Hbo3968         :S::NG:STA:NDAST::::::::::::::P:D::VK:A:TN:::E::::YASFP:AWM:
HVO_B0198       :SE:EAA::ST:TEQTTESAG:::::::::Q:::EI::NDPY:::A::::YGVAS:PFL:
Hbo2048         Q:GNTAQS::ESKATTEDD::::::::::::::::V::NPPH::::::K:YAVIPSVWM:
VNG2562         P:DDGST:Q:DAGSD::::::::::::::::::::V::NPPH::::::::YAAIPSVWM:
HVO_2094        A:A:EA:A:ATETATETAES::::::::::G:AAELS:::T::LDEP:TN:::HFPWFP:
HVO_A0541       VS::E:D::E:::TSDG:::::::::::::::S:S:A:::::E:DA:::RAL::YPVS::
HVO_A0557       AA:::ADGDA:--:::::::::::::::::G:::S:S:A:D::::::::N:MV:NLV:::
hla0004         DGSDDA:::G:DGSEDEETDDGGSAG::::::::E:A::::::LDA:::D:MV:SLL:::
HVO_2038        T:A:P:DD:----:::::::::::::::::R:AA:LS:A:R:E:TEP::N:::V:L:H::
HVO_B0150       NDSSTATKT:EP:VE:::::::::::::::::S:::A:A:TIELDE::KS:::V:V:H::
pNG7039         GDQSTA:PT::ED:::::::::::::::::R:A:::S:M:T:E:::::QS:::I:::HV:
Hbo0280         ::::ESTATGS::AESDDS:::::::::::G:SA:IS:::::E::::::N:::I:S:HT:
HVO_1991        :S::E:A:::EI:TPEDS::::::::::::::S:::S:::T:E:DEP:QSI::R:T:H:G
pNG7277         :AE:D:P:GNG--:::::::::::::::::::A:S:S:T:::::D:P::::::R:T:H::
Hut2909         R:E:::PSDPTETATTSEDTETTTETESD:T:SASIA:M:R:SL:EP::::::R:T:H::
Hbo3443         N:E::NQSGSSGDSETETDATN::::::::P:::S:A:M:::E::R:::SI::R:T:L:G
HVO_A0558       TD::::ADA:::SESTAE:::STADGS:::::::S:A:M:D::::G:::SI::R:T:H:G
Hbo2912         ::P::KDD-----:::::::::::::::::::S:::::A:T:E:DH:::N:Y:G:PNT::
pNG7190         DSG:D:S:PSDNG:::::::::::::::::P::ASLS:::::E:D::::N:::MYNQ:::
VNG1720         HSD:S:S::PPA-::::::::::::::::::HHAAVA:::DL:LTG::DRA:VVFPQ:::
Hbo0846         :AHPE:T:::E:TPEESETAAS::::::::P:::S:K:M::::LDA:::N:::VYPQ:::
Hmu0264         PDD::RPRTQTESTTDA:::::::::::::GH:A:LS:A:T:S:DA:::::::VYPQ:L:
Hmu1422         :ES:GG::DSPE:TKTPEDT::::::::::::S::::::::::::G::T:WLSTDSELT:
Hbo2774         AEP::SA:G:PA::::::::::::::::::::EACI::::CQ:::E::::YMVNN:EW::
Hmu1150         H:DDE:::::D:-:::::::::::::::::::EACI::A:CI:::E::::YIANN:EW::
rrnB0275        SSESESTP:S:D-:::::::::::::::::::::S:::M:P:::DGP::DWVAL:PS:::
HVO_B0144       SS:QTAVS::VS:TDTATGSDE::::::::P::::I::M:::A:DGP::RWTAL:PTF::
VNG2549         DSA:::AD::TAGSG:::::::::::::::::S:S:::::D:E:DA::D::AV:ESG:::
rrnAC0299       ::A:T:A::SKPAETAATDK::::::::::P:R::V::::::S::T::Q:WVAENASW::
Hbo3952         S:SQGKTATSTP:DT:::::::::::::::::::S:S:T:D::L:KP::S:AH:FPG:::
Hmu3344         TSE:QA::T:ENR:::::::::::::::::::::::::::D:E:D::::S:TV:NPD:I:
pNG7041         M::ATRAGG:E:DPATSDG:::::::::::A:S:::::::T:E::T::::IAPFTAD:I:
Hmu3301         P:ASTPTETSTP:TE:::::::::::::::R:S:::::::TLE:DG:::R:APFTAD:I:
Hbo3597         -------------:::::::::::::::::------------------------------
Hmu0262         DAPADAT:T:DADAETTADT::::::::::::S:S:::::T:E:DE::::WVANN:SW::
HVO_B0047       :::::AT::A:::TETETTTEAAE::::::::S:SI::::::::D::::AWIANN:SW::
rrnAC0899       :S:ASGT:AAESTPTATTEATGS:::::::::A:S::::::::::::::VWVANN:SW::
Hbo3224         ::A:::::::E:ATEAAADG::::::::::::S:::::::T:E:D:::::WA::CQG:::
Hut2908         P:E:::::::T::TEAETTTETATETTADTP:::E:A:::::S::E::::FTP:S:D:::
Hbo3275         S:V:::G::SE:ATEDV:::::::::::::::S:::A:M:::::D:I::QWVP:G:D:::
Hbo1611         ::E::E:SG----:::::::::::::::::::::S::::::L::::::DRWVA:D:G:::
pNG7040         -------------:::::::::::::::::-----:::A:D:::QT:::RWLP:G:A:::
HVO_1464        ::::EAA:::SA:TETQTTEADS:::::::::S:::::M:::::D::::SWAA:D:G:::

consensus       MAVALGHGDAVNAM----GY--PGRYYTQFYDELPGVSV-DWEGLT-----SSW---GPS
#oth            457333:769897714748<33=9:;<8>878857345825<9:7:64642;::::3::6
Hbo3312         VLM:::QA:RIVG:::::SR::::FWFQG::EL:::::MR:TTAIP:::::NTVSK::Y:
Hmu3372         VLT:::QA:GAVG:::::VD:::SFW::G:::F:D::TAPSEDE::QI:::TTEDR:ETD
Hbo3393         I:MGF:IQPKAV:A::::--::FD:LPLKY::A::::DF::ADAVRTLG::E:AES:KYD
Hbo3968         I:M:::IQP:AMMS::::--::LEQEQLKY:EA::DID:::LDSVQPLL::E:SES:EFD
HVO_B0198       :GM:::IHPSATTG::::--::LE:APLK:::L:-:LEF::ESRI:KLA:::GAES::FD
Hbo2048         IGM:::KQPSAT:S::::--::LD:APLKY:EH::D::F::PDSV:KLA::::AEE::FD
VNG2562         IGM:::IQPSAT:S::::--::L::APLK:::A::D:AF:HKAEIEQLA:::DSES::YD
HVO_2094        ::S:::Q::T::NL::::WWDGTVAGLEY:TAGFD:FEI:E:ADAA:::::GEY::::FT
HVO_A0541       A:::F:::::ITGIGYDKEL::F:NTVDYY::A:D::EF:E::K:GRVTP:A:NPN:ALD
HVO_A0557       A:::F:::::::SLGFDSDA::G::TLDAY:ER:D:::F::RSD:AQLNS:G:GSV:NID
hla0004         ::::F:::::::SLGFDADA::G:NTLDAY:A::G::AF::R::VRQLNTG:GGGI:SVD
HVO_2038        ::::::Q:ESL:G::YNPEG::F:QL:DLLFER:::::::::S::V:::::DT::::N:D
HVO_B0150       :V::::::::L::::YSPSN::FEGN:DKLLER:N:::::::SN:Y:::::N:::::N:D
pNG7039         :L::::R:G:I::::HAPE:::HQSL:QK:LHR:E:::I::::::Y:::::::::::P::
Hbo0280         ::L:::Y::NI::::HAP::::IQSLWSK:THH:D:::::::D::Y:::::::::::P:T
HVO_1991        ::F:::R::D:::V:NGPA:::YDTTWK::TAR::::E::::AD:Y:::::P:::::ET:
pNG7277         ::F::::::T:T:::HAPE:::YSGLWN::VER:::::L:::T::Y:::::::::::K::
Hut2909         ::F:::R::TIT:::HAPA:::YD:LWN::IER::::TL::::::Y:::::::::::Q:T
Hbo3443         ::F:::R::D:::::HAP::::YDALWN::TPR::::TL:::K::Y:::::::::::E::
HVO_A0558       ::F::::::::::::HAPD:::YDALWN::TPR::::EL:::T::Y:::::::::::E::
Hbo2912         ::::A:::::I:SI:YYPE:::H:TILNH:::R:D:::L:T::K:::::::D:::::NLG
pNG7190         :L:::N::::::S::FVPDM::A:PSMNHY:ER:S:::F:E::D:P:::::NPYD::NF:
VNG1720         :::::::::::::I:YVPEM::S:PTMNAY::R:D::DF::YG::P:::::DPLTD::FT
Hbo0846         ::::::::::L:SV:YVPEM::S:TTMN:Y:HH:D:::F:E:QN:::::::DPLSD::LH
Hmu0264         :::::::::::QSV:YVPEM::S:PTMNHY:HH:D:::L::::R:S:::::DPLSD::F:
Hmu1422         ::FC::QI:G----::::WI:::TPLRSFN:F:HL::--::LRSRYPNSDPYT:KEGEAD
Hbo2774         ::F:::QR:GFLTS::::A:MI::FLFEP:GLDV:PL:-:ET:S:SQ::::TN:D::---
Hmu1150         ::F:::QR:GFLTS::::A:MI::FLFEP:GLDV:PL:-:ET:S:SQ::::T:::::--D
rrnB0275        :GM::DA:QTL-GI::::QL:::Y::A:G::E:::::EY::PDAV::::::TLYQD::VD
HVO_B0144       ::F:::G:QTL---:::::IQNHD:FASEAFE::::IDF::ADDTV:::::ELVAD::V:
VNG2549         :V::::::::LT:V:::::N::SD:FH:DA::A:D::::::TS::V:::::DLVDA::VT
rrnAC0299       :G::::LTKPSAVV::::-L::S:E:R:WH:EDV::L:P:SK:DMV::::::L:QD::I:
Hbo3952         :::::::::TI:S::::::L:::S::H:NH:T::D:::I::K:S:::::::KLVGDA:I:
Hmu3344         :M:::::::::ESV::::W:::KS::V:RH::::D:::I::VSA:::::::QLYSD::IA
pNG7041         :L:::::::::QSI::::W:::R:::K:LH:E::D:::I::LD::::::::QL:ND::V:
Hmu3301         :M::::::::AQSI::::W:::Q:::K:RH:E::D:::I::LDS:::::::QI:ND::I:
Hbo3597         --------------::::--::-----------------:------:::::---:::---
Hmu0262         :GI:::QQPP-EGV::::WL::::::H::Y::DI:::::::TDEM::::::ALYQD:SV:
HVO_B0047       :G::::L-:TPMGV::::WL::::::H::Y:::I:D:::::KSSIR:::::QL:GDS:VG
rrnAC0899       :GI:::L-::PEGV::::WL:::S::H::Y:::I:::::::GSSVQ:::::KL:GDS:VG
Hbo3224         :GI:::QA:GLLSV::::::::KP:LH:HW:E::D::::::K:S:Q:::::ELYQG::ID
Hut2908         ::::::K::GIQGI:::::F::AD:::SYV:::::::::::R:QI-:::::EEDPE:VRT
