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7 genomes BUD1308 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2363

HVO_0481

Hbo1019

Hmu0001

Hut0203

hla0904

-

HQ1394A

Pairwise sequence scores
Consensus score2571 Hut0203 rrnAC2363 Hmu0001 HQ1394A hla0904 HVO_0481 Hbo1019
1694Hut0203 2527 1537 1537 1472 1540 1528 1568
1944rrnAC2363 1537 2510 2069 1657 1783 1746 1762
1883Hmu0001 1537 2069 2514 1677 1758 1762 1735
2077HQ1394A 1472 1657 1677 2706 1884 2027 2027
2205hla0904 1540 1783 1758 1884 2624 2051 2140
2268HVO_0481 1528 1746 1762 2027 2051 2622 2270
2326Hbo1019 1568 1762 1735 2027 2140 2270 2630

365 symbols
consensus       -----S-KSYL-A---VSDSDPVRVGLNGFGRIGRNVFRAVLENPDVELVGINDVMDFDD
#oth            11112232122323343543321.112..1.....221..323114121.1.....1122
Hut0203         :::::-:----:-:::M:A:::::I:I::Y:::::CTL::A:::D::QI:::::::::EK
rrnAC2363       :::::-:----:-:::--M:K:::::::::::::::::::S:H:D:::I::::::::DSE
Hmu0001         :::::-:----:-:::-MSEET::::V:::::::::::::S:D:DAI:I:::::::EDEE
HQ1394A         MYEVY:NM:EKSNLSANPSTN:I::::::::::::S:L::IIT::SI:::::::::E:::
hla0904         :::::MS::::T:DDD:::DEV:::::::::::::::::::::S:RID::::::::::::
HVO_0481        ::::M:E::::S:GEN:DE::V:::A::::::::::I:::::D::K::::A:::::::::
Hbo1019         ::::M:E::::A:GEK:G:D:V:::::::::::::::::::M:::K::::::::::::E:

consensus       MAYLAKYDTVMGRLD-GVSLDGDSLTVGGTDVP--LFNIQDPAELPWDELDVDVALECTG
#oth            13.111..111.222122131125.2222122311221212.22...22.2..112.2..
Hut0203         :E::T:::SAL:T:PYD:::E::::V:D:N:ID:::L:::N:E:::::D::::::I:S::
rrnAC2363       ID:F:Q::::::E:E::A:V:DGV:::E:::FEAGI:HET::TQ:::ED::::::F:A::
Hmu0001         :E::::::S::::::::A:::DGT:::E:::FEAGV:HET::TQ:::E:::::ITF:S::
HQ1394A         :G:::::::::::A::DI:Q::NM:S::E:T:::::Y:::::T::::GQ:E:::T:::::
hla0904         ::::::::::::::::::ER:::A::I:D:S:::::Y:V::::D::::::::::::::::
HVO_0481        ::::::::S:::::::::ER:::::SI:::S:S:::Y:V:S::::::G::::::::::::
Hbo1019         :::::::::::::Q::E::::::E:VA:D:S:::::::::S:::::::::N:::::::::

consensus       IFRTKEDASAHLDAGADKVLISAPPKGDEPVKQIVYGVNHDEYDGEDVVSNASCTTNSVT
#oth            1..1231.11..11..2112.......12..1.2.....11..2.1.12.1.......11
Hut0203         :::::DE:::::::::E:A:::::::::K::P:F:::::D::::::::::A::::::::S
rrnAC2363       :::::::::Q:::::::::::::::::::::::L:::::::::E::::::::::::::I:
Hmu0001         :::SH::::Q:::::::::V::::::::T::::L::::::::::::::::::::::::I:
HQ1394A         ::::RS::A:::E::::::I::::::::::::::::::::H::T:::IL::::::::::S
hla0904         V:::R::::::::G:::T:I:::::::E:::::L:::::::::E:D::I:::::::::I:
HVO_0481        ::::::::::::E::::::V:::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::
Hbo1019         :::::Q::::::::::H::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       PVAKVLDEEFGIEAGLLTTVHAYTGSQNLIDGPKAKTRRGRAAAENIVPTSTGAAQAATE
#oth            .111..22..1122131..1.....1.212.1.33.3..1.......1..1...12.121
Hut0203         :PMH::L::::VD:AEM::I:::::::AIV::::S:::::::::::::::T:::ST:TPD
rrnAC2363       ::::::::::::N::Q:::::::::::::M:::NG:P::R:::::::I::::::::::::
Hmu0001         ::::::QD:::::S:Q:::::::::T:::V:::NS:P::R:::::::I::T:::::::::
HQ1394A         :::::::D::E::S:::::::::::::A:::S:MT::::::::::::I:::::::::T::
hla0904         :::::::A::::D::T:::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::G::Q:
HVO_0481        :::::::::::::N:::::::::::::::::S:H::Q:::::::::::::T:::::::::
Hbo1019         :::::::::::::S::::::::::::::::::::::K:::::::::::::::::::::::

consensus       VLPQLEGKLDGMAMRVPVPNGSITELVVDLDDNPSVEEINAAFRAAADSGPLAGVLGYTD
#oth            1..1.1..211..1.....2..1..2.14.334222222.1..131.12.2.1.11.111
Hut0203         I::E::::FEA::I:::::S:::::I::::PG::D:D::::::EEY:A-:E:E:SM:V::
rrnAC2363       :::E:::::::::I:::::::::::F::::::DVTESDV::::EE::A-:D:E::::V:S
Hmu0001         :::E:::::::::::::::D:::::F:CT:ETDATESD:::::E::::-:E:E::::VS:
HQ1394A         :::::D::::::::::::::::::::::N:STA::::VV:D:::N:::D:::::::::::
hla0904         ::::::::I::::::::::S:::::F::S::E:VTAD:V:::::D:::::::::::::::
HVO_0481        I::::D:::::::I::::::::L:::::R:E:K:::::::D:::::::::::::::::::
Hbo1019         I::::D::::::::::::::::::::::S::ET:::::L:D:::D:::::::::::::::

consensus       DEVVSSDILGLPFSSMVDLQSTNVVNDGGLYKILTWYDNEYGFSNRMLDLAAFITE----
#oth            .211.1.12.211114...33.131331214.111.....2.1211.112.321344211
Hut0203         :PI::R::V:QQ:G:V:::GK:ST:QG:K:A::FA:::::M:YTSQ:MR::ED:V-::::
rrnAC2363       :D::::::::D:Y:TQ:::::::::--S:MT::::::::::::::::::V:EY:::::::
Hmu0001         :PI::R:V::Q:Y:T::::EN::::--:D:V:V:::::::F::A:::::::::VA:::::
HQ1394A         ::::::::I::::::::::N:::Q::A:::::::::::::F::::::::::Q:::NTNTN
hla0904         ::::::::V::::::Y::::::::IAG:K:L::::::::::::::::::M::YVQDEA::
HVO_0481        :::T:R:::::::::T:::NT::Q:::::::::::::::::::::::::V:H:V:HQ:::
Hbo1019         ::::::::V::::::T:::::::M:::::::::::::::::::::::::M:H:::HG:::

consensus       -----
#oth            11111
Hut0203         :::::
rrnAC2363       :::::
Hmu0001         :::::
HQ1394A         TSTNT
hla0904         :::::
HVO_0481        :::::
Hbo1019         :::::