| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2558 | NP0206A | VNG1465 | Hut1008 | HQ1864A | rrnAC1901 | Hmu2179 | hla0561 | HQ1019A | Hmu2587 | rrnAC2066 | NP0650A | Hut2142 | VNG2136 |
| 1265 | NP0206A | 2575 | 1193 | 1283 | 1127 | 1218 | 1219 | 505 | 432 | 635 | 607 | 527 | 388 | 543 |
| 1335 | VNG1465 | 1193 | 2757 | 1301 | 1247 | 1391 | 1301 | 517 | 343 | 534 | 699 | 555 | 379 | 521 |
| 1269 | Hut1008 | 1283 | 1301 | 2493 | 1255 | 1318 | 1317 | 492 | 390 | 469 | 699 | 488 | 386 | 454 |
| 1266 | HQ1864A | 1127 | 1247 | 1255 | 2507 | 1354 | 1421 | 411 | 323 | 601 | 647 | 576 | 407 | 521 |
| 1465 | rrnAC1901 | 1218 | 1391 | 1318 | 1354 | 2683 | 2093 | 427 | 408 | 421 | 661 | 532 | 403 | 480 |
| 1418 | Hmu2179 | 1219 | 1301 | 1317 | 1421 | 2093 | 2654 | 472 | 421 | 457 | 692 | 525 | 379 | 471 |
| 1110 | hla0561 | 505 | 517 | 492 | 411 | 427 | 472 | 2737 | 898 | 847 | 964 | 929 | 841 | 829 |
| 1005 | HQ1019A | 432 | 343 | 390 | 323 | 408 | 421 | 898 | 2624 | 949 | 1057 | 1103 | 905 | 977 |
| 1174 | Hmu2587 | 635 | 534 | 469 | 601 | 421 | 457 | 847 | 949 | 2622 | 1065 | 1100 | 1000 | 946 |
| 1380 | rrnAC2066 | 607 | 699 | 699 | 647 | 661 | 692 | 964 | 1057 | 1065 | 2607 | 1318 | 952 | 1036 |
| 1237 | NP0650A | 527 | 555 | 488 | 576 | 532 | 525 | 929 | 1103 | 1100 | 1318 | 2624 | 1004 | 1060 |
| 1003 | Hut2142 | 388 | 379 | 386 | 407 | 403 | 379 | 841 | 905 | 1000 | 952 | 1004 | 2748 | 1098 |
| 1069 | VNG2136 | 543 | 521 | 454 | 521 | 480 | 471 | 829 | 977 | 946 | 1036 | 1060 | 1098 | 2202 |
391 symbols consensus ----------------S-S-R-SDSDRR-LLRLSRAPLWVLAAAFAVLALAGVSLPL--- #oth 111222322366446978686876577675787635535654545645973457455111 NP0206A :::::::::::MATVE:NLR:LGT:RS:R::SG::IA:V::IGW:LLARW::I::SM::: VNG1465 MLGSDVCIHMSNRSQFVP:WLVPEAAGDLP:TV::LS:LA:::::::GYG::FAV::::: Hut1008 ::::::::::::::::-:-:-:------:------VA:ATI:IG:V:GQA:::R:G:::: HQ1864A ::::::::::::::::-:-:-:------:MMMI:::T:TG:I:V:IGVHF::IT:T:::: rrnAC1901 :::::::::MPTTSLG:VWQ:HR:T::HPS:W::::S:L:::V::GL:GA:E:RV::::: Hmu2179 :::::::::MRPTETL:AWRLYR:V:THPS:G::::A:L::LVG:GG:::::IEV::::: hla0561 ::::::MTETATRSAAHRGTTAVEG:D:ARSAVD:WFALYP:L:L:A:LPV:AVT::FPV HQ1019A :::::::::::::::MAV:ESL::TT:QV:G:SVFI:A:LILIGCIL::PLVE::SP::: Hmu2587 ::::::::::MAVEVTADRG:RLR:G::R:A:WTFL:A:LVLG:VT:AHIL:::TAV::: rrnAC2066 ::::::::::::::::MGVSYR:AVEPSVRY:VAL::G::ASL:VVAPF:::::I:P::: NP0650A ::::::::::::::MSNA:L:P:GTASAT:F::AFL:G:AVI::TTGAF:V:A::::::: Hut2142 :::LHLPIEFERVQQPTERGGFDG:VAAS:GVFL:WTG:LPLL:L::VVPLLAP::E::: VNG2136 ::::::::::::::::-:-:-:------:----------------------------::: consensus RLQAAVYLLGMVALNLPHGAYDHLANLRRRGERFTWRYI----VLYLVLGGGFVALFFLA #oth 753553334352542111.14114634143785456153353424.26432326341341 NP0206A QT::::::F::::::::Y:G:E:MV::DP:ELS:GL:::::::AA::A:VV::::V::V: VNG1465 EV::G::::::::M:::::G:E:FE:::::AAS:QGK:::::::A:::GIAA:G::::V: Hut1008 TT:::I::F::::::::::G:E:FN:I:Q::LT:Q:::V:::::E::A:VA::IT::A:: HQ1864A QT:::I:::::::::::::G:E:F::::::AM::RGK:V::::AG::CVAAV:M:V:V:: rrnAC1901 :A:MV:::V::::::::::G:E:FE:::::RPS:R:::V::::GV::AAI::::G::LA: Hmu2179 :A:MV:::V::::::::::G:E:FE:::::RPTVR:::V::::GA::LAI:A::G::L:: hla0561 E:GV::FA::TL:VGMV:::V:::IPM:AAPNVSVR:S:AVVS:A:A::::AV::A::V: HQ1019A ::RYLPFA:SLLIFG:::::V:::TPA:TVNTPV:V:SMLSVGG:::SI::VYLGWW:F: Hmu2587 PVRYG:L:VTLLCFG:::::A::HSVA:TL:VDL:P:FLAAFCAG::G:AVLYT:VW::: rrnAC2066 A::Y:PLVVSA:L:G:::::V::::VA:T::::PD::A:ARVFA::G:V::AYAVTW::: NP0650A TY:LIPLAASV:L:G:::::V::::LP:T:N::V:V:WLAAIG:::A:V::LYA:VW::: Hut2142 SVRYLPLVASV:VFG:::::L:YV:LP:ALSG:VDA:GLTIVG:::AI::::YLVAWLIV VNG2136 ---------------M::::I:Y::LP:AVTGTV:V:WLAVVG:::::::::YA:AW:F: consensus PVAALALFIAVTWAHWGQGDLYVLDALAGTDHLDTRAQRALAAVVRGGLPMLVPLVAFPE #oth .261345124313311.5.22532754614411444442522433..141.41.333215 NP0206A ::VG:::A:::AV:KG:H:G:R::::TV::S::K:T:::::::F::::TV:I:::FFW:G VNG1465 :::G:G:AVT:AV:KG:F:GVQSM:::Y:::::R::P::W::::::::AV:V::MLFWTD Hut1008 :::G:::A:L:AVLKG:Y:G:H:M::ET:SGY:R:PI::H:::L::::VV:A::I::W:G HQ1864A ::IG::IA:TIAV:KG:G::::A:QIT:::G:IQS::HQL::VAA:::AV:A::I:V::: rrnAC1901 :::G:::ALT:AM:KG:L:G:Q::E:TS:::::Q::F::G:::A::::AV::::I:FW:Q Hmu2179 :::G:::ALV:AM:KG:L:G:H::A:TS::G::Q::P:::::IA::::AV::::I:FH:T hla0561 ::::FIG:::L::L::::::VAA:-G:::VE::P:S:E:W:SL::::::::G:::L:H:: HQ1019A :TS:AIM:VFI:LL::::::::AILSFLDA:::P::FE:::SI:T::AM:::I::I:H:M Hmu2587 :AL:FVA:V:L::F::::::V:P:AT::DGR:::N::VA::TV:::::::::::::F::D rrnAC2066 :A::FV:::::::F::::::::A:R:::DA:::RSLP::IGTVL:::::::::::L:::: NP0650A ::G:V:A::FM::V:::::EI:P:V:::DA::::G:LE:G:T:AI::A::::::F::::D Hut2142 ::P:AVV:::L::F:::::E:F::RDAF:GG:::D:I:Q::TT::::::::A::::G::: VNG2136 ::P:AFA:V:I::L::::::::P:LDFLDV:Y::::PR::ATVLI::::::::::LG::: consensus TYRAVSSLMVGLFDPGA---LAAIAGLFDP-TRLVIGVGFAAATVAHLGAGYRR---AGG #oth 71641368326316433111564756716666275325442453453234.544232656 NP0206A DFA:F:TF::DM:EM:::::F:SV:PH::A:L:YGL:AV::V:A:S:VAV::L::::HET VNG1465 VFY:F::V:ISI:::S::::VS:LG:DIAT:R:::L:G:YG:LV:::::L::::::::A: Hut1008 :FETF:AY::NI:Q::G::::EPFTQY:SV:::PL::IT::TFA:::V:L::V::::RD: HQ1864A :FHTF::::I:MV:::G::::TG::RY::V:::II::::Y::TVIG::::::LH:RTVD: rrnAC1901 :FH:F:::::::VE:::::::SSY::S::T:::::::S:YGL:LT::IVL::V::::G:: Hmu2179 :FHSF:::::::VE:::::::::YS:Q::L:::R::A::Y:L:LG::V:L::V::::G:: hla0561 E::L:AEWV:R::VVDGRTAT::VDP::V:E::AAV:AFMIV::ALSV:V::::VRAGAS HQ1019A S:QR:LIGFIE::SVN-:::TIS:GF::SSPI:N:VTAVIIGL:IMTIA::AW:VYTGAS Hmu2587 R:A::ARTV:S:::::R:::TGSL:P::TQEAGI:A::::::I::VT:A::LAV:::::P rrnAC2066 W::R:ATDL:S::A:D::::V:::GWA:RTDV:TALALAYG:LV::T:AV:FA:::::DA NP0650A Q:EL:VTTL:::::AD::::A:TA:AA:T:TA::AVA:TVGGLVAVT::I:AVA::::SE Hut2142 R:L::LETF:EP:--:G:::SIGS:W::E:SGQAIVA:::GLV::VT:WR:W:LAKAN:R VNG2136 R::S:VDAFAAP:--:G:::SVGDLAV:::RV::WL::A:::::::V:A::R:::::THS consensus RR--P--WLLDAGETALLIAFFAVVPPVVAVGLYFPLWHSLRHVARLAAVDDD------- #oth 5322611244..1.342.332.3322123.1.2..23.113.122.76621873342224 NP0206A LS::T:::A:::::::::::Y:::::V:::::::::::Y:A:QS::I:::ES:::::::: VNG1465 TG::S::F:A::A::L::::Y::L::V:I:::::::::Y:A:Q:::SS::::TAMTQADA Hut1008 T:::S:::FV::::::V:::::::::V:::::::::::Y:M:Q:G:HVSIE::VPEQGGV HQ1864A SG::-:::MV::A::I:::GY:::::V:::::::::::Y:M:Q:::ELNIETNTTQ:::: rrnAC1901 :S::-::::I::::SL::AV:::S::VL::::::::F:Y:A:Q:::T:S:ETE::PVGDE Hmu2179 :S::-::::V::::SV::A:Y:::::VL::::::::F:Y:A:Q:::T:T:EAE::PVGDD hla0561 ::::G::::R::::V:V:W:W:LLAA::F:I:V::A:::A::::G::VL::P:::::::: HQ1019A A::::::Y:I::::IG::W:::IAL::IF:::V::CI::::::I::::II:HP::::::: Hmu2587 ::::A:::::::A:::::WG::::::::L:I:V::A::::V::I:::TEL:GV::::::: rrnAC2066 :::::::::::::::LG:L:Y::L::::L:I:V::C:::::::::::LL::::::::::: NP0650A TGWG:::::::::::G:::L:::A:::IF:I::::CF::::::IV::L:::NR::::::: Hut2142 :QSDNGG:R:::A:::::WV::LL:E::L:I:A::C:::::::IV:VGLL:ER::::::: VNG2136 PG::A:::RV::A::L::WV::F:::::F:::V::CV:::V:::::AI:::GS::::::: consensus --AADALDGG--DPRRAALRFWRDAAPGTLATFALLGALYWLVPNPLGG---LPGLVAFY #oth 119854155522564534323434233423134424353442516445456348344133 NP0206A ::---T::S:PDSS:T:PGTAVAAFVG:AI:::::A:L:FV:L:::MA:GTL:ISG:::F VNG1465 TGML::::AD::::A::T:AS:AVLIV:SV:::G:AAV:WL:S:Q::::GGI:V:::::W Hut1008 ::LTPF:ESD:::::VI::TA:GVLIA:SI::A:VV:TILFVASE::::APL:::::::W HQ1864A ::GS:L:G:TTVSAGGV:::A:VVLIA:A:::AIVAVGFW:V::::VPSESISF:::::W rrnAC1901 ::RW:L:G:A::::STV:::A:VVLVV:A::::GV:V:V::AF:::::TSDL:::A:::W Hmu2179 ::EW:LVG:S::SASTV:::A:GILIA:A:::::V:AVV:::F::::A:TAA:::A:::W hla0561 ::::A::GE::::A:::LA::A:::::L::GG:VVV::VAIAA:AGVAS:::PGD:L:TS HQ1019A ::SRQ:::SA::HI:P:VW::V:::::L:A:ALLFFAS::I:::RQPNN:::IES:A::: Hmu2587 :::LA:::R:::AVA:VVG::T:::L:A:VGAVV:F:G:ALA::TTVA::::VSEVGGL: rrnAC2066 :::TA::QNR::::SA:LA::A:::::L:A:SL::::G::F:::::P:S:::V:EW::L: NP0650A ::::P::::R::RYGA:LA::A:::::LSA:SLV:::L::LA::GSVDS:::PLS::GT: Hut2142 ::TVS::SA:::EWL:P:G:LAVE:L:T:::AGGF:W:::V:T:ASE:-:::VASAIGV: VNG2136 ::VHPS:RA::::ILGPLA::GVE:::M:A:AL::G:V:W:A::::PTT::::ESGA:L: consensus LVFIAILTLPHVVVGSWLDREQGIWYVP--- #oth 223212211..1212443.361231522211 NP0206A T:::S:IA:::::::::F:TDR::::::::: VNG1465 SI:VS:IA:::::::G::::TR::::::::: Hut1008 SIS:S:IA::::::::FM:::R::::::::: HQ1864A S:::S:IA::::L::NV:::QR:::H::::: rrnAC1901 SM::S:VA:::I::::L:::DR::::::::: Hmu2179 S:::S:VA::::L:::L:::DR::::::::: hla0561 ::G::A::::::::TA::::R:RV:RPGTGG HQ1019A ::G::A::A::::IV::M::M:AV:---::: Hmu2587 ::LL:V::::::::VT:::VR::::G--::: rrnAC2066 :::::VV:::::::V:IM:::::V:A--::: NP0650A ::L::V::::::::VA:M:H::RL:RPGA:: Hut2142 ::G::V:::::::IVT:I:::::F:---::: VNG2136 ::L::V::::::A:VT:M::V::VL---:::