Hbo3275         :G:::::A:SMIGI:::::Q::::E:::YV:E:::::::::KDRIEKN:::DLVEA::M:
Hbo1611         :G::::KT:GMTGI:::::G::SD::::DV::::::::::ER:T:EAN:::DLGDA:DM:
pNG7040         :G::::QA:GLTGI:::::G::GD::::YV:::::::::::Q:TI-:::::DANPE:VRT
HVO_1464        ::::::V::GLTGV:::::G::A:::::YV:::::::::::R:QI-:::::EAYPE:VRT

consensus       ---KELFYELDSDVHLADPAWLI--NWD-GWDQSDIEEIAENVAPFFGNSISRRH----D
#oth            22151>31473612658337<6;22;<;67369947853;6852.351295479;77349
Hbo3312         LN:E::L::::P:LLAT::NRF:::A:Y::S:TATV:SLVDDI::::::ESRSKRPSGWP
Hmu3372         :::I:MV::::P:LMAV::NA:M::GIY::L:EAGARR:QAD:::W:::ESR:KRFDGWT
Hbo3393         :::::V::DV:A::::M:SRM:K::KYS::::DE:L:::ES::G:IL:SL:RF--::::-
Hbo3968         :::::A:::V:A::::M::RI:K::RYS::::D::LK::EQ::G:IL:SL:RF--::::-
HVO_B0198       :::::N::AA:A::W:IAR:T:G::RYV:S::A::Y::VESQTG::L:TTLRFAP::::T
Hbo2048         :::::N::AA:V::::I::RS:K::FYA:N:SDA:::::SNATG::L:ST:RFAS::::S
VNG2562         :::::N::AA:C::::I::RM:K::FYA:N:TDD::AA:ESSAG::M:S::RFAS::::S
HVO_2094        :::::RL::::::L::V::::VT::TQ::N:NR::TD:V:D:IG:W:::YY:NFNAAPPE
HVO_A0541       :::R:::::::::::FL::CL:R::SPSFD:TEGEVAS::AD:G:W:::YY::TNADPPE
HVO_A0557       ::::::V::::::L::V:::LVA::SF::::::::V:::R:Q:::W:::AY::T:ARPPE
hla0004         :::R::L::::::L:::::CLFV::SF::::::G:MA:VRD::::W:::VY:::NSQPPE
HVO_2038        :::::EL::::::I::E:::LMA::TMK:A:EPD:VA::RTE:::W::::L::N:SEPPA
HVO_B0150       :::::TL::::::L::::::YVS::TM::A::TA:V::VQTEI::W::::L::N:SEPPA
pNG7039         :::::KL::::::::V::::KIA::TAE::::NNSLQ::ES::::W:::TL:GTQQEPPS
Hbo0280         :::::KL:::::::::::::RVA::TAE::::E::::::K:::::W:::TF:DA:QQPPA
HVO_1991        :::::KL::::::::::::::VV::QLE:Q::MA::::V:::IS:W::::L:A::ASPT:
pNG7277         :::::KL::::::I:::::::IA::KQ::S:GRE:F::::T::S:W::::L:D::AEPPS
Hut2909         :::::KL::::::I:::::::IT::VQ::N::PA:::::ESG:S:W::::L:DT:QEPP:
Hbo3443         :::::KL:::::::::::::GVS::AL::S:NAD:V:A:G::I::W:::YY:D::ATPPE
HVO_A0558       :::::RL:::::::::::::SVS::ALG:S:S:A:LD::E::IS:W::::F:A::QAPPT
Hbo2912         :::::G::::::::::T:::YAS::TLE:QL:EA:VA::SDKIG:W:::YY:DKRRDPPQ
pNG7190         :::::F::S:G::::FL::::A:::TQE:N::M::::::ID:IG:::::FY:GT:SDPQG
VNG1720         :::P:EC:A::::::FV:::YVS::TQ::A::AR:::T::SD:G:W:::FY:GTRADPPQ
Hbo0846         :::::QLL:::::::::::::VS::TQ::T::AG:VA::ESQ:::W:::FY:GT:AEAP:
Hmu0264         :::::RL:TH:A::::T::::VT::TQ::N:GAD:VD:V:TQLG:W:::FY:GT:DQPPE
Hmu1422         YDG::YV::VEP:LLMFF:QRRL::VYNKA::EG:L:::S:::::I::TNVY:NN::::S
Hbo2774         :::::I:::Q:P::I:M::NYMHKTG::KS::K::TN::S:::::::::N:L::R::::-
Hmu1150         :::::I:::R:P::I:M::NYMHSTG::ES::E::TD::R:::::::::N:L::R::::-
rrnB0275        :::::::::I:A:::FME:NQ:R::::Y:D::DR::R:VK::IG:::::F:R::S:::::
HVO_B0144       :::::::::MNA:::FI::HI:R::L:Y:::::::VD:::D::G:::::F:R:HS:::::
VNG2549         :::R:TLLD::P::Y:M::N::T::STF:EL:RG::DFLTQRS:::L::T:F::T:::::
rrnAC0299       ::::::LL:I:AG::FI::NYMV:::LIPN::R::V::MH:R:G::C::TSFSTY::::-
Hbo3952         :::::I::D::::L:MI::Q:::KN:TF::L:AA:::::S:K:S:::::T:F::T:::::
Hmu3344         :::::V::DIGG:L::M::NL:V:::KYKNIE::::::LESEI::::::T:F::T:::::
pNG7041         :::::P:::M:A:L::I::NA::::D:LGA:::::LT::R::::::L::L:F:QT:::::
Hmu3301         :::::T::DI:A:L::M::SAVT::D:FQA:::Q:L:::RS:::::I::V:F::T:::::
Hbo3597         :::--V:::::A::::I::NFMV:::RL:Q:S:E::D::DS::::::::T:FT:A::::Y
Hmu0262         ::::::::T::G:::VI::NF:L:::RFK::::I::D:VTD::::::::::FSGG::::Y
