| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4819 | NP3922A | Hut0621 | HVO_0892 | Hbo0647 | NP3916A | hla1550 | pNG7150 | Hmu0304 |
| 2616 | NP3922A | 5086 | 1885 | 1621 | 1629 | 1913 | 1825 | 1987 | 2027 |
| 2863 | Hut0621 | 1885 | 4777 | 2180 | 2157 | 1760 | 1832 | 1984 | 2028 |
| 2961 | HVO_0892 | 1621 | 2180 | 4808 | 2871 | 1847 | 1832 | 1880 | 1844 |
| 2843 | Hbo0647 | 1629 | 2157 | 2871 | 4952 | 1659 | 1819 | 1893 | 1857 |
| 2627 | NP3916A | 1913 | 1760 | 1847 | 1659 | 4723 | 1838 | 2006 | 1894 |
| 2801 | hla1550 | 1825 | 1832 | 1832 | 1819 | 1838 | 5336 | 1998 | 2264 |
| 2910 | pNG7150 | 1987 | 1984 | 1880 | 1893 | 2006 | 1998 | 4819 | 3001 |
| 3075 | Hmu0304 | 2027 | 2028 | 1844 | 1857 | 1894 | 2264 | 3001 | 4811 |
731 symbols consensus MRLLLPTG-----TRW-VAAAVAVVAVAASASFAADPGSA-APEPVAFDDTVTTGLTGED #oth 14655353111115232233332143235332.32334232433.241231165.22423 NP3922A ::QTYAV::::::---:::L::::::::LGGL:V::F::::T:::AD::E:::V::AL:: Hut0621 ::VT:---:::::---::L:GL:::LAG::LA::::::ASASA:::P:S::L::::A:V: HVO_0892 :A::T:ET:::::::::::::T:L:F:L::V::VV-:A:G:SVS::::::::K::G:SV: Hbo0647 :A::T:AE::::::::::VGV:::ILLL::V::VLT:V:GEQLQ::NYE:::DM:G::V: NP3916A :N------:::::I:VA::VVCCLL:LGGG:::FVS:ADS:::G:TE::R::AI:::L:E hla1550 VTRFD:Y:DLPRAL:IALV:LLL:A:::TAGA:::::EAT:::S:A:Y::V:EL::SS:T pNG7150 ::PA:T:-:::::VQVFALL:::LSTLVFA::::V:TT:::R:::::::N::QR:V:AA: Hmu0304 :ITSEA:::::::WQ:FAI:L:::A::VVT:A:T::A::::R:::::Y:E::GV:::M:A consensus ERRAEAEG---AELPRAQVFYSQYRYVVGYYGVGTAAAALDDPATERQFGYPLAVYVSDY #oth 43533352111552.131.21.322.21..512432143245354321..3.32321212 NP3922A :F:L:DKEDINVA:::V:::::::P:A::::::::FVETQRQ::H:QR::::TVT::T:: Hut0621 VQQ:Y:A::::H:I::VE::::H:Q::::::::AS:VT:V:REE:T::::R:IGI::::: HVO_0892 V:T::V:::::F:V:L:::HF:R::::I:::D:R::::DVST:ESA::::D::::F:T:: Hbo0647 L::::::::::FV:::SE::F:G:::::::G::D:::SE:A::S:R::::R::::::::F NP3916A Q:GV-:DE:::QF::::::A::::P:I:::R:L::::NDV::SLVRQ:::::Q::HIETV hla1550 DALM-:GS::::RV::T::::::LQ:::::N::ESF::T:::GR::::::::I:A::ETF pNG7150 :QI:RNRS:::ISI::::::::::::::::V:I:Q:VT::TE:GH:Q::::::::::::: Hmu0304 :QI:R:::::::SV:::E:::::F::::::P:IDRLVS:::A::RAS:::F::::::::: consensus SGASPDLDDDGSLVAESAPA-GWTPADEAHFVVGSGARTPSGPAVVPFSDRADAEAFAAA #oth 4254243434.53443673531.14.431411.223.12.211331..32131.431244 NP3922A