| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 6752 | Hut2168 | rrnAC0562 | Hmu1338 | hla0963 | HQ3197A | HVO_2621 | Hbo2221 |
| 5160 | Hut2168 | 6796 | 5021 | 4989 | 4239 | 4261 | 4470 | 4480 |
| 5298 | rrnAC0562 | 5021 | 6768 | 5435 | 4410 | 4437 | 4529 | 4615 |
| 5378 | Hmu1338 | 4989 | 5435 | 6688 | 4366 | 4498 | 4549 | 4765 |
| 5308 | hla0963 | 4239 | 4410 | 4366 | 6798 | 4693 | 4769 | 4794 |
| 5469 | HQ3197A | 4261 | 4437 | 4498 | 4693 | 6792 | 5177 | 5385 |
| 5622 | HVO_2621 | 4470 | 4529 | 4549 | 4769 | 5177 | 6826 | 5385 |
| 5713 | Hbo2221 | 4480 | 4615 | 4765 | 4794 | 5385 | 5385 | 6776 |
909 symbols consensus --------MTLHTRDVRQDVRELGALLGDVLEAQTSTEAFETVEDIRTAAIDYRRGDAAS #oth 111111111511513343111...1.1.21122.2.13212...31.312.2..2.2332 Hut2168 ::::::::::::G:ELT:::::::E:::TII:::D::D:Y::::T::NS::A:::::GE: rrnAC0562 ::::::::::::A:EIN:::::::::::E:::::::::::D:::T::NSC::::::::ET Hmu1338 ::::::::-----------:::::E:::E:I:::::::G:::::N:::SS::::::::DD hla0963 :::::::::V::N::::T::::::::V::::S:::::::Y:::::L:H:::::::::::: HQ3197A :::::::::D::S:G:K::IQ::::::::::AD:::DA::::::::::::::::N:KL:T HVO_2621 MWYSYSSR:R:::::::::::::::::::::::::::AS:::::EL:Q:::S::K:ESG: Hbo2221 :::::::::E:::::::R::::::::::::::S:S::QS:Q:::::::::::::K::LD: consensus RDELHRVLDRLSPEREDIVARAFTTYFELINLAEERERVREIREGSQEGDLEDGVEATVE #oth .352535233.3223122...........1......1.1.31.1131523.4.2352124 Hut2168 :EPI:DE:::::::MQ:V:::::::::::::::::::::::::::V:S:::S:T::EA:: rrnAC0562 :::V::A:N::N::TQ:::::::::::::::::::::::::::::::GDV:A:S::EA:R Hmu1338 ::DVE:T::::::DMQ::::::::::::::::::::Q::::::::::::V:::S:TDA:: hla0963 ::I:RESVEE::TT::E:::::::::::::::::::::::A::NADEN:S:H:SFD::IA HQ3197A :NQ:DQL::E:DS:::ST:::::::::::V::::::::A:VV:::A:TE::D::LI:::: HVO_2621 :ER:YD:VGD:E::::SV::::::::::::::::::::::V:::A::::T::::ILD:LD Hbo2221 :T::LQ:I:G:::DG:SV::::::::::::::::::::::T:::A::A::::::LV:::K consensus SLAEADADPETLERVLDDVLIEPTFTAHPTEARRKTVKAKLRSIANRLEELDERRLTDRE #oth 513332112122322.21.1.1...........11.1.1..1.11441151.1311.22. Hut2168 T:DAE:V::D:V:EI:E::M::::::::::::::::I::::W:VGKIIQD::QI:::::: rrnAC0562 D:::RG::::EF:Q::E::::Q:::::::::::::::::::::V:RDI:R:::::::E:: Hmu1338 K:S:RG:::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:GD::V:::V::::S: hla0963 EF::::VG:DE:REL:A::::::::::::::::QA:::::::::::H::A::::N::E:: HQ3197A ::ID::::S::VQ::::E::::::::::::::::::::::::::::K::::::Q:I:N:: HVO_2621 A:DDEEV:E:L:G:::E:::::::::::::::::::::S::::::::::T::::::::L: Hbo2221 :F:GGG:::::VQ::::::::::::::::::::::::::::::::S:I::M:::N::::: consensus RDQIWRDLDAEVTSLWQTPQVRDRRPEPTDEARNVQWYLENILFDVVGEVYDELEDALSE #oth 353321424..1....1.2...2.1.112..11.1...1.13..111211.3.1.24154 Hut2168 KRRMK:E:Q:::::::::::::::::DV:::TL:I::::::S:::IIS:::::::H:::: rrnAC0562 QKR:E:N::::::::::::::::::::V::::L::::::::V::::ID:::::::HT:ED Hmu1338 QED:ED::A::::::::::::::::::V::::L:::::I::V::E:ID:::::::::ID: hla0963 :NA::::IT:::::::S:R:::Q:S:::E::::::::::::T::::::DA:E:F:ETI:K HQ3197A H:::::KV:::I::::::S:::G:::::Q:::::::::::S::::::::::A:F::IIGS HVO_2621 H::E::HVV:::::::::S::::::::::::::::::::::T:::::::::E:::EE:RA Hbo2221 :Q:L::EV::::::::::S:::G:::::Q:::::::::::S::::::::::S:F::V:A: consensus EYD-DVDVPKLFEFRSWAGSDRDGNPFVTPEVTEETLERQRSVVLEKYRDALKRLSGVLS #oth 2.12221211.1..............1..111.21..1...311111.1241.2..1... Hut2168 T::GE::::::Y::::::::::::::Y::::::::::::::::A::L:::D::S:::::: rrnAC0562 V::E:I:IDT:Y:::::::::::::::::TD::::::::::ET::PL::TK::E:::::: Hmu1338 :::G:::::::Y:::::::::::::::::::I:::::::::D:::PL:::R::E:::::: hla0963 :::::::C:::::::::::::::::::::::::D:::A:::E:AV:::::RC::::A::: HQ3197A ::P:::S::::::::::::::::::::::::::TD::::::G::::::SQ:::::::::: HVO_2621 ::P:GL::::::::::::::::::::::::::::D::::::::A::::S:S::::::::: Hbo2221 ::P:E:::::::::::::::::::::::::::::D::A::::::::::S::::::::::: consensus QDASRIDTDDAFEESLAADKERLPGVAEEAEERYPDEPYRQKLKLMRERLRRVDDVRPGG #oth ..231324334141114313231.2.24122....3.......1....323.23...222 Hut2168 ::VENLEMS::::::HE:H:Q::::::DGI::::::::::::::::::SVL::::::S:A rrnAC0562 ::::N:A::AL:N:R:DRH:SK:::::K:::::::::::::::R::::SVI::S:::Q:: Hmu1338 ::::N:::T:::D:R::DH::A:::::S::::::::::::::::::::GVL::G:::S:: hla0963 ::GE:YAV::RLA::::::V::F:T:V:::R::::::::::::R::::::D::::::::E HQ3197A :::D:V:ISTQLKR::KT:Y::::::TA:T:::::G::::::::::::Q:::I:::::D: HVO_2621 :::T:::PGHEL:R::K::R:H::V:::::D::::N::::::::::::::::AE::::N: Hbo2221 ::G::::VGAE::R::I::R::::V::::T:::::E:::::::::::::I::IE::::D: consensus YADADELLADLEVIADSLRENGADVVADAHVEPLMRQVDTFGFTLASLDLRDHRENHTEA #oth .43632113..221131.152121312132.3..3.1.1...11..2..1...112..21 Hut2168 :DND::::::::I::E:::::D::EIV::::K::I:K::::::S::N::::::::K::N: rrnAC0562 :ESEE:::T::R:::::::::D:E:I:E:::D::I:K:E:::::::::::::::KM::D: Hmu1338 :S:SSD:::::RA:::D::A:D:::I:E:::D::V:K:::::::::G::M::::KM::D: hla0963 :P:G:AF::::D::::::ATD:Q:A:RESF::::R:::::::L::::::::::::K:::T HQ3197A :S:PEAF:S:::::DQ:::K::GE::::EY:::::::::::::::::::::::QK::::: HVO_2621 ::::S::M:::::VDA:::RT::EQ:::VY:::::::::::::::::::::::Q:::::: Hbo2221 ::AHH:::E:::I:DQ:::D::::::::EY:S:::::::::::::::::::::::::::: consensus VAEALAREGIDYASMDEDERVEFLTEAILQDEPVVDLEDPEDLSETAARVLRRFRKLAEW #oth 22.22333.21.4331.23.213..1....23221.3224211.12241.121.34312. Hut2168 