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7 genomes BUD1305 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2364

HVO_0480

Hbo1018

Hmu0125

Hut0204

hla0903

-

HQ1395A

Pairwise sequence scores
Consensus score3020 HQ1395A Hut0204 rrnAC2364 Hmu0125 hla0903 HVO_0480 Hbo1018
2062HQ1395A 3047 1644 1905 1973 1874 1941 1941
2213Hut0204 1644 3049 1904 1983 2012 1920 2070
2458rrnAC2364 1905 1904 3011 2370 2178 2224 2292
2582Hmu0125 1973 1983 2370 3026 2235 2235 2304
2535hla0903 1874 2012 2178 2235 3066 2280 2361
2566HVO_0480 1941 1920 2224 2235 2280 3002 2562
2643Hbo1018 1941 2070 2292 2304 2361 2562 3010

416 symbols
consensus       MAAFDTLDDLADD------QRVLVRLDLNSPVEDGEVQDNRRFERHAETVRELADAGHRV
#oth            143.3.1.1.4221111112...1.1.1...11..51...1..1.1.2.12..2211331
HQ1395A         :PS:::I:T:N::TDAPAEK:::L:V:I::::S::I:::::::::::R:IQ::SN::YHT
Hut0204         ::::N:::::::G::::::::::::V:::::::::V::::H::D:Y:::::::::RDNK:
rrnAC2364       -MT:Q:::::D:G::::::::::::::::::::::T:::::::D::::::S::V:R:FE:
Hmu0125         ::::Q:::::::G::::::::::::::::::::::A:::::::::::K:::::::R:FET
hla0903         ::::::I:::PA:::::::S:::::::::::I:::KP:::::::::::::::::::::::
HVO_0480        --M:K:::::DPE::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::E:::::
Hbo1018         :ST:K:::::EA::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::E:::::

consensus       VLMAHQGRPGRDDFVSLEQHADILADHIGRDVNFVADTFGDDAIAAIDALEAGDVLLLEN
#oth            211.......1.2.2..31.131.241214213.12112.331231.33132.21.1...
HQ1395A         I:L:::::::G:A:I:::G:TAV:EKYLDCE:::ID::H:KRVAK::N:T:S::::::::
Hut0204         :::::::::::::::::D:::E::EEYV:KPI:::E:IY::::::::EG::::EI:::::
rrnAC2364       AVL::::::::::::::A:::E::::::DH::D::DE:Y:PQ::HD:AD:DG::::V:::
Hmu0125         ::::::::::::T:::::::::::SG:::T::D:::::::E::L::::D:GG::::::::
hla0903         ::::::::::::::T::SG::::::::V::::A::::::::E:LD:::::G::E::::::
HVO_0480        ::::::::::G::::::::::::::S::D:E:G:::::Y:::::::::::::::::::::
Hbo1018         ::::::::::G::::::::::S:::::V:H::G:::::::::::D::ES:S::NI:::::

consensus       TRMCDDELPEEDPEVKADTEFVQTLAPEFDAYVNDAYSAAHRSHASLVGFPLVLPAYAGR
#oth            ...111....21.1211412..11.2331..11.....1...2...1...112111....
HQ1395A         ::::E:::::A::NI::N:A:::S:SKHV:::I:::::S::::::::::::SM::S::::
Hut0204         :::A::::::KA::EH:KSD:::::S:Y:::F::::::::::A:::T:::A:E:::::::
rrnAC2364       ::::::::::::::::SQ:::::::KD:::::I::::::::::::::::::::MD:::::
Hmu0125         :::::E:::::::::::E::::R:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
hla0903         ::::::::::A:::E::E:::::::::Q::::::::::::::K:::::::::::::::::
HVO_0480        :::::E::::::::::::::::R:::EHV:::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1018         :::::::::::::::::::A:::::::Y::::::::::::::::::::::::E:::::::

