7 genomes BUD1256 7 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC2458 HVO_2786 Hbo2521 Hmu0296 Hut1152 hla0932 NP1448A -

Pairwise sequence scores
Consensus score	839	NP1448A	rrnAC2458	HVO_2786	Hbo2521	Hmu0296	Hut1152	hla0932
418	NP1448A	818	270	308	321	244	342	303
442	rrnAC2458	270	863	359	285	380	325	333
541	HVO_2786	308	359	845	498	359	365	336
550	Hbo2521	321	285	498	905	363	403	409
515	Hmu0296	244	380	359	363	836	397	399
554	Hut1152	342	325	365	403	397	894	521
557	hla0932	303	333	336	409	399	521	992

135 symbols
consensus       MDAATES-------------------RPVSLDDEDELDALIAEADRVLVEFYTKGCTLCA
#oth            1434335433332211111111111131352324521122223415212222.2..33.3
NP1448A         ::::---:::::::::::::::::::VVRH::::RDFE:FVTSHEV:::::::T::PK::
rrnAC2458       ::TT::H:::::::::::::::::::SVRTVETR::::DVL:T::H:::MVR:T:::I:K
HVO_2786        -MSS:::ATAPT::::::::::::::K::RI:TVE:::::V::H::::LDI::::::::Q
Hbo2521         :T:EAPTTGTPS::::::::::::::::L:IES:A:::E::::N:L::ID:::::::::Q
Hmu0296         :STE:QP:::::::::::::::::::::HL::SKPA::D:::SEE:L::::H::::S::E
Hut1152         :T::SQYDATDPPE:::::::::::::::A:T:ATD:::::ETY:T:::::::D::GV::
hla0932         :KNN:::GASEPADDVSGSSTSTEVR:::::A:::A:::FV:D::AAVI::::D::GI::

consensus       SMEPVLGNVARATD-ATVATCNPRDDPPLVERFDVRSVPTLLLFEDGELVDRLADGFQPA
#oth            111.1.13112331123.235113413322121212.1.2121.41.12241211..212
NP1448A         A::::::T:::::G:VP:GL:D-LGSV:V:::::IA:T:::I::TN:DPA::::E::VG:
rrnAC2458       ::::I:DIA:K:::::::VVF::KH:LDA:DA::::::::F:::A::D:IH:R::::V::
HVO_2786        :I:::::::SK::::VV::ML::QT:MSVA::YTI:::::::::::::::::::::::G:
Hbo2521         :I::::::::::H:NL:::L::::E::::I:::NIQ:::::V::::::RAG:::::::GG
Hmu0296         A:A:::DA::KG::::::::M::::::V::DEY::::::K::::V:::::ET:E:::V:V
Hut1152         ::::I::I::QDS:::V:G:I::::::::::::::::::L:VV:RN::P:E:V:::::::
hla0932         :::::::::::EL::LA:::V::::::::::::::::::LFV::V:::P:A:R:E::I:G

consensus       DDLVAFVEEAR----
#oth            322422235553221
NP1448A         :R::E::DAVQE:::
rrnAC2458       E::IE:::RGLESRT
HVO_2786        QAV:D:::KE:::::
Hbo2521         AAIDD:LA:S:SDT:
Hmu0296         ::VR:::T::E::::
Hut1152         E:V::LL:S:T::::
hla0932         :::T:WITDHVA:::