|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2367 | NP6236A | VNG2025 | HVO_1875 | NP4490A | rrnAC2914 | Hmu2803 | Hbo1754 | hla0987 |
1378 | NP6236A | 2304 | 1101 | 1242 | 1262 | 1241 | 1262 | 1205 | 1241 |
1591 | VNG2025 | 1101 | 2311 | 1428 | 1447 | 1385 | 1399 | 1393 | 1436 |
1895 | HVO_1875 | 1242 | 1428 | 2362 | 1765 | 1662 | 1665 | 1728 | 1754 |
2063 | NP4490A | 1262 | 1447 | 1765 | 2362 | 1903 | 1874 | 1840 | 1810 |
1996 | rrnAC2914 | 1241 | 1385 | 1662 | 1903 | 2359 | 1991 | 1760 | 1744 |
1969 | Hmu2803 | 1262 | 1399 | 1665 | 1874 | 1991 | 2332 | 1718 | 1723 |
1970 | Hbo1754 | 1205 | 1393 | 1728 | 1840 | 1760 | 1718 | 2426 | 1898 |
1998 | hla0987 | 1241 | 1436 | 1754 | 1810 | 1744 | 1723 | 1898 | 2395 |
314 symbols consensus MTKRHVSLPADAEEGLRAFIDEVDERLSSDE---DTCDVVTDTLVDLHGDREAYERWQDG #oth ...1..11.5412333321223..3..132111111131.322.2..2.11121.2113. NP6236A ::::::EV:VETQAAIDET::Y::M:::E:-:::::A:A:AEI:A::F::SDV::QYRA: VNG2025 ::::::::::::KDVR:::VSG::::::AA:TPDELATA::G::A::R:E:D:::A:R:: HVO_1875 :::V:::::E::::::Q:::::::G::A:::::::::T::R:::I::F:::::W::::N: NP4490A ::::::::::T:::::E::LET::R::::::::::::Q::E:V:::::::::::::::S: rrnAC2914 :::::::::PL:::::::::::::::::G:::::::::::::V::::::::D:::::::: Hmu2803 :::::::::PL:::::::::S::::::A::::::::::::E:V:::::::::::::::S: Hbo1754 :::V:::::SE::RNVQ::::::::::::E:::::::E:::E::::::::::::::::A: hla0987 :::::::::DG::A:V:G:::::::::::E:::::::E::R:::I:::::::RW:A:::: consensus EDVSPAERVRLQGYDPCNATLESEYYAEKDEAAFQRSKHLQWLWRQFDATPMADNVEFAL #oth 322211212.12211.1.221.2.11..11133151..4.11..11..21.111.231.. NP6236A :SLP:MT:L:VRS:::R:VLI:T:HW::QELS:L:E::C:RY::EG::LS:LSN:LA::: VNG2025 D::R::AAA::ATL::R::S::::::::::::::A:::P:::::::::T::L::::DV:: HVO_1875 KP::::T:::::::::::::::A:::::::::K:K:::::::::::::::::::::A::: NP4490A D:::::::::::::::::::::::::::::::::EE:::::::::::::::::::::::: rrnAC2914 A:I:::::::::::::::T::::::::::::ER:K::::::::::::::::::::::::: Hmu2803 :::::::::::::::::::::::::::::::D::SE::Y::::::::::::::::::::: Hbo1754 A:L:::::::::::N::::::::::::::::SK:T:::N::::::::::::::::IH::: hla0987 :S:PR::::::::::::::::::::::::::EQ:::::::::::::::::::::::D::: consensus RFRRMLADHLFAECGDGCRFFKGITFTYGHNIEVGDNVVVHDDVHLDDRGRLTIGDRVSI #oth 1..11113...222.122.2.1.12321....23...2.1.11.1.....2.21.2.1.2 NP6236A P::QT::::::::A:::L:L:S::KIQC:::::M:::::::N::L:::::::Q::::::V VNG2025 P::::::G::::GV:EDV:L:::::M:::::::L:::A::::G:::::::E:VV:A:A:V HVO_1875 :::QT::::::::A::NL:I:::V::S:::::S::::T:I::::::::::K::::::::: NP4490A :::::::::::E::::::::::::::::::::SI::::::::::::::::E::::::::: rrnAC2914 :::::::::::DS::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N:::: Hmu2803 :::::I:E:::E:V::::::::::::::::::T::::::I:::::::::::::::::::: Hbo1754 :::Q:::::::E::::N:::::::::::::::SI:::T::::G:::::::K::::::::L hla0987 :::Q::GN::::::::D:::::::SV:::::::::::::I::G:::::::K::::::A:: consensus SDGAHLYSHDHDIVDQTDVRNYHTIIEDDARVTYDAMVRAGVRVGENAIVGARSVVQGDV #oth 1133.211.2..5...12.2.12.222111.21211112..232.1.13111213233.1 NP6236A A:RS:IHT:A::T:::S::T::E::LD::V:LG:GS:IS::C:I::::M::SGATTL::: VNG2025 :N:::::T::::V::::::T::R:E:GA:::::QG:L:::::::::::L::S:::::::: HVO_1875 ::S::I:::S::T::::E::::::T:G:::::::::::N:::S::::::::::::::::: NP4490A :::V:V:::::::::::E:D:::::::::V:L:F::::::::Q:::::V::::A:::S:: rrnAC2914 ::DT:V::::::A::::H:D:::::::::V:L:::S::::::K::::::LA:K:IAGK:I Hmu2803 ::D::V:T::::S::::H:D:::::::::::::::S:::::::L:::S:LA:K:S:SR:: Hbo1754 :::V:::::::::::::::::::::V::N::I:::::::::I:I:A:SV::::::::::: hla0987 :::V::::::::L::::E:::F:::V:::::::::::::::C:::::SV::::::::::: consensus PAHHIAVGSPAKSVRVKPGWESVADPLDA-ALVDRRDERELPYDLPDDLDQFDEFQRDLS #oth .2..111.2..2.231.1.1.21.23313143322233.314331.133341...3.213 NP6236A :P::::A:::::::KI:::::AI::--:PGP:::N:ER:Q::S:V::SV:E::::N:N:: VNG2025 :::::::::::E:::::::::A::A:::::GGER:QA::R:DDAV:A:AAVY::::::R: HVO_1875 ::::::::::::::K::::F:E::E:::::GGER:A::::I::E::::IEA::::D:::D NP4490A ::::VV::Q:::::::::::::::E:V:::DHH:G:SD:K:::E:::G:E:::::::::Q rrnAC2914 ::::V:A:T::::LT::D::::::E:IEG::N::::A::Q:SA::::N:E:::::::::: Hmu2803 ::::::A:T::E::AI:D:::::::S::G::N:::::Q:K:DSTV:::VT:::::G:::: Hbo1754 :D:::V::T::::I::::::::::A:VED:R::N:Q::::IT:::::G::T::::G:A:T hla0987 ::::VV:::::R:::::::::E:::E:EDGR:P::Q::::IE:::::::::::::::::Q consensus PPDRR--------- #oth 1.354322211111 NP6236A ::SES::::::::: VNG2025 ::GE:::::::::: HVO_1875 G:VDSHRRE::::: NP4490A :::::::::::::: rrnAC2914 :::HE::::::::: Hmu2803 ::::-::::::::: Hbo1754 :::TPDAPNPESHD hla0987 ::SSPQ::::::::