|
Pairwise sequence scores | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2654 | VNG2551 | HVO_B0197 | Hbo2047 | VNG2560 | pNG7275 | Hut2911 | HVO_1759 | Hbo1702 | Hmu1419 | hla0002 |
1614 | VNG2551 | 2705 | 1405 | 1413 | 1396 | 1467 | 1422 | 1507 | 1461 | 1398 | 1468 |
1963 | HVO_B0197 | 1405 | 2690 | 2142 | 2100 | 1653 | 1661 | 1848 | 1717 | 1787 | 1705 |
2001 | Hbo2047 | 1413 | 2142 | 2665 | 2076 | 1704 | 1698 | 1785 | 1740 | 1795 | 1720 |
1928 | VNG2560 | 1396 | 2100 | 2076 | 2622 | 1623 | 1609 | 1766 | 1632 | 1760 | 1637 |
2006 | pNG7275 | 1467 | 1653 | 1704 | 1623 | 2714 | 1770 | 1910 | 1881 | 1840 | 1815 |
2079 | Hut2911 | 1422 | 1661 | 1698 | 1609 | 1770 | 2906 | 2044 | 1798 | 1974 | 1885 |
2321 | HVO_1759 | 1507 | 1848 | 1785 | 1766 | 1910 | 2044 | 2701 | 2043 | 2169 | 2109 |
2108 | Hbo1702 | 1461 | 1717 | 1740 | 1632 | 1881 | 1798 | 2043 | 2647 | 1983 | 2133 |
2254 | Hmu1419 | 1398 | 1787 | 1795 | 1760 | 1840 | 1974 | 2169 | 1983 | 2746 | 2194 |
2213 | hla0002 | 1468 | 1705 | 1720 | 1637 | 1815 | 1885 | 2109 | 2133 | 2194 | 2835 |
409 symbols consensus --------MARSSRARLTRRFGWL----DGKLATLALGSLAVVVVAGLVQVSFGAYSMTI #oth 1143253445783653864377241231254.433332.23332312.2.111.313323 VNG2551 :::::::::S:Q::T:TGL:PSF-::::::A::GI:VA:T:A::LGA::::RY:G:Q:PL HVO_B0197 :::::::::SKVTD:VGAV:AE:RDRYA:SM::LVIV:::::LLG:T:L:::::::PL:L Hbo2047 ::::::::::GL:ERSERV:ET:V:::::T:::::IV:::G:LL::T:L:::::::PL:L VNG2560 :::::::::TANTD:SA:::----::::---:::::A:::L::LA:T:L:::::::PIP: pNG7275 :::::MVSET:GATDV:S:ART::DTL:::S:FG:CVA:V::AF::::L::::::::::: Hut2911 ::MAGESAT:TD:VS:HR:A:D::::::S:S:W:VV::::L:I:GGT:I:::::SF:T:P HVO_1759 ::VSGTTPTEQ::GSV:::L:::I::::::S:VS:C:A::V:::AG:::::::::F:::: Hbo1702 ::::::::-----------VLA:V:::::A::LSVC:T:V:M::L:::::::::T::::: Hmu1419 MSGEPVTGTEQ::GT:D::::V::::L::P::V:T:I::VVII:::::::::::::T:S: hla0002 MSNSGSVAGGDAA:RSSEG:I:::::F::P::VSV::A:V::::::::::I::::::::V consensus AEAWRAVFDPAVIFDPQVWRAFLLG-----------GELPE-LSRRTLIVWNIRLPRVLV #oth 531.41111351332642145122.323223232332331212554231..21.2..13. VNG2551 ETV:::L::R::WTN:D:LATI:::DGHAELLGVYRDTAV-:::DA:AV::TQ:::::V: HVO_B0197 S:::G::::S::V::AD::::::::::::::::::::DI::WFTQ:QFV::::::::::: Hbo2047 S:::HT:::GQ:L:SEA::::::F::::::::::::DDI:AW:::QQ::::::::::I:: VNG2560 :D::HT::::EIWSSAG::::::::::::::::::::Q:::W::::QVV::::::::I:: pNG7275 L:::Q:::::K:W:SV:A:QS:FF::::::::::::A::::::PK:::::::::M:::I: Hut2911 I:::Q:L:N:D:::NL:A::Y:VF:AEF::::PVLGA:::::MN::S:::::::F::::: HVO_1759 :::::::::::::::::::QV::::::::::::::::::::::G::::::::::::::F: Hbo1702 EQ:::::L::T::::SRWLLN::V:EELMRFITGFQ:::::::ANE:::::S::::::F: Hmu1419 GQ::A:::N:D:::NQ:A:H::::::::::::::::::M:::MGKES:::::::::::F: hla0002 G::::::L::::LL::RWLLN:FV:EGLMRSITGFQ:::::::AHG::::::::::::F: consensus AILVGANLAVSGAIFQAVTRNELASPFILGVSSGAGLMILLTLVVFSG------------ #oth 1321.11.111.....21.1......11..1.2...241122114231111111111111 VNG2551 :VF:::::::A::::::I::::::::Y:::::::::FAVVI:I:FSL::::::::::::: HVO_B0197 GV::::::::::::::V:::::::::YV::I:D::::VV:V::TFL:::::::::::::: Hbo2047 G:::::::::::::::V::Q::::::Y:::::D::::VV::A:TT:T::::::::::::: VNG2560 GT::::::::::::::I:::::::::Y:::::N:::MVV::::TL::::::::::::::: pNG7275 :V:A:MC::::::::::::::::::::::::::::::TV:::::L::S:::::::::::: Hut2911 :::::M:::::::::::::::::::::::::::::::::::V::AL::ATLVIPYVVGSV HVO_1759 :::::::::I:::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::::::::::: Hbo1702 