HVO_B0047       :::::Q::::NA:::I:::NF:L:::RG:Q:SEA:::::STQ:G:::::::FS:G::::Y
rrnAC0899       :::::Q:::I:A:I:VM::NF:Q::SRG:S:E::::D::ESQT::::::::FSTG::::Y
Hbo3224         ::::::::TM:A:I:VI::N:I::::NFK::E:A::D::T:G::::I::L:F:HT:::::
Hut2908         :::::Q::A:::::F:Y::QM::::::F:D:GPA:VS::R:::::L:A:L:F::E:::::
Hbo3275         :::::::::M:::::II:TGM:R::::F:D:RDE::A::S:Q:G::L::M:F::S:::::
Hbo1611         :::::V:::::N::::M::QM:V::::F:::SET:VD:::T::G:::::L:F::E:::::
pNG7040         :::::E::::::::::Y::QM:V::::F:D:S::::D:::::::::I::L:F::S:::::
HVO_1464        :::::E:::::N::::Y::NM::::::F:D:::A:VD:::::::::V::LVF::S:::::

consensus       AW--H-DYRY-YTLYEAFEKVAQVFQERERYEALASVHDELL-ATIQSRLP-PEDERPTV
#oth            :612:5938613422374466284443572383486538878186376;2126;665266
Hbo3312         N:PTGE::D:::AIP:FV:RYG:::::QK:AT:MVDLYETT::DD:T::::::L::::::
Hmu3372         H:PVGEP:D::LS:P:YIP:Y:AL:G:Q::GN::LELYEPFV:ESVTD:::::RED:RSM
Hbo3393         PF::GGRDP:::::::::::A::I::RQAQ:::WVTLKESFY::D:E::V:VSGGDE:::
Hbo3968         PY::D:RDP:::::::::::A:KI::RQAQ:::WVDLK:SVF:TE:::::::--:DS:::
HVO_B0198       :A::VSNEPNP:::::::::::T:::R:QQFQ:WQ:F::D:M:S::EAG:::::::::::
Hbo2048         SI::NEHEP:::D::G::::AG:I::RQA:FR:WQ:LY::FI:SN:E:K::::KS:::::
VNG2562         SA::VG:GPF::D:::::::A:EI::R:A:F::WQ:IKAD:M:D::SDG:::::SD::::
HVO_2094        E:::ADG:E:::D:W:L::R::SLYG::::::::Q::R:DQ::T:VEDG:::::S::::A
HVO_A0541       PC::RDR:EH::::W:YLGHI:A::R:E:::R:FR:LR:D:V::R:RAD::::AS:::SL
HVO_A0557       PY::AD::Q:::::W:IV:N:G:::R:ED::A::EA::SD:::D::R:D:::::S:::S:
hla0004         PC::RD::E:::G:W:IT:R::G::::S::F::::A:::D:I:E:V:AD::::TE:::::
HVO_2038        R:::ADQ::::H::W:I::R::A:::A:A::::::EI:GD:I:S::TAG:E:ETEA::ST
HVO_B0150       D:::ADQ:Q:::S:WDI:G::::::R:Q::::::SD:KTT:D:S::S:S:::AS:N::QT
pNG7039         G:::GDA:K:::::W:I:G:I::::R:GA::::::::RESM::Q::NAS:::S:S:::SA
Hbo0280         ::::QDG:E:::::W:T:GR:::::::E:::K:::D::NS:::T::EAN:::::S:::SA
HVO_1991        E:::TG::E:::::W:Q::::::MLR:E:::::::A:::DV::::TEAG:::::::::S:
pNG7277         G:::-AN:E:::::W:Q::L::EA:::QA::::::AI:::MR:S::DAN:::::S:::SA
Hut2909         :Y::ADG:E:::::W:Q::R:::L:G:QA:::E::AI:AD:::G::EE::::D:S:::S:
Hbo3443         ::::TD::Q:::D:W:M::R:::::R:EA::::::EI:RR:V:E:V:EE::::VEA:::A
HVO_A0558       E:::VDA:E:::G:W:I:A:::::L:AEAK:::::A::E:::::::AAD:::A:ED:::A
Hbo2912         S:::ADE:::::S:W:I::R:::::RAGS:AD::RD::ESMR:S::E:N::::TE:::::
pNG7190         PY::SG::Q:::::W:L:SR::T:::::R:::Q:RA:Y:::I:N:::TN:::::E::::A
VNG1720         GY::RDG:D:::::W:L:GR::D:::::A:F:::RR::ET:V::::AD:::::KRD:::A
Hbo0846         GY::-D::G:::::W:L:GH::D:::::T:::::NE::QN:V:S::R:N::::KED::S:
Hmu0264         GY::-D::Q:::D:W:L:GA::D::R:::::::::A::AD:V:ER:::Q::::VED:::A
Hmu1422         SL::-:N:DQ:PSI::::::L:R::K:EA::::FVE:::QMI:R:VN:K:::::E::::I
Hbo2774         D:::::::KL::SM:::L:RL:EL:::::::::::E::ASVQ:DE::::::::A::::EI
Hmu1150         E:::::::KL::SM:::L:R::EL:::::::::::E:::::Q:QEV:::::::A::::EI
rrnB0275        D:::::::P:::S::G::::I::::DREQ::QQF::F:E:F::TNL:E::::--ETT:EA
HVO_B0144       D:::::::::::::::::GLM:E:::AQD::Q:FVEL:E:M:::LVDEH::::A:Q:::A
VNG2549         ::::::::D:::S::::::T::EL:D:TD:FD:FQ:F::SA::DRLETA:::--S:G:RG
rrnAC0299       S::::E::P:::S::::T::::A:::RQD:FR::S:L:EGF::DRL:E:::::::Q::EI
Hbo3952         K::::::::::::::D::::::E:H::Q:KFSR:K:F::QYI:TD::TK:::GPNS::NA
