| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 6945 | Hut0893 | rrnAC1729 | Hmu2336 | hla0530 | HQ1051A | HVO_2945 | Hbo1592 |
| 5493 | Hut0893 | 7153 | 5319 | 5381 | 4914 | 4466 | 4701 | 4735 |
| 5507 | rrnAC1729 | 5319 | 7131 | 5756 | 4791 | 4575 | 4665 | 4748 |
| 5561 | Hmu2336 | 5381 | 5756 | 7189 | 4862 | 4487 | 4674 | 4705 |
| 5756 | hla0530 | 4914 | 4791 | 4862 | 7045 | 4922 | 5100 | 5241 |
| 5444 | HQ1051A | 4466 | 4575 | 4487 | 4922 | 7284 | 5245 | 5414 |
| 5727 | HVO_2945 | 4701 | 4665 | 4674 | 5100 | 5245 | 6864 | 5882 |
| 5850 | Hbo1592 | 4735 | 4748 | 4705 | 5241 | 5414 | 5882 | 6846 |
979 symbols consensus ------------------------------MPSGEYDPDTVEPRWQDRWVDEDTYAYDE- #oth 111111112222221212221112323112223.1...222.22..23..232212.321 Hut0893 ::::::::MSTEHETDDEPTDESTPDP:::ALA:D:::RET::::::Y:::N:VF::E:: rrnAC1729 MLPGCYTHRLNMSDTQDPPQDESTTDESADALD:::::REI::E:::Q::ADK::::::: Hmu2336 :::::::::::MSDTQD:ATDESPAEQ::QGIE::::::A:::::::H::EAE::::E:: hla0530 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R:::::E::::PD: HQ1051A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::TK::::::::E::T:ASS HVO_2945 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::AK::E::::::L:::P:: Hbo1592 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::AK:::::::::::S::D: consensus -----------------------------------EAVDPDTAFSIDTPPPTVSGSLHMG #oth 11111111111111111111111111111112223543.11.311..1.......1..1. Hut0893 ::::::::::::::::::::::::::::::::::S:TP:A::Q:T::::::::::::::: rrnAC1729 :::::::::::::::::::::::::::::::::::---:A::R::::::::::::N:::: Hmu2336 :::::::::::::::::::::::::::::::PESG:T:::::RY:::::::::::N:::: hla0530 ::::::::::::::::::::::::::::::::::DDP:::N:V::::::::::::::::: HQ1051A IVSASDSEFDPHLASESESSDEHTLDNSSDGAHVDIEA:::::::::S:::::::N::W: HVO_2945 :::::::::::::::::::::::::::::::::::R::::::V::::S::::::::::W: Hbo1592 :::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::A:::::::S::::::::::W: consensus HLYGFTLQDFVARFHRMRGDEVYFPFGYDDNGIASERLTEDELDIRHQDYERREFQEKCR #oth .2.1.........15..313211....1........1.1.1.1211.1112..1..3211 Hut0893 :::Q::::::::::R::TD:T:::::::::::::::::::R::::::S:F::::::::T: rrnAC1729 :::Q::::::::::::::D:T:::::::::::::::::::R:::::::::P::::::::: Hmu2336 :::Q:::::::::Y:::AD:T:::::::::::::::::::R:KG:::::F:::V:::::: hla0530 ::::::::::::::E::N:G:TF::::::::::::::::::::::::::F::::::A::: HQ1051A :V::::::::::::K::::SD:F:::::::::::::::A::::NV:::E:::::::QMTQ HVO_2945 :V::::::::::::T:::::::::::::::::::::L::::::G:K::::::::::KL:: Hbo1592 :A::::::::::::N::::K::F::::F::::::::::::::::V:::::D::::::M:: consensus EVCAQYEAEFTEDVQSLGISIDWDNTYQTIEPRVQRVSQLSFIDLYEQGREYRQRAPTIW #oth 1.1331.22..121.2.11.1..12..1..212.1.3.....21..12.11..21..1.. Hut0893 D:::D::DA::::::::A::V::::::K::::::::I:::::L::::::K:::::::::: rrnAC1729 