|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2845 | rrnB0240 | NP2612A | VNG2063 | hla1392 | HVO_1914 | Hbo1787 | NP2260A | rrnAC2815 | Hmu3126 |
1469 | rrnB0240 | 2879 | 1289 | 1371 | 1353 | 1261 | 1259 | 1319 | 1424 | 1420 |
1910 | NP2612A | 1289 | 2859 | 1678 | 1721 | 1598 | 1692 | 1875 | 1795 | 1824 |
2265 | VNG2063 | 1371 | 1678 | 3073 | 2245 | 2041 | 2092 | 1940 | 1936 | 2046 |
2468 | hla1392 | 1353 | 1721 | 2245 | 2846 | 2356 | 2297 | 1964 | 2008 | 2018 |
2299 | HVO_1914 | 1261 | 1598 | 2041 | 2356 | 2815 | 2383 | 1845 | 1892 | 1872 |
2404 | Hbo1787 | 1259 | 1692 | 2092 | 2297 | 2383 | 2825 | 1957 | 1971 | 1954 |
2192 | NP2260A | 1319 | 1875 | 1940 | 1964 | 1845 | 1957 | 2885 | 2038 | 2106 |
2297 | rrnAC2815 | 1424 | 1795 | 1936 | 2008 | 1892 | 1971 | 2038 | 2822 | 2387 |
2283 | Hmu3126 | 1420 | 1824 | 2046 | 2018 | 1872 | 1954 | 2106 | 2387 | 2844 |
420 symbols consensus --------------------------------SMPTPVIVAAYRTPQGKEGGVFADVRSE #oth 1111111111111111111111111111122344421.113.2..111341.1212121. rrnB0240 :::::::::::::::::::::::::::::MTA:DSQA:V:D:V::::VPKD:AL:GTHP: NP2612A ::::::::::::::::::::::::::::::MM:QRQ::::Q:V::S::TQ:::::ETG:: VNG2063 MRAAGSRPVNRWLDVGRCGSFKERGALAFGMAATT::::A:::::::::D:::Y::T::: hla1392 ::::::::::::::::::::::::::::::MTDET::::A::::::::RD:::Y:::::: HVO_1914 ::::::::::::::::::::::::::::::::-::V:::A::::::F::A::::E::::: Hbo1787 ::::::::::::::::::::::::::::::::-::Q:::A::H:::F::A::::E::::: NP2260A :::::::::::::::::::::::::::::::M:DN:::V:K:::::F:::D:::::::P: rrnAC2815 ::::::::::::::::::::::::::::::::-:::::::D:V:::::::D:AL:G:::: Hmu3126 ::::::::::::::::::::::::::::::::MTR:::V:D:V:::::::D::Y::T::: consensus DLSVPLIDHILAETGLTAEDVDDLMWGCAQQRGEQDNNVARVIALLSDLGESVPATTINR #oth 1.12312333123211433321.251.1.2.24..21.2..111.22411.41.12122. rrnB0240 ::VSTVLTALVDR::VP:VEW::FRL:::N:E:::GR:L::QSI:AGGFP:T::GA:TT: NP2612A E:::::VETMVEAA::AP:::::VR::::K:VD::S::L:::::::A-::::::G:::D: VNG2063 ::::TV:::::::::::GDHI:::Q::V::::T::::::::::::::E:::N:::AS::: hla1392 :::TR::::T:::::::GDH:::::::V::::T:::::::::::::::::::::::S::: HVO_1914 ::::T::::::D:HDVDPD::E:::::V::::A::::::::::::::A:::GT:::S::: Hbo1787 ::::A::::::D::D:D::::::::::V:::::::::::::::::::E:::GT::::::: NP2260A ::::::::Q::D:::::G::::::K:::::::E::G::M::::::M:E:::DT::::::: rrnAC2815 :::::::NQL::S::VE:::::::L::::::::::G::M::::::::::::::::S:::: Hmu3126 :::::::NQM::S::VESAQ::::V::::::::::G::L:::::::::::::::G::V:: consensus WCASSAQAIISAADAIAAGQRDCIIAGGVENMSRVPM-GDSYEHLHPELSEQYNIFQLQM #oth 1.1..221234.11.12..31223211...2..213212334542114132411243.3. rrnB0240 L:G::LTTLVD::R::E::DGAVYPVA:::H::T::F:---SDW:::AIEQR:DPDR:P: NP2612A L:::::E::M::::::R::S::V:V:::::::::NER:-RTGIGSYEAIA:R:DVDA:A: VNG2063 :::::ME::MR::::VR:::::AV:::::::::::::D::::A::::G::::::VPE:E: hla1392 :::::M:::::::::::::N:::::::::::::::::D::::::::::::::::V::::: HVO_1914 :::::M::::::S::::::N:E::V:::::S::::::D:::::::::::::::::::::: Hbo1787 :::::M::V:::S::V:::N:::VV::::::::::::D:::::::::::::E:::::::: NP2260A ::::::E:V:N:::::R:::::::::::::S::M:K:::EN-NKV::G:NDHH::AA::: rrnAC2815 ::::::E:LMR:::::::::::VL::::::S::::Q::DENTHNV::R:A:::::GE::: Hmu3126 :::::::::TT::::::::::E:V::::::S::::K:::ENTHNV::K:A:L:::GE::: consensus GMTAEKVAEEYDVSREEQDEYALRSQQRAAEATESGRFDDEIVPIETDDGE-----VEED #oth .1...31.422222.43..11121.12..12.212....1.1..121332511111222. rrnB0240 :Q:::TI:RTH:I::KA:::F::::HE::VA:M::::::A:T::VH::ETA:::::::S: NP2612A :Q:::Q::T:::M:::R::A:GA::::::V::::E:::::::::::GH:D:GNEVL:::: VNG2063 :::::E:::RHGIT:T:::::::Q::R::::::DA:::::::::VQ::S:L::::::::: hla1392 :::::::::::E::::A:::::A::H::::::::::::::::::V:::::L:::::ID:: HVO_1914 :::::::::::E::::A:::F:F::H:::::::D:::::::::::::A::V::::::T:: Hbo1787 :::::::::::::::::::::::Q::::::::A::::::::::::::EA:V:::::IT:: NP2260A :::::E:::R::::::T:::::A::::::V::::E:::::::::::GH:D:GNEVL:::: rrnAC2815 ::::::::S:ME:A:Q:::::::::H::::D::::::::::::::::E::Q:::::LDA: Hmu3126 ::::::::D::::A:R::::::::::::::::::::::::::::::::::P::::::DA: consensus EGIRPDTTAEKLSGLPTVFKGD--GTVTPGNASQISDGAAALLVTSRAFAEDHGLDVLAE #oth 212.21.1313123.211.44111111.11.1.131...12311..311.3221111.14 rrnB0240 KTP:A::SV:Q::E:::::RD:EAA::::::::PLT::::GM::::A:Y:DQ::::::GR NP2612A ::L::G::::AIAD::PA:EEG::::::AA::::::::::GV:L::::::DER:::I::A VNG2063 ::::::::L:A:GE::::::S::::S:::::::::::::::T::::E:::R::::::::R hla1392 :::::::::::::::SPA:T::::::::A::S:::::::SLT::::K::::::::::::: HVO_1914 ::::R::SM:I:G::DPA:S:::::S::A::S:::T:::::V:::::E::::R::::::S Hbo1787 ::::::::MDA:::::PA:T::::::::A::S:::T:::::V:::::E::AE:D::I::D NP2260A ::L::G::::::::::::::A::::S::::::::TT:::S::::::E::::EQ:FEI::: rrnAC2815 G:::::::L::::Q::::::S:::::::::::::V:::::G:M::::E::::R::::::: Hmu3126 ::::::::L:::GE::::::S::::SI:::::::V:::::G::L::E::::E:::::::: consensus VGTNNVAGVDPTVMGIGPVPATRGLLERTGRDIDDYDLVELNEAFASQCLYCQRELGIDD #oth 11523....2.2...1..1..2152412313341121...1.....1.2212321..115 rrnB0240 IE:RS::::::L:::R::I::::AA:DNA:LT:::I::::::::::A:S:H:K:::::PT NP2612A :EHH:::::::::::::::::V::IW:E::::A:::::::::::::::T::::D:::F:: VNG2063 ::DH:::::N:E::::::::::::::D:::E:::EF::::::::::::T::SRD:::::N hla1392 ::::::::::::::::::::::::::D:A::T:::::::::::::::::E:SR::::::E HVO_1914 ::::::::::::::::::::::::::D:A:T:::::G:::I::::::::E:SR::::::A Hbo1787 ::M:A::::::::::::::::::T::::N:::V::::::::::::::::V:AMD:::::H NP2260A I:N:A::::E:E::::::I::CEN:F::S:TSA:::::::::::::::TV:::EQ::F:: rrnAC2815 I:SHE::::::::::::::::V:K:T:::D:ET::::::::::::::::::::::::F:: Hmu3126 ::DHS::::::::::::::::VES:C::::::PEE:::::::::::::T::::::::F:: consensus DIFNVNGGAIAIGHPLGASGARLPVTLIHEMQKRD-AERGLATLCVGFGQGAAIEFERP- #oth 132........2.....11...111..2..1311112331.112...1...2.1213323 rrnB0240 ERL::::::::L:::::C::::ITT::L::::RQ:::TH::::M:::::::I:VV::N:C NP2612A E:::::::::::::::::::::::::::::L:R:G:GG:::S:M:::Y:::::::LWV:E VNG2063 :R:::::::::V:::::::::::::::::::N:::::GKA::::::::::::::S:::-: hla1392 EQY::::::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::S:-: HVO_1914 :SL::::::::L::::::::::::::::::::::::VD::::S:::::::::::::S:-: Hbo1787 :::::::::::L:::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::S:-: NP2260A E:::::::::::::::::T::::::::::::R:::D::L::::E:::::::::::::LR: rrnAC2815 ::Y::::::::::::::::::::::::V:::NR:::::L::::E::::::::::::RL:: Hmu3126 :S:::::::::::::::::::::::::::::N::::::L::::E:::::::Q::::RL:Q