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7 genomes BUD1242 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0314

HVO_2631

Hbo2211

Hmu2522

Hut0020

hla1211

NP4936A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score1439 NP4936A HVO_2631 Hbo2211 hla1211 Hut0020 rrnAC0314 Hmu2522
547NP4936A 1308 380 318 327 332 325 265
636HVO_2631 380 1408 493 397 329 345 290
642Hbo2211 318 493 1616 418 319 312 390
729hla1211 327 397 418 1597 447 368 338
802Hut0020 332 329 319 447 1954 510 570
834rrnAC0314 325 345 312 368 510 1678 676
764Hmu2522 265 290 390 338 570 676 1530

280 symbols
consensus       VSDD--DPDAREDDADRREDDP---------F--LDAADDEADDSTDAA--------DDA
#oth            112.22333454245234212211111111123444564535314533322111111325
NP4936A         M:E:::AD::AAGT::ESD:A::::::::::-::-E::VE:N::PEA:V::::::::EEN
HVO_2631        MT::::-----NSTD:AA:GE::::::::::-::--SVSGDR:::FGR::::::::::PG
Hbo2211         :TT:DG:DEPLS:I:R:VT::D:::::::::SAETTNH:A:T:EMSG:DSD::::::RES
hla1211         :TE:::EA::V::QT:TV::EA:::::::::-::DVLF:::SV:D::VV::::::::::I
Hut0020         :::::::::T::::S:::::::AQSEPDDFG:PAS:RD:V:::::NEQ:AEPAAETP:::
rrnAC0314       M:::ER::FEEL:SG:E::G::::::::::::ER:::GP:G:N:::::R::::::::QPP
Hmu2522         ::::::::FE:L::VE:-:G::::::::::::EQ::DEATAGA:GDER::::::::::::

consensus       DDPAAALDESD-P-DD-S------------------------------DEFDSDPASDAS
#oth            1.3434424235453354332332232332222222111111111111435334144142
NP4936A         ::::V:V:::L:-:--:-::::::::::::::::::::::::::::::A::ELE::D:E:
HVO_2631        ::S:E:VRAP:GSR:GR::::::::::::::::::::::::::::::::DA::A:L::LA
Hbo2211         ::RTT:A:R::ATNAVHRSEETNAVPDSPA::::::::::::::::::PTD:DV:L::LA
hla1211         :::F:Q:::--:-:--:-:::::::::::::::::::::::::::::::AP::RS:A:::
Hut0020         T::FER::GP:R:PGGDPFAEIDETAPEQAPDRSSFDTLGFEQTGEDSH:S:PE:TT:::
rrnAC0314       ::SWTDIES::E:T::M:ETGPSATDDDDLLSAVDT::::::::::::E::R::SVT:SD
Hmu2522         ::GS:GP:G:PQRDG:AE::::::::::::::::::::::::::::::PTLPD::FGEFD

consensus       RR---VA-RR-DADDPF---G-DRRDEDPF---GEEAFERVDVGEIDADDLWESLDEDAA
#oth            351114353355252313212445344132221222112422342315142.33243253
NP4936A         --:::--:--:------:::-:--------:::L::L:TE:ETPDV:GEE:::EVLA:P:
HVO_2631        G::::::E::ARSRVT-:::-::Q:::---:::TD:L::S:EI::L:R::V:T::V:GGD
Hbo2211         :::::::R::K::::S-:::-:::A:S:D-:::TKSL::SM::E:::S:T::AG:V::ES
hla1211         :A:::--:--:G:N:::DEL:PATGET:AA:::LD:::::M:::DLTEE:I:K::::::E
Hut0020         AE:::ATPGESA:E:::DRL:GQ::QG:::EGL::T:RDPATSA:T:-:::::N:SRS::
rrnAC0314       :P:::LSGSSP:S::::S:::M:E:G::::GS:::S:::::::DH::::KV:AEIAA:DD
Hmu2522         :DDAAT:D:EDP:V:::A::DVPD::G:::GG:::S:::Q:::::::::AV:::I:D:RE

consensus       ---------GAAASETD-----------AEERYAD-----VVSKHEYCQQCEHFSAPPEL
#oth            2334333342333433511111111111423131222214213.351.23.12.12..32
NP4936A         :::EATSEPAE::EAAV::::::::::::G:GA:VDSGET::Q:DK:::R::Y:A:::::
HVO_2631        DVEAEGVGV::E:TPV::::::::::::DG:GV::::::H::P:S:F::R::::A:::::
Hbo2211         :ATISVGAR:::E:ID::::::::::::ELPG:E:::::YI:P:S:F:HH:PY:AD::::
hla1211         GGFGSVGEF:G:V:::NTTGSDPGGRVG:G::F::AGVER:I::RT:::::P::::::AV
Hut0020         :::::::::-EPET::R:::::::::::G:R:F:E:::::-:D::S::EN::Y::E::DV
rrnAC0314       :::::::::----N::T:::::::::::P:S:::E:::::-::::R::E:::::::::NA
Hmu2522         :::::::::----P:VP:::::::::::E:S:::E:::::-::::A::E::PF::E:::A

consensus       ACTHEGTEIVEFLDMDRFRVRDCPMVAERDELE-------
#oth            2.412112.224223241.141..2.33224443443321
NP4936A         ::E:P::::AAV::SKQ:::V:::I::R:EHAKALFPDEE
HVO_2631        ::H::::T::GLE:S:H::::N::::EKD:---:::::::
Hbo2211         ::::D::::::VVE::::::::::::EDD:---:::::::
hla1211         ::G::::T:::SVGF:E::::N::::DDD:PTFDATRGE:
Hut0020         E:A::::N::::V:YETV::A:::V:V::E::AEMDDER:
rrnAC0314       H::ND::::M:::::ETV:LL:::V:::QH:I:DEQ::::
Hmu2522         H::::TA::::Y:::::V:LF:::V::::ED:::::::::