|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4773 | Hut0698 | Hmu0805 | HQ1190A | hla0331 | HVO_0748 | NP5204A | Hbo0783 |
2508 | Hut0698 | 4739 | 1991 | 1842 | 1923 | 2013 | 1768 | 1851 |
2886 | Hmu0805 | 1991 | 4619 | 2123 | 2121 | 2107 | 2238 | 2291 |
2922 | HQ1190A | 1842 | 2123 | 5154 | 2140 | 2152 | 2095 | 2575 |
3175 | hla0331 | 1923 | 2121 | 2140 | 4856 | 2316 | 2076 | 2574 |
3116 | HVO_0748 | 2013 | 2107 | 2152 | 2316 | 4917 | 2112 | 2626 |
2810 | NP5204A | 1768 | 2238 | 2095 | 2076 | 2112 | 4397 | 2329 |
3498 | Hbo0783 | 1851 | 2291 | 2575 | 2574 | 2626 | 2329 | 4831 |
706 symbols consensus -MPLD-PSA-----AATLARALP---------------------LDADTDD-ASACRCRP #oth 1243454362321265535242222222212111111111332333634434343.4.63 Hut0698 MSDTAAG:S::::::TE:::K:G:::::::::::::::::LETL:EVLQQKRSD::D:V: Hmu0805 :----:--M:::::RGWFS:ST::::::::::::::::::::::-------::PD:G:TV HQ1190A MSI:SIDT:SMTGIN:Y:R:I::SSVCEHLSSVVSASTIEMNALS:NANS:KE:R:H:CV hla0331 ::SF:L::LSRLGGDD:SL:S::::::::::::::::::::::W::G:::S:---:Q:D: HVO_0748 ::::GS::IDSL::SE:V:A:::DALGDRLA:::::::::DATGSQR:SR:S:GD:G:E: NP5204A :----:---:::::--M:D:LF::::::::::::::::::::::T:::---:---::::T Hbo0783 :::::FTAC:::::I:AVGS::S:::::::::::::::::::::::T::::DE:::::QH consensus AF-TPTGRG-DDRVELVVDATDCPGRGDLAASPACRATVVEALAERDADVIRTRSDGRER #oth 323213224242254.511131.133.2.24322.1211132.3521123221422.411 Hut0698 E-:------:EAGNQ:RL::SE:--D:::E:::D::E:::RN:VAGP::E:LVQ:N:CRH Hmu0805 R-:--R::N::TGET:L:::::::DG:R::E:::::R:::::::::::ERVV:::N:::: HQ1190A :VE::::T:VP::S:::::::::::S::::SAS:::E::ID::THN:VAI:::I:::I:: hla0331 S:RE:V:T:V::::V:S:::D::::::::::::::L:::::T:T:::::::::HHA:::: HVO_0748 ::S:::D:PD::T:T:A:::G:::H::S:ST:AP:::A:::::ET::::RLVV:A::L:: NP5204A R::------:-:GDR:C:ESD::::S:R::TE::::R:AI:::ES:::E:VL:A:A:F:: Hbo0783 S:E:::::T:T::T:::::::::::G::::GV:::::::IG:::D:::::V:V:A::L:: consensus TYADDAAALLVAAGRFAERVRFHDEALAERARRDPIDAAREATGRAGPVARIAAETGLAE #oth 2.4331213.5.1...3234221143114.1241.241133131.31133332211.143 Hut0698 R:RNN:::::S:::::INLLGDRER:IEQ:VVTE:LAV:S:LRE:VD:I:DVGV:S::L: Hmu0805 A:L::H::::C:::::V::T:::::::::::VT:::::::::V:::::::S:::::::GL HQ1190A ::::::::T:Q:I:::I:::::::PEI:T:::E::GK::YH::::::::GD::TD::FDS hla0331 :::GR:::C:I:::::R:QIE::ETR::::VT:E::E:::::S::E::PK:::::::::: HVO_0748 R:DA::TG::::::::::::::R:DR::D:::D::LG::H:::::::::R:A:V:::::: NP5204A A:EGT:S::::::::::DAMGY:::E::V:::S::LG:::T:S::G:RL::AVVD:::EA Hbo0783 ::D::::GV:L:::::::::G::::S:::::T::::::V:R:::::::::TL:::::::A consensus GAARADDYEDALRPHVGPTIARSRVARRPPPDARLRDRRDLDTGATVRLYE-DDDLPT-- #oth 42434433333.3242111222222353213122.3334211.1241.3.3343542411 Hut0698 