Hmu3344         D:::::T:::::::::::::::A::::::::::IR:I::DVV::DVEA:V::GP:A::NA
pNG7041         D:::::::::::S:::::::::EMV:::T:F::IR:I::::V:E:V:A::::APTD::NA
Hmu3301         S:::::::::::S:::::::::E:::::D:F::IR:M::::V:::V::::::AP::::NA
Hbo3597         D:::::::AD::::::::::::D:::AQD:F::FETY:N:VI::DV::::::--::T:DI
Hmu0262         T::::E::Q:::S:::::::L:A:::Q:D:F::FSAL::DFQ:SS:DDVV::::G:::E:
HVO_B0047       :::::E::::::::::::::F:::::RED:F::FEQ::E:FQ:SNLAPVV::AQG:::SA
rrnAC0899       E:::::::T:::::::::::LS:A::RTD:F::FQ:L:E:FQ:TSLEDLV:DS:S:::E:
Hbo3224         T::::E::Q::::M::::::::EI:::Q:::::FK:L:::YVRGRVAEQ:::A:S:AASA
Hut2908         :::::::::::::::Q::::L:EL::RE::FQ:FETL:E:F:::DV:A:M:::AS:::N:
Hbo3275         S::::::::F::::::::::::EL::::D::::FKQY:::FI:TE::::M:::SG:::N:
Hbo1611         K::::::::::::::::::::::L:::E::FN:FQ:L:::FI::E::RQ::::A::::N:
pNG7040         N::::::::::::::Q::::::E::::QA::::FKQL::DYI::DL::Q::::AE:::N:
HVO_1464        G:::::::::::::::::::::::::RED::::FEAF:::FI::E::AE::::A::::N:

consensus       A-LVWAGSNEP--TFY----PYRLNDPGTSTKHTRDLGVRDAFAGTDIEGLS------TI
#oth            6377:=7:;9684966212169;7:9:59<:56657375<4127788<;<::;7756184
Hbo3312         G:VLS:FT:PENSGHFGVSN:IPAL:ATHEL::YG::::V::::EQYG:ERGHYDL:::V
Hmu3372         :::INGRY:PENRDGWVVYN:NSEVEATWGK:QY:::::V:::D:AYDGQS:V::::::V
Hbo3393         ::AFNF:FDPESGK:F::::AANIDA:RND:RSF:M:::NN::Q:EEYVPFK::::::PV
Hbo3968         G:AFIIRF:VDGKG:M::::AANIDAFRND:RTF:K:::DT::K:ETYVPYK::::::K:
HVO_B0198       ::AI:R:VSPDSGQ:R::::VAP:HRL:NN::SYFRV:MK:::E:RYP::--::::::P:
Hbo2048         ::AI:R:V:PDSG::R::::ISPIHAKQNN:RTY:V::LK:::E:QIPD:--::::::P:
VNG2562         ::AI:R:VRPDTGQ:R::::IAP:DPDQNN:LTY:R::MQ:::::AVPD:--::::::P:
HVO_2094        ::YLSISTDLS::SI:::::LL:::A::YWNA:::P::AV:::GDEEFT:PFQ:::::EV
HVO_A0541       ::V:ADTGG--::::W::::::DFTGD:YLWA:L:PF:MQN:::T::AQTG:DG::::SY
HVO_A0557       GVVIYMDE---::A:::::::TKIDA::FA:S:I:P:::T::::AG:VTFET::::::SY
hla0004         GT:LYMDG---:::Y::::::SL:D:::FANA:V:PF::V:::GAD:VTYET::::::AY
HVO_2038        :RFL:R:----::GIW::::V:P::G:::VRA:::VFDAE::L:DVPSGT--::::::Q:
HVO_B0150       ::RIMTTPELD:::IW::::TFHM:G::FIRS:::PF::P::LSDVEESS--::::::::
pNG7039         ::::LFSTSGE::KIW::::G:KM:H::YYAA:::P::AT::L:DAVGD:YGDDGRNI:L
Hbo0280         ::M:LFS:SDD::SMW::::G:KT:A::YYAS:::P::AT::LTEAVGDSYENVGDDI:L
HVO_1991        V::LT:SDI:N::QVW::::A:TVGN::FM:S:I:P:APH:::E:SIES:S-:::::::V
pNG7277         V:MLA:ADLD-::EI:::::A:T:DN::FL:A:::PF:A::::E:SVETNS-::::::VV
Hut2909         V:MIA:QDLD-::EI:::::A:T:DE::FL:A:::PF:A::::D:EVESAS-::::::V:
Hbo3443         V::IGPSDL:-::KI:::::A:K:DT::FL:A:::AA:AVG::GDDVQS:S-:::::::V
HVO_A0558       V::LGPSDL:-::SI:::::A:N:ST::FL:A:::P:KPVS::GDDVES:S-:::::::V
Hbo2912         :::TFE:KED-::::W::::V::::AN:FL:A:::P:DAT::::DVTF::AQT:::::QV
pNG7190         I:R:TL:DD--::Q:W::::T:H::R::FWLAD::P::AN:::GDETWD::WG:::::SV
VNG1720         V:R:TYDEG--::S::::::T:H::E::YWLAD::P::A:::::DA:WAS:WG::::::V
Hbo0846         I:RATFSESNE::I:W::::T:H::E::YWLAD::P::AN::::EQ:WG::WG:::::SV
Hmu0264         V:RATLSGDGE::::W::::T:H::E::YWLAD::P::AN::::DQ:WG::WG::::::V
Hmu1422         ::YLSDA:DPNRGNI::::::VGFDGELGQS::F:::EAVN::EISE-----::::::QT
Hbo2774         :::INSA::PNEG::::::::M:TQ:E:VEL:PY:::DI:S::TADH::AG-::::::::
Hmu1150         :::INSA::PNEG::::::::M:TQAE:VEL:PY:::DI:ST:TADH::AG-::::::::
rrnB0275        :::LYPADKT:E::::::::L:Q:Y:G:VGK::W:::RL::::E:::VGHY:GNTSL:KV
