|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1444 | VNG1514 | hla1640 | Hut0587 | HQ1796A | Hmu1668 | Hbo2658 | HVO_2890 |
746 | VNG1514 | 1479 | 520 | 556 | 659 | 644 | 629 | 603 |
893 | hla1640 | 520 | 1491 | 569 | 711 | 599 | 703 | 630 |
833 | Hut0587 | 556 | 569 | 1447 | 697 | 710 | 691 | 699 |
948 | HQ1796A | 659 | 711 | 697 | 1438 | 642 | 814 | 808 |
909 | Hmu1668 | 644 | 599 | 710 | 642 | 1531 | 726 | 752 |
1026 | Hbo2658 | 629 | 703 | 691 | 814 | 726 | 1492 | 864 |
998 | HVO_2890 | 603 | 630 | 699 | 808 | 752 | 864 | 1457 |
221 symbols consensus VTTWVETPEGGRERGPRGLARAWIEVLLRPRRFFANGVAPGDQAPGLVFAIVVAAAYAGG #oth 1.2.125132..2..14122111532333.231.34112......1.1.24311422454 VNG1514 M:::::-:::::::::L:::KSFTQ:::N:VS::DEA:S:::::::::::M::VGVV:AT hla1640 ::S:IAD:::::A::::A:::::::A:V::::L::::::::::::A:T::VA::::::L: Hut0587 ::Q::DPTGR::::::M::L:::LG:MTT::E::Q:A::::::::::::LTGIV:IEESV HQ1796A M:::::::T:::::::::VV::::A:IIA::Q:::SA:T::::::::::::SI:T::VV: Hmu1668 ::Q:::N:T:::D:::IA:V:::A:I::::Q:::QA:I:::::::::::IA::VLVEE:S Hbo2658 ::::I:H:::::::::::V::::F:::T::Q:::R:::S:::::::::::V:::V::TTV HVO_2890 ::::::::RE::D::LT:IL:::VA:VV:::Q::RD:::::::::::::::A::LV:Q:L consensus RFAFV-----------PADIPAISDGPPLSALLALLAVVLLVAPAGLHLTAAIQTLLLIP #oth 4315311111111111.3531325455532.423222211121.241.211.31.34134 VNG1514 EL:AT::::::::::::S:AL:FPTADW:A:V:TVAL:::::T::AV:ALS:::::C:VI hla1640 WIVSE::::::::::::GVV:E:VVSV:V::AILF:L::V::::V:::::::VA::SV:L Hut0587 :Y:L:::::::::::::GAA:VL::R:VAT:V::V:VT:V:I::T::::L:::::I::W: HQ1796A L::GN::::::::::::SQ::QL:NNLMT::SITV::::::I:::I::::::V::IV::F Hmu1668 :::V:ELAQRGQLSLG:Y:Y:V:G:LE::T:::::V:I:VF::::V::::::A:::::A: Hbo2658 L:::::::::::::::::R:::LAG:QA:::FVG:A::A::L:::V::I:::L::VF::A HVO_2890 G:::E:::::::::::::T::::EG::LV:::V:::V:A:F::::L:::::::::A:::: consensus -LVE--------DRGGVSETVQVIAYAAAPCAVAGIPIPELRVVCAGYAAVLLVIGISEV #oth 2452111111123.1.1.....22...21.123112141412321231124.233.4231 VNG1514 ATIS:::::::ES:::::::::L::::::::V:T:LGV:V:TLLAGVW:WC:::V:T:V: hla1640 AS::FDDGIALR:::::::::::V:::SS:M:L::P:::::::::GA::::::L::FRI: Hut0587 :IT:::::::::::A:I::::::L:::T:::V:::::W:P:Q:AAT::GSL:::A:L:T: HQ1796A :V:P::::::::::A:::::::IV:::::::II:::::AA:Q::::I::SI::I:::R:: Hmu1668 ::AP::::::::::::I::::::::::T:::VF::L:L::V:IA:GIW::G:Y:Y:MGTI Hbo2658 TVW:::::::::N:::I::::::::::S:::::::::S::::L:::::G:::MF::L::: HVO_2890 ::LS::::::::R:A:::::::::::::::::F:SL:::GV:AL::V:G:::::V::::: consensus HGTSLLRAAVAAAVPAALLFGYAFGGFRAGAALL-ALG--- #oth .5324222321223.14231.33221341463245433341 VNG1514 :EI::P::VI:::::GV:A::AG::AIP::EQVIH:A:LAF hla1640 :::T:::TL::GVP::L:GY:V---:Y:VF::VRTLI:::: Hut0587 ::INQ:KGML:G:I:::::Y:V:::::D:VG:IV:---::: HQ1796A :T::T:::VI::GI::T::Y:S:L::ID::VE::QS:SIL: Hmu1668 :NL::P::L:VSVA:::V::::G:RA:A:AD::::---::: Hbo2658 :DV:IAH::::G::::TF::::V:::AT:FITIVRT::VI: HVO_2890 :Q:TVPK::L::::::GVV::::::::::LSE:AA::ALV: