7 genomes BUD1372 7 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - pNG7078 HVO_1031 Hbo0525 - Hut1525 hla2312 NP1388A HQ1592A

Pairwise sequence scores
Consensus score	2712	Hut1525	hla2312	HQ1592A	HVO_1031	Hbo0525	pNG7078	NP1388A
1834	Hut1525	2642	1575	1565	1650	1574	1421	1532
2064	hla2312	1575	2742	1742	1768	1719	1822	1803
2162	HQ1592A	1565	1742	2825	1932	2030	1605	1811
2200	HVO_1031	1650	1768	1932	2635	1984	1639	1782
2199	Hbo0525	1574	1719	2030	1984	2724	1673	1759
1945	pNG7078	1421	1822	1605	1639	1673	3192	1888
2051	NP1388A	1532	1803	1811	1782	1759	1888	2654

430 symbols
consensus       --------------------------------------------------------MTET
#oth            111111111111111111111111111111111111111111111111111111112342
Hut1525         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S
hla2312         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SSS
HQ1592A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SD:
HVO_1031        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo0525         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::M
pNG7078         MHRRRSGPTSQPLARGERGLPANRSFASLIAWLTSVRLLCRSPPFCCFYSLSTYTTVMY:
NP1388A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--M:

consensus       DDP-EYDVVVVGGGPAGLQTALYTTRLGHDTALVDRGGGRAAMMLDTHNVIGVTEDTSGN
#oth            24453.112.1......122...22...12.22111.......13.1..1..11.12..1
Hut1525         NE:S:::::::::::::QSA:::A:::::R::I::V:::::::IQ:V::L:::P::D::M
hla2312         ::-::::IA:::::::::T::::GA::::E:V:I::::::::::A::::::::::E::::
HQ1592A         :TVAD:E::::::::::::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1031        :E:R::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo0525         G:AES:::::I:::::::::::::A:::::::V::::::::::::::::::::::EV:::
pNG7078         :GQYD:::A:::::::::TS::::S:::M::IVIN:::::::::T:::::::::::V:::
NP1388A         :--:H:E:T:::::::::T:::::::::::::VIN:::::::::::::::::I:::::::

consensus       EFLATAREQVESYGGDFHRDFVTDADRL--DDGRFRLVGNDNEFVADRVVLATGFNDERP
#oth            .1.31111.213..3133.131223422112112141323441453321..12..2.21.
Hut1525         :L:Q:G:::L:G::C::Y::R:ASCS:E::G:D-I:::::S::YS:TA:::::::::V::
hla2312         :::::G::::Q::::T:E:G::::V::T::::D::::STTGA:ILS:::::::::S:K::
HQ1592A         :::::GT:::::::::VI::LI::IE:T:::::::Y:E:SS:A:R:::I::GV::S:KH:
HVO_1031        :::E:::G:L:D::T:I::::::::E::::::::::::::EG::::E::::GV:::::::
Hbo0525         :L:Q::::::::::A:::::L::E:T:::::::::H::::NS::::::I::GM:::::::
pNG7078         :::E::::::QD:::TYE:G::ESV:P:ADEEDG:TVTTS:G:LAVK::::::::A::::
NP1388A         :L:SR:T::IQE::A:Y::GT:::IQST:::E:-:AVTAG:T:VTTEH:::::::S:K::

consensus       DPPLPRTGKGLHYCLHCDAYMFVDEPVYVMGTGESAAHVAMIMLNFTDDVDILTRGDEPE
#oth            1..1....1...1......2..1111.1...1111111..1....2.11..2.1..22.2
Hut1525         E:::::::R::::::::::H:::::::::::H::::V:::G:::::::E::L:::::D::
hla2312         :::::::::::::::::::::::::::::::H::A::::::::::V::::::::::A::T
HQ1592A         :::V::::::::::::::::::::R:::::::::AT:::::::::::::::V:L::::::
HVO_1031        E::::::::::::::::::::::::S:::::HSD:::Y::::::::::E::L:L:::::T
Hbo0525         E::V::::::::::::::::::I:R::F::::::::::::::::::::E::::L::E::A
pNG7078         ::::::::::::W::::::F:::G:::F::::::A::::::::::Y::::::::::ET::
NP1388A         ::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::::::::P:::L::::ED::

