| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1503 | hla1733 | HVO_A0601 | HVO_A0549 | Hut0620 | Hbo0646 | NP3934A | pNG7145 | Hmu0308 |
| 783 | hla1733 | 7277 | 496 | 527 | 496 | 460 | 532 | 684 | 602 |
| 859 | HVO_A0601 | 496 | 1593 | 571 | 663 | 610 | 556 | 547 | 508 |
| 973 | HVO_A0549 | 527 | 571 | 1551 | 728 | 676 | 618 | 687 | 630 |
| 917 | Hut0620 | 496 | 663 | 728 | 1713 | 786 | 592 | 666 | 607 |
| 842 | Hbo0646 | 460 | 610 | 676 | 786 | 1588 | 549 | 601 | 512 |
| 892 | NP3934A | 532 | 556 | 618 | 592 | 549 | 1550 | 665 | 572 |
| 961 | pNG7145 | 684 | 547 | 687 | 666 | 601 | 665 | 1545 | 790 |
| 862 | Hmu0308 | 602 | 508 | 630 | 607 | 512 | 572 | 790 | 1399 |
967 symbols consensus -----------MC--SPHDDG--GSL---------------------------------- #oth 111122221123433545463114231122222122221221222212221111111111 hla1733 VTSDRAATVSSGIADT:NRG:::R::DSRHRRPVRSLRSRPDTPARRVPIVCVHCCVLVA HVO_A0601 ::::::::::::HHD::PR::ST::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::--::CD::RTV:::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 ::::::::::::VDSEQ:GV:::::WDSASGGRVGDVDSHCDGGGVRHGC:::::::::: Hbo0646 :::::::::::::DQR:A:::::NTF:::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::--::MSP:QS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 ::::MNHLVSFSVAS:MSEHA::TG::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::--::----MD::AT::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 LSATVAQFGAPVGTDRSRVRVERGVDPVRRVRLRRRRRIDDAPRARPGNGPPESVEEGDR HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 GRLAHGDRGDLAVEGSVDRGGRAVRSLAGLVDPDVCPLPVVPAVAVGPDPERARPGGRVV HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 RVADEVVRDDPARRDDRGRSCAQLVVRGHVALVQRPARAGREAEFVADERVVPDVRPGTR HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 RLHPRAGVPHVVADDRVARGTGHHRDPAEQLVAERVVGDQRVARVHEVRPVPIVGERGVP HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 DDRAVGTVEVDPVAAALERAVGHRHSRPHPRDSHEAVLPAIRPVDSEVADDRVRALPEEQ HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 PARVRLDRHVVDDESRCADRADPGIAVTVAELDVGVPHLAVVRTVDPTVVCATLARRLRI HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 AGLSSAPVDRESGERHVRRPHRDHRPVAVTADLCVFTGDRDRLVHRQSLLVGPRRDDDGR HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 VRRRGRDRRLDRRRVLPDDDRDRSVGAALGGRDPAVCSGPALGGHRAHRRRGVRIERPAS HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 DRLPVDRSSAVVGGERLGGTPFAERDDRLARRAPGVAPDDVGRLRRRRPLAGGLGCEQPG HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 LDRPRSGAVERLDVGGDRVAELAFGSTVVQRRRERFDAVVPDDVLELRVEDLRPRHPRRP HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla1733 RHQRVRFRGEPEFDHVVVGGRRGRGRLGVGGERPGRRDGGNEEERDERDSERARQVAVGI HVO_A0601 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0549 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0620 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0646 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7145 