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6 genomes BUD1415 11 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0172

rrnAC2354

HVO_0568

HVO_2035

HVO_A0150

Hbo0962

Hmu0446

Hmu0601

Hmu3002

Hut0818

hla2750

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score2589 Hmu3002 HVO_A0150 rrnAC0172 Hmu0601 HVO_2035 Hut0818 Hmu0446 rrnAC2354 hla2750 HVO_0568 Hbo0962
1112Hmu3002 2656 846 895 789 731 738 762 874 735 782 842
1247HVO_A0150 846 2599 891 808 929 993 933 966 903 913 986
1336rrnAC0172 895 891 2663 872 920 908 955 1066 997 964 1008
1370Hmu0601 789 808 872 2642 953 940 907 1103 1043 1088 1155
1380HVO_2035 731 929 920 953 2777 925 970 1120 971 1026 1109
1540Hut0818 738 993 908 940 925 2625 1186 1382 1218 1114 1267
1526Hmu0446 762 933 955 907 970 1186 2535 1399 1202 1235 1186
1828rrnAC2354 874 966 1066 1103 1120 1382 1399 2578 1425 1458 1412
1725hla2750 735 903 997 1043 971 1218 1202 1425 2761 1524 1493
1764HVO_0568 782 913 964 1088 1026 1114 1235 1458 1524 2649 1729
1810Hbo0962 842 986 1008 1155 1109 1267 1186 1412 1493 1729 2575

386 symbols
consensus       -------MDDSTLRDRLRQFGLSDKEVDTYLAILENGEAKASTIADAAGVSKRYVYSISE
#oth            12322535436535361653.1.211331.232157.222214212511111111.3144
Hmu3002         ::::::::GE:QI:ET:SA::::T::::A::V::QR:::TTRAVSE:::::QS:::E:AT
HVO_A0150       ::::::::VEDEVV:S:MRI::::::SRA:VT::R::ATTIRVVSEE:DI::S:A:D:VG
rrnAC0172       :MPDSTRQPSAPV::::Q:Y:::ET:AE::::VV:K:P:T:R:V:ET:::::S:::D:CD
Hmu0601         :MGTSDEH::EQ::EE::V:::::T:I:::::L:AC:::ST::VSETTD:TQ:A::N:A:
HVO_2035        :::::VTV:EP:V:E::KT::F::::A:::I:L:GQ::::::EL:QH:::::::::NVLG
Hut0818         ::::MSEG:::A:ARQ:AH:::::T:IQ::::V::::::::::::::T:::::::::VC:
Hmu0446         :::::::----------M:L:::E:::::::TV::Q::LT::E:S:VT::::::::::::
rrnAC2354       :::::::::::::::::E:L:::E:::::::S::SS:::T::E:::DT::::::::::::
hla2750         ::::::::::R::N:L::R::::::::::::SL:AH:::::::V:::::::::::::V::
HVO_0568        MVDDSPT:::RE:A:L:E:::::E:V:::::TL::L::::::Q::::::::::::::V:K
Hbo0962         ::::::::::AA:IEL:QR::F::::I::::T:::L:::::::::EE:D:::::::::A:

consensus       SLEERGFVEVNDHVVPTTIRARPPAEVIEALSDRLEEMEPALESRFSATAREQQRFEVIK
#oth            412421114111133..32.173.522245.46514342421353246646575523221
Hmu3002         A:A:::L:I:DESAT::KL:::::Q:AVD::TMH:S:F:T:V::VYDQP:ETAAG:::VH
HVO_A0150       K::::NLI:ID:::Q::QL::I::::G:DN:VSQ:QTV:SQ::DL:DSESY:::K:SI::
rrnAC0172       ::AVD:::S:D::RT::V:::T::S:AFS::KRE:DTL:A:VQT:YED::A:NNT:::V:
Hmu0601         R::G::L:R::::AS::::::L::::A::N:::::DSIR::::A::NE:TP:TPEIQM::
HVO_2035        :F:D::L::::::ET::::::VD::V::RR:::Q:SSL:TQ:::IHNPDPG:DR:Y::::
Hut0818         E::DQ::::::::::::K:::KR:ED:::I::N::::I:::::R:::EATSRP:::D:::
Hmu0446         ::::::::D:D::::::KV:::N:S::::L:T:E:T::::::SE:H:Q:E:NL:::D:L:
rrnAC2354       :::D::::::::::::::::::::E:::D::T::::::SG::D::Y::S:::P:Q:D:::
hla2750         ::A::::::::::::::::::N::D:::NR:RSDVDAIR:G::E:::RVE:QTEQ:::::
HVO_0568        E::S::::::::::::::::PL::M::::S::ESV:S:R::::E:YT::::D:E::::::
Hbo0962         K:QS:::::::::A:::::::Q:::D:V:S::TD::::R::::::::RA:PRSE::::V:

