| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4956 | hla2353 | HVO_1159 | Hbo0399 | NP4020A | Hut0516 | rrnAC1249 | Hmu1721 |
| 3810 | hla2353 | 5001 | 3631 | 3665 | 3102 | 2957 | 3181 | 3263 |
| 3907 | HVO_1159 | 3631 | 4981 | 3991 | 3187 | 3072 | 3229 | 3337 |
| 3933 | Hbo0399 | 3665 | 3991 | 5016 | 3183 | 3045 | 3321 | 3296 |
| 3753 | NP4020A | 3102 | 3187 | 3183 | 4902 | 3207 | 3402 | 3412 |
| 3704 | Hut0516 | 2957 | 3072 | 3045 | 3207 | 4982 | 3475 | 3517 |
| 4024 | rrnAC1249 | 3181 | 3229 | 3321 | 3402 | 3475 | 4931 | 3983 |
| 4101 | Hmu1721 | 3263 | 3337 | 3296 | 3412 | 3517 | 3983 | 4990 |
691 symbols consensus -MSLDTR-SGQQDRSGDALGDTFYPLFQLLFDEDGDFVSNVERKLAEARMPDNVEMYLSR #oth 121113324144543323.112...21431.12111..322.3..21..1122..21112 hla2353 :V::::G:V:DGSVD:NL:AEL:::V:E::::P:::::GDI:::::::::::Q::::V:: HVO_1159 MSN::S:T::GL:::T:T:::A:::::::::::::E:::DI:T::QQ:::::T::L:::: Hbo0399 :::::SPT::GL:::S:T:::A:::::R:::::::::::D:::::EQ::::AT::L:::H NP4020A :::FEY-:-:R:TAGT:::A:L::::YTR:::D:S:::A:L::::::::I:QT::I:::K Hut0516 ::::ER:RA:SPIGEAGG:::::::::GR::N::::::A:::T:::::::A:::::F::: rrnAC1249 ::::::P:GQ::VG::G::::::::AY:MV::DE:::::S::N:::::::A:::::F:A: Hmu1721 ::::::::-::RQL::G:::::::::::W::N::::::R:::K:::Q:::A:::::F:A: consensus ALAVGVLAGLALWLVGTLIGYLLVALGL---VGAAPTFLGIPLPEP-VAAILRSLKLPFL #oth 1.11.312.241.11.213.1241332111254342321.21424423344253134.23 hla2353 ::G::L:V:GT::AL:::T::GAFS::::::IDPETLS::M:A:T:AIK:F::::VV:TA HVO_1159 :::::::V::VS::::M:V::GVF::::::::S:DSVS::::VGSEAT:DT::::AM:AA Hbo0399 :::::::::GL:::L:S::::AMF:F::::::S:ETLS::::T:DAQT::F:E::TM::G NP4020A S:G::I:S::L:::L:::V:W:::SVV::::-T:P:::::L::::::YLS:VNE::F::I Hut0516 :::::SI::TS:::::M:L::::::TV::::A:QV:S:::LGF:KS::LPVIQA:::::: rrnAC1249 ::::::I::::::::::FL:::::Q:LF::AS:E:::LI:::VS:S::SE::AV:::::: Hmu1721 :::I::IS::::::::::::::G:TFL:GGTGAE::::I::::::G::S:A:DVI:I:A: consensus VLVSGLVFGSIGFAIGFGSLVAIPYFRASAREREINVLLSDSVSFMYALSVGGLNQLEIL #oth 23.1.12..31..14...22.12.123121.1.11.21.2.11..............1.. hla2353 ::::::::::::::::::GV:::::S::::::::::L::A:::::::::::::::::::: HVO_1159 :V::::::::L:::G:::T::::::ST::::K::::M::::A:::::::::::::::::: Hbo0399 ::::::::::::::L:::T:::V:FSK::S:K::::M::P:AI::::::::::::::::: NP4020A IA::::F::::::GA:::GM::K::LE:D::K:::::::::::::::::::::::::::: Hut0516 MI::::L::T::::V::::::S:::::::::::Q:::M:::A:::::::::::::::D:: rrnAC1249 :I:T:F:::A:::G:::::::S:::::S::::::::::::::I::::::::::::::::: Hmu1721 I::T:::::V:::G:::::::S::::::N:::::V:::::::I::::::::::::::::: consensus EAMARAEDTYGEVAKEFQSIVLETEYFDTDYRTAIRNQALQTPSDELSQFLTDMLSIVNS #oth 21113.1.....112......2..1..1....1.1.2.123...1......1.....11. hla2353 