A:HDIE:TER:EP:I:DRLVT::V:::S:VY::::E:E::G:E::L:::::D::A:Y:DE Hut0621 :::G:R:T:E:Y:TVT:D::V:::R:S::S::::::::::GS::::::::A:::SD::ER HVO_0892 ATV:::::G::Y:RT:HNRNP:::K:S::S:::D::::V::::IA:::::A:A:RS::D: Hbo0647 :TI::T:SE::FV:P:QGR:V:::A:ES:::::::E::V::::::L:::K:Q::TQ:::: NP3916A PD-DV:I::::A:::AGFGR:-::::::TF:A:NT::E:::::TP:::A::::::::VTE hla1550 D::R:GTIET:LFA::::GE:-::::A::TY::::D::S:A:ET::::RE:GA::::::D pNG7150 :DRPVRCG:::::RTATP:D:-:VE:NQ::Y::DGS::V:::::::::A::D::A::TET Hmu0304 G:V:V:CSAG:::S:SAT:E:-::::ET::Y::D:D::S:A::VI:::E::::::::TGD consensus HGGEVVDWETLRDRSFD-LDD-AAAVRERVDDRAAWADETVAAARELLDRPVSVVVGEDA #oth 3..4222.5235423431455222332452662544.132243244231..1122..4.2 NP3922A ::::::::::IL::::::I:::::T::D::::Q:RA::A::TNRTA::::::ET:::::E Hut0621 Y::A:RE:GA:EP:EDEP---R:SWL::AAS::K::::R::QDR:P:::::::IT::G:V HVO_0892 ::::::::A:::::AG:P:SSRL::FESS:AAHHE::NG:T::SDA:F:::::T:::::: Hbo0647 N::D::::K::QS:VG:P:QNRL:RFEREETT:RT::N::::T:D:R::::R:::::::: NP3916A ::::IRT:DDRATFAAS:DPG:GE:AK::::RQQRL:::N:S::M:::::::EI:::D:E hla1550 :::RA:::::V:S:::::T:S:::T::AMAPE:W:G::GRI:::ERRA:::::::::::: pNG7150 C::QII:::::KTY:::::KQ:::::::Q:GP:RSG::A::Q:::QHRN:::::E::T:: Hmu0304 C::R::::Q:V:A:EPT:T::P:::::AQ:EQ::SR:::R:G::::RR:::::::::R:V consensus PTVQAAIDAAPANTTVRVPPGTYD-GNVTVDRPVTLRGEG--ARLVGDGNGTVVTVRADR #oth 1.231.131..12.1151.21.151251422312124.23331524.12111.3223.23 NP3922A ::L::::::::PE:::H:::::::::P:E::A:I:V:::A:::SVH::::::::::S:SD Hut0621 ::LA:::E:::P:::::L:::::::::::IGK:L:VQ:A:ERTHV:::-::::LR:T:P: HVO_0892 :::E::VT::::::::Y::A:::SVDA:DLN:S:::::A:RDT::::::::S::HL:::: Hbo0647 :::A::VE::::::::FL:A:::RVDS:V:N:S::IA:A:PQTVIR:::::::FHL:::G NP3916A ::L:D:::::::G:AIEL::::::::P:EI::::::V::N:::TV:::D:S::I:IE::E hla1550 ::IE::VA::::::::V::::::E:ETL::NES::IA::D:::QIS:::D:S:I::::PD pNG7150 ::::::V::::P::::V::A:::N:EQ:MI:K:LS:S:P::::T:D:G::::::::T::: Hmu0304 A::R::::R::P:::I:::TA:TV:::::::K::::::::::T::D:G:D:::LR:T::: consensus VAVTGLAIAGVGNVTTRDPEAANES--------------D----WDARVELAYGYGDAGI #oth 211421414.2.45441645554331111222222224232222..352343.151..11 NP3922A A::S::N:S:::TG:PGPTVTGAHAHGVSEGGGHDHGAD:EDST:::GI:DD:AV::::: Hut0621 :GLAD:S:S:::KSN:GT:AN:S:T::::::::::::AD:::::::ESIRTT:::::::V HVO_0892 S::GN:::::::G:G::RVR:T:::::::::::::::V::::::::T:::::::R::::V Hbo0647 A:::D:R:T:::D:GS:GFDRR::T::::::::::::L:N::::::TT:Q::::::::A: NP3916A :::S::S:::I:D-SL:AD:VDA:G::::::::::::::-::::::R:T:E::::S:::: hla1550 ::L::::VD:S:G-Q:::::::R:G::::RADDGGVNGS:DGEV::TNIQ:G::H::::: pNG7150 :G:::FE:T:I::T:VG::TQS:D:::::::::::::::A:::::::T:TT:::NS::AV Hmu0304 :G:V:FE:V::::A:VGE:TN:DS:::::::::::::::-:::::::P:RRG::QS::AV consensus VADGANRLLVADVTIETPASGVILRDSPGAVVRNVTVDGADDWQDGFMGVVAMGSRIVVQ #oth 345424344143232311.1.423153433.1322213.223332.1..33213315112 NP3922A AVNVSEDA:I::TE:R:::A:I:::NA::T:::::S:V:NESF:Q:H::L:::R:PG:FE Hut0621 :F:::::S::SR:::Q:::::A:V:::D:V::E:LSI::TA:::::::::L::D:::::: HVO_0892 :L::::ESA:RG:E:D:::::I:A:E:ADS::DG:::R:::EPS:::::::LI:E:A::: Hbo0647 :L:D:D:GV::::::D:::::::V:H:NES:L::L::N:::TASE::::AILI:A:S::E NP3916A TVAE:D:I::EG:DM:::::::VF:::AES::A:SS::::EE:A:::::::::R:PL::: hla1550 R:I::PG:V:D:::V:AN:::LL::EGSH::::DLR:::::S:::::::IAG::::VT:T pNG7150 TGRN:SG:Y::NI:V:::::::V::RT:::::E::::N:TA:::::::::IG:HRP:::: Hmu0304 A:TNVSG:F::N:SV::::::FV:VGT:::::E::::::T:::R:::::::G:DEP:::: consensus DSTFTDGRDGVYTHRADGSVVRDNRFTDNRFGVHLMYTSDALVADNVARDQQIAGIVVMT #oth 3.2.53.1.11.1.1.1.422.2151432.211.3.11133.221.43234563.131.. NP3922A N:::AR:L::::::::::A:I:::EM:G::M:::T:FS:GV:L:::TIT:::S:::Y::: Hut0621 H::::G:::A::::H:::L::::::M:GM::A::E::::ET:::N:T:::TD:-:::::: HVO_0892 ::::I::::::::::::::::::::ME:G:Y:::Q::::E:::::::V:GDR:-:V:L:: Hbo0647 E:::Y:::::::::::::::::E:Q:APG:Y:::E::::ET::T:::V::A:M-::I::: NP3916A :::::E::::::::::E:VT::::H:VEG::::::::::::::DN:C:VS:ELS:V:::: hla1550 ::A:EG::::I:L:::::::::NST:::::Y:T:::::G:::I:::AF:NELFG::T::: pNG7150 ::V:NG::::::L:::::TA::N:A:R::::::::::::RS::::::::G:EY::V:::: Hmu0304 H:::::::::::L:::::T:L:N:T:RG::::T:::::::::I:::QV:::SH::::::: consensus RPSGNAIVGNDVRDSDFGIMPAGSDSYVADNVLVGNEYGLSTSADRSLYEHNVLAGNEVG #oth 4.5413122.3125265.2652.2221315.13131331232424323234.1332.43. NP3922A G:QR:G::::EIS:TPM::NIG:T:T::::::::E:DL:FRLE:TA:II:R::V:D:RD: Hut0621 ::RS:V:IE:R:SA::V::SVG::S:LA:N:T::A:R::MDLG:Q::TFA::::V::::: HVO_0892 ::V::LV::::::E::::F::::::T::::::FA::D::MDV:G::QV:VG::V:::G:: Hbo0647 ::TN:L::::E::::E:::V:::G:::Y:E::V:::::::QVAG::NTFAA::VV::D:: NP3916A S:A:T::TN:V:V:TAQ:VPTS:::A:IGG::IADT:QA:::::RN:::TE:TIV::::: hla1550 :::::::::::::N:SA:VQAS:TRT::GY:T:::::L:F:::SRG::::R::A:N::L: pNG7150 N:VA:::::::::H:GS:::L:::R::I:H::V:DTTQAM::N:::::::::::Y::DI: Hmu0304 