consensus       SRVTVLKRIAELIAAAESEVTLSVPASVLPEVEDELRAAVDRGVLVLLLVSGADAEPHD-
#oth            125.3421164425514412724225772133434.54.121223342334355775743
Hmu3002         ASQ::ER:LERQL:R::R::FAI::SNAF:T:A:A:AD:RE::LT:YC:LA:ES::S:VA
HVO_A0150       ::R:I:AQLNK::D:::::LV:AL::::::R:::S::E:RS:::FCM:::TEY:GTSSI:
rrnAC0172       ::P:IV::LEQH:E::DC::I:QI::RR::DIR:P::R:RE::I::::TL:SY:RATME:
Hmu0601         ::E:A::::KSA:S::RQ:LL:A::EH:F::I:S:::T:::SD:V:F::IG:M:EVDG::
HVO_2035        :KS::K::::S:VRQ::N::NV:::::L::DLAP::E:::::R::T:V:AN:HGD:AVS:
Hut0818         :::::V:::N:Y:EES:QRIA::I:H:T::R:IEG:QD::E:::F:::::TD:QPD:TEF
Hmu0446         ::Q:MI:::RSY::D:SN:I:::ISYEQ:::::::::::::::::AMV::T:VP:NSLE:
rrnAC2354       :::::I::LT:Y:RN::R:IM::::QQY:::ISE::G:::::::::M:V::S::NLRS::
hla2750         :::::I:::RS:L:D:D::::::IA:GH:::IR:S:VE::::::::::I:::::EV:D:I
HVO_0568        :::::::::G::VGR::::I:::L:YD::D:::::::::RE:::::S:V:::VE--::::
Hbo0962         :::::::::::::DR:N:::::G::Y:LVD:MA::::D::::::::::I:T:VS--:T::

consensus       DLDLDG-IASVVRSWDEPMPLMLTVDQQAGIVAPSEMLTRSNSDEQAISFAQEQLVPVLV
#oth            4563531414321518566.54242.55824322634365423394.2534154233524
Hmu3002         EM:DP:RY:H::::::GRP::FVVR:ALG:VL:SHG:::SRHGRGY:LA:N:NEVASGFF
HVO_A0150       ---D:A:T::IIQT:SA:A:VT::::RSD::I:SADAILN:::::Y::YH:E:HI:SS:F
rrnAC0172       -:::KE:::NA::IGLDGA:SL:AT:::R:F:S::T::SWDHDETN::T:T::AVAA:::
Hmu0601         GSEFA::::D:::Y:G:SL::VY:::DASAMIGD:TIVSGTHT:DV:VTVSEP::SGSIL
HVO_2035        EST:K::LG::::Y:ADGG:MLVC::RRH:LFS:P:FVMGRG::H:::::TEDR:S:A::
Hut0818         AAYDRP:V::A::::NV:V:V:::::GEF:::SS:::M:VA::::R:::LV::RI::T:F
Hmu0446         AAAF:::::TL::T::QIT::T::::::YSVL::VD:MV::::ELR:::LV:R::::I:T
rrnAC2354       --:AS::L::::::::Q:::I:::::A:F:L:S:A::V::T:::QR::A:V:Q::::::S
hla2750         :EG::::V:::::T:R:A::TL::::SA::V:::P:L:R:::T:R:::H:S::::A::I:
HVO_0568        ::A::::V::L::V:H:L::T:::::SRT:LIS:G::VA::::ES:::V:::PH:G::I:
Hbo0962         ::E:S::L:::A:A:E::::T::S:::E::::::T::::::::AA:::VL:::::G::::

