[O] (DegQ) COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain 7 genomes BUD1319 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG0226 rrnAC0296 - Hbo2028 Hmu1377 Hut0407 Hut3001 - NP0660A HQ1855A

Pairwise sequence scores
Consensus score	2665	Hbo2028	NP0660A	VNG0226	Hut3001	HQ1855A	Hut0407	rrnAC0296	Hmu1377
1465	Hbo2028	2715	1038	1073	1056	1138	1068	1236	1150
1578	NP0660A	1038	2622	1114	1098	1058	1176	1221	1163
1647	VNG0226	1073	1114	2632	1393	1474	1114	1209	1318
1651	Hut3001	1056	1098	1393	2758	1492	1232	1283	1327
1752	HQ1855A	1138	1058	1474	1492	2771	1175	1267	1263
1632	Hut0407	1068	1176	1114	1232	1175	2615	1414	1396
1846	rrnAC0296	1236	1221	1209	1283	1267	1414	2678	1601
1845	Hmu1377	1150	1163	1318	1327	1263	1396	1601	2600

387 symbols
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Hbo2028         MG:LP:S::DF:I::::G:FGTYT:S:::::::::-:::::APQ:KT:GSAT:TSTS:VA
NP0660A         ::MPE:::::::A::AGGI::::::::::::::::-:::::-:A::RESPPPATP::PNP
VNG0226         ::-:MPS::DV:RLGAGVL:A:T:::::::::::::DTAPNRVAAAE::::TT::TTT:S
Hut3001         MTPETS::::F:ALG:T:L:SAI::::::::::STSLSAPE:S::ESPSPSAAG:SPET:
HQ1855A         MT:SKIG::::::LT::::LG:::::NTQTQSQSN:QTGST:MS:DLS:E::L::Q:TA:
Hut0407         ::-:------------M::L::::::VESPTGDVA:SASEQ:::TTN:TVE:QVDEP:T:
rrnAC0296       :MKQS::::AM:::L:T::::AT::::::::::::QSPGTG:DS::::GEQP:-S:::VA
Hmu1377         :M:D:Q:::GV::SMA:::GASV::::::::::::-:::::Q::AL:AT:GS:GQSAS:G

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Hbo2028         PR::SDDSK:DSA::A:A:::AFGVENPVTGQ::R::::A::IN:TS::::::::SG::R
NP0660A         E:Q:R::D::EAT:E::AF:----::::::G::Q::G::::::-::F::::Q::IA:L:D
VNG0226         R:E:::::::::::::::MI::QS::::::-----:::T:WL:N:TTL:::A::::RS:T
Hut3001         :AE::::R:::ET:P::TT:Q:T:::::::-----:::T::Q::E::::::A::::T:S:
HQ1855A         :ATN::GE::::T:::::::QPEG::::::PRA:-:::T::L::SN::I::A::T:E:TT
Hut0407         -D::R:AD:::S:S::::QI:VI:::::::PFGTA:T:::::::ER:L:::::::SN:::
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Hmu1377         -----:S:::EQ:V:::AT::::::::::::NS::::::A:::S:DYL::::::::::D:

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#oth            431116522.43251212.441...2253255.331511314454152.21.211.1.12
Hbo2028         :DIQYTT:::TS:EI::::MFA:::I:D::HV:E:VR::Q:SLR::QI::::S:::S:::
NP0660A         :N::::R::::D:G:IA::V:A:::::S-T:I::Y:MS::L::TV:P:::::L:L:S:::
VNG0226         :N:::N::T:E:GR:R::::N::::AVT:T:::AA::::ALRT:S:VA:::::::::::A
Hut3001         AQ:::H::T:ASGP::::::H:::::I:PGTV::::A::::GDQ:::I:R:::V::::YN
HQ1855A         ADI::SQ:::::G:::::::H::::AIAI:SP:E:VS:I::IPG:A:I:QR::::::::N
Hut0407         L:::YPSTG::E:::::::SD::::::S::EH:PA:GS:SL::DE:A:::::::::::Y:
rrnAC0296       Y::::A:TG::::::::A:V:::::::RIGA:::-V:::S:::TE:::::::::::::::
Hmu1377         I:::Y:ESG:IESA::AV:A::::::I::T:K:A:::::S::::D:G:::::::::::::

