7 genomes BUD1363 7 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC0280 HVO_2678 Hbo2402 Hmu1404 - hla0790 NP2580A HQ2722A

Pairwise sequence scores
Consensus score	787	HVO_2678	NP2580A	Hmu1404	rrnAC0280	hla0790	Hbo2402	HQ2722A
347	HVO_2678	675	234	156	261	249	260	232
492	NP2580A	234	807	379	388	317	303	329
423	Hmu1404	156	379	759	406	265	282	276
492	rrnAC0280	261	388	406	960	337	325	304
458	hla0790	249	317	265	337	883	396	302
512	Hbo2402	260	303	282	325	396	854	444
433	HQ2722A	232	329	276	304	302	444	910

146 symbols
consensus       ----------------MAAVTTPLDEEARSIFADLGYSVSRDGRELRAERKWRTVHVTVL
#oth            11111111111111111322232253213421431114124436123...1..3.4..32
HVO_2678        ::::::::::::::::-----------------------------ML:::::::::::A:
NP2580A         :::::::::::::::::G::::S::::::T::R::::E:TTEND::::::::::::::TA
Hmu1404         ::::::::::::::::::::::S:ADQ:S::::::::::::TDG:::::::::V:R::CS
rrnAC0280       MASGNVYQIASGTGSQ:G::::S:::Q:::::D::::T:::T:T::::::D::V:T::::
hla0790         ::::::::::::::::::TASI:PTT:::DV:RE:::T::EG:Q:FV::::::R:L::::
Hbo2402         ::::::::::::::::-----M::S:::::::NR:::D::G::::FV::::::::Q::::
HQ2722A         :::::::::::::::::PT:S:::L:::QV:::R::::::G::S:FI::::::S::::::

consensus       RSEEA---R--IADGGR------LRCFVTWKDRAGDLRRRLTGADPSYDWAVIGVDSDGD
#oth            635554432323322.31334332....145342353331.556423.1..121145224
HVO_2678        S:R::TEC:PVL::::T:ETPYRF::::::D:HISA::E::R:I:LP:E::I:::SNG:G
NP2580A         DP::::::-::-NTY:::::::::::::ADA::::EV:D::L:LE:D:::::MS:E-:::
Hmu1404         EPST-:::-:::PTD::::::::H:::::EMED:VTTY:::SVES:::::::L:::D::E
rrnAC0280       N:QDP:::-:::PE::D::::::::::::RT:D:TH:S:::NRQ:V::::::::ITE:::
hla0790         CM:NDDIG:Y:L::::D:::TPR:::::::RN::::::D::VSKK:P:::::::INA::K
Hbo2402         GTDSNVRG:RA:T:::E:AREYPF:::::::EG:::::GQ::D:::::E:::::::::QH
HQ2722A         ::GATLSNKRART:::TVSNQCQ:::::AP:TETTLIKE:::AMN:E:E::IM::E:NE:

consensus       -------YAVV--HPEAT--------
#oth            111112313.4213134522212111
HVO_2678        :::::ND:E:::::GTN:::::::::
NP2580A         ::::::::Q:L::::S:DVLPAP:::
Hmu1404         ::::::::::Y::R:S:-::::::::
rrnAC0280       ::::::::E::R:::GD:AMSADANT
hla0790         ::::::DF::MEGA:GSP::::::::
Hbo2402         :::::DQ:D::::L:::R::::::::
HQ2722A         GKGHTDK:D:I::L::TN::::::::