| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3039 | HQ1986A | hla0189 | NP3610A | Hmu0366 | rrnAC0944 | HVO_2877 | Hbo2643 |
| 1545 | HQ1986A | 2943 | 1235 | 1186 | 1288 | 1314 | 1322 | 1367 |
| 1853 | hla0189 | 1235 | 3071 | 1378 | 1593 | 1463 | 1529 | 1510 |
| 1870 | NP3610A | 1186 | 1378 | 3117 | 1519 | 1540 | 1587 | 1572 |
| 2098 | Hmu0366 | 1288 | 1593 | 1519 | 3078 | 1683 | 1753 | 1725 |
| 2256 | rrnAC0944 | 1314 | 1463 | 1540 | 1683 | 3263 | 2005 | 2244 |
| 2329 | HVO_2877 | 1322 | 1529 | 1587 | 1753 | 2005 | 3247 | 2153 |
| 2412 | Hbo2643 | 1367 | 1510 | 1572 | 1725 | 2244 | 2153 | 3264 |
481 symbols consensus ----------------MNRNDRSIVAFTMLAHGLVHTYELSIPIFVVIWLDEFD------ #oth 1111111111111122224212212212122.131.21.112.11231.143.3322112 HQ1986A ::::::::::::::::::GS:W:V:K:::VG:A:F:A::::::V:II::::I:T:::::: hla0189 :::::::::::::::::DSAEQR:::::AGS:::::::::::::LLTV:VG::S:::::: NP3610A ::::::::::::::MELAS:::::A:::::G::V::WF::A:::LL:V:::A:::::::: Hmu0366 ::::::::::::::::::D::::::G:A::::AT:::::::::::::V::QQ:S:::::: rrnAC0944 MRETVTHLPAADTNHTV:A:::A:T:LV:::::::::::MAV::::::::T:::LINLGI HVO_2877 ::::::::::::::::V:::::::::LV:::::M::::::::::::A:::G::ASIDLGL Hbo2643 ::::::::::::::::V:::::::::LV:::::M:::::::L::::T:::M:::VVNLGL consensus ----VTTATLGLIVTLGYALFGIGALPGGILVDRIGSRRLIIACLLGMAGSFLLLGLAPN #oth 2233113.42.32122.1121.3..1.2.112.24122321441.3..2211412231.2 HQ1986A ::::T:E:F:::::GV:::AI::::V:S:::S:KY::N:VV:VA::::GFG:G:ISIS:: hla0189 ::::T:A:V:::V::V::G:::V:::::::::::F::KP::L:::G::::::::VS:::: NP3610A :::::SV:VI::V:A::::P::L::::A:V::::F:PKQP:LW::T::SL::AA:AV::S Hmu0366 ::::T:::L::T::AV:::::::::::::V:A:LLSA:TVV:G:::::G:::::::F::G rrnAC0944 AQFN:::::V:V::::::G:::A:::::::V::::::::::TG:::::G::YI::::::S HVO_2877 ATVP::::S::VMTG::F::::L:::::::::::V::K:::V::::::::::V::A:S:: Hbo2643 TQLD::A::::WV::A::G::::::::::V:::::::::::SL::F::::::V::::S:: consensus IVVVALALLLWGAAASVYHPAGLSLISKGVEERGTGFAYHGIAGNLGIALGPLATALLLL #oth 23221.1134..32..1......2.1.22233.1.2111..21..2.121..12113..2 HQ1986A :::L::::AI::IS::L::::::::L:RRI:N:S:A:::::V:::V:TV::::L:SI::I hla0189 LLTL:::IAV::VT:::::::::::L::S:DQ:::ALG::::G::::::::::::::::: NP3610A :YA:::C::A::I::::::::::A:::T:::D:::V::W:::::::::::::F:::T::: Hmu0366 :PTI::::G:::V::::::::::::L:T::S::::::::::M:::V:::F:::::::::: rrnAC0944 M::I::::V:::LS:::::::::::::::::Q::::L::::V::::::G::::VA:V::: HVO_2877 L::::::::V:::::::::::::R:::T:::::::::::::::::I::GF::FL:::::: Hbo2643 L:::T::::C:::::::::::::A:::::MN::::::::::::::V::G::::L::I::V consensus FFDWRTVAALLAVPALVAAAYALRADFDETAAV------------DADTGGDEKAGA-GV #oth 222.33.132142.22224221442522252112222111111223335333324331.5 HQ1986A :LP::S::::SVI:T::GISI:FKLPLG:KK::::::::::::::-------::KKN::T hla0189 A::::I:T:A:T:::A:V:::G:TV:I:DALPDTENA::::::VS:G:ID::GGS::N:A NP3610A ::E:QL::LA::::GV::T::G:S::::S::::::::::::::::--:DTP:DAG:S::R Hmu0366 A:::::::G::SI::AL:V:::VT:E:::M:::::::::::::::R::G:A::GR:G::P rrnAC0944 VAE:::::LV:G::::L::V::SQ:S:::::::::::::::::::T:A:D:GS::SS::I HVO_2877 ::::HL::GV::L:::A:::L:T::N:E:Q:::AAADGGEGGDAG:S:::::G::::::: Hbo2643 :L::T:::M:::::::::G:::T::K:::S:::::::::::::::::GA::SS::D:::: consensus ASLAEFVTDSKHLFAGGFALVFAVVLCSGLYYRGVLTFLPDLLGGLPGFEPIPD---LLP #oth 412423333125.32211222144.343.11..121.1..22.42334352234155132 HQ1986A :VYR:LYE:TQI:VVS::PIII:A::LY::::::T:::::QI:LDA:M:NQ:TL:::--- hla0189 :::STIAD:TRV:L::::LI::VF:TF::::::TF:::::::::DV--LGGLI::IQ:ID NP3610A S::---:S:::S:::SS:L:::SI:TIV:::::::::Y::EI:Q:::AMAGVA-:::-:: Hmu0366 S::G::::GTRT::TA::::AIC:::MN:VF::::::::::V:::F--LP::T:YVR:FD rrnAC0944 D::G::L:E::::LT:S:L:::V::M::::::::::::::E::R:::::::::I:ET::: HVO_2877 E:F::L:SQ::::::::::::::L:MF::::::::T::::::::SVI:I::::V:SA::: Hbo2643 G:F:::::E::R:I:::L:V::L::I::::F::::::::::::S::DT:D:::L:AS::: consensus AG--------AGRAEELDPARYFYAGLLTVGVLGQYAGGKLTDRIPVERGLVGAFGALAV #oth 22332211223262421324413.311.32.23...21.112113332311334133.21 HQ1986A --::::::::--FGYT:N:TQ:I:TA:::A::G::::::R:::VVKA:YA:IL::VL:VI hla0189 PE::::::::SPY:::F:V:::L:VAV:M:::::::L::RIA::V:P::A:MVLM:I:T: NP3610A ::I:::::::----:::SLGD:::V:::VA:MA:::VA::::R:M::A::::VV:::::: Hmu0366 P:::::::::SPM:::F:L:S:V::::::::IA::::::::::::S:TT::I:V:A:::: rrnAC0944 P:VLSALGIEV:TGQT:K:QD:::::::LI:::::::::::S::::::Y:IA:S:LV::: HVO_2877 ::LVSG:::S::::PT::VELFV:::::::::F:::V::::::::RT:::I:AG:::::: Hbo2643 ::LADALGVE::SGRM:K:E::::S:::M:::::::::::::::L:::W::::::::::: consensus LAVLFVPVSAAGLGPLLAVCALLGFVLFAIQPFYQATVAEYTPAGTRGLSYGYTYLGVFG #oth 3.22.2.2363133322252221.2311422.31.221.21213241.1.1.1...13.. HQ1986A C:LA:::ILTT:FIS:IIM:I:I:::IYLTA:I::TVI::HAAN::H::::::::::M:: hla0189 ::L::::A:ET-IVTFI::SL:::V:::TV::LS:::::A:S:SEA::I:F::::::I:: NP3610A :::V:I:::GL::VAV:VY::V:::T::::E::::EA::V::::DS:::::::::::M:: Hmu0366 V::::::AAQ:::::::::S:V::::::::::L::::I:::S:PDD::::::F:::AN:: rrnAC0944 ::::::::::M:F:::AVLG::::IA::VV::M:::A:::::::::::::::F::::::: HVO_2877 I:IA:L::ASL:V:::::I::::::F::IV:::::::::::::::L::::::F::::::: Hbo2643 :::::L::VN:::A:::VFG:I:::F::V::::::::::::::::::::::::::::::: consensus VGALGAALAGTILTYAGPTALFLALAGIAVAGALLAVALAR---RQDA------------ #oth 3.1112322.43.34344232.43.12113212342441324322342222222222111 HQ1986A I:::::P::::A:S:MSTRV:::::::::GLAGMVSIY:LVW::K::-:::::::::::: hla0189 F:S::::::::V::R:::RE::FV:::::AL:::S:AGVS:LAT:::-:::::::::::: NP3610A L:::NISFG:FL:E:LSL::F::S:SV:::::TAV:WR:ITAPVG:A:PAAEADAASSDD Hmu0366 :::A::::S:IL:SAV:TDGT:::::AFP:L::A:::::S:VGT:RG:A::::::::::: rrnAC0944 :::::GG:::S::AF:NA::::GT:::::LVA:VTG:::::::::K--:::::::::::: HVO_2877 :::::G:I::Y:::V:DS::::AV:::F:A:AT::G:T:L:::::RPTPA:::::::::: Hbo2643 :::::G::::::::::T:::::TT::::::::::FGFY::::::KNG:ATGSEVTSD::: consensus - #oth 1 HQ1986A : hla0189 : NP3610A D Hmu0366 : rrnAC0944 : HVO_2877 : Hbo2643 :