consensus       VMETEYEANTAIATR--EFDGQVTMVVGGTKATDVIDVMNNLGDKVDRFLLGGIAGELFL
#oth            ..11..11.12112111.11.2.1.21..1.11...2.222.2241.3..11.22.....
HQ1395A         ::::::H:::::GQK::::::T:V:TL:::::::::::I:::AGS::::::D:VV:::::
Hut0204         :::A:::Y::GV:E:AR:TE::::::L::N:SE:::S:V:::::AI:T::I::LP:::::
rrnAC2364       :::::::::::::EK::::::::::::::::::::::::TH:DE:::D::::::::::::
Hmu0125         :::::::::::::QK::::::::::A:::::::::::::DH:::T::D::::::::::::
hla0903         :::::::::::::::::::::P::::::::::::::G::DA:D:R::::::::V::::::
HVO_0480        ::Q::::::SS::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::::::::::
Hbo1018         ::Q::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::

consensus       RAAGHPVGFDLD-DMDLFDDQWEENRETIESLLEERRDQITLATDLAYEDEDGDRAEIAV
#oth            ..3141..3.23223122.4..2313231123232221313.12.2..223211.1.311
HQ1395A         ::SNV:::::ITSET:RY:A::KH:SKV:K:I:T:HS::::::S::::NE-A:E::::::
Hut0204         ::E:::::M:VG:::::L:G::::TKD:L:D:VAN:::EFE:P::F::::D::E:::::L
rrnAC2364       ::::Y:::Y:I:::AN:Y:E:::::S:K:::M::DH:::::::V::::::-::::::Q::
Hmu0125         ::D:A:::::::P:L::Y:S::AD:H:L::RI:::N:EK::::::M::A::::::::TN:
hla0903         ::::::::H::E:GT::::E:::::::L:::V:D::G:A:R::::::::GP::::::V::
HVO_0480        ::::ND:::::E:G::F::::::A:::::::::D::G:::K::V:::::::TD::G::::
Hbo1018         :::::D::Y:VG:G:::::::::A:H::::::I:::G::::::V:::::::ADE::::::

consensus       DDIDEKDVSYLDVGSDTVEAYAPVIRDSEAVFVKGALGVFEDERFAVGTVGVLEAIAETD
#oth            22.3..23211.1.23.233.422.2111.......1.2..2.1.13..23111..1211
HQ1395A         :S:I::S::FM:I:TT:A:S::E::::AD::::::::::::T:A::K:::R::::::DSN
Hut0204         E::::::TG:::I:H::I:::V:I:EE:::::::::V:::::::::D:::ELI:::GR::
rrnAC2364       :::E::S::::::::E::ME:S::::::::::::::::M::::::S:::A:::::::D::
Hmu0125         A:::::T::FM::::::A:G::D::::::::::::::::::E:::S::::S:::::::::
hla0903         ::::::TDG::::::E:IA::E:P:HE:D:::::::::::::::::D:::::::::::::
HVO_0480        AN:T:::RA::::::M::DE:D:I::::::::::::::L::::::::::T:::R::::::
Hbo1018         E::::::RA:::I:T::::::D::::::::::::::::L::::::SE::::::R::::::

consensus       CFSVVGGGDTSRAIEMYGMSEDDFGHVSIAGGAYIRALTGAPLVGVEVLQRE----
#oth            ..........1.112..11311112.1.......11....22.411.1.3553311
HQ1395A         ::::::::::::::G::D:NRA::D:::::::::::::::Q::::::::KS:SI::
Hut0204         ::::::::::A:TLS:::L::::YD:I:::::::LN::::QE:EAA:::IEQAT::
rrnAC2364       :::::::::::::::::::E::E::::::::::::::::::E:::::::::-::::
Hmu0125         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:I::::::::D:::
hla0903         ::::::::::::::::::LD::::S:::::::::::::::E::PA::::EAAAGRQ
HVO_0480        ::::::::::::::G::::D:A:::::::::::::::::::::A:::A:KQD::::
Hbo1018         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::DN::::