HVO_B0144       L:::YPADGAGF:Q:::::::F:FD:G:V:::QW::::LT::L:A::VGHY:FSDRG::L
VNG2549         :::::G:::::T:S:S::::::L:SGA::NK:PFH::N::::I:DSG:DA::QSQRS:E:
rrnAC0299       :::LSP::T::E::::::::::::G:R-:AY::W:::::S::L::SE:QSFTS:DRG:::
Hbo3952         L::C:Q:::::E:::::::::A::SGK::NK:AFH:V:IT::LS::G:D:::ESNRG:::
Hmu3344         :::::Q:E:::E:E::::::::::SGK:ANKE:FHT::IT::::::GVD:::TTDRG::L
pNG7041         :::MF::EEPE::A:T:::::::ISGN:ANKE:FQT::IS::::D:GV::Y:GSE:::SL
Hmu3301         ::::F::EEPE::E:S::::::::SGN:ANKE:YHT::LS:::::SGVD:::TTDRG:::
Hbo3597         ::ILYPADVP:E:S::::::::-:VGS:SQS::WN::H:G::L:NQ::TDAQA::GG:::
Hmu0262         ::IM::::D::T:E:S::::::-:VSR:::F:QW::::::::L:E::V:DFHE:SRG:R:
HVO_B0047       ::V::::GD::E:E::::::::-VI:E:::F::LN::K:N::L:T:EVRDFYS:NRG:AV
rrnAC0899       ::I:::::D::T:S:S::::::-:IED:::F:QW:::R::::::K:EVRDFHA:DRS:KV
Hbo3224         :::IY:AG:::E:K:S:::::::::TG:::I::L:::K:K:::E:::VK:I:STNRT:K:
Hut2908         M::TFE:TD::E:::S::::::::::R:::K:QW:::::A::LS::G:::::TTDRG:EL
Hbo3275         M::TFE:T:::D:::S::::::::T:K:::K:QWN::::A::L::::::N::TDNRG:EL
Hbo1611         L:::YE::D::E:::S::::::::::R:::K:QW:::::S::LS::G:H:I:TTDRG:R:
pNG7040         L::TYE:T:::E:S:S::::::::::K:::K:QW:::::T::L::::::N::TTNRG:EY
HVO_1464        F::TFE:TT::E:::S::::::::::K:::K:QWN::::T::LS:::::N::TTNRG:EL

consensus       DYETLLEADPDVILVR------GG----------KTPEEFRDTVREFLEDHPVGSELTAV
#oth            18.924752.17368;212233982322233;94<8:9<9:99839=49657657525.2
Hbo3312         GF:G::AV::::LIFDEAVNAL:::::::::QTVYGNTKAYERTL:L:RTDDI:QR::::
Hmu3372         :H:G:::Y:::::IFN::::::F::::::ITYRAFDGTNYIQQQ::L::::::::RV:::
Hbo3393         GI:K::DV:::Y:GMI:::::::Y:::::::LS:YIDDSQLQK:V:TAQ::D:L:Q:R::
Hbo3968         G::K:::V::EY:ALV::::::DN:::::::LT::SDN:TFQETV:AAKN:ETM:Q::::
HVO_B0198       G::E:INV:::Y:GAV:::::::A:::::::LTSS:R:::V:::V:PF:NNES:QR::::
Hbo2048         G::K::DI:::Y:GAV:::::::::::::::LTSL:HD::VS::V:PF:NNSN:Q:::::
VNG2562         G::E::DV:::Y:GAV:::::::::::::::LTSQ:HA::V:::V:PF:AN:N:QQ::::
HVO_2094        :V:A::::::::::AL::::::WT::::::::::V:ETFDF:GLKQN:R:D:::R::A::
HVO_A0541       :::VMV:TA:::V:RY::::::W:::::::::::TALRDTFRSN:DEVLSN:LAD:VP:F
HVO_A0557       :F:AM::I::::L:HS::::::Y:::::::::::IDSYYDVASI::T::N::::G::S::
hla0004         :H:Q:::V::::::HQ::::::Y:::::::::::VESYYDVAA:::E:A::::AG::S:I
HVO_2038        :M:A:V::::::V::D::::::::::::::::::LG:D--WT:TKQE:Y:E:TAQG:S::
HVO_B0150       :L:::V:T::E::::E::::::NA::::::::::FARSDDWRA:KNEFHND::AG:IS::
pNG7039         :T:L::::::::L::L:::::::P::::::::::MAGSHNL:DI:SQ:A:NE:TR:I:::
Hbo0280         ::::::::::::L::L:::::::P::::::::::M:EYHNI:DI:AK::::D:AKKI:::
HVO_1991        :F:A::::::::L:FL::::::S:::::::::::MQ:SVSTNDL:AT::SD::AA:IS::
pNG7277         :F:::::::::I::HL::::::::::::::::::FE:STNLPKR::AFKSD:::::I:::
Hut2909         :::A::::::::::HL::::::::::::::::::FE:NTDLAAR::EFQSD::A::I:::
Hbo3443         :A::::D:N::::FAL::::::::::::::::::MH:KTSMADI:DG:GGNN:TR:VA::
HVO_A0558       :F::::::::::::TL::::::::::::::::::MH:NTSMPDI:TGFQ:D:::A:IS::
Hbo2912         :::AM::::::::::L::::::FT::::::::::MSSSYSISD:::A::SS:::::IA::
pNG7190         G:::M:::::::::HL::::::W:::::::::::M::RYDM:DI:GR::S:S::K::A::
VNG1720         G:::M:D:::::::HL::::::W:::::::::::A::NYEM:A::SR:RGDA::GR:S::
Hbo0846         :F:AVA::::::::HL::::::W:::::::::::M::NYQMSD::AA:DS::::::::::
