|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 5509 | NP1722A | Hut1053 | pNG7017 | VNG6379 | hla0626 | HVO_1692 | Hbo3144 |
3644 | NP1722A | 5482 | 3148 | 3299 | 3367 | 3340 | 3365 | 3260 |
4135 | Hut1053 | 3148 | 5592 | 3600 | 3646 | 3666 | 3782 | 3707 |
4331 | pNG7017 | 3299 | 3600 | 5499 | 3838 | 3857 | 4045 | 4009 |
4637 | VNG6379 | 3367 | 3646 | 3838 | 5530 | 5045 | 3938 | 4002 |
4632 | hla0626 | 3340 | 3666 | 3857 | 5045 | 5526 | 3950 | 3932 |
4643 | HVO_1692 | 3365 | 3782 | 4045 | 3938 | 3950 | 5545 | 4667 |
4586 | Hbo3144 | 3260 | 3707 | 4009 | 4002 | 3932 | 4667 | 5495 |
752 symbols consensus -------------SRRAKAARIRQLMETEGDAIGENTQGFNEGRYESVADLDDYEGLKDE #oth 11111111123454244314411331321.111411.221.41112123511..24.142 NP1722A ::::::::::::M:::DR:E::::V:AED::::::::RTV:QLSGYAIDQF::::Q:REQ Hut1053 MSGKTSKRDATGT:K:::::K::EI::Q::A::ET::::::D:::::::R:E::Q::::: pNG7017 :::::::::::::--M:T:DE::E::R:::A::A:::::::T:::D::G::E:::D::RA VNG6379 :::::::::MSADT::Q::E:::H:LD:::::VH::::V::::::::T:N::::DE::N: hla0626 :::::::::MSVEN:KR::RH::H:LD::::SVH::::V::::::::T:::::::A:::: HVO_1692 ::::::::::MSKA:E::::K:::::::::::V:TS:R::::::::::QS::::::::S: Hbo3144 :::::::::::::------------::::::::NTS:S:::R::::::QT::::::::S: consensus ARAIKEDAIERLPELIDQLREAVEANGGTVYIADDAADANRYIREVVDDRDADRVVKSKS #oth ..4..11..12...111111221.3...21.2.1.1.1..2.223.3232322211.... NP1722A ::Q::AE:::T:::R:EEV:A:::::::E::V::::::::D::ET:LEM:::::I::::: Hut1053 :::::::::D::::::EE::DS::E::::::L:E:E:E::E::ES::A:A:GEL:A:::: pNG7017 ::G:::::::E::::L:::T:T::::::::::::::::::E:::D:A:E:A::::::::: VNG6379 ::::::::::::::::::VT::::::::S::V::::::::::ME::::G::---:::::: hla0626 ::E::::::::::::::EVT::I:D::::::::::::::::::SD:::G:N---:::::: HVO_1692 :::::::::::::::::::::T::S::::L::::::::::::V:::CE:KE:E::::::: Hbo3144 ::N::::::::::::::::::T:::::::L:L::::::::::V:::CEEKE::::::::: consensus MTSEEIEVNEALEAAGVDVVETDLGEWVLQVADEAPSHIVAPAIHKSREEIAALFNERFD #oth ..1..111.15.114151.2....1.1.1.1.1.1...111..1.1.113..4..11311 NP1722A ::T::LSL::R:A:G:FE:T::::::F:I:::::S:::LIG::M:R:ADD::::::D:L: Hut1053 ::T::L::::H:::::::::::::::::::::E:::::L:::::::::D:::R::E:::: pNG7017 ::::::::::::::D:::::::::::::::I::::::::::::::::::S::E::::Q:: VNG6379 ::::::::::S:::R:G::W::::A:F:::::::::::::::::::::::::T::::V:: hla0626 :::::L:::D::::S:A::W::::A:F:::I::::::::::::::::::::::::::V:E HVO_1692 ::::::::::D::::DI:::::::::::::::::S:::::::::::::DA::D::::T:E Hbo3144 ::::::::::E::G::M:::::::::::::::::S::::::::::::::A::D::::::: consensus PDEPLE-TAEELTRFAREQLGELIEDADVGMTGANFITADTGTLALVTSEGNARKTVVAT #oth .21..111121..4...231124.43.11.1.....22111..21...1......21231 NP1722A :A:::AGDPH:::A:::DVV::H:RA::A:I:::::VVSE::::C:::N:::::::A:TP Hut1053 ::V:::::::D::N::::::ADD:AN::::::::::L:::S::M:::::::::::::AS: pNG7017 :::::::::A:::H::::K:::Q:I::E::I::::::A:::::M:::::::::::::A:: VNG6379 :E::::::::::::::::Y:::K:L::E::::::::V::::::::::::::::::C:Q:: hla0626 :::::::::::::::::GY:::K:L::E::::::::V::::::::::::::::::C:QS: HVO_1692 :::::::::::::M:::::::D:::G:::::::::::::::::M::::::::::::A:VP Hbo3144 :E:::::::::::M:::::::A:::::::::::::::::::::I:::::::::::SA:VP consensus DTHVAVAGVEKVVPSVEDLQPFVELIGRSGTGQDITSYVSLLTPPVDSPTVDFDDDET-- #oth 2..........21.1.1..2..1...111...1.....2..2...312.212.3432311 NP1722A P::::::::::L::::S:::::::::A:T:::::::::L::V::::ET:A:::ET::Y:: Hut1053 E::::::::::I::::::::::::::::::::H::::::::::::I:A::--::G:AF:: pNG7017 ::::::::::::I:T::::H::I::::::::::::::::::::::::T:V:::T::::PL VNG6379 :::::::::::L:::::::::::::::::::::::::::::F:::S::::--:GGN:L:: hla0626 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::F:::G::::--:GET:L:: HVO_1692 ::::::::::::I:T::::R:::::::K::::::::::I:::::::E:::::::APD:PL Hbo3144 ::::::::::::I:T::::H:::::::K::::::::::I:::::::E::::E:::PD:PL consensus -ESEDDRDFHLVLIDNGRMEMREDDQLRETLYCIRCSACSNSCANFQHVGGHAFGGETYS #oth 12442..2.....2....22..2.11.1........1..1.1.....2...........1 NP1722A :VPA:::T:::::L::::L:::N:E:::::::::::G::::::::::S:::::::::::T Hut1053 :GDP:::E:::::V:::::A::D:ED:E:::::::::::A:::::::Q:::::::::::T pNG7017 S:FDS:::::::::::::L:::D:E::::::::::::::::::::::S:::::::::::: VNG6379 :::G:::E:::::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::: hla0626 :::G:::E:::::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::: HVO_1692 S:T:T:::::::::::::FD:::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::: Hbo3144 S:T:T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus GGIATGWEAGVEGLDSAAEFNDLCTGCSRCVNACPVEIDIPWINTVVRDRINRGKD-GDL #oth ...1......13.212.111.......1..122...3.............2..1321342 NP1722A :::G:::::::Y:::::::M:::::::::::EK:::K:::::::::::::L:::AEPETF Hut1053 ::::::::::IG:EE::E::::::::::::TE::::G:::::::::::::L:::D:P:AF pNG7017 ::::::::::I::::V:EK::::::::T::::::::G::::::::::::::::D:E:APG VNG6379 :::::::::::H:E::::::::::::::::::Q:::N::::::::::::::::::::::: hla0626 :::::::::::H:Q::::::::::::::::::Q:::K::::::::::::::::::::::: HVO_1692 :::G::::::::::::::::::::::::::TT::::::::::::::::::V:::EV:SE: Hbo3144 :::G:::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::E: consensus DWLVEGLTPDEEPGGVDLQKRFFGNFETLAKLGSAFAPLSNWAADTGPARSLLERTLGVD #oth 13..3.....2.12.221...1...1212.12..321111.12.42322.5221132.1. NP1722A :P::A:::::S::A:L:I:::L:::V:R::AV::LAPG:A:TL:::Q:V:R::::VA:I: Hut1053 :H::S:::::P::A:L::::::::::A:V:::::::::::::::ELP:S:WIA:KL:::: pNG7017 E:::D:::::::DD:AP:::::::::::V::::::T::V:::L:::TL::QTMS:V::I: VNG6379 :F:::::::::::::::::::L::::D:::::::::::::::::R::::::::::::::: hla0626 :F:::::::::::::::::::L::::D:::::::T:::::::V:QA::::::M::::::: HVO_1692 ::::::::::::::::S:::::::::::A::V::F:::V:::::GL:VS:D:M::F::I: Hbo3144 ::::::::::::::::::::::::::::A::F::::::::::V::::V::T:::K:I::: consensus