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7 genomes BUD1296 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC3080

HVO_0040

Hbo1453

Hbo1454

Hmu2742

Hut2642

hla0662

-

HQ2437A

Pairwise sequence scores
Consensus score1170 Hbo1454 Hut2642 HQ2437A rrnAC3080 Hmu2742 hla0662 HVO_0040 Hbo1453
500Hbo1454 1152 324 372 368 390 495 485 504
711Hut2642 324 1178 629 692 671 432 485 489
708HQ2437A 372 629 1198 732 662 470 493 489
843rrnAC3080 368 692 732 1178 804 526 559 550
842Hmu2742 390 671 662 804 1181 521 514 525
683hla0662 495 432 470 526 521 1171 600 580
758HVO_0040 485 485 493 559 514 600 1146 741
700Hbo1453 504 489 489 550 525 580 741 1127

161 symbols
consensus       --MATETATTQTESTGNGDWRAGVLAGIAGALVMGALMIVMNRATLAVAIPSLYGLAGPP
#oth            1223223553566425544142.131.221231121234223432122...11.223112
Hbo1454         :VEQQQRDEQSELT::VER:Q:::V::LL::VAFS::LAISAP:A:TA::::M:::S:--
Hut2642         :::::::SH:V:RGVQPTNVVK:G::::::::::::::::::E:VI::::::::T::P::
HQ2437A         MSTT::::NNPQADVY::E:T:::IG:::::I::A:AI:A::TP::::::::::T::P:A
rrnAC3080       :::S:T:E::::YDVST:N:K::::G::::SA:::::IL:::T::::::::::::::P::
Hmu2742         :::S::NVDA:RTA::TA::K::::G::::::A::V:VL:::D::::::::::::::P::
hla0662         :::::::::ATNV:IEH:::::::AG:L::G::F::M:S::TPGV:EM:::AM::IE::A
HVO_0040        ::::S:::::RL:::TATS::T::A::SLA:V::::M:V:QM:PV:E:::::M:::T:--
Hbo1453         ::::::ATMQTV:::S:D::Q:::::::I:GI::::M:V:QM:SA:E:::::M:FFS:--

consensus       GAA-GMAIHVSHGAILGVAFAALARALDDDGDG--RSLGLGVGWGVLTWVGLAALVMPVW
#oth            2432.341.22...32.14.12335445455643344212.421.132.341.121..2.
Hbo1454         :M::::G::L::::L:::V:V:VL:LWP:P:RTVT:AAIA:TAY::VL:GI::VF:::L:
Hut2642         SVPL:::V::F:::M::L:::VTVGM:GM:SN:::QVV:::IA::::::::::::L::::
HQ2437A         NVGL:LFV:L::::::::I::::IGVGEFS:L:::ARV:V::V:::I::A:F::::::::
rrnAC3080       SP:A:LVV:L::::VM::M::G:::V:SLESS:::KL:::::::::A:::LF:::L::::
Hmu2742         NPGL::VV::::::V::LG:::::Q:::VRETN:::LV:::L::::::::::::::::::
hla0662         ::V::W:::M::::VI:LG:::I:ILKP:LD:SIGT:::V:A:Y:L:V:LA::VI:::I:
HVO_0040        :::::FT:::A::::::::::G:VS:::F:L::SL::::A:::Y::VL::V::V::::::
Hbo1453         :L:::FT:::A:::::::V:::V:ATRNLSTG-::Q::::::AY::AL:AV::VF:::::

consensus       LGAVGSPASPPLPNFAPPSLLGHVVYGAVLGVVYAALRDRF
#oth            .11..1112.11.12333..11.31..5.112513244445
Hbo1454         :S:::FAGA:S::A:DLM::V:::L::I:::AT:PR::R--
Hut2642         :S::::::::SF::::M::::W:G:::L::::G::VAA:GN
HQ2437A         :::::::::::::::::::::W:LL::V::::I:DVSE:IA
rrnAC3080       :::::::::::F:::::::::W::::::::A::::VTA::I
Hmu2742         :SV::::::::F:::::::::W:A:::L:::::A::::T:L
hla0662         :::::F:GA:::::IGVE::V::::::T:::G::S::SN--
HVO_0040        ::::::::N:::::VNVT::V::::::::::AS:P::DGV:
Hbo1453         :SV:::::N:::::VNVT::V::::::G:V::A:S:V::::