D::::::::::::RARS::LT:::R:::GH::V::T:R::::N:G:::::::::SD:A:: consensus VRASTIVPSNRVVRNDFVANDRHVTSGLGPLRVWTHDGRGNYWEGAPGLDAG-DGVLDRA #oth 3224232.114114..322.22225345.12.2123323..1.23143436243543313 NP3922A AE:WSLL:T:::TH::::G:E::I:VSS::::::::::::::::::V:PTD::-T:IE:P Hut0621 L:TG::::T:::TD::L:D:::Y:DT:R::V::::----::H:GTL::R:TDA::RI::: HVO_0892 ::G:STF:T:V:::::I:D::VR:E:S:::M:T::AG:E::::GDL:LE::DA:::Y::: Hbo0647 L::TD:L:::W:::::V:::A:R:A:N:::::T:::H:V::::GAL:LP::DG:::Y::: NP3916A M:::SVF:TST::::::AD:::::RATT::::::SDGDE:::::::A:----:---:::R hla1550 A::T:V:::S:I:A::::G:AD:A:A:A:A::::ADGD::::::::---NV:VHEPGE:: pNG7150 :::::V::::I:TD:::I:::::AI::P:::::Y:::::::::S::YD:TG:TGP::AQS Hmu0304 :T:A:::::::::E:::::::::A::RP::M:IY:::::::::S::YD::E::GQA:S:P consensus YRPTGPVDARLHRSDAAVALAEAPAVRALRRLRGTVPGLRSASIVDTAPRTEPANPERVA #oth 13.122..341122211521241.2344.25322321.3.45311.411234.3414434 NP3922A :T:::E::SL::Q::G:P:::Q:::TD::AGFE:SM::M:ANE::::::LCS:::EAWFE Hut0621 F:::::::SVVG:::G:AT::TS:::TM::QFQAA:::::::NVI:DE:::D:VH:D::: HVO_0892 :Q:S:::::E:G:EPG:L::S:S::M:::::A:DA:S:::GSGV::A::::::VR::TL: Hbo0647 :Q:S:S:::::GETPGTTT::QS::AAT:::V:DV:S:::QTGV::::A::R:FD::A:V NP3916A :T::D:::E::::T:::RT:SD::V::G::T:::S:::M:GE:V::A:::SH:V:ET:IE hla1550 ::::A::::A:::EV::::VR:S:::AL:D::::::::A::G::I:P::AA::YS:D:ID pNG7150 :S::DS::R:::QT::::V:RA::S::G::A::::T::F:RG::::R::LAD:::::T:R Hmu0304 :S::DS::R:::::::::V:S:::S:H:::S::::T::F::::::::::L::::::RLL: consensus AARNA-------------------------------ETTDGGASP--------------- #oth 426344432211111111111111111332221212443542543211111111111111 NP3922A QNDRTNLQPV:::::::::::::::::CR:::::::ADSET:TH:NP::::::::::::: Hut0621 ::Q:::::::::::::::::::::::::::::::::TAAGA:V::::::::::::::::: HVO_0892 :LNAT::::::::::::::::::::::::::::::::E::D----::::::::::::::: Hbo0647 E:M::TETTN:::::::::::::::::STVIDAADTSQQT::::A::::::::::::::: NP3916A T::ALADGT:::::::::::::::::::::::::::A:AEEVCGV::::::::::::::: hla1550 ::LDPDAGPVRADWRAELGDGSGESDEDAAMNAHDRNA:S::IG:RPQRSDRTTVPTVEG pNG7150 RL::-:::::::::::::::::::::::::::::::::SME::A-::::::::::::::: Hmu0304 T:T:-:::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::: consensus ----------- #oth 11111111111 NP3922A ::::::::::: Hut0621 ::::::::::: HVO_0892 ::::::::::: Hbo0647 ::::::::::: NP3916A ::::::::::: hla1550 ATASIRGVSDA pNG7150 ::::::::::: Hmu0304 :::::::::::