D::T:F:D:::Q:::::A:::::::::K::A:D:::::::::L::::::::::::::::: Hmu2336 :::ET::::::::::::A::V::::::K:::::::::::::::::::K:::::::::::: hla0530 ::::E:::Q:::N:::::V:V:::H:::::::::::I:::::L:::D::::::EK::A:: HQ1051A :::Q::::::::KM:Q:::::::NQ:::::SSD:K:T::::::::::::::::K:::::: HVO_2945 ::T:E::S::::KM:N::::::::Q:::::S:E:::::::::V::::K::Q::::::A:: Hbo1592 :::E::::::::KM:N::::::::Q:::::S:E:::A::::::E::DD:::::::::A:: consensus CPECETAISQVETEDDEQGSHFHDIAFPLV--GNGPADDG-ETFTISTTRPELLPACVAV #oth ..1.........1..321413.1..1.312332434322432211.............11 Hut0893 ::D:::::::::Q::T::HTT:N::E::::AD:::E:::::::L::::::::::::::SI rrnAC1729 ::D:::::::::Q::KDKHTK:N::::D::ET:E::::ED:A:::::::::::::::::: Hmu2336 ::D:::::::::Q::EH:ETL:N:::::::ED:T:::::-:::L::::::::::::::SI hla0530 ::::::::::::::::::A:::::::::V::::GDAT:::A:E:V::::::::::::::: HQ1051A ::::::::::::::::::P::::::::E:INKN:PRSEHRTD:::::::::::::::::I HVO_2945 :::::::::::::::::::::::::E:GVA::------:SE:S:V::::::::::::::: Hbo1592 :::::::::::::::::::::::::E:EV:::------:SE:E:V::::::::::::::: consensus FVHPDDDENQHLVGGEARVPLFGQEVPIIEDERVDLETGSGIVMCCTFGDQTDIEWYQAH #oth ......12.12...33.11...212..111.1...1...1.2.........1......1. Hut0893 :::::::A:A:::::T:E:::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::: rrnAC1729 :::::::::::::::S::::::E::::V:A:::::M:::::::::::::::N:::::::: Hmu2336 :::::::A:::::::T:::::::H:::::::D:::::::::V:::::::::::::::::: hla0530 ::::::::::N:::ES:E:::::H:::::A:::::M:::::::::::::::N::::::V: HQ1051A :::::::D::D:::AD::::::D:T::::A:::::M:::::::::::::::::::::::: HVO_2945 :::::::D:A::::Q::EI:::::R:::L::::::::::T:L:::::::::::::::::: Hbo1592 ::::::E:::::::E:::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus DLPLRIAIDESGTMTDVAGEYEGLSTTEAREAIVADLDDAGALLDRRDITHTVNVHERCG #oth 1.2..2.....111.12.23.3.22231..11.22..23313..13.212.1.1.....1 Hut0893 ::::::::::::::::R::::::::::::::::I:::::::H::ES::HH:S:Q:::::E rrnAC1729 :::::L:::::A:::::::::::MH::::::::IE::REE:S::ES::HD:::Q:::::E Hmu2336 :::::::::::::::::::D:Q:Q::RD::D::L::::AE:Y::EQ::HD:::Q:::::E hla0530 ::N::V::::::H:::::EG:::MHAD:::::::E:::G::::::::::::::::::::: HQ1051A ::D::::::::::::::::S:S::DS:::::S:::::SESD::::::E:::::::::::: HVO_2945 :::::V:::::::::EE:DD:A:::AD:::::::S::::::::::K:A:::::::::::: Hbo1592 N:D::::::::::L:::::::::::SE:::::::S::::D:::::K:A:::::::::::: consensus TEVEFLVTEQWYVELLDKTDEYLEAGREMDWYPEKMFTRYKHWIEGLQWDWCISRQRSSG #oth 131.1..11...121..221..111.11.1.2....11..11.1...1...3.....1.. Hut0893 ::::Y::::::::DM::S:E:::::::::::::::::::::::::::E:::::::::D:: rrnAC1729 E:::Y:::::::I:::::KE::I::::Q:E::::::A:::E::::::E:::::::::D:: Hmu2336 ::::Y:::::::::M::R:::::::::Q:::H:::::S::E::::::E:::::::::D:: hla0530 :S::::::::::::M:::::::::I::::E:S::::::::E::V:::::::L:::::::: HQ1051A :NI::::KD::::K:::::::::T:::::E:::::::::::N:::::::::A:::::::: HVO_2945 :S:::::KD:::IK::::RE::::::EQ:::::::::::::N:::::::::A:::::::: Hbo1592 :G:::::KD::::::::::::::::::::::::::::::::N:::::::::S:::::::: consensus IPFPVWYCEDCGEPVVAEREDLPVDPLSDDPPVDACPECGHDEFEPEDDVFDTWATSSLT #oth ..1.....11.11214.2113........4...12..1.2113151.2..1......... Hut0893 :::::::::::::::F:D::::::::::::::::S:::::GAD::::S:::::::::::: rrnAC1729 ::I:::::D::::::M::::Q::::::::A::::S:::::::SLT::E:::::::::::: Hmu2336 ::I:::::::::::IP:NKA:::::::::E::::::::::::DLR::E:::::::::::: hla0530 :::::::::::::I::::KA::::::::::::::::::::::::::::::L::::::::: HQ1051A ::::::::DA:EHV:I::K:S::::::::N:::ES::A:N::T:I::::::::::::::: HVO_2945 :::::::::::EHV:::D:::::::::::G::::::::::::::AA:::::::::::::: Hbo1592 ::::::::D::EHV::::::N:::::::::::::T::::D::::V::::::::::::::: consensus PLINAGWDWDA-----------DAEEFTMDRPELYPFDLRPQGHDIISFWLFHTVVKCYE #oth ..1......231111111111122132332421..2112...............1..... Hut0893 :::::::::QPADESAETADSV::G:::F:N:::::MN:::::::::::::::::::::: rrnAC1729 ::V::::::::::::::::::::S:S:::EL::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2336 ::V:::::::::::::::::::E::A:S:EN::::S:::::::::::::::::::::::: hla0530 ::::::::::E:::::::::::::G::::EH::::Q::::::::::::::::::L::::: HQ1051A :::::::::ND:::::::::::NT:TIEFGDSG::::N:::::::::::::::::::::: HVO_2945 :::::::::NP:::::::::::ET:AMEL:::::::::M::::::::::::::::::::: Hbo1592 ::::::::::E:::::::::::::::IVI::E::::::V::::::::::::::::::::: consensus HTGEVPFDSVMINGMVLDENREKMSKSKGNVVSPDEVLEEFPVDATRYWAAGTAVGDDFP #oth ....1..131.1..1.......1....1...13.22.2321....1......111...1. Hut0893 ::::I:::T::V::::::::::A:::::::::::EA:::D:::::::::::::SI::::: rrnAC1729 :::::::EN:::::::::::::A::::::::IP:S::::::::::::::::::SI::::: Hmu2336 ::::::::N:::::::::::::A::::::::IP:SD:::::::::::::::::SI::::: hla0530 :::::::EET::::H::::::::::::V::::E:EA::A::::::::::::::::::::: HQ1051A :::::::::::::::::::::::::::::::IA::::IT:Y::::A::::::S:::::L: HVO_2945 :::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::K:::::A::::::S:::::L: Hbo1592 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSKY::::A::::::S:::::L: consensus YKEKDLRAGEKLLRKLWNASKLVEQLAPDA-YPEPFDHEDLAAIDRWLLAELDAEIESVT #oth 12.2112...1.21......1..12.22324432343331.332.1.1..31.322131. Hut0893 F::N::E:::R::Q:::::::::D::::GNN:E::---:::::::E::::K::DT:::L: rrnAC1729 :::G::E:::R::Q::::::R::D::T:A:RPD::---:E:::V:E::::::::TV:::: Hmu2336 :::G::E:::R::Q::::::R:::::::APEAVD:V:ES:::P::E:F::::::TV:::: hla0530 F:::::::::::I:::::::::::S:::EP:::DTPAD:::REL:::::::::DR::RL: HQ1051A :S::GI::::::::::::::::::D:TT::PD::TMS:A::E::::::::RI:T::DRL: HVO_2945 :Q::G:V:::::M:::::::::::S:TE:::-:AE:::D::K::::::::S::R:L:F:: Hbo1592 :S::G::::::::::::::::::DS:SE:::-::S:::D::KQ:::::::S::R:::H:: consensus