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7 genomes BUD1261 14 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0441

VNG2392

rrnAC2075

rrnAC2993

HVO_0027

HVO_1485

Hbo0060

Hbo1470

Hmu0048

Hmu2719

Hut0016

- -

HQ2287A

HQ2413A

HQ3727A

Pairwise sequence scores
Consensus score1556 HQ2287A rrnAC2993 Hmu2719 VNG2392 Hut0016 HQ3727A HVO_0027 Hbo1470 HQ2413A VNG0441 HVO_1485 Hbo0060 rrnAC2075 Hmu0048
718HQ2287A 1575 463 384 608 572 348 419 398 350 508 619 646 543 451
903rrnAC2993 463 1536 731 732 755 552 628 661 279 459 479 503 516 387
858Hmu2719 384 731 1479 781 784 549 600 678 298 484 527 510 438 381
1023VNG2392 608 732 781 1590 1009 568 643 665 458 571 652 651 408 370
980Hut0016 572 755 784 1009 1586 520 597 649 428 621 622 626 457 403
678HQ3727A 348 552 549 568 520 1622 722 726 215 350 368 407 407 285
795HVO_0027 419 628 600 643 597 722 1472 815 240 490 401 420 426 341
860Hbo1470 398 661 678 665 649 726 815 1562 260 471 412 454 428 314
619HQ2413A 350 279 298 458 428 215 240 260 1796 396 665 680 241 208
792VNG0441 508 459 484 571 621 350 490 471 396 1574 657 577 514 404
845HVO_1485 619 479 527 652 622 368 401 412 665 657 1572 959 474 447
851Hbo0060 646 503 510 651 626 407 420 454 680 577 959 1593 493 484
687rrnAC2075 543 516 438 408 457 407 426 428 241 514 474 493 1457 579
588Hmu0048 451 387 381 370 403 285 341 314 208 404 447 484 579 1513

262 symbols
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HQ2287A         ::GMSVLE:T:KEC::EID::::E:S:I:S:DAQLNRNR:::E::IA:MH:HN:LIL:::
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Hmu2719         :::QEF::T:SSE:K:::::::::::::::::::::EGPI::G::D:A:Y:GE:V:G::G
VNG2392         :::SE:H::::TA:D::::::::::S:::D::::::::P::V:::DA:Y:::E::A::::
Hut0016         :N:EQFSHQI::::D::::::::::::::D:A:D::DET::S:::DA::H::V:YEQ::A
HQ3727A         :::S::AATL:::H:::F::::::::M::I:N::::GGI:R::::INAD:ISTVT:E:S:
HVO_0027        --MSE:L:TL:::H::P::::::::::::V::::::G:::R:::::EAA::::L::W:::
Hbo1470         :NG:::::RI:::H:::F:::::::::::::::::EA:::R::::DDQ:::::VLED::M
HQ2413A         :N:QT:KREIETEA:S::RQ:D:NEF:R:AA:::PTAQ:L:E::::S:R:::V::ET:TQ
VNG0441         :N:ERFP:::A:RTR:::D::::::R:V:I::ADLTTPT:::R:::S:A::::::::L:A
HVO_1485        ::::SFRES:ETAKR:Q:D::::::L:L:::EADLSEP:::R:::YS::::RG::A:::E
Hbo0060         ::GETFRAV:E::KQ:E:E::::QQL:V:::DADLTRER::EV:::S::::RE::RK:::
rrnAC2075       :::GATIN::::QT::ERD::::D:V:I:A:DATLETEV::TT::T::SGL::ALGQ::A
Hmu0048         ::::TF:ER::A:SA:K:D::::E:V:L:A:DATLE:A::R:TLSG::AGRRAV:::::G

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HQ2287A         ::::P:::::::::::T::QI:REV::T:I:::E::I:LA:S::::::::::::::::::
rrnAC2993       :AN:::::::::::::::::L:V:::T:TAERG:STD::PV:::::::::::::::::::
Hmu2719         ET---::::::::::::----::A::DTAS:::ETIVDK:G:::::::::::::::::::
VNG2392         T:PHA:::::::::::D:Q:::ATT:S:::::::A:RG::::::::::::::::::::::
Hut0016         ::GN::::::::::::E::D:::ET::::::::E::AGK:::::::::::::::::::::
HQ3727A         NNIS:TDGHVDEIDETDPD:V:ALI:TDAGKRAMDLNPDIS:::::::::::::::::::
HVO_0027        ::PN::::::::::::E:::L:S:L:DTA:E:AET:G::S::::::::::::::::::::
Hbo1470         V:HG:::::::::::::::VLLA:L:D:M:::AESAEPDGY:::::::::::::::::::
HQ2413A         T:S:A:::::::::::D:K::::SVVEQ::T:H:::::AI:TIVSTNNYSSSSSSGNGNG
VNG0441         AA:T::::::::::::A::::CDSF::T::::::::::A::A::::::::::::::::::
HVO_1485        ::T:E:::::::::::E:S::::AT::Q:AE:L:::LGA:::::::::::::::::::::
Hbo0060         ::ESE:::::::::::T:QG::TTV:EQ:DT:LR:::N::::::::::::::::::::::
rrnAC2075       EA:S:::::::::::::V:TQ::G::EAAAERA::ID:DAG:::::::::::::::::::
Hmu0048         ET:GP::::::::::::::D:::R:SERAATRHGTLS:::::::::::::::::::::::

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rrnAC2993       :::::::-::::RT:::::V:DD::G:V::::::F::WT::DKKVK::YT:::T:Q::::
Hmu2719         :::::DH:P::GER:::FET:ARQ:E::A::::::::WT::AKK:D:::T:::::Q::::
VNG2392         :::::AH:PAS::AN:::TH::::::::A::::::L::I:ATEKSK::FT:::::Q::::
Hut0016         :::::DH:P:SEGV::IQ:::::::G:V::::::F:::TIAAEKSK::FT:Y::::::::
HQ3727A         :::::QK:A::VSR:RLY:V:ESME:I:S::::::LA:S:MTIEQVS:MV:::I:N::::
HVO_0027        :::::::-:::GSK:NVY:V:AEFE::DG:::::ALA:A:::LK:V::MV:::::D::::
Hbo1470         :::::::-:DRG:D::LY:R:AFE:D:PG:I::::L::Y::VSEYAG:MV:::::D::::
HQ2413A         NYDANLEAQTQEA:GP::A::::RE::LQ:IAS:M:::::A:LQ::SR::SY:ESHS:IT
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Hmu0048         ::::::::SPTETAWPVVEH::::GAD:::A::A::ATG::G:::AL:A:N:::N:G:::

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rrnAC2993       ::::::::::::::::::ST::SAG::VV:LR:EAAE::DA:::D::::D::E:::ID::
Hmu2719         :::::::::::::::::SQV::::GG:I::LREQA::A:::----:G::D::E:::S::V
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HQ3727A         ::::::::::::::TK::NE::::KRMI:S:R::I:TA:NST::::TA::D:QNS:::::
HVO_0027        :::::::::::::::MA:ND::T:K::LNDQ::TLEAAVSDLVDD:---AV:RE:::::V
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HQ2413A         ANASHGESIPETEHNPAVT::Y::FDE::KV:AD:::::TTR:TTES::D::I:V:TYT:
VNG0441         ::::::::::::::HDR::::::::R::S::TADAAAA::SC:DG::::AR::D::ADAV
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Hmu0048         AV::E:::RR:DA::L::R:::