LV:T:K::::::E::S:::::::::::::::D::I:I::D:G:::ES:K::TL:SDA:G: rrnAC0562 I:::VD:Q:::::::::::::::::::::::NT:I:M::T:G:::D:T:::D:::AT:D: Hmu1338 I::TVD:D:::::D:::::::::::::::::GQI::M::VDG::DDS:::I:::::::D: hla0963 :::TV:V::V::RE::::A:Q::::::::::D::::ADE:G:V:::TE::::::QEF::: HQ3197A :H:VFINS::E:D:Y::AD:I:I:::::::T:::::::::G:V:D::R::::::SM:G:: HVO_2621 :H::::H::L::YGSS:Q::::L::D::::E:::::::::G:V::::E:::::::::G:: Hbo2221 :H::::::::::YDR:::G::AV::::::::::L:::SNR::::D::D:::T::E::G:: consensus QREYGVDAIDTYCISMTEEPSHVLEVLFLADQAGVVSLPDHCGLDVVPLLETESALNGAR #oth .2.1.22.....1..12.12..1......1..111.1..11..2.1...1.111..3111 Hut2168 ::::::::::::A::WF::S::A::::::G::::I:D::GY::F:I:::F:S:Y::TRV: rrnAC0562 :N:F:I::::::A::WC:::::A:::::::::VDI:D::GY::F:::::::S:Y::S::: Hmu1338 :::F::::::::A::WC::A:::::::::G::::I:D::GY::::I:::::SKY::D::: hla0963 :D:::PQ:::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::::E HQ3197A :::F::G:::::::::::N::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::: HVO_2621 ::::::G::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::: Hbo2221 ::::::G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus RIMGTLFENEAYAQALAARNNVQEIMLGYSDSNKENGFLAANWDLYKNQRRLAAICDDFD #oth 111.2..1.1..331.21.232..11......1....1.....2..3..112.4111121 Hut2168 EML:::::::::S:::E::::T:::L::::::S::::Y:::::E::R::K:M:N:::::G rrnAC0562 ::::::::::::S:::E::D:I:::::::::::::::::::::S::N::K:::D:T::Y: Hmu1338 :::::::::D::EE::::::G::::::::::::::::Y:::::S::R::K:::::T:::: hla0963 ::L:E::D:::::T::EV:GEI::V:::::::::::::::::::::E:::QI:RF:REE: HQ3197A E::::::::D:::A::S::D:::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::::: HVO_2621 ::::::::::::GT::::::D::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::: Hbo2221 ::::S:::::::E:V:::::G::::::::::::::::Y:::::::::::::::::::::: consensus VTMRLFHGRGGSISRGGGPMNEAMLALPNETVTGQIKFTEQGEAIAEKYANPRIAERNLE #oth .21..............1..11.1.....1..1..1.............1.34....1.. Hut2168 ::L::::::::::::::V::H::::::::Q::N::::::::::::::::G::D::::::: rrnAC0562 :E:::::::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::HD::::::: Hmu1338 :E:::::::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::EA::::::: hla0963 ::L::::::::::::::::::::L:::::::::::V:::::::::::::::R:::::E:: HQ3197A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::::::: HVO_2621 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2221 :K::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H::::::: consensus QMLNAQVRARQNAIEEPVEDVPDAWIDAMETMAAAARAEYRDLLETDGFVSYFEQATPIT #oth ...1..111.32.322.2.11.23.31.1111141.143.32..211..131.1.....2 Hut2168 :::::::L::Y::M:N::::I:EE::E:F::A:EH:S:::::::::::::E::::::::: rrnAC0562 ::::::I::::::::::::EI::E:AE::::A:D:::D::Q:::::::::EF:::::::: Hmu1338 ::::::::S:Y::L:::::E::E::E:::::ASE:::QK:ES::Q:E:::DF:::::::S hla0963 :::D::I::::E:T:::T:::::S:V:::::::P:::ET:::::N::::::::G:::::S HQ3197A ::::::::::H:::R::T::::S:::::::E::S:::KQ:Y:::N::::IT::G:::::G HVO_2621 ::::::I:::LQ::RT:E:E:::R:V:::D:::::::::::::::S:::::::::::::: Hbo2221 ::::::::::HE::Q::E::::E::::::D:::::::Q:::N:::SE::::::::::::: consensus VIENLNLGSRPASRSGERSVEDLRAIPWVFSWTQARCIIPGWYSLATGIQAYLDEGGD-- #oth .1.2..1.......121.11....1.........2.1.21..11223.2231.121.111 Hut2168 ::::::M:::::::TED::L::::S:::::::::::::V:::F:V:::::G::::::::: rrnAC0562 ::::::M::::::::ED:::::::::::::::::::::::::::IS::LD:::EN::::: Hmu1338 ::::::M:::::::::D:::::::::::::::::::::::::::I:::L:::::D::::: hla0963 :V::::::::::::::::T:::::::::::::::T:L:L:::::::S::D:::::V:EEE HQ3197A :::D::::::::::::::T:::::::::::::::S::::T:::A:GG:::S:::N::::: HVO_2621 :::E:::::::::::D::::::::::::::::::S:::L:::::::A:VN:F:ED::::: Hbo2221 :::D::::::::::::::T:::::::::::::::S::::T:::A:G::L:T::::::::: consensus -METLQEMYEEWPFFRTTLDNAALALARTDLEIAEEYADLADDELRERFFPRLREEYERA #oth 1431.21..32.11.212111.21...11132..21..3...21...31114144.1123 Hut2168 :::::K:::::::Y:G:I::H:GM:::KS:M:::T::::::::::::::::WI:S:::NS rrnAC0562 ::::::::::N::::::K::::S::::::::G::::::::::P:::::IY::IV::::NT Hmu1338 :V:::::::::::::Q:K::::S:::::::FD::::::A::::D::::I::DI:Q:::DT hla0963 GF:::::::A:::::::::N:::::::::EP:::A::::::::D:::::::E:IG::::G HQ3197A :IT::KS::TD::::::::::::::::::::D:::H::S:::P::::D:::H::T:CN:S HVO_2621 ::DD:R:::D::A:::S:F::::M::::::::::T:::N:::E::::E::T::T::::D: Hbo2221 :RA::R:::D::::::::::::S::::::EFG:::H::A::::D:::A:Y:::F:::::: consensus VDLVLEISGRDSLLKREWLEESLRRRNPYVDPLNLLQTRLLAQTHRTEEEERTLRLTVKG #oth 322231121123.14.3.1311.3.............22..411.1.12.1.1.....3. Hut2168 :E:IQ:::::ET::N:S:M::N:Q:::::::::::::::::::S:L::T:R:A:::::H: rrnAC0562 :AK::::T:Q:G::S:D::K:N:E:::::::::::::V:::K:S::::T:R:::::::Q: Hmu1338 ::I:T::T::::::::::::QN:D:::::::::::::V:::::S:L::T:R:::::::Q: hla0963 RE:::::::::E:IR::::A:::D:::::::::::::AN::GR:::::::::::::::N: HQ3197A RE::C:V:::::::E::::DQ:::::::::::::::::H::E:::::D:::::::::::: HVO_2621 A::M:D::E:S:::::::::::::::::::::::::::H::S:::::D:::::::::::: Hbo2221 H::::DVI::E:::::Q::D::::::::::::::::::H::S::::::D::::::::::: consensus IAAGMKNTG #oth ......... Hut2168 ::::::::: rrnAC0562 ::::::::: Hmu1338 ::::::::: hla0963 ::::::::: HQ3197A ::::::::: HVO_2621 ::::::::: Hbo2221 :::::::::