|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2453 | NP3802A | Hmu1074 | rrnAC0038 | VNG1364 | hla1220 | HVO_2879 | Hbo2645 |
1794 | NP3802A | 2483 | 1461 | 1560 | 1490 | 1686 | 1541 | 1582 |
1877 | Hmu1074 | 1461 | 2482 | 1849 | 1612 | 1572 | 1737 | 1719 |
2004 | rrnAC0038 | 1560 | 1849 | 2494 | 1781 | 1706 | 1827 | 1777 |
1964 | VNG1364 | 1490 | 1612 | 1781 | 2430 | 1691 | 1818 | 1755 |
1997 | hla1220 | 1686 | 1572 | 1706 | 1691 | 2463 | 1816 | 1751 |
2085 | HVO_2879 | 1541 | 1737 | 1827 | 1818 | 1816 | 2432 | 2034 |
2083 | Hbo2645 | 1582 | 1719 | 1777 | 1755 | 1751 | 2034 | 2473 |
336 symbols consensus ----MTDTLFLTSDEIAGLATPAEYVDAVRDGYRQRGEGAPAEPRTKLLNEEPPGMLTGY #oth 122223431..3111221..11.11.21..21.122.2111.3...2.4323.1.12.2. NP3802A :::::::V:::R:::L:::::::::::::::::ESY:TDGT:A:::::T:::::::C::: Hmu1074 MSASDEP:::::::D:D::::M::::E:::::::D::H::::R:::T:YADS:A:::::: rrnAC0038 :MTTDATA:::Q:::V:D::E:::::::::E:::::::::::T:::T:FSD::A:::::: VNG1364 ::::----M::SA::::::::::D::::::S:::::::::::::::A::R:D:A::F:D: hla1220 :::::::::::::ADVDD::E::D::AV:::A:::I::::::::::::::R:::::::T: HVO_2879 ::::----::::::::S:::::::::A:::E:::::::::::::::::F:R:::::::T: Hbo2645 ::::::E:::::::DVS:::::::F:::::::::::::::::::::::P::N:::FF:T: consensus AAVLPDTGAMGGYTYSAGFGGGDAWFMTPLFDAESGEPLALLDGASMNPFKTGAAGAVAV #oth 3.2..32.1....1.1...133.11.31.11..2..312.12....1..2....2.1.11 NP3802A L::::SV::::::::A::::D::VH:AL::::::::RMI::::::::::H::::T::::: Hmu1074 T:I::TV::::::::A:::::Q::H:VL::::::::D:::VF::::L:::::::T:G::I rrnAC0038 L:I::::::::::::A:::S:R::H:TL:I:::D::D:::V::::::::H::::::::G: VNG1364 S:L:::D:V:::::::::::S:::::::::Y::D::A::::::::::::L::::::::G: hla1220 :::::E::::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2879 :::::E:::::::M::::::AE:::::::::::Q::::::::::::::::::::::G::: Hbo2645 :::::::::::::M:::::::Q::::::::::::::::M::I::::::::::::V:::G: consensus DALARADASTLAVIGSGAQARGQLRATATVRDLETVEVYSPTAESRESFAAEMDDRLDAS #oth 11..141.322.22..1...11.1311.1..111314.1...311.21..312134.113 NP3802A :::::E::T:C::::::::::::::::::::EF:::Q:F:::L:::Q:::D:F::::A:A Hmu1074 :E::PPR:DD::LF:::::::A::K:A:A::E::R::::::::D::M::::::NEQ:::T rrnAC0038 :::::R:::D::I::::::::::V::::::::FDRI:::::::DN::::::::N:A::PT VNG1364 :E:::::::E::::::S:::H::VQ::::::::D:IH:::::P::::::::DL:AD:::: hla1220 ::::::::TEI:::::::::::::AT::::::F:A:R:F:::::N::A::E:F::::::D HVO_2879 N::::D::::::L::::::::::::TA:A::::DS:W:::::K:::::::G:::RT:::: Hbo2645 :::::D::E:::IV::::::::::::::A:::::::W:::::K:::::::G:::R::::: consensus VAAVASSAAAIEGADIVITATNASEPVFDGDDLEPGTHVTAMGQYHPEKRELDATTIERA #oth .1..2.212.22...1.1...3.12..11224122.1........223.2.1132211.1 NP3802A :S::P:A:D:LD:::V:::::R::T:::EDA::PD:A::::::::DRG:Y::PPE:VA:S Hmu1074 ::::::PS:::::::::V::::::::::::SE:::::::::::::::::::V:::::::: rrnAC0038 ::::::P::::::::V:::::S:::::::::L:::::::::::::::::N:::::::::: VNG1364 :S::E:::::VT:::::::::S:::::::S:N:DA::::::::::::::::::TAA:::: hla1220 :S::::ASE:LD:::V:::::T:::::I:DA:V::::::::::::::K:N::PPEL:A:: HVO_2879 ::::::::::V::::::V:::T:TD::::::L:D:::::::::::::::::::E:::::: Hbo2645 :::::::::::::::::::::::::::::::R:::::::::::::ATD:::::::::::: consensus TYVPDLRERATQDAGSFLAAVDAGVVDEDHVHAELGEVVAGEAAGRTSDEEITVFDSGGT #oth 1..1.113.222...1.12.321.11.2..13.1..111..424..214111.1...... NP3802A ::::::HD::F::::A::::R:::L::D::IR:D::DI::::::::::::A::::::::: Hmu1074 :::T:::::VAN:::A:IH::EE::::::::::::::I:::T:Q::::ED:::L:::::: rrnAC0038 :::::::::V:::::::IN:L:::::::::::::::DI:::N:S::Q:P::::::::::: VNG1364 :::::::G:T:::::::I:::::::::S::I:::::D::::T:P::Q:AD:::::::::: hla1220 :::::I:A::A:::::::::IE::LI:::::A:D::::::::HP:::::D:V:::::::: HVO_2879 :::::::::::M:::::::::E::::::::I::::::::::V::::EDR::::::::::: Hbo2645 K::::::D:V::::::::H:LAE::::::::Y::::::I::KVE::ED:::::::::::: consensus GIETVAAAHMLYERAREDGLGEEIDFAPASEALTGR #oth 11....1141.111.52411.3211.1.1.11.1.4 NP3802A :V::::::W::::K:::A::::R:E:::G::::::E Hmu1074 A:::::::Q::L:::::R::::::E::::::::::: rrnAC0038 A::::::G:::::::KA::R::::::::::K::::: VNG1364 ::::::::N::::::V:QD::S:L:::::::::Y:E hla1220 ::::::::::::K::S:::R:QT::::::::::::K HVO_2879 :::::::::::::K:H:E:::TT:::S::::S:::Q Hbo2645 ::::::G:YL:::K:QSE:::TT::::::::::::A