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------SRRRVLAAVGAG #oth 1111111111111111111111111111111111111111111111113..531534344 hla1733 ETRHGGPSIAEGLADLVRSSNRRLNRSRGPKTVVFEYPLMTETEPLSV::::L::G:::: HVO_A0601 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::AATK::SL: HVO_A0549 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::T::S:::VA Hut0620 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::S:AATS Hbo0646 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R::HF:L:SAGV NP3934A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::VSAV:: pNG7145 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::CF::GT:TV Hmu0308 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::EL:---::T consensus GVAALAGCLGG----------DTPDPVSLDGGQACDQCGMVIDQHPGPVGQIFYRDNAP- #oth 243241..123643312111144121.315335611411.3.5322..4114214135.1 hla1733 LSL:A:::::DES::::::::ASIT::::::ER:::::::I:AD::::::::HFE:DE:: HVO_A0601 AL:::::::::GSNAG:::::P::E::D:S::KED::G::::GL:A::N::::::::::: HVO_A0549 ::::T::::::LGTDGGG::::A:EA:A:T::EQ::A:::::::::::A::L::A:HS:: Hut0620 ::LSM::::S:::::::::::P:::::T:GSDDV::V:::I:P:::::TTEV:::N:D:: Hbo0646 :A:S:::::::NEGGGDGGQTTA:TA:TIPE:ST:EV:::N:R:N:::ITE:::Q:KQ:: NP3934A :IG:V::::D:DR:::::::::G:::::::D:::::T:D:L:EM:::::::A::G:D::R pNG7145 A:VS:S::::NS:::::::::EEI::::IES::N:::::::::::::::::TY:Q::T:: Hmu0308 ALGL::::QSQ::::::::::T::E::T:::TES::H:::::G:QS::::ETY:E::S:: consensus ----EGHDNPARFCSATCT-YQYRFEREDRGWTPAAFYLTDYSTVDYELRTDGGDTFISA #oth 111141213122.21432211425135223.22434512....21123333231414213 hla1733 ::::::-GR:GQ:::S:::::T:::DA::A:R:VR:AF:::::L::Q:VFQE:S::MF:S HVO_A0601 :::::::::::W:HTLSMGLFP:Y::HRE:::EAT:V:V::::::::::S:E:::::::T HVO_A0549 ::::::::::::::::WE::FS:ALD:::D::NR:GG::::::::E:D:FD:::Q::::: Hut0620 ::::S::::::::D:TWEA:F::D:::R:::::R::::V::::S::::I:::A:T::::T Hbo0646 ::::N::::::::D:VWEA::::E::KD:A:::DV:::V::::S:E:RTFEE:::::::S NP3934A SLPDDRD:GA:W:::S::A:::FIL:E:E::HE::IS:G::::::::T::D:N:V:V::: pNG7145 ::::::::P::::::T:::::RH::AK:QS:::::ETF::::::T:::I:::::K:I::R Hmu0308 ::::A:::P:T:::::V::::RH::QT:Q:::::TVT::::::S::G:VGETD:TALLTR consensus HLEADAFAPATDLTYVVGSDVEGAMGPDLIPFSDADDAEAFAEEHGGQTAAADDVTRELI #oth 242231.32453212.142214.2..43213.1344.122.23121.4345331221352 hla1733 :V:RE::SRMI:::V:AR:E:V:::::E::S:GEEE:V:S:V::Y::EPM::E::D:GTL HVO_A0601 PTG::T:GD::EM::::E:E:L:G::K::::::SES::DG:VA::::K:VVF::::P:WL HVO_A0549 ::D::::::MD::V::::T::N:S::::FV::::DG::::::DA:D:AVYERA:IS:D:: Hut0620 :P::A:::D:SAV:F::::S::::::R:::A::SD:::T:::D:Y::S::QFA::::SM: Hbo0646 NY:SS::V:::EV::::D:S:K::::R::V:::K:S:::S:QS:F::SL:TH:E::P:V: NP3934A ::::::::DLH:::F:AD::A:::::GS::G:::P::::::QS::::ELL:H:E::::VL pNG7145 ::::E::::VGQ::V:AN::::::::TAIV::::SA:::S::::Y::::LP:E:IS:::V Hmu0308 ::D:S::::T::V:V:::A::::::::A:V::GE::::T::::::::::V::T:LS::AV consensus AGL---- #oth 4453331 hla1733 EA::::: HVO_A0601 R:YMRS: HVO_A0549 :RR:::: Hut0620 GS:AQT: Hbo0646 ::IGQ:: NP3934A T::GMGM pNG7145 G:M:::: Hmu0308 EQE::::