|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1846 | HQ1315A | hla0921 | HVO_0179 | NP6106A | Hut1910 | VNG1285 | Hbo3594 |
941 | HQ1315A | 1694 | 645 | 614 | 660 | 764 | 715 | 693 |
1136 | hla0921 | 645 | 1853 | 930 | 875 | 755 | 808 | 743 |
1217 | HVO_0179 | 614 | 930 | 1942 | 965 | 826 | 881 | 807 |
1194 | NP6106A | 660 | 875 | 965 | 1926 | 805 | 890 | 849 |
1149 | Hut1910 | 764 | 755 | 826 | 805 | 1819 | 927 | 856 |
1265 | VNG1285 | 715 | 808 | 881 | 890 | 927 | 1875 | 1171 |
1231 | Hbo3594 | 693 | 743 | 807 | 849 | 856 | 1171 | 1834 |
263 symbols consensus -----MDHRLDEIDRRILYALMADARNTSAPMIAEEANVSAATIRNRIAQLEEEGIIRGY #oth 122223422112212112241361111121232.2235.121.1....63..34.11111 HQ1315A :::::--------------------------:::::VD:TP::V::::N::::S:::::: hla0921 ::::::S:H:::::::::H:::S::::::::::::GL::::::V::::ER:::::V:::: HVO_0179 MPYRNT::::::::::::::::D:::::::STL:A::G::G:::::::HK::DS:::::S NP6106A MSDTGSE::::Q:::::I::::G::::::::D:::HLS::G::V:::::R:::R:::KD: Hut1910 ::::::::::::::K::::Y:A::::::A::E::::ME:T::::::::R:::T:::L::: VNG1285 ::::::SD::::V:K::::N:VR::::::::D::D:V::::G::::::TH::AA:::::: Hbo3594 ::::::VD::::V:K::::H:VQ:::::::::V::::H:::G::::::K:::AD:V:::: consensus HADVDYEQADGRLTNLFICTAPVDERERLAKAAAAIPGVINVRELMAGRRNLHVTAVGED #oth 3151212333.31233241221332123225333421.1131.3.14.24113121..32 HQ1315A :T:IN:::SN:KV:TQ:T:::::GK:STF:DK:::T::I:H::::L::QD::VI:::::: hla0921 T:I::F::::::::SV:M::V:A:::::::L::RS::::::::V::::::D:Q:V::::E HVO_0179 T:Q::F:L:G:K::::YL:DV::T:::A::HE:R:::::::::T::T:::::::L::::S NP6106A Q:TI:F:::::S:M::YL:H::FG:V:AVSRKLGTV::::::::::G:::::::L:::R: Hut1910 L::I::KAIE:HV:YE:R::::IPD:DH::Q::LD:S::VAA::::::TT::T:::::T: VNG1285 ::V:S:P:VG::::::Y:::S::PD:D::S:QV:E::::VS::Q::K::S::::::::D: Hbo3594 ::H::::R:E:::R::V:G::EI::::::T:QI:D::::V:::Q::C:TG:V:::T:::: consensus TDDLRRIARELSALGLEIEDEDLLQEELFRPYHPFGPEDARDGPSIADFMSLAGGAEVVE #oth 24114112332333115112.522251324..431311244444532.23412112211. HQ1315A :N:IN:::HQ:::A::S:QR::IVID:R:Q:::R:A::ED:APSAVT::QAV:::G:L:: hla0921 :S:::E::::::G:DIR::::E:::T::HT::SR:LSD::AH-:VVT:TVT::D:TA:I: HVO_0179 :G::::V::L:TDI:IH:::::::E::::A::G::D:D:GGHA:EAN::I::T:D:S::: NP6106A :::::::G::IEE:DI:::::F:::Q::HF::L:Y:::ES:P:KPL::Y::::::::::: Hut1910 :::IG:::A:::D:::T::::SVIE:QY::::D:::::::PK:::LT:::G::::::::: VNG1285 MQE:T:::ND:::I::D::E:N:::S:EI::::E:::D:SQ::HT:::::E:S::::::: Hbo3594 AQE:A:VT:DVAEM:::V:::H:::H:E:::::A::::GR::RQ::::::::S::::::: consensus VTVSEDAEIAGLTLEDANERGILEDETLVVSIERDDEILTPRGDTEIRPDDLVTVFSR-- #oth 23.444.21224.242.52422244421.221..224411.421131213.2.1113211 HQ1315A F::::T:G:::M::A::HRE:L:PEKV:::G::::GSHI::NS:A::E:G:::S:::P:: hla0921 :C:TDE:P:V:::PTA:R:E:::SAN:V:T::::EGS:IH:ADE:T:::N:V:::LPK:: HVO_0179 :P:QS::P::S::::::S:::::D:::::IA:::G:RE:::H:::V:E:::I:::L::AG NP6106A L::E:S:P:V:C:::E:TQKN:I:EQ:::IA:::::TVI::K:::::Q:Q:V:::::P:: Hut1910 F::::G::::DR:I:::V:SDL:A::M:::G::::GDV:::K:E:V:QAG:V:SL::K:: VNG1285 LS:AA::::::H::RE:::::VI:SDV::::::::::M:::::::RV:::::::::C::: Hbo3594 :S:TPG::VD:M::SE:::Q:LV:P:V::::V:::E::::::::::::A:::::L:A::: consensus GGAPEDALTAFRAP--AAE---- #oth 3235344332.443554434311 HQ1315A EAL::QLV:::DSDTRS:SEQA: hla0921 DASA:EH::::V::EE:::SSAS HVO_0179 :D:DA:::S:::G:QTESSPG:: NP6106A :::G:LVAEG::S:PDHEA:::: Hut1910 T:LET::::V:G:Q::---:::: VNG1285 ::ISQET:SV:GKRGS:T:T::: Hbo3594 :DI::KTIA::TDD::---::::