| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2506 | Hbo1668 | HVO_0629 | hla0289 | rrnAC2229 | Hmu0438 | HQ2476A | VNG2529 |
| 1978 | Hbo1668 | 2499 | 1856 | 1828 | 1756 | 1724 | 1898 | 1790 |
| 2063 | HVO_0629 | 1856 | 2470 | 2131 | 1769 | 1819 | 1863 | 1818 |
| 2068 | hla0289 | 1828 | 2131 | 2494 | 1847 | 1819 | 1872 | 1826 |
| 2142 | rrnAC2229 | 1756 | 1769 | 1847 | 2663 | 2183 | 1988 | 1951 |
| 2166 | Hmu0438 | 1724 | 1819 | 1819 | 2183 | 2559 | 1993 | 1948 |
| 2243 | HQ2476A | 1898 | 1863 | 1872 | 1988 | 1993 | 2540 | 2038 |
| 2129 | VNG2529 | 1790 | 1818 | 1826 | 1951 | 1948 | 2038 | 2530 |
365 symbols consensus -------------MVSKRFVLKRLLLLVPVLFGVATLVFAILHLAPGDPARVIAGQRASA #oth 11111111111111313..221.21..1...2...12..2..1.11....22.2.1..22 Hbo1668 :::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::TE HVO_0629 ::::::::::::::I:T::::::::::::::V:::S:::S::::S:::::LT:::E:::E hla0289 ::::::::::::::FP:::::::::::::::I:::::::S::::S:::::LT:::E:::Q rrnAC2229 MNWTQFLFRLVEPV:PP:::I::::::I:::::::SV:::::::::::::II:::::::: Hmu0438 ::::::::::::::::I::::::IA:::::::::::V::::::::::::::::::::::: HQ2476A :::::::::::::::::::LFR:V:::::::::::::::S::Q::::::::I:V:::::: VNG2529 ::::::::::::::A::::I::::::::::::::::F::V:::::S:::::::L::::PQ consensus EQVEQVRSELGLNDPLWVQYLRFLADAAQFDFGQSYSIARGTSVRSVLADRLPVTLELAI #oth 211322152...31.213..33..41212121.1.13131133123113321.1.....1 Hbo1668 A::AA:::D:::D::::M::G:::V:IVTLNL:E::I:Q::::ILTI:RA:::::::::: HVO_0629 :F:R::EES::::::I::::G:::::::::Q::E:FI:Q:N:T::E:::NK::::::::L hla0289 :F::RI:AD::::::I:::::D::GNV:R::::E::V:N:N::::E::S:T::::::::L rrnAC2229 ::L::I:V::::RR:::E:::G::W:::R:::::::::S::N:::::IS::::I:::::: Hmu0438 ::L::::R::::HR:::I:::S::::::::::::::::S::AP:::::L::::::::::: HQ2476A Q::A::::::::::::::::I:::I:::T:::::::K::Q:EP:QN:::S:::::::::: VNG2529 Q::I:L:Q:::::::VY:::A:::V::::::::::::V:Q::A:::::::KI:::::::L consensus YGQLIGILLGIPLGIISAVKQDSLTDHLTRIGALTGISVPIFWSGPLLILLFATFLGVLP #oth 1..23.121.1.1.11..12..11...31.1...2...1..1.1...1..1.112.221. Hbo1668 ::::::V:::::F:::::::::TI::::::V:::::::M::Y:T:::V:::::Q::N::: HVO_0629 :::::::S:::::::L:::::::I::::::::::A::::::::::::::::::QV::W:: hla0289 ::::F:::F:::::VL::::::T::::T::V:::A::::::::::::::::::QV::::: rrnAC2229 :::AA:::::L::::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::S:Y:D:F: Hmu0438 L:::A::F::L::::L::IR:::::::V::::::::::::::::::::::A:::Y:DWF: HQ2476A :::IT:::::::::V:::::::::::::::V:::::::::::::::::::::S::::I:: VNG2529 :::A::::::::::V::::E::T::::FG:::::S::::::Y::::::::A:S:::::F: consensus TSGRIAST-FL-D-W-LFGVE-LPLTGMVTVDTLLL----GNWDAFISAVRHLLLPALVI #oth 1.1..41121132313232332222..12.3.12121111.234114..13.12..2311 Hbo1668 A:N::::-:--:-:-:--QFDPPVY::LI:F::FIFGIQS:DFA:::::AS:M::::A:: HVO_0629 :::::SV-:--:-:-::YN::AIRV::L:::::F:A::::::::M:V:::::MI:::S:: hla0289 :::::S:-:--:-:-:VYN:GAIRV:::::I::::A:::::D::M:W:::::M:::S::: rrnAC2229 ::::::::L::P:T:T:::R::::::::I:L::I::::::::TE::L::AH::F:::V:: Hmu0438 :::::D::L::P:S:L:L:R:::::::L::::S::::::::::T::T:::H::F:::::: HQ2476A :::::G::I::SEQ:S:::M::::::::::I::::::::::EF:::::::::::::V::L VNG2529 A::::E::I::A:S:S::::T:::::::L:::::::::::::VS:WV:::M::I:::AT: consensus GIYSMALISRMMRSSMLEVVRQDYMRTARAKGQGAKITVLKHGFRNALIPVVTVIGIQFG #oth .1.21..1...........1....1.........11..21...11..11..1.1...... Hbo1668 :::G:::::::::::::::I:::::::::::::::::::M:::LQ::::::I:::::::: HVO_0629 :V:::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::::::M:::I:::::::: hla0289 :V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::: rrnAC2229 :V::T::::::::::::::I::::I:::::::::::::LM:::::::::::::::::::: Hmu0438 ::::T::::::::::::::::::::::::::::::R:::::::::::::::::I:::::: HQ2476A :::Q:::L::::::::::::::::::::::::::::::I:::::Q::::::::::::::: VNG2529 ::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::IM::::::::V::I:::::::: consensus TLLGGAVLTETVFGIGGIGTLLVEAIGVGDYPVVQGTVLTFALLFTLVNLGVDITYSYLD #oth 2............1.2.1.131.3..313...2......1..1...1..13..2..11.. Hbo1668 ::::::::::::::::::::M::K::E::::::::::::V::F::::::::::L:::::: HVO_0629 G::::::::::::A::::::::::::K:::::I:::::::::F::::::::::::::I:: hla0289 G::::::::::::A::::::::::::E:::::I:::::::::F:::::::V::V:::::: rrnAC2229 :::::::::::::::N:M:LTI:T::::S:::::::::::::::::::::F::V:::::: Hmu0438 :::::::::::::::N:M:LTI:T:::AL:::::::::::::::::::::V:::::G::: HQ2476A ::::::::::::::::::::M::S:::AS:::L:::::::::::::F::F:::::::::: VNG2529 S::::::::::::::E::::I::S::NAN:::L:::::::::::::::::L::V:::::: consensus PRIQQ #oth ...2. Hbo1668 :::D: HVO_0629 :::E: hla0289 ::::: rrnAC2229 ::::: Hmu0438 ::::: HQ2476A :::D: VNG2529 :::::