|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2106 | VNG2558 | VNG2552 | HVO_1760 | Hbo1703 | Hut2910 | Hmu1420 | pNG7276 | hla0001 |
1376 | VNG2558 | 2314 | 1076 | 1000 | 1119 | 1212 | 1200 | 1228 | 1150 |
1360 | VNG2552 | 1076 | 2064 | 1311 | 1315 | 1193 | 1163 | 1128 | 1110 |
1438 | HVO_1760 | 1000 | 1311 | 2212 | 1648 | 1163 | 1212 | 1216 | 1226 |
1466 | Hbo1703 | 1119 | 1315 | 1648 | 2122 | 1203 | 1251 | 1304 | 1188 |
1611 | Hut2910 | 1212 | 1193 | 1163 | 1203 | 2360 | 1390 | 1437 | 1401 |
1681 | Hmu1420 | 1200 | 1163 | 1212 | 1251 | 1390 | 2329 | 1625 | 1631 |
1684 | pNG7276 | 1228 | 1128 | 1216 | 1304 | 1437 | 1625 | 2289 | 1534 |
1618 | hla0001 | 1150 | 1110 | 1226 | 1188 | 1401 | 1631 | 1534 | 2188 |
336 symbols consensus -----------------E-MMQEQPNGDTDATDNEDAA----S-----LSGDDLVLSYPG #oth 111111111112245552545544553533356443444444353433251221222.34 VNG2558 :::::::::::::::::-:-:TR::AN:ATG::TP:RG::::-::::::::T:::VR::: VNG2552 :::::::::::::::::-:-:PQR:HT:::EDPV:S::::::-:::::VL:T::E:G:-- HVO_1760 :::::::::::MSNQQP:NPK:MAQH:E:::NTSGNERVESD:DRESA:A::A:E::::T Hbo1703 :::::::::::MAESEY:H:TV::TQNKGEQ::VVS:-::::-::::::V::::T:::AT Hut2910 MPGKTPEPDGGVSQVIE:PVSR:NGETPA:GEQP::GRADGETAASE:FR:::::I:::S Hmu1420 ::::::::::::::MARNTTETR:R::SEE:LS::S::DAIG:KQASE:::E::::R::S pNG7276 :::::::::::::::::-::S:DNS:S:GI::V:DT::GSQS:HRDRP:V:::V::::S: hla0001 :::::::::::MSTEHANATDS:V:S:T:::SETV:SVGAGDASA::::DAES:::G::N consensus GDEPVIDGESIDAPPGEVTALVGPNGSGKSTLLKGLAKQLAPDAGSVLLDGRDIHEMGTK #oth 4241.1112224233.21...1...........12214213124.3.31..43134333. VNG2558 ::D:::::::VTV:V:D::::I:::::::::::NA::NKHS:AD:T:::::HT:D:L:S: VNG2552 ::TT:V:CAD:VV:A::::::::::::::::::::FSAE::::::T:::::TAV:DRSP: HVO_1760 SE:::VECDR::I:R::I::::::::::::::::S:::::S::S:::Y:::KS:S:YDD: Hbo1703 T:Q::VECDR::I:R::I::::::::::::::::A:S::::::T:N:::::QT:Q:Y:D: Hut2910 S:Q:::::A::EVA:::::::::::::::::::::V:D:::L:S:V:R:::T:::D:E:: Hmu1420 M::::::::RLV:T::A:::::::::::::::::::::::T::E:T:::::::V:S:::: pNG7276 T::::::::::T:E::A::::::::::::::::::::N::E:E::::::::Q::QTLE:: hla0001 APA::::::::A:E::A::::::::::::::::::::T:::::D:::MV::::V:A:D:: consensus ELARKLGLLSQENDSPNSITVEDLVYHGRYPHRGFFDQLTDEDRAAVERAIDLAGVEHLR #oth 22.12..1.1.1222.4211.32.121.....11.1152212.4311221121..12.11 VNG2558 ::::R::::::::VT:GG:S:RE::ER:::::Q::::S:::A:::::TD:LRV:::D::S VNG2552 Q::SE::::A::::A:GGL::G:::T:::::::::L:A:N:A:H::ID:::::::::::: HVO_1760 AF::E::M:::QH:::T:L::::::::::::::S::E:VS:D:HE:::::::::::::I: Hbo1703 :F::E::::::::::::T::::E:A:::::::::::E:VSE::EE:::::::::::D:I: Hut2910 :::::::::::::VA:D:::::Q::E:::::::::::G:::A::GEID:S:E:::::::: Hmu1420 ::::::::::::ST::E:::::::::::::::::::ETT:E::NR::D:::::::CG::: pNG7276 AI::::::::::ST:::::S:::::::::::::::::SV:E::E:::::::::::CG:I: hla0001 A:::::::::::ST:::::::D::::::::::::::ERT::::AR:::Q::E:::CG::: consensus DREVGSLSGGQKQLAWIAMVLAQDTDVLLLDEPTTFLDLHHQLEVMEIVRTLRDESDVTV #oth 234213.....1..111..1...1...........1..1...11.112122.1122.3.1 VNG2558 G:D:::::::::::V::::A::::::::::::::::::P:::::::D:IQA:::DH:T:: VNG2552 :TALSE:::::::::FV::A:::::::::::::::Y:::::::R:::V::::NEDR:::: HVO_1760 :KQI:N:::::S:::::::::::::::::::::::Y:::::::R:L:T::Q:NE:R:::: Hbo1703 :QT::N:::::::::::::::::::::::::::::Y:::::::R:::T:QQ:N:RR:::I Hut2910 E::::Q::::::::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::M:: Hmu1420 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::I:: pNG7276 E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::IE:::::::I:I hla0001 E::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::M:::::IE:::::::::: consensus VVVLHDIEQAARLADRMVALKDGEIRARGPPEEVVTEELLADVFRIDAAVSYTPRGPRIV #oth 2.....13....3..321.12..22311.4.2211.131.11..311.3.4533411214 VNG2558 :::::::N::::Y::HVI:::::T:H:::Q:AD:::K:T:RT::D:E:T::T:SH:MQV: VNG2552 C:::::LQ::::F::YL:::D::TVYDW::::D::::D::::::GV::::::DDE-:::: HVO_1760 A::::::A::::F::YL::MQ:::LYDW:::R:::::::::::::VE:::N:S:D-:E:: Hbo1703 A::::::A::::F::YLI::Q:::VYDW:::R:::::::::::::VE:::::::D-:E:I Hut2910 :::::::Q::::H::::I::::::::::::::A:I::R::::::E:::::ER:::::::E Hmu1420 :::::::::::::::E:::::::A:::::T::::::::::::::E:::E:DVIE::::VT pNG7276 ::::::L::::::::::::::::::Q:::R::D::::Q::::::E:E:E::A::::::VN hla0001 :::::::::::::::::::::::::::::A:::I:::D:::::::V::D:VQ:EN:::VT consensus PLRARHD-D--------------------------- #oth .32212233444333233333333123232111111 VNG2558 :IE:L::E:GTDHEHAPGSRTPTRETAADGGTPPAE VNG2552 :R::LD-:-::::::::::::::::::::::::::: HVO_1760 :K:SL--:-::::::::::::::::::::::::::: Hbo1703 :KHSL--:-::::::::::::::::::::::::::: Hut2910 ::HP::EG:PDKQS:::::::::::::::::::::: Hmu1420 :::::::DVDRAGGDAEEAEGSPPEVLEAE:::::: pNG7276 :I:::::G:DHTGGGDTAESDRAEEVVAE::::::: hla0001 ::::::EDTE::::::::::::::::::::::::::