|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1383 | Hut2158 | HQ2329A | Hbo3406 | hla0366 | NP3724A | rrnAC2647 | Hmu2865 |
792 | Hut2158 | 1558 | 500 | 481 | 492 | 527 | 647 | 678 |
791 | HQ2329A | 500 | 1647 | 636 | 607 | 537 | 560 | 552 |
796 | Hbo3406 | 481 | 636 | 1430 | 658 | 559 | 587 | 600 |
820 | hla0366 | 492 | 607 | 658 | 1319 | 591 | 630 | 603 |
797 | NP3724A | 527 | 537 | 559 | 591 | 1369 | 654 | 629 |
984 | rrnAC2647 | 647 | 560 | 587 | 630 | 654 | 1714 | 898 |
933 | Hmu2865 | 678 | 552 | 600 | 603 | 629 | 898 | 1525 |
244 symbols consensus -----------------------TS-RLAGSPTAETLAVLLAVFLAQQALGAVG----LV #oth 122222222222122233244434454564211332233544122414322323111245 Hut2158 :::::::::::::::::::MDRAG:TAQ:S:::TVLIG::VV:::F:EL::VF:::::VS HQ2329A :MGNQQPRRSQSSGKSGDEILPR:TV:GGR::::::VVL:CGF::I:YP:S:I::::::: Hbo3406 :::::::::::::VSSTNELPDRR:NLIF:N:V::::LAM:F:SVLTWTVSFI::::::: hla0366 :::::::::::::::::::::::--:---MRA:L::::IASL:GI::G::RL:D:::::A NP3724A :::::::::::::::::::::::--:-MSSR::LQA::ACVV:::L:::G:::::::LGD rrnAC2647 MPRMRSETEGCPSVSCVESDNIG:MKP:RQ:::VV::::IG::::::::V:V:T:::APR Hmu2865 :::::::::::::::::::::::MRR::L::::VM::::F:::::C:ELVSL:AGGVAMQ consensus ALFALAPPLSSNPWTLVTSVYAHGGIGHLLANAVALALAGILVERRTTPLRFHAFFIGTG #oth 33.1.2311455...111.111.4233..32.1231413.421214.212..11.1242. Hut2158 FA::::W:::E:::::::::FV:RR:M::VP::LF:FVI::IL::::E:W::Y:::VVV: HQ2329A G::::S:IVIIE::::I::T::::S::::MS:LI::I:F:A::::T::R::::T:::L:: Hbo3406 G:::::::VLAP:::::::::::V:P::::S:::IVL:::T::SMS::R:::::::V::: hla0366 :I:::ST:::VA:::V::::::::S::::::::L::L:V:P:::::::R::::::V:::: NP3724A :V::::L::::Q:::::V:::::::LT:::::::::V:I:P::A:V:::A:::::::I:: rrnAC2647 S::::S:::F:R:::::::::::A:LS::I::::GV::::VVL::::S::::::::LS:: Hmu2865 S::V:TT:VTH::::V:::::::S:VS::V:::::::VV:::L::Q:::A::::::VVA: consensus ALAGVAQVTLAGLLG-------GPVAVLGASGAVFALFGYLLASNRITDTLIDRIRLSPR #oth 111.2321322422122221134341...3...2.1.4..2132.342322423352421 Hut2158 VI:::LE::VGQV::::::::::::::::::::::G:L::I:SG:P:::AVA:::SVD:: HQ2329A ::::::EI::GS::A::::::FS:R::::::::::::::::IT::A:A:::::T:DRVTD Hbo3406 ::::L:H:W::::F::::::::V:S::::S:::A:::V::V::A:PASSAIL::L:::S: hla0366 ::::IT::::G:::::::::::PQT::::L:::::G:G:::::::VVSA::F::L:::T: NP3724A ::::I:::LVLMPF::::::::-GG::::::::I::::::::VG::G:GR:LSVVA:GT: rrnAC2647 :::::S::SI:S:V:PLVPGMVSH:S:::::::::::::::::A::L:::V:GGFE:A:: Hmu2865 ::S:L:E:W::P:V:AVLGG:A:Q:S:::G:::::::A::::T:::L::RVVGT:Q:::: consensus AQLAV---LAGVAAVLTAATAAPGVALVAHFTGLVLGLVAGRAHLLRPRQS---P----- #oth 443231114243.223142224113..11.12.233.231.1431.35642553234333 Hut2158 VAIL::::MI:::LAI:WL:RGRQ::::::::::::::L:::::V::AE::TRS:PRGGR HQ2329A ISW::TAV:II::::MAILLSG::T:::G:AA::AI::::::MR:::IDN:SSTSAQRSV Hbo3406 :VI:I:::V:I::L:::VLFS:::S::I:::::A:M::I:::LQ::-----:::-::::: hla0366 ::F:L:::FGLA:L::::T::::::::I::A::AFC:::T:::G::DVQ--:::-::::: NP3724A GK:V::::::VL::L::::::T::A::::::V:F:::AA::GSR::HTSG:AG:-::::: rrnAC2647 V:::L:::AG::::AI:L:::N:::::I::::::L::FL:::V:::::TD:PQT:ETANY Hmu2865 L:::A:::F:AI:V:V:L:::R:Q::::::::::L:::::::V:V:::::KGAQ:EPA:: consensus ---- #oth 1111 Hut2158 RGQF HQ2329A :::: Hbo3406 :::: hla0366 :::: NP3724A :::: rrnAC2647 :::: Hmu2865 ::::