|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1556 | HQ2287A | rrnAC2993 | Hmu2719 | VNG2392 | Hut0016 | HQ3727A | HVO_0027 | Hbo1470 | HQ2413A | VNG0441 | HVO_1485 | Hbo0060 | rrnAC2075 | Hmu0048 |
718 | HQ2287A | 1575 | 463 | 384 | 608 | 572 | 348 | 419 | 398 | 350 | 508 | 619 | 646 | 543 | 451 |
903 | rrnAC2993 | 463 | 1536 | 731 | 732 | 755 | 552 | 628 | 661 | 279 | 459 | 479 | 503 | 516 | 387 |
858 | Hmu2719 | 384 | 731 | 1479 | 781 | 784 | 549 | 600 | 678 | 298 | 484 | 527 | 510 | 438 | 381 |
1023 | VNG2392 | 608 | 732 | 781 | 1590 | 1009 | 568 | 643 | 665 | 458 | 571 | 652 | 651 | 408 | 370 |
980 | Hut0016 | 572 | 755 | 784 | 1009 | 1586 | 520 | 597 | 649 | 428 | 621 | 622 | 626 | 457 | 403 |
678 | HQ3727A | 348 | 552 | 549 | 568 | 520 | 1622 | 722 | 726 | 215 | 350 | 368 | 407 | 407 | 285 |
795 | HVO_0027 | 419 | 628 | 600 | 643 | 597 | 722 | 1472 | 815 | 240 | 490 | 401 | 420 | 426 | 341 |
860 | Hbo1470 | 398 | 661 | 678 | 665 | 649 | 726 | 815 | 1562 | 260 | 471 | 412 | 454 | 428 | 314 |
619 | HQ2413A | 350 | 279 | 298 | 458 | 428 | 215 | 240 | 260 | 1796 | 396 | 665 | 680 | 241 | 208 |
792 | VNG0441 | 508 | 459 | 484 | 571 | 621 | 350 | 490 | 471 | 396 | 1574 | 657 | 577 | 514 | 404 |
845 | HVO_1485 | 619 | 479 | 527 | 652 | 622 | 368 | 401 | 412 | 665 | 657 | 1572 | 959 | 474 | 447 |
851 | Hbo0060 | 646 | 503 | 510 | 651 | 626 | 407 | 420 | 454 | 680 | 577 | 959 | 1593 | 493 | 484 |
687 | rrnAC2075 | 543 | 516 | 438 | 408 | 457 | 407 | 426 | 428 | 241 | 514 | 474 | 493 | 1457 | 579 |
588 | Hmu0048 | 451 | 387 | 381 | 370 | 403 | 285 | 341 | 314 | 208 | 404 | 447 | 484 | 579 | 1513 |
262 symbols consensus MDADDLVDAVRDDNETALSRLGSSKALYALTGGEMDPDAVLAAAAAREHAAADTFDAWAD #oth 13266385633447514331.1.42614.5151324665215511552733463458125 HQ2287A ::GMSVLE:T:KEC::EID::::E:S:I:S:DAQLNRNR:::E::IA:MH:HN:LIL::: rrnAC2993 :T:A::I::::::QQ:E::::::::T:::D:R:::E::V:::::::::Q::HE:::::S: Hmu2719 :::QEF::T:SSE:K:::::::::::::::::::::EGPI::G::D:A:Y:GE:V:G::G VNG2392 :::SE:H::::TA:D::::::::::S:::D::::::::P::V:::DA:Y:::E::A:::: Hut0016 :N:EQFSHQI::::D::::::::::::::D:A:D::DET::S:::DA::H::V:YEQ::A HQ3727A :::S::AATL:::H:::F::::::::M::I:N::::GGI:R::::INAD:ISTVT:E:S: HVO_0027 --MSE:L:TL:::H::P::::::::::::V::::::G:::R:::::EAA::::L::W::: Hbo1470 :NG:::::RI:::H:::F:::::::::::::::::EA:::R::::DDQ:::::VLED::M HQ2413A :N:QT:KREIETEA:S::RQ:D:NEF:R:AA:::PTAQ:L:E::::S:R:::V::ET:TQ VNG0441 :N:ERFP:::A:RTR:::D::::::R:V:I::ADLTTPT:::R:::S:A::::::::L:A HVO_1485 ::::SFRES:ETAKR:Q:D::::::L:L:::EADLSEP:::R:::YS::::RG::A:::E Hbo0060 ::GETFRAV:E::KQ:E:E::::QQL:V:::DADLTRER::EV:::S::::RE::RK::: rrnAC2075 :::GATIN::::QT::ERD::::D:V:I:A:DATLETEV::TT::T::SGL::ALGQ::A Hmu0048 ::::TF:ER::A:SA:K:D::::E:V:L:A:DATLE:A::R:TLSG::AGRRAV:::::G consensus DEDDD------------AAAAFEDAAAEERDHYDRVTAELD------------------- #oth 539641111111111143565267524535314444:44543111111111111111111 HQ2287A ::::P:::::::::::T::QI:REV::T:I:::E::I:LA:S:::::::::::::::::: rrnAC2993 :AN:::::::::::::::::L:V:::T:TAERG:STD::PV::::::::::::::::::: Hmu2719 ET---::::::::::::----::A::DTAS:::ETIVDK:G::::::::::::::::::: VNG2392 T:PHA:::::::::::D:Q:::ATT:S:::::::A:RG:::::::::::::::::::::: Hut0016 ::GN::::::::::::E::D:::ET::::::::E::AGK::::::::::::::::::::: HQ3727A NNIS:TDGHVDEIDETDPD:V:ALI:TDAGKRAMDLNPDIS::::::::::::::::::: HVO_0027 ::PN::::::::::::E:::L:S:L:DTA:E:AET:G::S:::::::::::::::::::: Hbo1470 V:HG:::::::::::::::VLLA:L:D:M:::AESAEPDGY::::::::::::::::::: HQ2413A T:S:A:::::::::::D:K::::SVVEQ::T:H:::::AI:TIVSTNNYSSSSSSGNGNG VNG0441 AA:T::::::::::::A::::CDSF::T::::::::::A::A:::::::::::::::::: HVO_1485 ::T:E:::::::::::E:S::::AT::Q:AE:L:::LGA::::::::::::::::::::: Hbo0060 ::ESE:::::::::::T:QG::TTV:EQ:DT:LR:::N:::::::::::::::::::::: rrnAC2075 EA:S:::::::::::::V:TQ::G::EAAAERA::ID:DAG::::::::::::::::::: Hmu0048 ET:GP::::::::::::::D:::R:SERAATRHGTLS::::::::::::::::::::::: consensus -------E---DDPPAMHDYLRGLDTTAERL-GGLVGRPLVSDRTHEQLIGFFVGEAD-- #oth 11111665668666464554.37654367.3221411361256356615221.3243211 HQ2287A :::::APDDPNQS:NSL:KH::N:EE:PV:IGA::L::::::L:SLL:V:N::IN:GN:: rrnAC2993 :::::::-::::RT:::::V:DD::G:V::::::F::WT::DKKVK::YT:::T:Q:::: Hmu2719 :::::DH:P::GER:::FET:ARQ:E::A::::::::WT::AKK:D:::T:::::Q:::: VNG2392 :::::AH:PAS::AN:::TH::::::::A::::::L::I:ATEKSK::FT:::::Q:::: Hut0016 :::::DH:P:SEGV::IQ:::::::G:V::::::F:::TIAAEKSK::FT:Y:::::::: HQ3727A :::::QK:A::VSR:RLY:V:ESME:I:S::::::LA:S:MTIEQVS:MV:::I:N:::: HVO_0027 :::::::-:::GSK:NVY:V:AEFE::DG:::::ALA:A:::LK:V::MV:::::D:::: Hbo1470 :::::::-:DRG:D::LY:R:AFE:D:PG:I::::L::Y::VSEYAG:MV:::::D:::: HQ2413A NYDANLEAQTQEA:GP::A::::RE::LQ:IAS:M:::::A:LQ::SR::SY:ESHS:IT VNG0441 :::::DDADTAA::G:I:::::ERPDDTT::::AV:::G::A:::LA:FV::::ND:A:: HVO_1485 :::::EAVDLP:E:GV::A::::REDAI::VAA:M:::G:::I:::T:V:::::N:T::: Hbo0060 :::::KEWESD:E:GP::S::::RTE:V::IA::M:::::::QQ::N::::::IN::::: rrnAC2075 :::::::-:::-::DGFI:H:ETVSG::R:VGA:::AA:::A::FYL:VVS::IN::::: Hmu0048 ::::::::SPTETAWPVVEH::::GAD:::A::A::ATG::G:::AL:A:N:::N:G::: consensus --------------PQTADLFRDLRSDTEADLDRGLDLLAEVCESDDDWEAAAAAADAVI #oth 111111111111115622461133344555632554321755446353235.652.7421 HQ2287A ::::::::::::::TAA:::::::::E:N:T:E::VE::DA::::N:EY:Q:RD::VMT: rrnAC2993 ::::::::::::::::::ST::SAG::VV:LR:EAAE::DA:::D::::D::E:::ID:: Hmu2719 :::::::::::::::::SQV::::GG:I::LREQA::A:::----:G::D::E:::S::V VNG2392 ::::::::::::::::::Q:::::KG:LDDQ:E:T::::DA::AA::::QT:SD::::A: Hut0016 ::::::::::::::::::Q::::VGG:LDPQ:E:AGE::ES:::::::::Q::E::S:A: HQ3727A ::::::::::::::TK::NE::::KRMI:S:R::I:TA:NST::::TA::D:QNS::::: HVO_0027 :::::::::::::::MA:ND::T:K::LNDQ::TLEAAVSDLVDD:---AV:RE:::::V Hbo1470 :::::::::::::::T::SE::T:::AI:DER::VVET:::::::::::D::HE:::::V HQ2413A ANASHGESIPETEHNPAVT::Y::FDE::KV:AD:::::TTR:TTES::D::I:V:TYT: VNG0441 ::::::::::::::HDR::::::::R::S::TADAAAA::SC:DG::::AR::D::ADAV HVO_1485 ::::::::::::::EPR:::::::KAE::ET:AT::::::DR:AT:::::R:RMV:EY:V Hbo0060 ::::::::::::::EA:::I::::KAE:NET:EA:::::E:::ATE::::T:QMV:GYT: rrnAC2075 ::::::::::::::E:R::T::EI:REAS:-::D:ETA:GHLS::ER--:T:::::TEAV Hmu0048 ::::::::::::::DA:::AC:TV::SYGE:A:D:AA:VV:LGAQP---DR:QR::AET: consensus QAAYDDYAETLEGMGVDPKPVC #oth 7311231446.46114322331 HQ2287A NVV:EV:TTD::AL:I::::I: rrnAC2993 ST:::E:F::::DL::N::::: Hmu2719 :::::::F::::DL::N::::: VNG2392 :::::E:TAQ::S:::N::::: Hut0016 :T:::A:T:S::S:::N::::: HQ3727A E::::E:VDS::Q::IK::N:: HVO_0027 E::::E:V::::::::K::N:: Hbo1470 E::::::V::::R:::K::N:: HQ2413A RL:A::TRDA:A::S------- VNG0441 D:::QE:VAA:N:::::A:S:: HVO_1485 :L::::::DG:AEL::::::L: Hbo0060 :L::::::DA:Q:L:F::RS:: rrnAC2075 G:::::::::::A::L:::::: Hmu0048 AV::E:::RR:DA::L::R:::