consensus       GSFLGNYWPMAEEVYVTDPDPLPATYDNFRHAVLQATLHLRAGEDLVADVDGRPTDSDED
#oth            2213212.1414155274344..33157.1332242124345176362556534577454
Hmu3002         :NYVS:V:::G:QRF:AE:PT::::FEL::SG:TT:A::TT::H:V:::L:VVA:TDETA
HVO_A0150       D::IA:::::G:Q:H:GSKSQ::::FTS:::::FD:::::MD:AVVT:EM:I:::Q:NAA
rrnAC0172       ::Y::::::IG:::L:SR:PS:::R::M::PV:FTT::A:::::SV:::LYA:::G::D:
Hmu0601         :MYFSA:::A:T:L:::::::::R:::W::Q:T:H::V:EQ::V::Y:E:E------T:S
HVO_2035        :::::::::L:::IHLHE::E::::::R::::IFA::RY:KR:YT:::EIEL::A::N:A
Hut0818         E:::A:F:LS:D:LS:IEAA:::Q:::S:E:::F:::::::E:TAVS:C:EAT:NEGGA:
Hmu0446         :::F:::::I:A::::D::RS:::E:GC::::::D::::::DDRPISI:TAVT:CRDT::
rrnAC2354       ::::::::L::T::A::::A::::::HD::::::::::::::DH:IHVSA:V:AVQA:D:
hla2750         :::::::::A:N:IATAA:A:::VE:A::::T:::V::R::V::IPRVT:G::W::R:-E
HVO_0568        :::F:::::::A:A:T::::::::M:H:::::::::A:CE:::I::DVT:S::MVHT:-G
Hbo0962         :::::::::::A:T:TC:L:E::::::D::::::::::RA:T:T::::H:T:::VHVENG

consensus       FETISGTVVEVRQGLVEPTTNDFPIENSLVVETDDG-TVSVGGQ----GAFLEDYEARAV
#oth            544551313334.3324.62132241221222233414512..511111233.2223271
Hmu3002         RQFEGVPIR::::N::::VN:A:::::::::::::::L::::::ACGL:PYY:E:A::E:
HVO_A0150       :::TT::I:A:K:S::R:FS::::TQE:F::::P:D::FT:::S::::K:::::F:::R:
rrnAC0172       ::V:::E::D:::N::A:HNS::GF::::::D:G:S:RIT:::Y::::::::::::VKHT
Hmu0601         GT:V::P:T:I::AFI:::::::TL:::FFID:G:::I:::::K:::::S:I:::QS:S:
HVO_2035        :::RF::ITD:T::::K::::SI::::AFLIDDGTE:QL::::P::::::IV:P::::R:
Hut0818         V::VT:R:::TN::I:D:V::E::::HT::L:::E::RTT:::H:::::::::E:A::T:
Hmu0446         RQS:E:::IGTH::::::A:::::V::::::K:NNR:R:T:::P::::::M:::F::KDT
rrnAC2354       TT::E:::::TK::::::E::SY:::HT:::DIG:R::::L::S:::::S::::::TD::
hla2750         PAE:::R:::SK::M::::::E::VQH:::::::::K::T:::::::::::V::I::DL:
HVO_0568        PTELH:R::DI::::L::AN:S::V::AF:::::E:::Y:I::::::::::V::F::D::
Hbo0962         PSEL:::I:DI::::L::S::S::V::T::I:::::::F:I::K:::::::I::F::DT:

consensus       TLRAAD--------------------
#oth            53583444423222222222222211
Hmu3002         :I:D:-::::::::::::::::::::
HVO_A0150       VF:SVSDAKQG:::::::::::::::
rrnAC0172       :::R:-::::::::::::::::::::
Hmu0601         M::RL:AVE:::::::::::::::::
HVO_2035        ::DVVESSGQSVPELIARSDALNR::
Hut0818         K:E:::::::::::::::::::::::
Hmu0446         VTLT::::::::::::::::::::::
rrnAC2354       ::SL:E::::::::::::::::::::
hla2750         RIEED:GDHEEADAGESDEADGADGV
HVO_0568        EFT::E::::::::::::::::::::
Hbo0962         E::HLG::::::::::::::::::::