|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2571 | Hut0203 | rrnAC2363 | Hmu0001 | HQ1394A | hla0904 | HVO_0481 | Hbo1019 |
1694 | Hut0203 | 2527 | 1537 | 1537 | 1472 | 1540 | 1528 | 1568 |
1944 | rrnAC2363 | 1537 | 2510 | 2069 | 1657 | 1783 | 1746 | 1762 |
1883 | Hmu0001 | 1537 | 2069 | 2514 | 1677 | 1758 | 1762 | 1735 |
2077 | HQ1394A | 1472 | 1657 | 1677 | 2706 | 1884 | 2027 | 2027 |
2205 | hla0904 | 1540 | 1783 | 1758 | 1884 | 2624 | 2051 | 2140 |
2268 | HVO_0481 | 1528 | 1746 | 1762 | 2027 | 2051 | 2622 | 2270 |
2326 | Hbo1019 | 1568 | 1762 | 1735 | 2027 | 2140 | 2270 | 2630 |
365 symbols consensus -----S-KSYL-A---VSDSDPVRVGLNGFGRIGRNVFRAVLENPDVELVGINDVMDFDD #oth 11112232122323343543321.112..1.....221..323114121.1.....1122 Hut0203 :::::-:----:-:::M:A:::::I:I::Y:::::CTL::A:::D::QI:::::::::EK rrnAC2363 :::::-:----:-:::--M:K:::::::::::::::::::S:H:D:::I::::::::DSE Hmu0001 :::::-:----:-:::-MSEET::::V:::::::::::::S:D:DAI:I:::::::EDEE HQ1394A MYEVY:NM:EKSNLSANPSTN:I::::::::::::S:L::IIT::SI:::::::::E::: hla0904 :::::MS::::T:DDD:::DEV:::::::::::::::::::::S:RID:::::::::::: HVO_0481 ::::M:E::::S:GEN:DE::V:::A::::::::::I:::::D::K::::A::::::::: Hbo1019 ::::M:E::::A:GEK:G:D:V:::::::::::::::::::M:::K::::::::::::E: consensus MAYLAKYDTVMGRLD-GVSLDGDSLTVGGTDVP--LFNIQDPAELPWDELDVDVALECTG #oth 13.111..111.222122131125.2222122311221212.22...22.2..112.2.. Hut0203 :E::T:::SAL:T:PYD:::E::::V:D:N:ID:::L:::N:E:::::D::::::I:S:: rrnAC2363 ID:F:Q::::::E:E::A:V:DGV:::E:::FEAGI:HET::TQ:::ED::::::F:A:: Hmu0001 :E::::::S::::::::A:::DGT:::E:::FEAGV:HET::TQ:::E:::::ITF:S:: HQ1394A :G:::::::::::A::DI:Q::NM:S::E:T:::::Y:::::T::::GQ:E:::T::::: hla0904 ::::::::::::::::::ER:::A::I:D:S:::::Y:V::::D:::::::::::::::: HVO_0481 ::::::::S:::::::::ER:::::SI:::S:S:::Y:V:S::::::G:::::::::::: Hbo1019 :::::::::::::Q::E::::::E:VA:D:S:::::::::S:::::::::N::::::::: consensus IFRTKEDASAHLDAGADKVLISAPPKGDEPVKQIVYGVNHDEYDGEDVVSNASCTTNSVT #oth 1..1231.11..11..2112.......12..1.2.....11..2.1.12.1.......11 Hut0203 :::::DE:::::::::E:A:::::::::K::P:F:::::D::::::::::A::::::::S rrnAC2363 :::::::::Q:::::::::::::::::::::::L:::::::::E::::::::::::::I: Hmu0001 :::SH::::Q:::::::::V::::::::T::::L::::::::::::::::::::::::I: HQ1394A ::::RS::A:::E::::::I::::::::::::::::::::H::T:::IL::::::::::S hla0904 V:::R::::::::G:::T:I:::::::E:::::L:::::::::E:D::I:::::::::I: HVO_0481 ::::::::::::E::::::V:::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::: Hbo1019 :::::Q::::::::::H::::::::::E:::::::::::::::::::::::::::::::: consensus PVAKVLDEEFGIEAGLLTTVHAYTGSQNLIDGPKAKTRRGRAAAENIVPTSTGAAQAATE #oth .111..22..1122131..1.....1.212.1.33.3..1.......1..1...12.121 Hut0203 :PMH::L::::VD:AEM::I:::::::AIV::::S:::::::::::::::T:::ST:TPD rrnAC2363 ::::::::::::N::Q:::::::::::::M:::NG:P::R:::::::I:::::::::::: Hmu0001 ::::::QD:::::S:Q:::::::::T:::V:::NS:P::R:::::::I::T::::::::: HQ1394A :::::::D::E::S:::::::::::::A:::S:MT::::::::::::I:::::::::T:: hla0904 :::::::A::::D::T:::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::G::Q: HVO_0481 :::::::::::::N:::::::::::::::::S:H::Q:::::::::::::T::::::::: Hbo1019 :::::::::::::S::::::::::::::::::::::K::::::::::::::::::::::: consensus VLPQLEGKLDGMAMRVPVPNGSITELVVDLDDNPSVEEINAAFRAAADSGPLAGVLGYTD #oth 1..1.1..211..1.....2..1..2.14.334222222.1..131.12.2.1.11.111 Hut0203 I::E::::FEA::I:::::S:::::I::::PG::D:D::::::EEY:A-:E:E:SM:V:: rrnAC2363 :::E:::::::::I:::::::::::F::::::DVTESDV::::EE::A-:D:E::::V:S Hmu0001 :::E:::::::::::::::D:::::F:CT:ETDATESD:::::E::::-:E:E::::VS: HQ1394A :::::D::::::::::::::::::::::N:STA::::VV:D:::N:::D::::::::::: hla0904 ::::::::I::::::::::S:::::F::S::E:VTAD:V:::::D::::::::::::::: HVO_0481 I::::D:::::::I::::::::L:::::R:E:K:::::::D::::::::::::::::::: Hbo1019 I::::D::::::::::::::::::::::S::ET:::::L:D:::D::::::::::::::: consensus DEVVSSDILGLPFSSMVDLQSTNVVNDGGLYKILTWYDNEYGFSNRMLDLAAFITE---- #oth .211.1.12.211114...33.131331214.111.....2.1211.112.321344211 Hut0203 :PI::R::V:QQ:G:V:::GK:ST:QG:K:A::FA:::::M:YTSQ:MR::ED:V-:::: rrnAC2363 :D::::::::D:Y:TQ:::::::::--S:MT::::::::::::::::::V:EY::::::: Hmu0001 :PI::R:V::Q:Y:T::::EN::::--:D:V:V:::::::F::A:::::::::VA::::: HQ1394A ::::::::I::::::::::N:::Q::A:::::::::::::F::::::::::Q:::NTNTN hla0904 ::::::::V::::::Y::::::::IAG:K:L::::::::::::::::::M::YVQDEA:: HVO_0481 :::T:R:::::::::T:::NT::Q:::::::::::::::::::::::::V:H:V:HQ::: Hbo1019 ::::::::V::::::T:::::::M:::::::::::::::::::::::::M:H:::HG::: consensus ----- #oth 11111 Hut0203 ::::: rrnAC2363 ::::: Hmu0001 ::::: HQ1394A TSTNT hla0904 ::::: HVO_0481 ::::: Hbo1019 :::::