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7 genomes BUD1377 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2647

-

Hbo3406

Hmu2865

Hut2158

hla0366

NP3724A

HQ2329A

Pairwise sequence scores
Consensus score1383 Hut2158 HQ2329A Hbo3406 hla0366 NP3724A rrnAC2647 Hmu2865
792Hut2158 1558 500 481 492 527 647 678
791HQ2329A 500 1647 636 607 537 560 552
796Hbo3406 481 636 1430 658 559 587 600
820hla0366 492 607 658 1319 591 630 603
797NP3724A 527 537 559 591 1369 654 629
984rrnAC2647 647 560 587 630 654 1714 898
933Hmu2865 678 552 600 603 629 898 1525

244 symbols
consensus       -----------------------TS-RLAGSPTAETLAVLLAVFLAQQALGAVG----LV
#oth            122222222222122233244434454564211332233544122414322323111245
Hut2158         :::::::::::::::::::MDRAG:TAQ:S:::TVLIG::VV:::F:EL::VF:::::VS
HQ2329A         :MGNQQPRRSQSSGKSGDEILPR:TV:GGR::::::VVL:CGF::I:YP:S:I:::::::
Hbo3406         :::::::::::::VSSTNELPDRR:NLIF:N:V::::LAM:F:SVLTWTVSFI:::::::
hla0366         :::::::::::::::::::::::--:---MRA:L::::IASL:GI::G::RL:D:::::A
NP3724A         :::::::::::::::::::::::--:-MSSR::LQA::ACVV:::L:::G:::::::LGD
rrnAC2647       MPRMRSETEGCPSVSCVESDNIG:MKP:RQ:::VV::::IG::::::::V:V:T:::APR
Hmu2865         :::::::::::::::::::::::MRR::L::::VM::::F:::::C:ELVSL:AGGVAMQ

consensus       ALFALAPPLSSNPWTLVTSVYAHGGIGHLLANAVALALAGILVERRTTPLRFHAFFIGTG
#oth            33.1.2311455...111.111.4233..32.1231413.421214.212..11.1242.
Hut2158         FA::::W:::E:::::::::FV:RR:M::VP::LF:FVI::IL::::E:W::Y:::VVV:
HQ2329A         G::::S:IVIIE::::I::T::::S::::MS:LI::I:F:A::::T::R::::T:::L::
Hbo3406         G:::::::VLAP:::::::::::V:P::::S:::IVL:::T::SMS::R:::::::V:::
hla0366         :I:::ST:::VA:::V::::::::S::::::::L::L:V:P:::::::R::::::V::::
NP3724A         :V::::L::::Q:::::V:::::::LT:::::::::V:I:P::A:V:::A:::::::I::
rrnAC2647       S::::S:::F:R:::::::::::A:LS::I::::GV::::VVL::::S::::::::LS::
Hmu2865         S::V:TT:VTH::::V:::::::S:VS::V:::::::VV:::L::Q:::A::::::VVA:

consensus       ALAGVAQVTLAGLLG-------GPVAVLGASGAVFALFGYLLASNRITDTLIDRIRLSPR
#oth            111.2321322422122221134341...3...2.1.4..2132.342322423352421
Hut2158         VI:::LE::VGQV::::::::::::::::::::::G:L::I:SG:P:::AVA:::SVD::
HQ2329A         ::::::EI::GS::A::::::FS:R::::::::::::::::IT::A:A:::::T:DRVTD
Hbo3406         ::::L:H:W::::F::::::::V:S::::S:::A:::V::V::A:PASSAIL::L:::S:
hla0366         ::::IT::::G:::::::::::PQT::::L:::::G:G:::::::VVSA::F::L:::T:
NP3724A         ::::I:::LVLMPF::::::::-GG::::::::I::::::::VG::G:GR:LSVVA:GT:
rrnAC2647       :::::S::SI:S:V:PLVPGMVSH:S:::::::::::::::::A::L:::V:GGFE:A::
Hmu2865         ::S:L:E:W::P:V:AVLGG:A:Q:S:::G:::::::A::::T:::L::RVVGT:Q::::

consensus       AQLAV---LAGVAAVLTAATAAPGVALVAHFTGLVLGLVAGRAHLLRPRQS---P-----
#oth            443231114243.223142224113..11.12.233.231.1431.35642553234333
Hut2158         VAIL::::MI:::LAI:WL:RGRQ::::::::::::::L:::::V::AE::TRS:PRGGR
HQ2329A         ISW::TAV:II::::MAILLSG::T:::G:AA::AI::::::MR:::IDN:SSTSAQRSV
Hbo3406         :VI:I:::V:I::L:::VLFS:::S::I:::::A:M::I:::LQ::-----:::-:::::
hla0366         ::F:L:::FGLA:L::::T::::::::I::A::AFC:::T:::G::DVQ--:::-:::::
NP3724A         GK:V::::::VL::L::::::T::A::::::V:F:::AA::GSR::HTSG:AG:-:::::
rrnAC2647       V:::L:::AG::::AI:L:::N:::::I::::::L::FL:::V:::::TD:PQT:ETANY
Hmu2865         L:::A:::F:AI:V:V:L:::R:Q::::::::::L:::::::V:V:::::KGAQ:EPA::

consensus       ----
#oth            1111
Hut2158         RGQF
HQ2329A         ::::
Hbo3406         ::::
hla0366         ::::
NP3724A         ::::
rrnAC2647       ::::
Hmu2865         ::::