7 genomes BUD1290 10 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG1965 rrnAC0549 HVO_1542 HVO_A0275 Hbo1706 Hbo3504 - Hut0467 Hut2174 hla2213 - HQ1732A

Pairwise sequence scores
Consensus score	2582	Hut0467	VNG1965	HVO_1542	Hut2174	hla2213	Hbo1706	HVO_A0275	rrnAC0549	Hbo3504	HQ1732A
1144	Hut0467	2489	824	918	872	817	819	1080	1083	1074	1026
1627	VNG1965	824	2637	1461	1614	1606	1610	1053	1202	1117	1171
1900	HVO_1542	918	1461	2628	1698	1648	1666	1167	1389	1296	1430
1906	Hut2174	872	1614	1698	2623	1841	1915	1084	1383	1284	1379
1896	hla2213	817	1606	1648	1841	2691	1836	1128	1253	1327	1442
1929	Hbo1706	819	1610	1666	1915	1836	2624	1151	1323	1298	1411
1504	HVO_A0275	1080	1053	1167	1084	1128	1151	2701	1296	1490	1495
1691	rrnAC0549	1083	1202	1389	1383	1253	1323	1296	2694	1387	1561
1660	Hbo3504	1074	1117	1296	1284	1327	1298	1490	1387	2579	1597
1804	HQ1732A	1026	1171	1430	1379	1442	1411	1495	1561	1597	2714

391 symbols
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Hut0467         -:MVAEAGYFA:E-::-:---M:VV::::::I:::::GMA:LSLS:LALVV::V::AAS:
VNG1965         :PGLTLAT:::VD:AP:P:A:::LT:L:::::::::::::S::::::::LI::SLTL:P:
HVO_1542        VF::FA::I::::VST:R:I:::L::::::M::::L::::S::::::::L:::T:G:VIR
Hut2174         VLQ:V::A:::V:LGV:E::::::::L::::::::L::::::V::::::F:::GLA::E:
hla2213         :N:L::::I:::::EV:Q::L:::T:L::::::::::::::::::::::F:::GLA:::R
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HVO_A0275       -:MID::SFLSF:-::-:---M:V:::::::::::::GQ::::::::L::A:::G:LATE
rrnAC0549       -:M:IAFG:TAVD:::-:-:::A:::::::::::S:::::::C::::M:LI:::G:VVSE
Hbo3504         -:M:::SE:WAVE-::-:---M:::::::::::::L:::::::::::L::A::T:VVA:A
HQ1732A         :Y:::::::::::VDTPQLIF:::::::::::::::::::::C::::A::A:::::LVGV

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Hut0467         :AT:SP::::-:::::::FE::SLV:Y::AL:::V::::::::A::LGRHE---:ES:SF
VNG1965         D:-----:::-::::::PVS::NA:::::IV::::::::::::::::GT::P:L:A::GW
HVO_1542        QFE::DLVTA:EL::::G::I::::::::FV::::::::::::::::G:::AD::::SE:
Hut2174         N:GDL::IE::DI:::::::V::T::::M:T:::V::::::::T:::G:K:PD::E:::W
hla2213         GI:SSA:SDV:::::::YVSV::V::::AIT::::::::::::::::::K:P:::K:GE:
Hbo1706         N::TL:GIPG:EV::::::::::V::::AIT::::::::::::::::G:K:P:::G:EE:
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Hbo3504         E------:::-:::::::GSI:::VA::EP:S:A:S::::A::A::::::-:Y:::SG-F
HQ1732A         DA::T:VAIT-::::::GAPV::T::::A::::::S::A:A::A:::::KD:A:P::G::

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#oth            3..31.3.5212.121.2.11.13..32.3444544723111111144.4.42144.431
Hut0467         P::R::::FTPN:AQV:A:LA::A::VI:YWLAAL:RTF:::::::T::V::VMA:::V:
VNG1965         ::::G:N:Q:::::::::::::AV::A:::::AKVVTA:::::::::I:::N::VA::AT
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Hut2174         G:::G:::L::::::::I::::AI::A:::V:::VG:::::::::::I:::N::::::AT
hla2213         G:::G:G:T::::::::I::::AI::VI:::F::L:N::FSNVLGMSP:::F::V::FAT
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HQ1732A         :::P:::::::L::R::::::::I:::I:AVG:L:SA:::::::::A::W::::IM::V:

consensus       ALLARVAFGYPLIGSPAGD-GLLDMSPFERGEMR----AAADGGGED-G----RPATEPW
#oth            1421.31.1.121.45324124.1.2.11433512223544125566834324.211...
Hut0467         G::::I::::::V::IRD-::::::::Y::R:I:::::T:LE:HED:E:T::::L:V:::
VNG1965         ::I::PV::::IV:::S:S::::::G::::D:PH::::P:::::AAEHAG::::::::::
HVO_1542        :FI::I::::::::::::S::::::::::K:T::::::--G::S:--:-:::::::::::
Hut2174         :V::::::::::::RV::T:SV::::::::::D:::::P::E:EST-:-:::::::::::
hla2213         :F:::PV:::::::K::::::Y::::::::D::H::::PE::TD::HA::::::::::::
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HQ1732A         :A:H::::::::::G--::RN::::::::NE:::::::::T:::EVATDGGYK:L:V:::

consensus       LPHQYKWANVTAIGLVGGILGGYIWLQTGSVFLGFGISAASLLFLNLGVEKIPVTHHITL
#oth            1.1.13.4325321134.221123436.3151121111131.4113311232.11..121
Hut0467         A:Q:HR:LQTVLL:::V::FAA:VTYV:QRYY:A:::TLVL:GLSVA::DRL:IL:::AF
VNG1965         ::Q::T:TG::L::AIF:V:A:FL::::D:::::Y:L:::::V::QFD:PNF::::::::
HVO_1542        :::::::V:IVV:::GA:::::WT::I:E:F::AY:::::::::::::::::::::::::
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HVO_A0275       ::Q::::L::SLL::AV:V::A:LGYA::::Y:::::::V::I::SI:L:HF::::::::
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Hbo3504         ::::::::::A:VS::V:L::AF:AME:::I::A::::::::V:::::::R::::::MS:
HQ1732A         ::::::::::GM::::A:L:::F:A:S:::A:::::::::::T::::::::::::::M::

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#oth            4121522443522544531111165432331153.3431.41.442.22.1.21..2...
Hut0467         :A::IV:LSMP::--:FG:::::IE:::GLGAG::LA::::A:FGG::L:::A:::::::
VNG1965         L:A:::G:LGF::SVF:::::::P:L:VV:::C::V::::V::CGE:IL:S::G::::::
HVO_1542        G::AF:::::P::MV:G:::::::PLIIV::A:G:LIG::::::::::A::::G::::::
Hut2174         I:::::::L:M::A:LD:::::::PLV::V::G::::AG::::I:::L:::::G::::::
hla2213         L:A::::::VD:::VAG::::::-V:::::::I::V::G:A::::::L::S::G::::::
Hbo1706         M:A:S::AV::::A:VG::::::PIAI::::::::A::G::::L:::I::S::G::::::
HVO_A0275       :A::TAVF:M::::E::AVSSLPLAEVV:VGAAM::VC::F::LF:::::::G:::F:::
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#oth            .21.3462342331552.3234333224312
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