| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2707 | HVO_2031 | Hmu0686 | Hmu2849 | VNG0794 | rrnAC2761 | hla1842 | HVO_1401 | Hbo0148 | VNG0903 | rrnAC2656 | HQ2450A |
| 1398 | HVO_2031 | 3010 | 2102 | 947 | 918 | 988 | 1070 | 1197 | 1140 | 996 | 1044 | 1030 |
| 1411 | Hmu0686 | 2102 | 3012 | 955 | 894 | 1002 | 1065 | 1093 | 1048 | 989 | 1125 | 928 |
| 1554 | Hmu2849 | 947 | 955 | 2442 | 1434 | 1564 | 1240 | 1295 | 1288 | 1126 | 1227 | 1177 |
| 1554 | VNG0794 | 918 | 894 | 1434 | 2390 | 1703 | 1228 | 1249 | 1197 | 1184 | 1220 | 1210 |
| 1640 | rrnAC2761 | 988 | 1002 | 1564 | 1703 | 2371 | 1293 | 1310 | 1277 | 1140 | 1250 | 1229 |
| 1848 | hla1842 | 1070 | 1065 | 1240 | 1228 | 1293 | 3012 | 1597 | 1581 | 1490 | 1611 | 1645 |
| 1965 | HVO_1401 | 1197 | 1093 | 1295 | 1249 | 1310 | 1597 | 2753 | 2098 | 1474 | 1572 | 1646 |
| 1949 | Hbo0148 | 1140 | 1048 | 1288 | 1197 | 1277 | 1581 | 2098 | 2793 | 1412 | 1602 | 1603 |
| 1691 | VNG0903 | 996 | 989 | 1126 | 1184 | 1140 | 1490 | 1474 | 1412 | 2591 | 1539 | 1479 |
| 1932 | rrnAC2656 | 1044 | 1125 | 1227 | 1220 | 1250 | 1611 | 1572 | 1602 | 1539 | 2981 | 1734 |
| 1821 | HQ2450A | 1030 | 928 | 1177 | 1210 | 1229 | 1645 | 1646 | 1603 | 1479 | 1734 | 2787 |
417 symbols consensus -----------------------MDRR-FLK-AAGVAGIAGLAGCSGG------GGDDGD #oth 123332323344344442344544411623323535244522111321232111334445 HVO_2031 :MAARDTGNGDAADETTRETRRGIE::DV::SGISL:A:::V:::L:::::::::S::ET Hmu0686 MVSEPDPDGESTAVDQRGDSDTPIN::DV:RSG:A::ITG:::::L--::::::T::G:: Hmu2849 :::::::::::::::::::::::----:---:----------------::::::----ME VNG0794 :::::::::::::::::::::::----:---:----------------::::::------ rrnAC2761 :::::::::::::::::::::::----:---:----------------::::::------ hla1842 :::::::::MPRTRPVVGDMASDF:::R::::::SA::LV::::::::PSGDGSD:S::N HVO_1401 :::::::::::::::::::::::::::S:V:::::::::::::::T::PSE::::SE:TT Hbo0148 :::::::::::::::::::::::::::K:::::T::::::::::::::PT:::::::STA VNG0903 ::::::::::::::::::::MADF:::E:::L:G:TV:ASLV::::S-::::::::GG:: rrnAC2656 ::MWLMCDTEVFNAYRHRWWDMSQR::T:IS:SV:T:TAI:::::L::DGGDGS:::G:: HQ2450A :::::::::::::::::::::::::::T:V:::T:I::::::::::::PSG::::AGNTE consensus TETDGEDGGDG---T------E-GP-----ANVGMVYALGGLGDRSFNDAANRGIQRAAE #oth 4544544433345423543233324422212522211241.11.41...2.34.233.34 HVO_2031 :T:TAA:D:G:DPE:TGETTESG:SEGET:T::AI:SSPA:F::QA:::L:LQ:L:T::: Hmu0686 GAG::G:::::DTE:DTTDGG:G:T:::::T:IAI:SSSA:F:::A:::L:LE:LEN::: Hmu2849 ::QVD::A---:::-::::::-:--:::::TQ:::I:::A::D:::::::::::::::RL VNG0794 -----------:::-::::::-:--:::::----::::::::D:::::::::::A:::RL rrnAC2761 -----------:::-::::::-:--:::::----::::::::D:::::::::::::::RL hla1842 DSS::D::S::SDGSDGSDGEDGSDGDDVP:T::I::SD:::::N::::::QQ::LQ:E: HVO_1401 AA:TT:SS:GDETT:AEQTTE:S::S::::::::::::::::::K::::::K:::EQ:ES Hbo0148 ::::T:ADTTESGE:TQETTE:S::A::::::I:::::::::::K::::::K:::E::KS VNG0903 :----------:::-::::::-:--:::::TK::T::GT:::::G::::Q:KQ:LE::KK rrnAC2656 :DS::G::::::::-::::::DS::A:::::RI:::::T:::::G::::Q:QT:AI:::D HQ2450A :::ESDNS:::MEV:TATETT:RS:A::::::I:::::T:::::G::::Q:QS:AIQ:E: consensus ELGIEYDEHEPDAASEFGTFQQRLAQSTNPDYDLVCCIGFAQADALSENAEEYPDQRFMI #oth 14214352311355543455.442.4153151..23111151432.543155221.4111 HVO_2031 :YD::IQQV:ETNQ:NYQ:V:S:::E:::::::::VLVSYNHTQ::QT:::A::::NW:L Hmu0686 :YD::LQQV:ETNQ:NY::V:S:::E:Q::::::IVLV:YQHTQ::ET:::::S:::W:L Hmu2849 DY::SFSN:::ETRDDIAML:K:::D:RL:N:::L:::::V:EES::DI:S:::E::::: VNG0794 DH::A:TN::::SIA:L:ET:AT::A:S::A::::::V::R:::G:ESA:AAA:::Q::: rrnAC2761 DD:V::TN:::TSVAG::EI:AE::S::S:S:::I:::::L::EG:::A:S::T::Q::: hla1842 :F::::::S:::G:G:::Q:::LY:S::D:E::::S::::N:G:::T:T:PQ::::D::: HVO_1401 ::::A:::VQ:S::E::PQ::R:F:::SS::::::S:::Y::KS::::T:PSFS::K::: Hbo0148 ::::::N:AQ:S::E::P:::R:F:::A::::::I:::::::KS::KQTSKNF:::K::L VNG0903 ::D:T:E:SQ:ENN:::A:D::QY::DGS--F:::N:V:Y::K:::AT::ADF::::WAL rrnAC2656 ::N:::::SQ:E:VQD::SL::QY:::S::N:::I:::::L:::::T::::Q::E:D::: HQ2450A DF::V:N:AQ::EV:Q:SN:::QF::::D:::::::::::L:::S:A:T:GSF:::D::: consensus VDDVVDADNVASYVFREHEGSFQAGVLAGLLTTREFSAGAGSTNPDSTTVGFVGGVEGPL #oth 21451143..32.4151231.113.61.242132234313112531442......41641 HVO_2031 IN:SI:QP:::G:TWAN:QM:::::::::TM::::LPYEGN:LD:::S::::::::D:S: Hmu0686 IN:HIERP::GG:IWAN::M:::::::::TM::::LTHEGN:ND::G:::::::::D:A: Hmu2849 ::G::::E::T::::S:::::::::H:::E::S::IDL:T:A:V::QR:::::::::N:: VNG0794 ::TA:::S:::::::E:QT::::::R::A:::::DID::G:A::::AR::::::::DE:: rrnAC2761 ::S::E:::::::::::::::::::N::::::::DVDL::::::::E::::::::LDQ:: hla1842 ::T:::EP:::N:L:::Q::::LM:::::R::ET:::::::::D::::::::::::DS:V HVO_1401 ::::::E::::::L:::EQ::::V:Y::::I::Q:::::S:::TA::KS::::::T:TE: Hbo0148 :::QI:R::::::T:K::::::LV:H:::::::QQ:E::::::SGN:KK::::::R:A:: VNG0903 ::ET::Q::::::R:::EA::YLV:E::::::Q::::::S:A::::AA:::::::I:T:: rrnAC2656 ::S:::::::G::::G::Q:::LI:LM:AK:S:QD::::::::QG::AS:::::::::D: HQ2450A A:S::ESP::V::T:K:::::YL::LM:S::::QD::::T:::VS:::S::::::::SD: consensus IKRFEAGFEAGVEHADEDVDVLTAYVGSFNDPAGGREIAASMYDAGADIVYHAAGAAGLG #oth 153.21215..254343222.534.4.215.4331543.531135.1.1111.1132.4. HVO_2031 :NA::RSYR::::WV::NL::TVG:I:NYT:TQTANN::T:Q::::::::::::A:::Q: Hmu0686 :NA::RAYV::::WVN:::::RVG:I:NYE:TQTAAN::S:Q:::::::::Q::A:::Q: Hmu2849 :E:::::YR::TNY::S::T:RSS:L:::S:IE:AYDT:KT:::E::::::::::S:::: VNG0794 THG:H:::Q:::T:TAS:I:::A::I:D:E:VEAA:TA::A::::::::::::::G::V: rrnAC2761 :HK:::::R::::Y:NT::::::E:L:N:D:VQ:A:D:::K:::D::::::::::G::V: hla1842 :R::Q:::::::DY:SDN:::T:S::::YA::S::Q:A:L:::QN:V::::::S::T:V: HVO_1401 :RK:Q::Y::::A::::EIS:DV::::::S:S:K:K:::T::::N:::V::::::GS::: Hbo0148 ::K:Q::::::AK::::ELT:S:::A:::S:S:K:K:::T:::ED::::::::::GT::: VNG0903 ::K:::::T:::NDVS::I:::SS::::::::SA:QSQ:R::FNS::::I:::SA:T:D: rrnAC2656 :G:::::YK:::K::E:::::Q:::::D::::S::Q:A:L:::ES::::::::::NT:T: HQ2450A ::::Q:::::::AAGSDNI::S:N:T:::::::A:::A::A::NG::::IF::S:NT:T: consensus VFQAAQEAGRFAIGVDSDQSVTNPNYADVILASMVKRVDTAVYNAIEAIVNDNFNGGEVT #oth 111..126111.2...31..415351211121.11.112421162344334224621445 HVO_2031 ::::::D:N:::::::A:::::L:E:Q:::MG:A::YINEGT:EVA::T:Q::WSAVQGS Hmu0686 ::::::::N:::::::A:::::L:D:Q:::IG:AI::INEGT:RVA:G::Q::WDEVSGR Hmu2849 ::::::ASN:Y:::::A:::RS::Q::::::::::::::N:::S:TSD::ETD:Q::S:V VNG0794 :L::::AN::Y:::::::::RS::R::::V:::::::I:::::D::::TIDGDLPA:D:V rrnAC2761 I:::::AH::Y:::::::::RS::R::::V::::::::NV:::D:AT:T:A::LPA:::V hla1842 ::::::AE::::F:::Q:::IS:ESF:::::::::::::::::ES:SN:ID::HQ:::TL HVO_1401 :::::K:Q:K::::::::::Q:E:::::::::::::::ES:::TSV:NVI::E::::ST: Hbo0148 :::::::Q:K::::::::::K:D::::N::::::::::E:::HTSV:N:TE:EY::::K: VNG0903 ::R:::DI::::::::R:::::KSDF:::V::::::::::::::::N:VA:G::A:::T: rrnAC2656 ::R:::::::::V:::R:::::KE:FS:I::::::::::N:::A:::STT::::D::A:N HQ2450A ::::::::::::::::RA::I:RDS:::I::G::I:::::P:::::A:K::GE:T:::SL consensus SL-GLEENGVEVVYGQQLGSEIPDDVKDALSESREAIIAGDITVPTEPE-------- #oth 421..262116321.4321432.3415531363135123.2141.334544322111 HVO_2031 NIL::::EA:R::L::AV:D:L::V:TEN:EAA:::::N::V:::CSASGC:::::: Hmu0686 NVL::DQDA:A::L::AI::KL::A:SQN:E::KQ::VD::V:::CTAAGCQD:::: Hmu2849 ::::::A:::DL:::IS:EPAV::E:AA::QQ::DD:V::E::::::V:G::::::: VNG0794 :::::AT:::S:Q::T:::PA:::A:T:::G:T:::LV:::::::::RPQSAGGGGV rrnAC2761 :::::DSD::G::::TS:EPA::::IRE:::T:::Q:A::::V::::RSNTGGA::: hla1842 A:::::S::::C:::D:I:G:V:::IVS:V:DA:DE::::N:D::ETTSD::::::: HVO_1401 T::::::D::AA:::AE::::::Q::::S:::::::::::::EI::TT::::::::: Hbo0148 T:::::K::I:C::::EI:GG::E:::T:V::::Q:::D:::S::DTT::::::::: VNG0903 R:::::DD::VA:::D:::A:::QS::::V:K::TEL:::::D:::::-:::::::: rrnAC2656 T:::::Q::::A:::::::::::QS:::EV:GV:QS::D:::S:::D:DNA:::::: HQ2450A :::::A:E::GLI::DS:::K::A::A:EV:TA:DN::S:::S:::S::::::::::