G::::::::I::::::::::::::::Y::::::::::A:::::::::::::::::::::: Hmu1419 GAI::M::G::::::::I:::::::::::::::::::::::V::::G::::::::::::: hla0002 :AI::M::G:::::::::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::: consensus ---LAPFLPLIAALGGAGAFLLVYAIAWKNGTSPVRLVLAGVIVGTVFGSLQTGLFFFAD #oth 11124231.23..2..43..22..31..22..2.........1.21..4.1.113.1.22 VNG2551 :::-TSL::VA:::::T::::::::V::RG::T:::::::::V:::::N:::::V:Y:I: HVO_B0197 ::::L:LM:VL::V:::I::::::L:::::::::::::::::V:::::::V:RAM:::IN Hbo2047 ::::L::::IL:::::::::::::I::::D::N:::::::::::::::::::RA::::I: VNG2560 ::::L:VM::L::::::V:::I::::::::::N:::::::::V:S:::::V:RA::::I: pNG7275 ::::::::::F::V::SI::::::M:::QG::::::::::::::NM::T:::R::::::: Hut2911 ALDISSL::I::::::I:::::::::::::::::::::::::::::::Q::::::::::S HVO_1759 ::::VAY:::L:::::MF::V:::L:::::::::::::::::::::::Q:::::::::V: Hbo1702 :::::::::::::A:::I::F:::I:::Q:::::::::::::::S:::Q:::::I::::: Hmu1419 :::::A:::::::V:::V:::I::::::::::::::::::::::::::::V::::::::: hla0002 ::::SA:::::::::::V:::V::::::::::::::::::::::::::S::::::::::: consensus DLGVVQSAIAWTTGSLTGTDWEQVRIALPWTILAVLLALAGARQLNVLLLGEQTARSLGM #oth 2212221.34.22.1.1.11.222122123134234114432221111....21.41... VNG2551 SN:AMRT:VS:LA:T:::VG:TD:ELIVVP:L:V:PV::IA::H:D::::::RR::A::: HVO_B0197 :::::M::Q::LS:::L::::A:::::::F::V:LG::::VTKE:D::::::E::Q:::: Hbo2047 N:::AM::QM:LS:::L::::::I:::::F:V:::::::LVT:::D::::::E::K:::: VNG2560 N::::M::QT:LS:::L::::A:::::::F:V:SLA::FLVTNE:D::::::E::E:::: pNG7275 ::::::::L::I::::::VG::EF:::VIP:LA:T:::::::::::L:::::E::S:::: Hut2911 :I::::::::::::::::V::::::M::::::PV:A:SVIS:::::::::::R::S:::: HVO_1759 :I:::::::::::::::::::::::M::::S:I::G:::GSS:::::::::::::::::: Hbo1702 ::A:::::::::::::::V::::::L:::S:T:::I::AL:::::::::::::::::::: Hmu1419 :I:I:::::::::::::::::::::M::::S:V:I:::IT::::C::M:::::::K:::: hla0002 :I:::::::Q:::::::::::::::LV:::::V::::SI::S::::L::::::::K:::: consensus SVEKVRFALSGVAILAAAAAIAVAGIVGFVGLIVPHMVRNIVGSDYKRLLVGCLFVGPAL #oth 31.23..41132.1111111111..111.1..1...4..22..11213132..212.... VNG2551 R::TI::G::VL::::T:::VS:::L::::::V:::A::TV:::::R::::::::A:::: HVO_B0197 P:::::::VA:I:::ST::::::::L::::::::::::::L:::NS::::I::A:L:::: Hbo2047 P::R:::FVAAI:::ST::::::::LI:::::::::::::::::NS::::I::::::::: VNG2560 P::::::GVA:I:::ST::::::::LI::::::::::::::::NNTRD::A::VVL:::: pNG7275 :::R:::M::A::::::ST::S::::I::F::V:::I::L::::::R:::I::V:::::: Hut2911 N::RM:::::T::VV::::::::::::::::::::::::::::::::H:V:::::A:::: HVO_1759 :I:::::::::::V:::::S::::::::::::V:::L:::V::::::::V:::::A:::: Hbo1702 :::RT::L:::::::::S::::A:::::::::::::V:::L::::::::M:::::::::: Hmu1419 :I:::::::::::V:::::S::::::::::::::::::::L::::::KVI:::::::::: hla0002 :I:::::::::::V:::::S:::::::S::::::::::::L:::::::VI:::::::::: consensus MVGADVGARLALSPV-----QLPVGIVTGLVGGPYFLYLMRKQENMGEI #oth 2.3...1...1152321222.3...111.12......1.1.12243123 VNG2551 V:V:::I:::G:GG:::::::V:::V:::::::::::L:L:RT:SFN:F HVO_B0197 L:::::::::::::I:::::::::::I:::::::::::::::K:DI:SV Hbo2047 L:::::::::::::::::::::::::IS::::::::::::::K:QL::: VNG2560 L:::::::::::D:::::::::::::I::::::::::::::RT::L:D: pNG7275 ::V:::::::::::A::::::V:::V:::V:::::::::::R::Q:::: Hut2911 ::A:::::::G:MVLAGSSQ:M::::::::L::::::::::::DT:::: HVO_1759 ::A:::::::::N:I::::::::::V:::::::::::::::::Q:I::V Hbo1702 ::I::::::::MA::::::::V::::::::I::::::::::::QDL:DV Hmu1419 ::::::::::::N::::::::I::::::::::::::::::::KQ::::: hla0002 ::::::::::GM:VITGADS:I:::::::::::::::::::::Q::::L