|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 5124 | hla2160 | Hbo2628 | VNG1413 | rrnAC1000 | Hmu1646 | VNG2566 | hla0239 | VNG1533 | rrnAC0672 | HVO_1269 | Hbo0277 | Hut1336 | Hmu0484 |
1539 | hla2160 | 5255 | 350 | 409 | 390 | 502 | 669 | 927 | 1085 | 1001 | 394 | 1168 | 821 | 877 |
1570 | Hbo2628 | 350 | 4974 | 1267 | 1352 | 1406 | 697 | 734 | 889 | 887 | 587 | 885 | 932 | 888 |
1752 | VNG1413 | 409 | 1267 | 4069 | 1486 | 1585 | 845 | 896 | 950 | 1272 | 898 | 1156 | 971 | 1029 |
1935 | rrnAC1000 | 390 | 1352 | 1486 | 5324 | 2296 | 906 | 960 | 961 | 1133 | 805 | 1193 | 1014 | 1085 |
2087 | Hmu1646 | 502 | 1406 | 1585 | 2296 | 5275 | 889 | 1030 | 1017 | 1161 | 780 | 1186 | 1015 | 1098 |
2197 | VNG2566 | 669 | 697 | 845 | 906 | 889 | 5430 | 1398 | 1558 | 1643 | 962 | 1660 | 1489 | 1622 |
2608 | hla0239 | 927 | 734 | 896 | 960 | 1030 | 1398 | 5660 | 1949 | 1884 | 1200 | 2078 | 2008 | 1923 |
2682 | VNG1533 | 1085 | 889 | 950 | 961 | 1017 | 1558 | 1949 | 5453 | 1968 | 1233 | 2027 | 1868 | 2098 |
2781 | rrnAC0672 | 1001 | 887 | 1272 | 1133 | 1161 | 1643 | 1884 | 1968 | 5252 | 1414 | 2546 | 1854 | 1946 |
1768 | HVO_1269 | 394 | 587 | 898 | 805 | 780 | 962 | 1200 | 1233 | 1414 | 3175 | 1601 | 1195 | 1268 |
2936 | Hbo0277 | 1168 | 885 | 1156 | 1193 | 1186 | 1660 | 2078 | 2027 | 2546 | 1601 | 5443 | 1916 | 2165 |
2571 | Hut1336 | 821 | 932 | 971 | 1014 | 1015 | 1489 | 2008 | 1868 | 1854 | 1195 | 1916 | 5467 | 2326 |
2780 | Hmu0484 | 877 | 888 | 1029 | 1085 | 1098 | 1622 | 1923 | 2098 | 1946 | 1268 | 2165 | 2326 | 5300 |
836 symbols consensus --------------------------PRFEPLDAPTGLAVADPIENAQFELLTPRPVAPA #oth 111112222222222234446656766776667677257583744586666756665667 hla2160 :::::::::::::::::::VTDDAIDD:VGFEADGRT:CIR:AL:GEK:P:YFD:EPQ:Q Hbo2628 ::::::::::::::::::::::::::-MVTLTVTD::VQAVG:-DT:TAVVTADGWS:DD VNG1413 ::::::::::::::::::::::::::---------------------------------- rrnAC1000 :::::::::::::::::::::MVTWGVAG:RVGRDG:E:LDWDG:T:DPTA:VHQLHNRE Hmu1646 ::::::::::::::::MSTWGVTYAGD:SAES::SG:FEG:::TGLPALCAQLN:LSEAS VNG2566 ::::::::::::::::::::::::::MVVPLS:GH::::LN:N:Y:RRVVMR::TR:T:T hla0239 MSVTTAAAHRRRGDPAADRTRSSPMSIDID::SDAA::T:T:H:::T:::VY:D:::E:: VNG1533 ::::::::::::::::::::::::MN:A:T:TTS::::R:H:R::::::::Y:ESR:::T rrnAC0672 ::::::::::::::::::::::::MTLT:::::DRP::::I:Q::RQRYRIH::T:I:LR HVO_1269 ::::::::::::::::::::::::::---------------------------------- Hbo0277 :::::MEGFGDSESSPSFDSSETYLELSLDAASGGD:VV:T::::RH::::S::SVID:E Hut1336 :::::::::::::::::METLPLSST::::::A::::IQ:V:::DGG::TF:::D::ETD Hmu0484 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