|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1439 | NP4936A | HVO_2631 | Hbo2211 | hla1211 | Hut0020 | rrnAC0314 | Hmu2522 |
547 | NP4936A | 1308 | 380 | 318 | 327 | 332 | 325 | 265 |
636 | HVO_2631 | 380 | 1408 | 493 | 397 | 329 | 345 | 290 |
642 | Hbo2211 | 318 | 493 | 1616 | 418 | 319 | 312 | 390 |
729 | hla1211 | 327 | 397 | 418 | 1597 | 447 | 368 | 338 |
802 | Hut0020 | 332 | 329 | 319 | 447 | 1954 | 510 | 570 |
834 | rrnAC0314 | 325 | 345 | 312 | 368 | 510 | 1678 | 676 |
764 | Hmu2522 | 265 | 290 | 390 | 338 | 570 | 676 | 1530 |
280 symbols consensus VSDD--DPDAREDDADRREDDP---------F--LDAADDEADDSTDAA--------DDA #oth 112.22333454245234212211111111123444564535314533322111111325 NP4936A M:E:::AD::AAGT::ESD:A::::::::::-::-E::VE:N::PEA:V::::::::EEN HVO_2631 MT::::-----NSTD:AA:GE::::::::::-::--SVSGDR:::FGR::::::::::PG Hbo2211 :TT:DG:DEPLS:I:R:VT::D:::::::::SAETTNH:A:T:EMSG:DSD::::::RES hla1211 :TE:::EA::V::QT:TV::EA:::::::::-::DVLF:::SV:D::VV::::::::::I Hut0020 :::::::::T::::S:::::::AQSEPDDFG:PAS:RD:V:::::NEQ:AEPAAETP::: rrnAC0314 M:::ER::FEEL:SG:E::G::::::::::::ER:::GP:G:N:::::R::::::::QPP Hmu2522 ::::::::FE:L::VE:-:G::::::::::::EQ::DEATAGA:GDER:::::::::::: consensus DDPAAALDESD-P-DD-S------------------------------DEFDSDPASDAS #oth 1.3434424235453354332332232332222222111111111111435334144142 NP4936A ::::V:V:::L:-:--:-::::::::::::::::::::::::::::::A::ELE::D:E: HVO_2631 ::S:E:VRAP:GSR:GR::::::::::::::::::::::::::::::::DA::A:L::LA Hbo2211 ::RTT:A:R::ATNAVHRSEETNAVPDSPA::::::::::::::::::PTD:DV:L::LA hla1211 :::F:Q:::--:-:--:-:::::::::::::::::::::::::::::::AP::RS:A::: Hut0020 T::FER::GP:R:PGGDPFAEIDETAPEQAPDRSSFDTLGFEQTGEDSH:S:PE:TT::: rrnAC0314 ::SWTDIES::E:T::M:ETGPSATDDDDLLSAVDT::::::::::::E::R::SVT:SD Hmu2522 ::GS:GP:G:PQRDG:AE::::::::::::::::::::::::::::::PTLPD::FGEFD consensus RR---VA-RR-DADDPF---G-DRRDEDPF---GEEAFERVDVGEIDADDLWESLDEDAA #oth 351114353355252313212445344132221222112422342315142.33243253 NP4936A --:::--:--:------:::-:--------:::L::L:TE:ETPDV:GEE:::EVLA:P: HVO_2631 G::::::E::ARSRVT-:::-::Q:::---:::TD:L::S:EI::L:R::V:T::V:GGD Hbo2211 :::::::R::K::::S-:::-:::A:S:D-:::TKSL::SM::E:::S:T::AG:V::ES hla1211 :A:::--:--:G:N:::DEL:PATGET:AA:::LD:::::M:::DLTEE:I:K::::::E Hut0020 AE:::ATPGESA:E:::DRL:GQ::QG:::EGL::T:RDPATSA:T:-:::::N:SRS:: rrnAC0314 :P:::LSGSSP:S::::S:::M:E:G::::GS:::S:::::::DH::::KV:AEIAA:DD Hmu2522 :DDAAT:D:EDP:V:::A::DVPD::G:::GG:::S:::Q:::::::::AV:::I:D:RE consensus ---------GAAASETD-----------AEERYAD-----VVSKHEYCQQCEHFSAPPEL #oth 2334333342333433511111111111423131222214213.351.23.12.12..32 NP4936A :::EATSEPAE::EAAV::::::::::::G:GA:VDSGET::Q:DK:::R::Y:A::::: HVO_2631 DVEAEGVGV::E:TPV::::::::::::DG:GV::::::H::P:S:F::R::::A::::: Hbo2211 :ATISVGAR:::E:ID::::::::::::ELPG:E:::::YI:P:S:F:HH:PY:AD:::: hla1211 GGFGSVGEF:G:V:::NTTGSDPGGRVG:G::F::AGVER:I::RT:::::P::::::AV Hut0020 :::::::::-EPET::R:::::::::::G:R:F:E:::::-:D::S::EN::Y::E::DV rrnAC0314 :::::::::----N::T:::::::::::P:S:::E:::::-::::R::E:::::::::NA Hmu2522 :::::::::----P:VP:::::::::::E:S:::E:::::-::::A::E::PF::E:::A consensus ACTHEGTEIVEFLDMDRFRVRDCPMVAERDELE------- #oth 2.412112.224223241.141..2.33224443443321 NP4936A ::E:P::::AAV::SKQ:::V:::I::R:EHAKALFPDEE HVO_2631 ::H::::T::GLE:S:H::::N::::EKD:---::::::: Hbo2211 ::::D::::::VVE::::::::::::EDD:---::::::: hla1211 ::G::::T:::SVGF:E::::N::::DDD:PTFDATRGE: Hut0020 E:A::::N::::V:YETV::A:::V:V::E::AEMDDER: rrnAC0314 H::ND::::M:::::ETV:LL:::V:::QH:I:DEQ:::: Hmu2522 H::::TA::::Y:::::V:LF:::V::::ED:::::::::