Hmu0264         ::::M:::::::F:HL::::::W:::::::::::M::NYSITDT:TR:::SAS::R:S::
Hmu1422         :::G::Q::::::IIQGALEYT:NLVSDENGEAVFDLDQ::KNYVLPM::NS::QKV:::
Hbo2774         :::::::V::EILV:H::::::W:ISTTGDQDT:FS:KA::EQFVTPF:ED:T::Q::::
Hmu1150         :::::::L::EM:VIH::::::W:IGTTGNQNT:FSQRA::EQFVTP:QEDSI:GQ::::
rrnB0275        :F::::DI::::L::::::::::Q:::::::VE:EDQAT:EE:IVDS:RNN::A::::::
HVO_B0144       :I:A:M:I::E:L:::::::NY::::::::::::ASEST:QKE:V:P:Q:QAGSHS:Q::
VNG2549         :A::::NV::::LF:::::::::H:::::::ED:::AA::Q:::VS::QN:DTAGRI:::
rrnAC0299       :::P:::I::E:L:LY::::::TD:::::::TH:R:DTA:E::Y:S::Q::DTA:Q::::
Hbo3952         ::::V::I:::S::L::::::::H:::::::EQ:::R:::EN::VK:MKN:E:A:::R::
Hmu3344         :::::::V:::A::L::::::::H:::::::GD::SR::::N::LS:MRE:S:A:Q::::
pNG7041         :::::::I:::SL:L:::::::YH:::::::REG::R:::ENS:LASMK::E:::Q:R::
Hmu3301         :::::::I:::SL:L:::::::YH:::::::KRG:SR:::E::ILSYMQ::::::Q::::
Hbo3597         :::::::I:::ALAI:::::::LQ:::::::GE:I:::Y:EENIVSH:KN:D:A:Q:R::
Hmu0262         :F::::KI::EH:MF::::::::Q:::::::EA::SR:A:E::ILAYM:N:E:A:Q::::
HVO_B0047       :F:::::V::E:L::::::::::Q:::::::EA:::R:::QN::VS:M:N:E:AG:::::
rrnAC0899       :F::::DI::EYL:L::::::::Q:::::::EN:::RS::E:::VS::KSDQS:::::::
Hbo3224         :::Q:::V:::TL:LK:::::::H:::::::ET:::EA::QN:LVKHMKN:DI::Q::::
Hut2908         :::N::TV::::L::::::::::H:::::::ER::SAQ::::::LAYM::::::::::::
Hbo3275         :::N:::V::::L:I::::::::H:::::::EQ::SAS::::::LAYMK:::::::::::
Hbo1611         ::::M::I:::::ML:::::::AH:::::::ER::SAT:::E::L::MR:::::::::::
pNG7040         ::::::SV::::::I::::::::H:::::::ER::SAT:::E:ILQ:MQN:T:::Q::::
HVO_1464        :::N:::I:::::::::::::::H:::::::ER:::::::::::LAYM::::::G::A::

consensus       QNGRVYRGGARYQGPIMNLFQTEMTAKQLYPDEFG-WP-------YPEIPEDEQLFDRQR
#oth            5437445729886..26224741481674246822434847513966566:695111264
Hbo3312         ::D:L:P::TGS::::I:::::::L::::::A:::P:RG::::::LG:T:T:::::::::
Hmu3372         D::DLFV::TP:::::I:M:::::A::::::E:::AY:G:::::::G:LSA:::::::::
Hbo3393         E::NFV:T:GQ:M:::ID::S::AL::::::::Y:E::G:::::SIHDV::E::::::::
Hbo3968         ::DNFV:SAGTNM::VID::SA:AV:M::F:::::E::G:::::TIDD::TEN:::::::
HVO_B0198       :E:NLI:SAGQ:M:::VDM:S::AV::MV:::Q::E::G:::::AVGDV:::::::::E:
Hbo2048         KE:NLV:T:GQFM:::VD:YS::AL:::VF:EA::E::G:::::ALGSV:::::::::::
VNG2562         E::NLV:T:GQFM:::VD::S::AL::MV:::A::S::G:::::SPT:::AS:R::::::
HVO_2094        R:D:::PQ:T:W:::L:::::::::::::::ER::A::TYEDGDD::DFGA::::::HA:
HVO_A0541       RD::Y:PS:NGM:::::::::L:::::::F:ER::A::GYGDGES::::::A:R::::E:
HVO_A0557       R:D:::PS:TPV::::::::::::::::::::R::A::AYDGG:A::V:::G:R::::E:
hla0004         E:D:F:PS:NPV:::::::::I:::::::F:ER::E::AYELGDG::D::D::R::::D:
HVO_2038        A:D::FPI:V::G::L:::::L::I::::::EQ::A::TYEGG:P::DV::A:R::::::
HVO_B0150       K:DQ::PLS:::G::::::::L::VS:::::EQ::E::DYDGG:P::DFSKE::::::EQ
pNG7039         :E::I:AQ:::R::::L::::::::::::::NQ::E::GYVDGDP:::::AE::::::::
Hbo0280         EE:Q::VQ:T:R:::LL::::L::::::::::Q::E::GYTNGEP:::::A:::::::::
HVO_1991        ::::::PQ::::::::L::::L::S:::F::EA::E::TSDGG:P::::::::::::::H
pNG7277         :TD:I:PQ::::::::LH:::L:::::::::EQ::E::TYTEG:P:::::PE::::::::
Hut2909         :SE:::PQ::::::::L::::L::::::::::Q::E::RYTEG:P:::::AG::::::E:
Hbo3443         K:D:::AQ::::::::L::::I::::::::::Q::A::TYAEG:P:::::::::::::E:
HVO_A0558       K:D:I:AQ:G::::::L::::L:::::::S::R::A::QYSEG:P::::::E::::::::