consensus       LSGSVSAGIVSGVNRTIPAP-TGFSIPDAVQTDAAVNPGNSGGPLVTLDGDVVGVINSGG
#oth            .411113..1..21.3343123323.1111....211.......11321.4.11122112
Hbo2028         :K::M:K::I::::::AFN:I::V:::N::::::::::::::::::NTE:S:::::SA::
NP0660A         :ES::::::I::K::SPNH:V:D::::NT:::::GLE:::::::V::M::::T:IAVA:A
VNG0226         :N:T:TT::I::T::A:::::::YR:::::::::::::::::::::S::::::A:V::::
Hut3001         :D:::TS:::::TD:L::S::A:YQ::::I:::::::::::::::MD:::S::::V::KQ
HQ1855A         :::T:TS::::::::S::::::::T::::I:::::::::::::::MS:::Q::A::::::
Hut0407         :::::::::::::D::LSS::GE:::::TI::::::::::::::::N:E:E:::::SA:Q
rrnAC0296       :::::::::::::D::LQSA:NN:::A:::::::P:::::::::::::E:::::::::::
Hmu1377         :::::::::::::D::L::A:N::::::::::::::::::::::::::::T:::::::::

consensus       GDNIAFAISAALTRRVVPSLIETGDYEHPYLGVRLTDVTPRVAEANDLDEARGVLVVEVI
#oth            1211111..22.221.213..22.513.212.1426412.5212..2.5234.1213513
Hbo2028         AE::G:::::::S:::I:::::N:Q:H::F:::DYAP:G:L:::::::T:PN::I::T::
NP0660A         :A:VG::::PL:A:::LTE::Q::N:::::::IQ:IE:::T:::::::::::::::::TA
VNG0226         ::::::G::::::D:::::::D::::::A::::SF:P:::T::D::G:T:S::L::MS:D
Hut3001         ::S:::G::::::Q::::E:::S:T:::A:M::S:DV::::L::::::A:PQ:L:::QTV
HQ1855A         ::::::G::::::Q::I:R::::::FN:S:I:::FES:::EI:R::G:KTP::L:I:D::
Hut0407         ::::GL:::S::::N:::A:::::S:::::::I::L::::A:::::::S::S::Y:T:T:
rrnAC0296       :::V::::::P::Q:::::::Q::::D:::M::G:RS:S:::::::N::PGS::YITR:V
Hmu1377         ::::G::::::::::::::::DS:A:D:S::::::::L::PIV:::::RT:E::YID::V

consensus       DDGPADGVLQGSDGETVVNGQAVPVGGDVILAVDGTPTPTRQDLGSFLALETSPGDTIPV
#oth            522.2223.3313424424144121.1.1134342433525341325.1.2141.22353
Hbo2028         :::::E:I:RA::ETVERR:VSI:::S:I::E:::V:VRD:NE:LAH:S::::::E:::L
NP0660A         P:::P:QT:R:A::::::GD:L::T:::::VGLA:SQVDSNA:::TI::::L::::RTTA
VNG0226         PS::SA:R:V:::AT:I:D:G::R::::IV:::N::RVH:LE:VL:L:::H::::::VS:
Hut3001         RG::::S:::P:SI:-Y:G:RQ::::::::R:I::::ME:FE::A:Y:::::R:::::E:
HQ1855A         :GA::::I::S::RQQI:D:TR:R:::::::G:G:QKIL:TE::::Y:::Q:N::E:V:I
Hut0407         EGD:S::::::ATE:::::::SI:::::::THIE:E::::S:Q:::V:::::QV:QPATI
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Hmu1377         T::::E:::EP:N::E::::VR:G:::::VV:M:E::::S::H:S:::::::T:::::A:

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Hbo2028         :IY:N:IT:P::L:::T::T:S:::::
NP0660A         ::I:::E:::ID:PI:S::::::::::
VNG0226         RL::::D:R::D:E:::::SG::::::
Hut3001         AI::::DER::::::D:::DRSTSPLR
HQ1855A         ::::N:Q:::LTIE::Q:::-::::::
Hut0407         R::::::TE:L:::I:S:S:AE:::::
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Hmu1377         D:::E:S:E::DL:::E:::R::::::