consensus       WSDETDEQLRAHPVDIVEEDISGMQKD-DDGWLEAFEFEDGTVREYRGGFAMYGSNYNTA
#oth            ..12.224222..111122123.3423112...222..1..22.2.1...1.1.12.224
Hut1525         ::EG:A:TIEG::I:VIH:::A:V:NG:E::::KTL::A::EI:::K:::::::AE::NG
hla2312         :::::AA::D::::EV:S::VT:VEN:P:S:::::L::::::R::::::::::::D::::
HQ1592A         :::K:::::::::I::::S::D::N:S::N::::S::::::SI:Q:::::::::::::::
HVO_1031        :::::::LV::::::::::EL:::T:R:::::::S:::::::::::K::::::::::::T
Hbo0525         ::E::::R:::::I::I:TE::::R:S::N::::::::::::::N:::::P::::::S:D
pNG7078         :::::QTM:DN:::E:::TEL::K:T:::::::S:Y:::::S::::K:::P:L::D:HAE
NP1388A         ::::::T:::N:::EV:H:::T:LE::::::::S::::::::::::::::P::::E:::D

consensus       LAEELGCDLNDDGTVAVDDHGRTSVDGVYAVGDITPGHNQIPVAMGKGAKAGIAIHYDLR
#oth            .125.1222211.115.11211.2231.1....2.1....2.1.1.3..31.121.331.
Hut1525         ::R::::AI::::::E::::::::A:N::::::L::::::L:I:L:A::::::D::FS::
hla2312         :::G:::::TEG:EID::::::::EN::F:::::::::::V:::::Q:::::L:::K:I:
HQ1592A         :F:T:::E:D:::::I::ESME:T:::::::::::D:::::::::::::Q:::D:::Q::
HVO_1031        :F:A:DV::D:::::P::::::::::::F:::::::::::::::::::::::::::ME::
Hbo0525         :::Q::::::E::::::SED:E:::E:::::::::::::::::::::::Q::L::::E::
pNG7078         ::D:::L:R::::::::::::E:::S:::::::L::::::::I:::E::D::::::K:::
NP1388A         :::S::VE::::::IG:::::::N:::::::::V::::::::::::E::RC::GN:::::

consensus       EFPRSLDDIRAEGPVTDDEVPGISDRLLAAAVTFEEHAA-PR----EAEA----AD----
#oth            31.113132223.1.4441..122252533.55122342223111144323343231111
Hut1525         D:::DP:VLD:Q:::R:E:::::P:Q::EQ::D:HTY--:--::::----::::--::::
hla2312         :::::QET:E:D:::DA::::A::PA:M:T::AH:G::GGA:VKGV::KEETPA::::::
HQ1592A         ::::D:EE::::::::ET::::V:::VQN::AS:::AQ:P:I::::::P:PDAT:EVDAE
HVO_1031        :::K:::E:::::A:SV:D:::::PG::DK:KQ:N:SH::--::::----::::--::::
Hbo0525         ::::::::V:EN:A::R:::::LG::IH:::DE:::AR:P:I::::QSPEVESAV:::::
pNG7078         KY:::V:::ES::A:E:V:::AV:EE:F:T:L:H:G:::G::::::SE::PEVR::::::
NP1388A         A::::::::ES:::::EAD::AV:EK:KE::T:H:G:--::G::::AG:::::::G::::

consensus       --------DD
#oth            1111111111
Hut1525         ::::::::GE
hla2312         ::::::::::
HQ1592A         ADAIEPPS::
HVO_1031        ::::::::::
Hbo0525         ::::::::::
pNG7078         ::::::::::
NP1388A         ::::::::::