SRRELPEFERETLVDWFEDRDPRV----DDPRRRVVLYPDAYTNYVQVERGKAAVRALEA #oth 4..11.313111.32.143.424211132314.411111.4...1233...111..2..1 NP1722A Q::D::TLAD::::E:AA::PTD-::::::AD:KA:V:::M::::FEP:::QQ:::L::: Hut1053 R:::M:K:T:G::RK:AKG:E:PA::::-::D:E:::LA:T::::MH::::::T:::::: pNG7017 P::D::A:::::::::AG:::SQ:::::TN:E::A:::::L:::H:::::::::::V::S VNG6379 :::::::::::S::E:::K:G:::::GR:EA::Q:A::::::::::RT::::::::V::: hla0626 ::::::A::::S::E::D::G:::::GP:EA::Q:A::::::::::RT::::::::V::: HVO_1692 A:::::::Q::::K::::S:TS:::::::::V:TA:::::V:::H::::::::::::::: Hbo3144 ::::::::Q::::C::::S::SA:ASGG:K:S::::::::V:::H::I:::::::::::: consensus LGVDVVVPDVGESGRAPLSQGMVATAQSHAEAVYDALAPHIDAGRDIVVIEPSDLAMFHR #oth .124.4113141....1.....11..423.4213331312212.2.1.11....2..142 NP1722A :::A:S::S:P::::::::::::S::D:A:SD::A:::E:::::::::::::::I::::N Hut1053 ::TE:HIA::S:::::A:::::I:::REQ::::A:S:D::L:::::::MV:::::::LRN pNG7017 ::::::::PAPS::::::::::::::TD:::R:TK::E:::AD:::V:::::::H:::T: VNG6379 :DIR:D::PA:::::::::::::S::::N:N:::::I::A:A::H:V::::::::::::: hla0626 :D:H:E::AA::::::::::::::::::N::::::::::AVA::H:V::::::::::::: HVO_1692 ::::::::::RS::::::::::I:::ED::HD::AG::E:::D:::::::::::::::QS Hbo3144 :::E::::::AS::::::::::IS::E:::RRLFSD:S:YL:E:Y:::::::::::::D: consensus EYERLLPEDSFERLAENSYEVMEYVYGLLENGADADALPA---GGGEEIAYHSHCQQRTL #oth 1.111.234334213331..12..111.2111.2412.441112423411.......... NP1722A ::G::::DRAA::::GS:::LF::L:E:TDG::ELG::E::::ATDGSVV:::::::::: Hut1053 D:::::DTET:D:I:T:::::L::::::V:::::MG::AD::::H::::::::::::::: pNG7017 ::::::D:S::TDI:A:::::F:::F:::D:::SV:S:ST:::VT:A::::::::::::: VNG6379 :::::::::DYAA:Q:H:::L:::::::::::::I:V::G:::::D:R:::::::::::: hla0626 :::::::::DY:A:DGH:::::::::::::::::I::::E::::D::Q:::::::::::: HVO_1692 :::KF:::K::::IS:A::::::::F:::D::::::::S:::::A::::::::::::::: Hbo3144 :::KF:APE:QR::S::A:::::::F:::::D::::::TGPQS::KSGV::::::::::: consensus GLEAHTEAVLEDLGYDVATSDVECCGMAGSFGYKSEYYELSVDVGDRLRDQFTTDETADR #oth 1.222.112.233.1.13.11...........1.22..11.11..24.141232323411 NP1722A ::A:Q:::L::AV::::S:T::::::::::::::Q::::::M:::E:::ESRPEGDH--- Hut1053 ::D:::::I:DR::F:L:::K:::::::::::F:QQ::DV:MA:::D::E::::P::E:: pNG7017 ::::::V::::EC::::V:::::::::::::::::D:::::M:::::::T:LED:GVQ:: VNG6379 D::PY:V:::::C:F::T:::::::::::::::::::::::::::ET:V:::::ED:::: hla0626 :::P::V:::::A:F::T:::::::::::::::::::::::::::ES:V:::::E::::: HVO_1692 :::G::::::S::::::::::::::::::::::::::::::::::SE::G::Q:::NR:: Hbo3144 ::AGY::S:::R:::::V::::::::::::::::T:::D:::::::E::S::Q:P::R:: consensus TVVASGTSCLEQLDALLERRPAHPVRLLAPQ- #oth 21.......21.122.131335..13.22253 NP1722A -L:::::::C:::S::EGE::P:::T::STDS Hut1053 :::::::::HD::TD::::KVT::IE:I::AE pNG7017 P:::::::::::I::::::Q:R::IE:::T-: VNG6379 :::::::::::::::::T::::::::::DT:: hla0626 :::::::::::::::::S::::::::::DG:: HVO_1692 ::::::::::::::S::S:PTQ::IQ:V::RR Hbo3144 ::::::::::::::S::T:PSK:::Q:V::K: