[V] (NorM) COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump 7 genomes BUD1291 10 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG0727 pNG7305 rrnAC2776 HVO_A0162 - Hmu2058 Hmu3155 Hmu3345 Hut1436 hla0794 - HQ2506A

Pairwise sequence scores
Consensus score	3560	Hmu3345	HQ2506A	rrnAC2776	Hmu3155	VNG0727	hla0794	pNG7305	Hmu2058	HVO_A0162	Hut1436
2264	Hmu3345	3466	1910	1672	2017	2015	2039	2026	2059	1893	1743
2358	HQ2506A	1910	3706	1848	2179	2038	2037	2082	2037	2041	1976
2257	rrnAC2776	1672	1848	3080	2316	1905	1955	1990	1960	1927	1839
2692	Hmu3155	2017	2179	2316	3794	2413	2419	2413	2381	2312	2245
2802	VNG0727	2015	2038	1905	2413	3623	2753	2766	2639	2270	2245
2929	hla0794	2039	2037	1955	2419	2753	3544	2795	2852	2349	2262
2982	pNG7305	2026	2082	1990	2413	2766	2795	3600	3029	2340	2291
2965	Hmu2058	2059	2037	1960	2381	2639	2852	3029	3662	2226	2161
2631	HVO_A0162	1893	2041	1927	2312	2270	2349	2340	2226	3598	2479
2537	Hut1436	1743	1976	1839	2245	2245	2262	2291	2161	2479	3592

564 symbols
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Hmu3345         :::T:WG::::::::::D::TD-:::T:::AR::LW:AI::AV::A::::::::::L:I:
HQ2506A         MNID::SAA:K::::I::R::::E::E:P::RS:::::::::::::::V:::F:::::::
rrnAC2776       ::---------::::--------------------------------------------:
Hmu3155         ::VT:L:E::RAFSVV:R:::::E::::S::T:::::::::I::::::V:::::::::::
VNG0727         ::::::SQ:SK::::::R:::SF:::::R::::::::AM:::::::F:::::::::::::
hla0794         :::::L::VD::::::::::D:F:::::::A:::::::M:::V:::F:::::::::::::
pNG7305         ::::I:S:V:S:::::::::::F:::::::::::::::M:::::::F:::::::::::::
Hmu2058         :::::L::I:::::::::::::F:::::S:::::::::M:::::::F:::::::::::::
HVO_A0162       ::-------MS::::::::QD::N::E:::V:::LY::::::V:::::::::::::::::
Hut1436         ::-------VS::::::::QS::A::E:S:V::::Y::::::V:::::V:::I::::::S

consensus       ---GQYSTDALAAISFAFPMVFLLISLGMGISVAGSVLVAQHTGAGETREAEYAASQTVT
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Hmu3345         ::::R:::TS:::M:::::::Y::L:::L:V::::::::::::::ED:E::NFV::::I:
HQ2506A         ::::R::::::::::LG::L:Y:F::::L:LT:::::::::::::TQ:AQ:D:::::::A
rrnAC2776       :::----------------:I:::::::::L::::::::::::::E:H::::::::::::
Hmu3155         ::::::::E:::::::::::::F::::A:::::::::::::Y:::::PEK:Q::::::::
VNG0727         ::::::N::::::::::::::::::::::::::::::::::Y::::KDEQ::::::::::
hla0794         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Y:::::A::::::::::::
pNG7305         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F:::::E::::::::::::
Hmu2058         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Y:::::E::::::::::::
HVO_A0162       ::::::::E:::::::::::::::::::::L::::::::::::::E::DK::::::::::
Hut1436         GIG:EAG:::V:G:T::::L::::::F:::L:::::::::::F::E:RS::R:::::::A

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#oth            224431441.551234.3421523..154..34.23.122211.1511.1.41.11.1..
Hmu3345         Y:AV:::V:::I::L::D:L:AV::::GA::TE::::LRI::::IG:L:T:V:::S:L::
HQ2506A         :TIAIGI::::A:VI::DEV::VF::D:V::AL::D::RI::F::::L:::II:::::::
rrnAC2776       ::L:::::::TA:::::::::::::::NE::::::G:L::V::::TA::::::::S::::
Hmu3155         :::::::FF:VT:::::::::RFV:::ES::::::::L::MA:::A:L:::L:::S::::
VNG0727         :S::::L:::GI::::::::::VV:::DA::RP::S::::VA:::AA::::A::::::::
hla0794         :::I:::V::G::::::GE::E:M:::A::::L:AS::E::::::VA::::A::::::::
pNG7305         :::IV:FG::I:::LG:DT::::M:::E::::M::S::E::::::L::::::::V:::::
Hmu2058         ::AI:::V::V::F:A::A::GVM:::A::::L::S::EL:::::L:::::A::::::::
HVO_A0162       ::F:G:AM:::F::PL:RP::DF::::::::::::::::::A:::::::::::::S::::
Hut1436         W:IGG:A:::LLAFPV:GPLIE::::::S:::::R:::R::A::::::::::::::::::

consensus       YGDTITPMLVMFGSVVLNIVLDPFLIFGWT--E--P--GTIPFPEL-------------G
#oth            2...2...1..1.1.11.121..11.2.2421122122233521311111111111111.
Hmu3345         ::::V:::::::::::::VA:::I::Y::G::-::-::---:V:::::::::::::::::
HQ2506A         S:::L::::::L:T:IM:VI:::I::::VG::-::-::---:V:::::::::::::::::
rrnAC2776       A::::::::::::T::::::I::::::::WV:-::-::----:::M::::::::::::::
Hmu3155         A:::V::::::::T::::V:::::::::::LV:SA:VV:::A::::::::::::::::::
VNG0727         ::::::::::::::::::::::::::::::VV:NA:LV::VS::R:::::::::::::::
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pNG7305         :::::::::::::::::::II:::::::::VV:NA:LV:::S::::::::::::::::::
Hmu2058         ::::::::V:::::::::::I:::::::F-:::SN:LFSMLDLGS:EATLLAATGYTGS:
HVO_A0162       A::::::::::::T::::V:::::F:N::AL:-::-:::P:Q::R:::::::::::::::
Hut1436         S::::::::::::T:::::A::::::Y:::LV:NA:VV:::A::::::::::::::::::

consensus       IQGAAIATVFSRALALVVGLAIMFSGRRGVQIHLADMVPDLEYLRKLLRIGLPASVEGTG
#oth            15...2..121.32.311.231122.62.23.5343.5.15513221212.3.112.331
Hmu3345         :R:::F:::AC:G::AAF:V:LLLY:TQ:L::RP:K:I::I:FGK:IG:V:::SA::EGA
HQ2506A         VD::::::::::GS:A::::W:L:::GH::::T:S::W::R::I:::::::A:::L:N::
rrnAC2776       VV:::V::I:::GV:::::IG:LL::::::R:::S::A:::::::::::L:I::::::::
Hmu3155         V:::::::I:::GV:MA::::::L::A:::K:SPGE::::PA:V:::::::V:::I::::
VNG0727         :::::::::::::::FA:::::::R:T:::E:NA:::L:::S:::R:V:::::::I::::
hla0794         :E::::::::::::::::::::::R:V:::R:NV::::::AS:::R:::::::::I::::
pNG7305         :E::::::::::::::::::::::R:N:::::::R::A:::S:::R:V:::::::I::::
Hmu2058         :T::::::I::::V::::::T:::R:::::::::G::::::D::PR:V::::::::::M:
HVO_A0162       :::::::::I::V::M:::I:::V::S::I::::T::R::FR::::I:H::I::::::A:
Hut1436         ::::::::::::S::M::::::::::::::R:D:RS:L:SIG:::T:::V:::::::S::

consensus       RALSMNLLLFIVGLFPDPVVAAFGIGTRVFSVIFLPAIAVARGVETMTGQNIGADKPDRA
#oth            .1212.12.31.23.2241..11.1.1.1..2111..1.321.....2...3.13331.1
Hmu3345         :::AI::M::::::::TA:::GY:V:I::::LVV:::V:F:S:::::A::::::REH:::
HQ2506A         ::::V:AI:L::T::ST:::::::V:I::::M::M::::ID:::::::::::::GNS::V
rrnAC2776       ::::V:AM:::::T:SVT::::::V:I::::LV:M::::MD::::::::::L::ER::::
Hmu3155         :SI:V::M:IV::T:ST:::::::V:::I::L::M:::::D:::::::::::::::::::
VNG0727         ::::::::::::AT:::HI:::Y:::::::::V::::::I:::::::::::V::G:::::
hla0794         ::V:::::::::A:::::::::Y::::::::::::::::::::::::::::::S::::::
pNG7305         :::::::::V::AM:::T::::Y:::::::::V::::::::::::::::::M:::R::::
Hmu2058         ::::::::::::AF:::A::::Y::::::::::::::::::::::::::::M::::::::
HVO_A0162       ::::I:A::IV::::STS:::::::::::::::::::::::::::::S::::::G:Y:::
Hut1436         ::::V:AM:IV::M:A::::::::::::::::::::::::G:::::::::::::G::E::

consensus       ARAARLAAKALFGVLSVLGVLVFFVAPPIVSVFTTDPE-----VVAIGAQFLRYVALTFG
#oth            541353..342.31.342.232345134124313424322222.323232.1132111..
Hmu3345         E:TVSF::V::::::TFV:LV:WVG::V::D:::R::D::::::::A::T:::F::P:::
HQ2506A         SKTN:F::ITS::I::I::IIT:IF::E:IRA:DDS:A:::::::EQ::T:::WI:P:::
rrnAC2776       :T:NHF:::VS:AI:T::::VTI:A::AV::::SD::::::::::R:::E::QW::P:::
Hmu3155         NT:NHF::::S:LI:AAV::V:::T::T::N::SP:Q::::::::R:::E:::W::P:::
VNG0727         ::::::::TM:::::::::LI:YWYPE::::::VGAGQENSAQ:IEA:S:::::::::::
hla0794         E:::N::::T::A::::A::A::L:PE::::::VGADQADAGR:::V:S::::I::::::
pNG7305         :K::G:::TV::::::LA::::W:T:A::ADL:::::::::::::E:TT::::::::S::
Hmu2058         Q::TG:::TV::::::AA:I::::::A::AD:::::::::::::::VAT:::::::::::
HVO_A0162       EQ:NYV:::G::F::GL:::AI:L:PE:::::::::A:::::::LEV::E:::::S:S::
Hut1436         GM::YA::::M:AI:::::L:I:LFPR:::APLSPSA:::::::T:::VE:M::T::S::

consensus       FIGIMRAYSGGFRGAGKTLTAAAISVLMLGVIRLPVAWVASQG-----------------
#oth            .1.15..1211...1...22..2131431131.113123224724243111111111111
Hmu3345         :::VR::FNA::::::::G:::I:V:GV:::V::ST:YG:ADI:::::::::::::::::
HQ2506A         :V::L:::::::::::::::::V:TIVLF:F::::::Y:V:::LIPFD::::::::::::
rrnAC2776       ::::V::::::::::::::::::LA:T:::I::::::::::RPVSVPA::::::::::::
Hmu3155         :::VV:::::::::S::::::::LAI::::F:::::S::::RVVDVSTVSLSVPGVGTLA
VNG0727         ::::A:::T:S:::::::MV::::::IT:::::F:L::ATIGS:::::::::::::::::
hla0794         ::::::::T:S::::::::::::::::::::V:F:I::::AGR:::::::::::::::::
pNG7305         ::::::::T:S::::::::::::::::::::::F:I::F:AVP:::::::::::::::::
Hmu2058         ::::::::T:S::::::::::::::::::::::F:I::F:AGE:::::::::::::::::
HVO_A0162       :::::::F:::::::::::I::V:::VT:AG::::::F:::::LLPTD::::::::::::
Hut1436         :::VI::F::S::::::::I::::A::T::::::S::F:T::-:::::::::::::::::

consensus       ----------------LGET---GIWLSFAVSNVVGALIAYAWYRRGTWRDGDLTE----
#oth            11122122121213232143222...32.22.1241142.32.131....3512331111
Hmu3345         ::::::::::::::::::P::::::::G::L:::::G:L:F:::S:::::GT::MG::::
HQ2506A         :::::::::::::IWIF:TRTPE:::F:::I:GI:A::V:AG:FE::::::R::::GTDT
rrnAC2776       :::WLGPQVVDLFAYS:A:Q:::::::A::::::LA:GL:A::FL:::::EA:PRN::::
Hmu3155         TDILAGTPVADAFAYS::SR:::::::G::::::LA:VL:W::FS:::::EA:::D::::
VNG0727         ::::::::::::::::::SA::::::::::::::I::I:::::::::::::TGVVD::::
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pNG7305         ::::::::::::::::F:::::::::I:::::::A::I:::G:::::::::S::::::::
Hmu2058         ::::::::::::::::I:::::::::::::I:::A::V:::G:::::::::N::::::::
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Hut1436         :::::::::::::FW:::R:::::::VA:V:::AG:::::WL:::::::::::VR:::::

consensus       ----NPA--D-DDAGVEPAATDD-
#oth            111177543463445634255521
Hmu3345         ::::---::-:-:::P:::DD:-:
HQ2506A         PADA:R:TEQSS:PDPD:S:SET:
rrnAC2776       ::::---::-:---NS:::VA:::
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VNG0727         ::::ATT::AQE:T:::QS:QT::
hla0794         ::::RS:AG:V:EPV:AAES::::
pNG7305         ::::TKV:::I:E::I:MS:DG::
Hmu2058         ::::DGI:::L::::M:::T::::
HVO_A0162       ::::S::GGELENDD::LSSGL::
Hut1436         :::::IEVDAT:P:ET::EP:V:D