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7 genomes BUD1328 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC1530

HVO_2382

Hbo2083

Hmu2080

Hut1600

-

NP1786A

HQ3174A

Pairwise sequence scores
Consensus score1808 HQ3174A Hbo2083 NP1786A Hut1600 Hmu2080 rrnAC1530 HVO_2382
1187HQ3174A 1860 1169 1041 1036 1018 651 1058
1384Hbo2083 1169 1868 1182 1165 1087 694 1205
1435NP1786A 1041 1182 1804 1242 1155 733 1149
1452Hut1600 1036 1165 1242 1795 1272 751 1149
1404Hmu2080 1018 1087 1155 1272 1828 769 1114
856rrnAC1530 651 694 733 751 769 1094 741
1336HVO_2382 1058 1205 1149 1149 1114 741 1811

263 symbols
consensus       VIVVATADFELYHGVVGELRDRGVTFTTVEPGDELPDGARVVVVGPDDEHD----PGDVE
#oth            211111311221133142122122411122233431332424334342444111423434
HQ3174A         M:::::D::::::D::::::::D:R:::I:S:ADP:P:T:::IRT:S:TIS:::L:P:A:
Hbo2083         :::::::::::::EI::D::::::A::::K::A:I::Q:D::::SGT::VE:::I:SG::
NP1786A         M:::::::::V:::::D::G::D:P::::::DE::::::E:AI:::E:::P::::--AI:
Hut1600         ::::::::::::::::T:::::::::::I::A:::::RTEAI::::E::I::::V::::A
Hmu2080         ::::::E:::V::::::::::::L:::::::::Q::::TA:::TAA:ES::::::::G:D
rrnAC1530       ---------------------------------------------------::::-----
HVO_2382        :::::::::D:::EA:S:::S::::::::::::S::ER:::LLT::::DL:GTGSD:N:T

consensus       TVRADPGEPRRAVEEALAILRGG-GGRTVVGVDPGERPGIAVLSGDTVVAAFQVPAADAV
#oth            41425353411112334232113131332212111431111223133111..1..22334
HQ3174A         S:VVAGS:A:::::S:VS:::::DD::::::::::SS::::I:V::EIIG:::::LSE::
Hbo2083         ::V:SA::T:::::::IS:::::::::::I:::::T:::::::::::I::::H::L::T:
NP1786A         ::::N::D::::::::V:L:::D::::::::::::::::::::V:G:::::::::::::P
Hut1600         V:E:::A:::::::DL:::M::E:A::I::::::::K::::::A::V:IG:::::PDQVG
Hmu2080         V:::::EN:::::D:VA:L:::::D:KLI::I:::D::::::C::EMI::::::::DRVA
rrnAC1530       -----------------------:----------------------M:::::::::::IT
HVO_2382        R:T:TGDDV::::D::::S:::D:::Q::::::::T:::::::::E::::::H::L::::

consensus       EVVREEVEDA--VDPLVRIGDGARLQGARIIDELEDVPVELVDETGTTPYLGTGARGMGD
#oth            33133.2312113.12..1.1...13.13111113312..1...1....1..2.1.....
HQ3174A         GTIKS:LT:VDDS::I::V:N:::::::QLVND::::A::::::A:::::::A:::::::
Hbo2083         :TI:Q::::S::P:AI:::::::::::ST:VN:::::T::::::::::::::::::::::
NP1786A         A::AR:T:::::A:::::V:::::IK::K:::::::I:::::::::::::::::::::::
Hut1600         D:::R:::::::A::::::::::::V:S::V:D::A::::V:::::::::::::::::::
Hmu2080         :A:H::LAE::::::::::::::::L::::::D:G::T:::::::::::H::::T:::::
rrnAC1530       :I:::::::::::::V:::::::::V:::L:::IQS::::::::::::::::S:::::::
HVO_2382        ::I:::TD:::::::V::::::::::::KL:N::DG:A::::::::::::::S:::::::

consensus       VLAAVNIARIEGERIESRDIEPTAGELQRIKDRSREASETNRAIDEALARRVAAGELTIE
#oth            1........33..21211211..2..131..21..331231.1.314...1..5.3.124
HQ3174A         I::::::::RS::V::T:TL::::::I::::::::QMAPE::T::AK::::::I::::LT
Hbo2083         :::::::::MN::VVD:::::::Q::::::::H::RV::N::T:::R::::::::D::VS
NP1786A         ::::::::::::::VS:::::::::::::::::::AE:DDD:::T::::::::N:D:::A
Hut1600         ::::::::::::::VD:I::D::::::D:::E::::E:::::::::::::::::::::::
Hmu2080         :::::::::::::E::::E:D::::::K:::E::::::::::::G::::::::D:Q::::
rrnAC1530       :::::::::LD::E::::T:::::::::K:::::::::D:::::S:E:::Q::T:A::V:
HVO_2382        :::::::::RD:::::::E::::E:::T:::A:::::::D::T:::D::::::G:::S:D

consensus       EALAEHRSDNNTG----------
#oth            ...32.24344344333222111
HQ3174A         :::SR::N::D:HTESD::::::
Hbo2083         ::::::Q:E::D:AENTETDGTE
NP1786A         :::RR::QQE:G:::::::::::
Hut1600         :::::::E:DA--::::::::::
Hmu2080         :::::::D:GD:NDA::::::::
rrnAC1530       ::::K:N::SP:EEGEPDSG:::
HVO_2382        :::D::::REE--::::::::::