R:::T::::::::SQ::::::N:::::G::::N:::Q:SME::::::::::A:::::::: HVO_1159 :::::::::::::SR::::::Q:::::G::::N:::Q:::L::::::::::::::::::: Hbo0399 :::G::::::::::R::::::Q:::::G::::N:::D::MV::::::::::::::::::: NP4020A ::::::D::::::SQ::::::::::::::::::::::::M::::E::::::::::::I:: Hut0516 ::I:A:D:::::::::::::::::T::::::::::::::I::::::::::::::::::D: rrnAC1249 QS:GK:::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::::I:: Hmu1721 Q:::K:D:::::C:::::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::I:: consensus GGDMESFLEDQKEKHMRTAKQEQEKMLETLELFGEMYMTLSLFPLLLIIILVIMSMMGEA #oth ..1.22..2.1.2.11..11.21142.1.1....................1.1.1.1.31 hla2353 ::N:::::K:K::::L::S:::R:MT::::::::::::::::::::::::::::G::::S HVO_1159 ::::QG::D:K:D::L:::::Q::QT:::M::::::::::::::::::::::::::L::: Hbo0399 ::N::Q::D:K::::L::::::::MT::::::::::::::::::::::::::::::L:Q: NP4020A :::::Q::::::::::::S:::::TV::::::::::::::::::::::::V:::::L::: Hut0516 ::::T:::::::N:Y:::S::T::R:::::::::::::::::::::::::::V:::::N: rrnAC1249 ::::T::::::::::::::R::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N: Hmu1721 ::::T:::::::D::::::::::Q:::D::::::::::::::::::::::::::::::D: consensus QDRLLYATVYGLIPLTGVGFLVLVSTVKQDEIGDGYLRPDDGSDRLVQDEREGLFHLGLI #oth 244.2.2...1...11121........22.131..1.32234533334454423232..2 hla2353 D:F:::::::A::::::::::::::::::::P::::::::G:::::R:TSK:::L:F::: HVO_1159 :S:::::::::::::::::::::::::::::::::F:S:::E::::QGQQ::::V:M::V Hbo0399 :QS::::::::::::::::::::::::::::P:::::Q:AESP:::E:SH::::V:M::: NP4020A ::A:::G::::::::I:A:::::::::V:::V::::::A:::A---:A::SSSM:D:::A Hut0516 STQ:M:I:::::::MIN:A::::::::TS::SS::F:L:::PKM:AQIEGETN::S:::: rrnAC1249 :QS:I:G::::::::::L:::::::::T::S:::::::SSP:EKE::V::GV:V:N:::: Hmu1721 :N::::G::::::::::A:::::::::TR::V::::::::GKD:DF:V:DGL:FLN:::V consensus EDYTGQFSVFDRIKSREGTHKTLQILKRPHLFFRDNPLYVLALTVPAALVAVGLAVIGGA #oth 1412.4252.1..431...233432152.11.1111.131.32.1.32323124314514 hla2353 :AFV:::G:::::RN::::Y::K::VSA::::L::::::T::::::::::I::VT::S:N HVO_1159 :S:V:E::L:S::::::::F::REL:R::::::KRH::FT:::::::::ALL:VS:A::: Hbo0399 ::F::E:RL::::H:::::Y::KEL:EN:::::::::::T:V::::::T:F:LT:::::: NP4020A A::A:RRA:::::ETK::::L:::L:A:::::::::::A:::I::::SA:L::MS:SA:V Hut0516 :Q:::SYDI::::ND:::::QVID:::A::I:L::::P::::V:I:IT:::LV:::LM:W rrnAC1249 :S:::TY:::::::::::::EL:A::T::D:::::H::L::W::::LSIL::VA:IVI:W Hmu1721 :N::::YTI::::::::::YEFM:V::::D:::::H::F::GV:::VTI::LL:V:VFDL consensus APLSLDGMIARPVWGTFFWVYVPAYINLIPLAIFHEWNVRSRRAIIGKLSENLRKLSSAN #oth ..212111215.242..2.3.1.3.2233..24.11.12211431211..12....1... hla2353 ::TTF::WVN::::A::V:::::::LV:A:::V::::SQ::K:::T:::::S:::::::: HVO_1159 ::TTW:::::N::::::I:F:::V:LVAV::TA::::::H::A::T::::D::::::::: Hbo0399 ::::W:A:LNQ:I::::V:W:I:::VIG::::F::S::N:::Q:VV:::::::::::::: NP4020A :::::E::::A::M:::::::::L:::::::TL:Y::::::::K:TDS::DD:::::::: Hut0516 ::T:::::::D:LQ:::::L:::::::F:::::::::::QY:HS:::::::::::::::: rrnAC1249 ::::::::::V::RS::::::::M:L:F:::M::Y:::Q:::K:::::::::::::A::: Hmu1721 ::M::::::::::L:::::::::L::::L:::::Y:::::::KT:::S::::::::A::: consensus DTGMTLLESVKTVSDTSSGKLADEFEVMHAKVNYGTSLKDALREFNNKYHVPRLARTVKL #oth 1..1.....242.13..2.1.11..22211..2..11.14..1......21...1..1.. hla2353 :::Q::::::E:::E::T::::E::::V:::::::M::R:::V::::::A:::::::::: HVO_1159 :::Q:::::I::::::::::::::::::::::H::M:::E::V:::::::I::::::::: Hbo0399 :::Q:::::::::::::::::::::::::::::::M::RS::V:::::::I::::::::: NP4020A :::::::::IRV:A:::::R::E::R::Y::::::::::T::::::::::I::::::L:: Hut0516 E::::::::LNI:AR::::R:::::SI::R::Q:::N::Q::::::::::::::S::::: rrnAC1249 :::::::::::V::E::::::S::::TI:::::::::::::::::::::N:::::::::: Hmu1721 ::::::::::QV::T::G:::SE:::I::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ISEAQEASSQITDVLSTAAQASENQDDIERERKSRTRMQVVIILMTYLTLLGVMAILKTQ #oth .21.....11.13..1............1.2.111....21..2..11...1.1.2.111 hla2353 :::::::::E:::::T::::::::::::::N:I:Q:::::A::V:::V:::::::::Q:: HVO_1159 :TK:::::::::E::T::::::::::::::::I:::::::A::::::V:::A:::::::: Hbo0399 ::K:::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::::::::A:::::::: NP4020A ::K:::::::::Q:::::::::::::::::N::::::::M:::I:::V:::::::L::VE Hut0516 ::::::::N::Q::::::::::::::::D:D::::::::::::I::F::::::I:M::V: rrnAC1249 :A:::::::::Q:::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::::L:::: Hmu1721 :::::::::::QN:::::::::::::::D:::IA:::::::::::::::::::::L:::: consensus FLDVMAGLSSQASGSGG---SGAGG-QSFGGG--VDT-DLLSMLFFHAVTLQAILSGFIA #oth .211.21.342.333321112442.132..2311313123.11..1.1.11.142.22.1 hla2353 :I:::GD:::::D:G:A:::::G:::AG::::GG::P::V:::::::::::::V:::::S HVO_1159 :::::::::::::S::::::ATT:::P:::::::I:P:::::L::::G::I::M:::::S Hbo0399 ::::::::T::::A:SSGSQAVQ:::P::::A::::::AM::L::L:::::::A:::::S NP4020A :::T::::VD::GAAEA:::ED:P:AGQ::D:::L:V::E:T::::::::::G:I::V:: Hut0516 :FET:::::QT:D--T::::ESI::::Q::SS::MPSN:::::::::::S::::F:AI:: rrnAC1249 :::::S::AT:::::SS::::S:P::GG:::S::::::E::::::::::::::L::S::: Hmu1721 :::::::::ES:A:A::::::::T:::::::N::::::::::L::::::::::L::S::: consensus GYIRNVDIISGVKFAVILQTIALVVWIAVG- #oth ....31413111.1112.3.11.31123111 hla2353 :::::A::V:::::::V:M:L::G:::Y::: HVO_1159 :::::A:LQ:::::V:::::LS:A::MV::: Hbo0399 ::::SA::::::::V::::::::A::AV::: NP4020A ::::E:S:MASL::V:V:P:L::::FMLI-: Hut0516 ::::::R::::L:Y:IA:M::S::::M:I:G rrnAC1249 ::::E:KLVA::::::V:S:::::::::::: Hmu1721 ::::D:N:::::::::::P::::IT::::::