|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1210 | NP3400A | hla2732 | HVO_1231 | Hbo0327 | HQ2442A | pNG2033 | Hut2420 | Hut2631 |
528 | NP3400A | 1184 | 354 | 429 | 362 | 314 | 358 | 399 | 335 |
611 | hla2732 | 354 | 1278 | 429 | 417 | 418 | 444 | 437 | 395 |
727 | HVO_1231 | 429 | 429 | 1240 | 755 | 410 | 480 | 489 | 463 |
688 | Hbo0327 | 362 | 417 | 755 | 1270 | 370 | 484 | 458 | 435 |
617 | HQ2442A | 314 | 418 | 410 | 370 | 1218 | 492 | 551 | 493 |
708 | pNG2033 | 358 | 444 | 480 | 484 | 492 | 1198 | 598 | 500 |
873 | Hut2420 | 399 | 437 | 489 | 458 | 551 | 598 | 1220 | 1012 |
791 | Hut2631 | 335 | 395 | 463 | 435 | 493 | 500 | 1012 | 1132 |
180 symbols consensus MYRAGHYGAALLAYAPVGFALIVAGFPELAFLGGVGAVLLAMLPDYDQRLPGITHRGPTH #oth 2327113132.1322.323324431235113221243352131..3.4321224...4.. NP3400A :H::::V:::::T:V:F::V:-S:AE:A::I:::::V:V:SR:::I:FV:::VE:::A:: hla2732 ::WR::V:I::::::::AG:VR:::E:::TV::AAV::TF:T:::L:H:::-VA:::::: HVO_1231 :::F::W:VS::VF::L::::VQ::R:::::VA:AAMCW::::::::M:V:::S:::::: Hbo0327 :F:Q::::VS:IVF::::::::HL:R:D:::VV::VMLW::::::V:H:I:::P:::::: HQ2442A :::K:::::S::::::::CLT:I:::DVA:V::::LTLAI:P:::::TQIDTL::::V:: pNG2033 :::N::::::::FVT:ISAV::SI::VR:::VA:IT::GF::V::L::::::V::::L:: Hut2420 VH:E::V::::::::::::IVF:V::EGA:MA:A:::G::::V:::::HV:::::::L:: Hut2631 ----------:::::::::IVF:V::EGA:MA:A:::G::::V::::::V:::S:::I:: consensus TVWFAALVG-VL-LGGAGLIAGS-GDGTLAAIALG--V-F-----GFL--VGTLTILSHI #oth 124.13221242132244334563434433335321143311111.221111333241.2 NP3400A ::G:LLV:TA:::A:VGFV:S:TF:T::TPGQSAV::L:-::::::A:::I:ATAVG::L hla2732 :IA::LTA:::::VAL:AA:VFPV::::AP:T:A:::TALPPWTP::VGGIA::SLC::V HVO_1231 ::L::::::G:G:G:::Y:L:SNA:QPEA::TT::::A:::::::::A::::A::V:A:L Hbo0327 SLA::G:::G:FA:V:Q::VLAGVD:IG:::::D:SV:V:::::::::::::F::VFA:L HQ2442A :IS::V:T::C::VAVLTT::VVFA:ARIVS:LIS::IP::::::::V::I:LTG::::: pNG2033 :::::LV:::F:::A:::TVV--:---:I:PSLI:::TVT:::::::A:::::G::M::: Hut2420 ::::::::::LG:::L::VAI:::N::::T::G:::::::::::::L::::::V:::::: Hut2631 ::::::::::IG:::LI::AI:::N::I::::D:::::::::::::L::::::V:::::: consensus AADALTPMGVRPLWPVRGDHYSLDLARAANPIANYGLLGLGIAASALALYLGNAL----- #oth 11.211.2.24234132454213333413123..121133.1324433433453342311 NP3400A L::M:A:P:LPL::::SRAQFTVNVTHPRD:L::::::TF:VVLTV:VG:VAS--::::: hla2732 :G::I::::IW::R:F::W:VT:::TP::::R::RLF::A:V::L::SVA:TL--::::: HVO_1231 :::V:::A:I:::::LSSRKFT:S:WT:D:TV:::::FAV:VF:V:A:A::SV::::::: Hbo0327 LG:::::A::NF:::LS:YE:TISAW::D:KL:::::F:V::F:V:A::::AVT:::::: HQ2442A ::::::::::::FGE-D:T::::E:VS:K:T::::L::VA::V::FV:IVI:D:IRNIII pNG2033 :::::::A::::WS::DDTR::::IV::K::L:::A:::::::SAT:GIWT:GTAAGL:: Hut2420 ::::::::::E:YA:::D::::Y:V:::::::::::::A::::::GV::VV::::TNM:: Hut2631 ::::::::::E:FA:::N::::Y:V:::::::::::::V:::I:TGI::AVV:V:SNI::