Hbo2912         K:D:::AQ:::::::::::::L::::::V::EV::E::GYADGEP::::::S::::::::
pNG7190         :TD:::AH:M::H::::::::I::::::::::I::E::TYENGDH:::::SA::::S:D:
VNG1720         A:N:::AS:M:::::::::::L::::::::::V::A::GFEDGGS::AL:AS:R::::S:
Hbo0846         :ED:::PA:M:::::::::::L::G:::::::V::E::EYTDGEP::::::E::::::TK
Hmu0264         E:D:::PA:M:::::::::::I::G::::::EI::E::AYTDGEH::::H:G:R::::::
Hmu1422         :EN:IEP::VSR:::LT::YN::IL:Q:V::KQ::EFDPE::::NPFDSA:EH:::::E:
Hbo2774         :E:N::P:AFGS:::LV::L:::LV:Q::::E:::AFDAE::::TF::V:AEQ:::::::
Hmu1150         :E:N::A:AFGS:::LV::L::::A:Q::::E:::AFEAE::::KF::VSKEN:::::::
rrnB0275        ::DA:::::YLD::::I::::::AA:QRI:S:::-:--:::::::-----SE:TV:::::
HVO_B0144       EDDA::SA:YLD::::I:FYH:DRA::DI:T:S:-:--:::::::-----:NVT::::E:
VNG2549         E::D:::::PI:L:::QH::L::RL:TA::DQV--:--:::::::------TTT::::AE
rrnAC0299       :::A::PA:GM:::::I::SK::RA::::F::::D:--:::::::-----:E:T:Y::::
Hbo3952         K::K:F:::PI:P::LHH::LV:RY:TGYF::T:-:--:::::::------SGE::::EE
Hmu3344         E:ET:F:::PI:A::LH:::LL:RF:QSFF::I:-:--:::::::-----TED::::H::
pNG7041         ::DM:F:::PI:A::LH:::MI:RY::RYF:E::-:--:::::::-----TETH::::DH
Hmu3301         :E:::F:::PI:A::LH:::MI:RY:TGYF:EA:-:--:::::::-----TEDE::::::
Hbo3597         ::D::VY::LT:::::IH:::L:RA:QG::::::-:--:::::::-----AG::::::K:
Hmu0262         E::D:::::PL:::::T::VL::RA:H:V:D----:--:::::::-----I:::::::::
HVO_B0047       :::D:::A::L:::::T::VV:DRL:RT::D----:--:::::::-----A::R:::A::
rrnAC0899       :::N:::::PL:::::T::VL::RA:S:V:E----:--:::::::-----V:RE::::::
Hbo3224         K:D::F:::PT:::::H:::LV:R:::D::::T:-:--:::::::------SGE::::::
Hut2908         :::Q:::::FL:::::Q:::L::RA::::::ET:::--:::::::--DVTG:DE::::::
Hbo3275         ::N::::::YLR::::H:::L::RA:::::::V:::--:::::::--DVTS:TK::::::
Hbo1611         :::::::::YL:::::H:::L::RG:::::::V:::--:::::::--DVTS::K::::::
pNG7040         ::E::::::YLR::::H:F:L::RA:Q::::NI:::--:::::::--DVTS:TE:::::Q
HVO_1464        :::::::::YLF::::H:::L::RA:::::::V:::--:::::::--DVTD:AE::::::

consensus       VADIINGDF--
#oth            25633537:42
Hbo3312         ::::::::L::
Hmu3372         L:E:AT:::::
Hbo3393         :::::::NV::
Hbo3968         ::::::::V::
HVO_B0198       LV::V::N:::
Hbo2048         ::::::::L::
VNG2562         :::A:::VGL:
HVO_2094        :EELVA:GSL:
HVO_A0541       :T::VA:E:::
HVO_A0557       ::G:VT::-::
hla0004         ::G:VT:EAE:
HVO_2038        ::::::::LQP
HVO_B0150       ::N::::::::
pNG7039         :::::T:AGQ:
Hbo0280         ::::VS::N::
HVO_1991        :::::::E:::
pNG7277         ::::V:::I::
Hut2909         ::AV::::I::
Hbo3443         ::S::R:N:::
HVO_A0558       :::::::NL::
Hbo2912         ::::V::AI::
pNG7190         ::N::TDG-::
VNG1720         ::A:VT::AQ:
Hbo0846         ::AAV::EL::
Hmu0264         ::E:VTR--::
Hmu1422         :R::::::L::
Hbo2774         :S::::::I::
Hmu1150         :R:::::::::
rrnB0275        :::::T:ST::
HVO_B0144       ::E:VH:NI::
VNG2549         L:S::TD--::
rrnAC0299       I:::RA::I::
Hbo3952         L:S::TS--::
Hmu3344         ::E:VTDSA::
pNG7041         L:T::TDGRDE
Hmu3301         L::::::NV::
Hbo3597         :S::V::::::
Hmu0262         ::::V::E:::
HVO_B0047       ::::A::NL::
rrnAC0899       ::::VA::L::
Hbo3224         ::::VT:::::
Hut2908         ::::V::EI::
Hbo3275         ::::::::I::
Hbo1611         ::::VT:E:::
pNG7040         I:N:VT:::E:
HVO_1464        ::::V::E:::