EKFENREFSKARDELRSFFWNTFCDDYLEIAKQRLREG--DDASAAYTLRTAHRRFLKLF #oth 3212411.....13..11..21........1.1.32331122511211.43..11..21. Hut0893 ::LDTY::::::N:::T:::S:::::::::::::----::::K::::::V::::T::::: rrnAC1729 A:::DY::::::N::::::::::::::::::::::SD:::EAV:TEF::LQ:::T::Q:: Hmu2336 DR::AY::::::N::::::::S:::::::::::::SGD::GS::TEFA:TR:::T::::: hla0530 GL::D:A:::::::::::::::::::::::V:::----::E:DA:::::::::::::::: HQ1051A ::::S::::::::G:::V::H:::::::::::H:I:::TTG::A:::::TV::::::::: HVO_2945 ::L::::::::::R::::::H:::::::::::::V:::::::P::::::Q:::K:::AC: Hbo1592 ::LQ:::::::::D::::::::::::::::::::V::S::::E::K:::::::::::::: consensus APILAHVTEELWRDMYAE--------------G-RSSIHRADWPEPLGLDADLEAGETAM #oth ..2.1.22..1.433143332211111223332435.1.433..212.21.132..11.1 Hut0893 ::F:P::V::I:QAK::::::::::::::::V:E:N:::VSE::::R:Y::::A:::::: rrnAC1729 ::F:P:I:::::ERC:E:::::::::::::::-:D::::TT:::TSG:Y::::::::::: Hmu2336 ::F:P:I:::::DRI:RTDGST::::DRAGLA:GD::::TT:::T:G:Y::::::::::: hla0530 ::L:::::::::H::::DGASDPDAVDAAVAD:A:D:::L:::::::::E::H:::AA:T HQ1051A ::::::AS::::H:::VSNSID::::::KTDDISSE::::QS::N:::I::NVD:::A:: HVO_2945 ::::::::::::::::D:::::::::::::::-:-A:V:DQP::::::::::VA:::::: Hbo1592 :::::::::::::E:HE:::::::::::::::-:-T:V:::S:::::::E::F::::::: consensus AVVGALRKYKSDNQLPLNADLDRVEVYGDVAGFEDDIAGVMHVADLELL-DEAPDIETVI #oth 2111...3..1321121..32.3.2121116111311331..124133313131412111 Hut0893 :TI::::G::T:HGMA::::I:::::::::S:::SA:QQA:::DE:SVV:EDD:E:S:E: rrnAC1729 E::S:::R::TE:G::::::::H:::F:HI:::::AV:EA::::Q:DTY:::::::T:E: Hmu2336 E:IS:::T::T::G::::::::H:Q:::H:E:LA:AV:EA::::::::::AD::::T:E: hla0530 :::::::::::K:::::::E::A::::A::R:::E::T::::::::TVHP::DAPV:::: HQ1051A S::::::::::NA:::M::T::::LIW::ID:::S:::D:::IET::SV:S:R:S::S:V HVO_2945 :::::::::::::::SM::PV:L::::::IH:::E:VS::::IEK:::::::E:E::S:V Hbo1592 :::::::::::::::SM::PI:L:Q:::::QD::A::S:::::EEM:T::A:E:Q::S:V consensus TGIDLDYSLVGPEYGAQVGDIEAAIEAGEYEIDDDRLHVAGVTLDPEMFAIEEERTYSGD #oth 2211.1.12...21.32.22.12111621..231251123111.3311.3121313.5.1 Hut0893 AE:S:::AT:::K::D:::G::Q::ATD:::L:G::::AGD:::E:DE:EVRK:H::A:E rrnAC1729 S::::::::::::F:SE::A:D::::D:D::::G:T:Q::::E::D::::V::S:::::E Hmu2336 SD::::::I::::::N:::::::G:AQ:D:::E:G::::::::::A:::E:::A:::::: hla0530 :::::::AT:::K::D::::::::LAKE:::::GEE:::T::::VE:E:::::::Q:Q:: HQ1051A ::V::E::::::AF:NA:S:::T:::S::::VV::Q::TE:I:::::::D:QKR:Q:T:: HVO_2945 ::V:::::::::::::::P:::::L:GDD::VE:GVM:::::E::::::T:::S:E:V:: Hbo1592 ::V::::::::::F::::P:::::L::E:::VG:GH::A:::E:A::::T:::::K:M:: consensus GEM--LETDDAVVIVQN-- #oth .1111311221211.2333 Hut0893 ::L::V::::VAIV::S:: rrnAC1729 :::::T::ES:::V:R-:: Hmu2336 :::::I::ET:::::G-:: hla0530 ::L::::A::V::::R:EA HQ1051A :::LD:D:::VI:::::N: HVO_2945 :D:::::AG::I::::HAD Hbo1592 :::::::AG:::::::HEN