T::QI:SVSEV:T:EI:L::GHYF:DQSVDD:S::QQVI:::::TEA:I:ARS:AI:R:: Hmu0805 C:R:VGEIAS-:S:::::::GHT:LGAD::A:G::::S:R:S::GR:::::R:::::V:: HQ1190A LTE--TAV:T::S:F:A::LS::HLE:S:::::T:L:VT::S:D:IA:M:ST:TNVDSNT hla0331 TV:S:EETG:V::A:A:::::AT:I:SA:::::A:V::WEI::::::::::GAGP:R::: HVO_0748 ::S:SA::G::::AV::::L:::::DP:::A:G::VEAT::::::VA:R:::CPRD:V:: NP5204A FVG--G:::TL:::::::SL::::::T::::A:T::T:YE:::::V::R:A:::G:D::: Hbo0783 :VE::::::SL:WSY:::SV::::::::L:S::A:L:::E::::::::::R:TG:GRL:: consensus -----YHLTPAEHRLDDAATATLAAAYDRLARGIVTGG----ERAAGRAVRSVADDD-DP #oth 11111.1.213433.1461531.33132322315231111113..231.1152133311. Hut0698 ::::::A:DM::L::SEPERER:LDG:::I:N:DI::-:::::::STH:IQAAS:GSV:: Hmu0805 ::::::::E:LGAT:::::M:::ERGRELV:D:T:::-::::::::W::I:T::CE:::: HQ1190A EAKQY:::D::F:N::ST:ID:::M::EC:GT:S:D::GGDGS::SS::::Y::T:E::: hla0331 ::::::::::PSA::::E:VER::D:K:::LDDP-:::::::D::P::::::I:SAG::: HVO_0748 ::::::::::P:ST::QR:AR::E::H::::::::DA:::::P::P:::::LA::A::A: NP5204A ::::::::::::::::ES:::::D:::QA::::A:S::::::::::S:::::::::E::: Hbo0783 ::::::::::VA:E::AD::::::::HEC::::::Q:::::::::::::::H:::::::: consensus VETLTAVLRRHTRGYGVLEDLFADPRVSDVFASAPVAENPLRVVVDGERMRTNVRLSPDG #oth 133.331.51..4.2.22322.2.1211.14212.123112.235..1344..112425. Hut0698 L--::SI::K::Q:::I::::::::QIT::YVT:::SR::::ILR:::S:S:::F::A:: Hmu0805 ::R:GR::D:::A:::::AEC:D::::T::::T::::S:::::R::::LAT::::V:RR: HQ1190A ::A:::I:T:::Q:L::I:H::::D:I:::I::S::SKT:I:I:L:::::A::I::R:S: hla0331 :S::VD::::::::::AF:HV:::D::::ATL:::::::::::::::::C::::::P:E: HVO_0748 ::::A:I:AK::T:N:::D:::S::A::::YV:T:AD:::I:::A::VS:P:::::A:G: NP5204A :G::VS::EK::G:L:::T:C::::A::::::T::::::R::LRH:::TL:::::MTAA: Hbo0783 :::::D::N:::::N:::D::::::::T::V::::::S::V::AI::::I::::::T::: consensus AAALASRFRRESGRAFSRASPTLDATATA-GGRRVRVAGVTAPASDGLGFAFRAHDETAW #oth 122...12.14..12..112.11.13322342431.1.12.2.1...32.11.2315342 Hut0698 :::::::I::T::::::::T::V::K::LDSETD:::::::K:V:::IA::::QQASDRF Hmu0805 VE::::Q:::::::::::::::::::T:V::D::::I::T:::V:::PA::L::::R:V: HQ1190A ::T:::::::::::::::ST::::::V::ET::QI:I::I::::::::::::::R:T:P: hla0331 ::T::::L::T:::G:::::::::::IE:EA:-:::::AT::::::::S:T::RG:PD:: HVO_0748 :ES::::L::V::AS::::D::::TVVE::::AN:::::::::::::::::::R::::PL NP5204A :D::::Q:::S::::::Q:::::::::D:::::::::::::D:V:::T::T::::::SSF Hbo0783 :::::::::HA:::G::::::A:::AID:PN:S::::::::::::::I::::::::GR:: consensus TLPRLVANGTLTPAAAAFLSVAVERGAATLVAGTRGAGKTTLLGALLWELPADTRTVLIE #oth 1.25.1431122133.211.21231212312..4.......2..2..1.12341.2241. Hut0698 :::K::Q:::V::DV:G:::::::GN::::I:::::::::::::T::Y::T::::::V:: Hmu0805 :::Q::D:D:VP:::::L::L::D:A:::::::P::::::::::::::::DPGV::LV:: HQ1190A ::T::LTV:S:::::::::::VTA:::::I:::::::::::::::::::::HT::L:SV: hla0331 ::A:::DG::I:::::GL:::::K::VTG::::G:::::::A::S:::::::E::SI::: HVO_0748 :::A:::::::SAD::TLC:L::::::SV::::S:::::::F::S::::::R:V:::::: NP5204A S:AD::E::::::VS:G:::::A::::SL:L::A:::::::::::::::I:P:V:::A:: Hbo0783 :::G:::S:::SAET:::::F::::::TG:::::::::::::::S:::::::A::L:TV: consensus DTPELPVAALQAAGRDVQPLRTDTGD----GAEFTPTEALRTALRLGDGALVVGEVRGEE #oth ......12313341.12.3.3154341111123421331111.....3..112..1..1. Hut0698 :::::::ES::SV:::::A:::G:SH:::::P:V::SG:::::::::::::::::I:::: Hmu0805 ::::::::Q:::D::E::S:V:AR:::::::PGLPAD:T::::::::E:::A:::::::: HQ1190A :::::::E::REH:::I:::Y:E:DTTGIT::T::::A:::::::::N:::AI::::::: hla0331 ::::::A::VT:::::T:R::V--:::::::::PS:S::V:::::::G::I::::::::: HVO_0748 ::::::ASS:LD:D::::S:::::TG:::::P:P::Q:::HA:::::::::AL::::::: NP5204A :::::::SE::S:::::::::VTE::::::::SI:A:A:::::::::::::::::::::: Hbo0783 ::::::::::RDG:::::::H::L:E::::DGS:S::D:V::::::::::::::::::D: consensus AAVLYEAMRVGAAGNAVLGTIHGDGGAAVRERVVSDLGVPASSFAATDLVVTC----TRD #oth .21......1..3341.......22232.1....2..1.23.1.13..11.143333244 Hut0698 :Q:::::::I::NA:::::::::::ATD:Y:::::::::DP::::V::::::IQSLP:PQ Hmu0805 :Q::::::::::G:S:::::::::::ED::::::A::D:::::::T::::::MGRFE:E: HQ1190A ::A:::::::::HSH:::::::::S:V:::::::::::::::A:S::::I:::::::::R hla0331 ::A:::::::::::E::::::::EDP::::::::T::::SP::::::::I:VL::::--- HVO_0748 ::::::::::::NA:::::::::::A:D:::::::::::::::::::::::::::::-EH NP5204A :Q:::::::::::DGT:::::::G::ES::::::T:::::V:A::D::F:::VEAYDDS: Hbo0783 :SA:::::::::H:H:::::::::SP::::::::::::::E::::::::::::::::::: consensus GDDRRVAAIEEVR--RHDDDVAFEPLFERDGGGLQSTGRIDRGDSRLVEALAR-PDESYA #oth 33211133111.1116423326.1312344353343.1334213143234.221321211 Hut0698 :R::::SR::::V::YDGS::R::::Y:S::TAARP:::::Q:E::FIHQ:SD::G:A:: Hmu0805 :PA:::::::::V::SAG:A:D::::YRLRE:R::::D:LE::N:E:LA:::D:S::::: HQ1190A ::::F:SHV::::TGETT::IQ:VS::T:ID:K:T:::V:E:::::II:R:C:GTTD::: hla0331 -::H::ET:A::V::G::GEAS:::::::T:S::V::::::::E:::::S::E:T::::: HVO_0748 A:EH:::RV::::::PVG::A:::T:::H::RA:EP::SVA::::LA::S:::::G:::: NP5204A ERA::IN:::A:::::::EG:G::HVGGVGVD:M:L:DA-------A:SP:C:::T:HTD Hbo0783 :S::::ETVA:::::QT:EG:H::T:YG:::N:I:E::VVT::::S::A:::::H::::: consensus DVRDALDRRADRLGRLARTERT-PDDLAGA-AD---RTVAA----- #oth 22134233.3342543224443514443435343222556611111 Hut0698 :I:ESMAE::::::::::DG::D:TEV:::Y:G::::IR:D::::: Hmu0805 :::AG:TE:T:EIR:RE:RTG-:-------:--::::::E:::::: HQ1190A :F:TT:AD:HET:E:R:EI:LVN:KQG:VSWDTANPQNLDE::::: hla0331 S::::V:::GE:I:EA:::G:IT:ERYV:RDG:GWQ::DSLGGGNQ HVO_0748 ::L::::A::TH:AS::E::::A:::::A:R:E::::GSGC::::: NP5204A E::AVVH::::SFQG-------:-------:--:::-----::::: Hbo0783 ::L::::::TAT:SH::E:DQ:R::::PN:A::V:::E:RR:::::