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7 genomes BUD1338 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1530

rrnAC0003

HVO_2472

Hbo2372

- -

hla0749

NP4366A

HQ3017A

Pairwise sequence scores
Consensus score685 HQ3017A NP4366A rrnAC0003 Hbo2372 hla0749 VNG1530 HVO_2472
433HQ3017A 727 284 319 306 316 304 293
372NP4366A 284 630 263 319 318 291 308
455rrnAC0003 319 263 744 307 384 331 321
442Hbo2372 306 319 307 666 356 356 402
502hla0749 316 318 384 356 838 368 346
451VNG1530 304 291 331 356 368 649 381
449HVO_2472 293 308 321 402 346 381 678

116 symbols
consensus       ------------------APAVAD--AGLSIP-DDADADEAAAIAAAVAAHLRDRQRAAA
#oth            11111111111122223333655333652311132.232.....11.141.141342111
HQ3017A         ::::::::::::::::MS::ST::IEYTV:::::::T:::::::V::IT:::N::E::::
NP4366A         ::::::::::::::::::------::MQVE:::P::::::::::V:::RS:V----A:LE
rrnAC0003       ::::::::::::MAADTDSAVD::LV:EIAAQL:::STA::::::V:IG:::T:::::::
Hbo2372         ::::::::::::::::::MSR:D:::VN:::::TA::E::::::::::::::::Q:V:::
hla0749         MATDASESDDVAPRSGDT::G:SAVLD::::::EH::DA:::::::::::::::GE::::
VNG1530         ::::::::::::::::::M::EM:::--:T:::E::SEE:::::::::QS::---AAM::
HVO_2472        ::::::::::::::::::--MSGELLS:::::::::::E:::::::::G:::H:QSV:::

consensus       AAAAAA----DDDDTWDGERWRFAGRVESLQGRSV-RVPDDAPTDAWAAAGRADRF
#oth            1.224312111443214132.212..3333321341.12321.114.2.1..42.2
HQ3017A         I:L:T:AEKSE::E:R::D::A::::ID::S::RLQ::S:RL:R:D:S::::IG:-
NP4366A         :::DDG:::::A::D:H:D::::T::LN:::N:RS::::T:::RNE::::::T::Y
rrnAC0003       ::::::AA::::G:S:::RQ:S:S::::AT:K::::::RS:::::P:S:::::E::
Hbo2372         ::E---:::::ET:S::::::S::::MRAVS:CAA::I::G::R:G::::::T:::
hla0749         ::::::::::::NPD:E:K::S:::::DR::N:::::::V:::::P:T::::::::
VNG1530         :::::D:::::NEA::P::K::::::::QQG:::::::::G::::::S::::R:::
HVO_2472        ::::G-:::::GEE::NE::::Y:::L::VT:CGH::::SG::::::::S::V:::