|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3020 | HQ1395A | Hut0204 | rrnAC2364 | Hmu0125 | hla0903 | HVO_0480 | Hbo1018 |
2062 | HQ1395A | 3047 | 1644 | 1905 | 1973 | 1874 | 1941 | 1941 |
2213 | Hut0204 | 1644 | 3049 | 1904 | 1983 | 2012 | 1920 | 2070 |
2458 | rrnAC2364 | 1905 | 1904 | 3011 | 2370 | 2178 | 2224 | 2292 |
2582 | Hmu0125 | 1973 | 1983 | 2370 | 3026 | 2235 | 2235 | 2304 |
2535 | hla0903 | 1874 | 2012 | 2178 | 2235 | 3066 | 2280 | 2361 |
2566 | HVO_0480 | 1941 | 1920 | 2224 | 2235 | 2280 | 3002 | 2562 |
2643 | Hbo1018 | 1941 | 2070 | 2292 | 2304 | 2361 | 2562 | 3010 |
416 symbols consensus MAAFDTLDDLADD------QRVLVRLDLNSPVEDGEVQDNRRFERHAETVRELADAGHRV #oth 143.3.1.1.4221111112...1.1.1...11..51...1..1.1.2.12..2211331 HQ1395A :PS:::I:T:N::TDAPAEK:::L:V:I::::S::I:::::::::::R:IQ::SN::YHT Hut0204 ::::N:::::::G::::::::::::V:::::::::V::::H::D:Y:::::::::RDNK: rrnAC2364 -MT:Q:::::D:G::::::::::::::::::::::T:::::::D::::::S::V:R:FE: Hmu0125 ::::Q:::::::G::::::::::::::::::::::A:::::::::::K:::::::R:FET hla0903 ::::::I:::PA:::::::S:::::::::::I:::KP::::::::::::::::::::::: HVO_0480 --M:K:::::DPE::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::E::::: Hbo1018 :ST:K:::::EA::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::E::::: consensus VLMAHQGRPGRDDFVSLEQHADILADHIGRDVNFVADTFGDDAIAAIDALEAGDVLLLEN #oth 211.......1.2.2..31.131.241214213.12112.331231.33132.21.1... HQ1395A I:L:::::::G:A:I:::G:TAV:EKYLDCE:::ID::H:KRVAK::N:T:S:::::::: Hut0204 :::::::::::::::::D:::E::EEYV:KPI:::E:IY::::::::EG::::EI::::: rrnAC2364 AVL::::::::::::::A:::E::::::DH::D::DE:Y:PQ::HD:AD:DG::::V::: Hmu0125 ::::::::::::T:::::::::::SG:::T::D:::::::E::L::::D:GG:::::::: hla0903 ::::::::::::::T::SG::::::::V::::A::::::::E:LD:::::G::E:::::: HVO_0480 ::::::::::G::::::::::::::S::D:E:G:::::Y::::::::::::::::::::: Hbo1018 ::::::::::G::::::::::S:::::V:H::G:::::::::::D::ES:S::NI::::: consensus TRMCDDELPEEDPEVKADTEFVQTLAPEFDAYVNDAYSAAHRSHASLVGFPLVLPAYAGR #oth ...111....21.1211412..11.2331..11.....1...2...1...112111.... HQ1395A ::::E:::::A::NI::N:A:::S:SKHV:::I:::::S::::::::::::SM::S:::: Hut0204 :::A::::::KA::EH:KSD:::::S:Y:::F::::::::::A:::T:::A:E::::::: rrnAC2364 ::::::::::::::::SQ:::::::KD:::::I::::::::::::::::::::MD::::: Hmu0125 :::::E:::::::::::E::::R::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0903 ::::::::::A:::E::E:::::::::Q::::::::::::::K::::::::::::::::: HVO_0480 :::::E::::::::::::::::R:::EHV::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1018 :::::::::::::::::::A:::::::Y::::::::::::::::::::::::E::::::: consensus VMETEYEANTAIATR--EFDGQVTMVVGGTKATDVIDVMNNLGDKVDRFLLGGIAGELFL #oth ..11..11.12112111.11.2.1.21..1.11...2.222.2241.3..11.22..... HQ1395A ::::::H:::::GQK::::::T:V:TL:::::::::::I:::AGS::::::D:VV::::: Hut0204 :::A:::Y::GV:E:AR:TE::::::L::N:SE:::S:V:::::AI:T::I::LP::::: rrnAC2364 :::::::::::::EK::::::::::::::::::::::::TH:DE:::D:::::::::::: Hmu0125 :::::::::::::QK::::::::::A:::::::::::::DH:::T::D:::::::::::: hla0903 :::::::::::::::::::::P::::::::::::::G::DA:D:R::::::::V:::::: HVO_0480 ::Q::::::SS::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::::::::::: Hbo1018 ::Q::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::: consensus RAAGHPVGFDLD-DMDLFDDQWEENRETIESLLEERRDQITLATDLAYEDEDGDRAEIAV #oth ..3141..3.23223122.4..2313231123232221313.12.2..223211.1.311 HQ1395A ::SNV:::::ITSET:RY:A::KH:SKV:K:I:T:HS::::::S::::NE-A:E:::::: Hut0204 ::E:::::M:VG:::::L:G::::TKD:L:D:VAN:::EFE:P::F::::D::E:::::L rrnAC2364 ::::Y:::Y:I:::AN:Y:E:::::S:K:::M::DH:::::::V::::::-::::::Q:: Hmu0125 ::D:A:::::::P:L::Y:S::AD:H:L::RI:::N:EK::::::M::A::::::::TN: hla0903 ::::::::H::E:GT::::E:::::::L:::V:D::G:A:R::::::::GP::::::V:: HVO_0480 ::::ND:::::E:G::F::::::A:::::::::D::G:::K::V:::::::TD::G:::: Hbo1018 :::::D::Y:VG:G:::::::::A:H::::::I:::G::::::V:::::::ADE:::::: consensus DDIDEKDVSYLDVGSDTVEAYAPVIRDSEAVFVKGALGVFEDERFAVGTVGVLEAIAETD #oth 22.3..23211.1.23.233.422.2111.......1.2..2.1.13..23111..1211 HQ1395A :S:I::S::FM:I:TT:A:S::E::::AD::::::::::::T:A::K:::R::::::DSN Hut0204 E::::::TG:::I:H::I:::V:I:EE:::::::::V:::::::::D:::ELI:::GR:: rrnAC2364 :::E::S::::::::E::ME:S::::::::::::::::M::::::S:::A:::::::D:: Hmu0125 A:::::T::FM::::::A:G::D::::::::::::::::::E:::S::::S::::::::: hla0903 ::::::TDG::::::E:IA::E:P:HE:D:::::::::::::::::D::::::::::::: HVO_0480 AN:T:::RA::::::M::DE:D:I::::::::::::::L::::::::::T:::R:::::: Hbo1018 E::::::RA:::I:T::::::D::::::::::::::::L::::::SE::::::R:::::: consensus CFSVVGGGDTSRAIEMYGMSEDDFGHVSIAGGAYIRALTGAPLVGVEVLQRE---- #oth ..........1.112..11311112.1.......11....22.411.1.3553311 HQ1395A ::::::::::::::G::D:NRA::D:::::::::::::::Q::::::::KS:SI:: Hut0204 ::::::::::A:TLS:::L::::YD:I:::::::LN::::QE:EAA:::IEQAT:: rrnAC2364 :::::::::::::::::::E::E::::::::::::::::::E:::::::::-:::: Hmu0125 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:I::::::::D::: hla0903 ::::::::::::::::::LD::::S:::::::::::::::E::PA::::EAAAGRQ HVO_0480 ::::::::::::::G::::D:A:::::::::::::::::::::A:::A:KQD:::: Hbo1018 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::DN::::