|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2589 | Hmu3002 | HVO_A0150 | rrnAC0172 | Hmu0601 | HVO_2035 | Hut0818 | Hmu0446 | rrnAC2354 | hla2750 | HVO_0568 | Hbo0962 |
1112 | Hmu3002 | 2656 | 846 | 895 | 789 | 731 | 738 | 762 | 874 | 735 | 782 | 842 |
1247 | HVO_A0150 | 846 | 2599 | 891 | 808 | 929 | 993 | 933 | 966 | 903 | 913 | 986 |
1336 | rrnAC0172 | 895 | 891 | 2663 | 872 | 920 | 908 | 955 | 1066 | 997 | 964 | 1008 |
1370 | Hmu0601 | 789 | 808 | 872 | 2642 | 953 | 940 | 907 | 1103 | 1043 | 1088 | 1155 |
1380 | HVO_2035 | 731 | 929 | 920 | 953 | 2777 | 925 | 970 | 1120 | 971 | 1026 | 1109 |
1540 | Hut0818 | 738 | 993 | 908 | 940 | 925 | 2625 | 1186 | 1382 | 1218 | 1114 | 1267 |
1526 | Hmu0446 | 762 | 933 | 955 | 907 | 970 | 1186 | 2535 | 1399 | 1202 | 1235 | 1186 |
1828 | rrnAC2354 | 874 | 966 | 1066 | 1103 | 1120 | 1382 | 1399 | 2578 | 1425 | 1458 | 1412 |
1725 | hla2750 | 735 | 903 | 997 | 1043 | 971 | 1218 | 1202 | 1425 | 2761 | 1524 | 1493 |
1764 | HVO_0568 | 782 | 913 | 964 | 1088 | 1026 | 1114 | 1235 | 1458 | 1524 | 2649 | 1729 |
1810 | Hbo0962 | 842 | 986 | 1008 | 1155 | 1109 | 1267 | 1186 | 1412 | 1493 | 1729 | 2575 |
386 symbols consensus -------MDDSTLRDRLRQFGLSDKEVDTYLAILENGEAKASTIADAAGVSKRYVYSISE #oth 12322535436535361653.1.211331.232157.222214212511111111.3144 Hmu3002 ::::::::GE:QI:ET:SA::::T::::A::V::QR:::TTRAVSE:::::QS:::E:AT HVO_A0150 ::::::::VEDEVV:S:MRI::::::SRA:VT::R::ATTIRVVSEE:DI::S:A:D:VG rrnAC0172 :MPDSTRQPSAPV::::Q:Y:::ET:AE::::VV:K:P:T:R:V:ET:::::S:::D:CD Hmu0601 :MGTSDEH::EQ::EE::V:::::T:I:::::L:AC:::ST::VSETTD:TQ:A::N:A: HVO_2035 :::::VTV:EP:V:E::KT::F::::A:::I:L:GQ::::::EL:QH:::::::::NVLG Hut0818 ::::MSEG:::A:ARQ:AH:::::T:IQ::::V::::::::::::::T:::::::::VC: Hmu0446 :::::::----------M:L:::E:::::::TV::Q::LT::E:S:VT:::::::::::: rrnAC2354 :::::::::::::::::E:L:::E:::::::S::SS:::T::E:::DT:::::::::::: hla2750 ::::::::::R::N:L::R::::::::::::SL:AH:::::::V:::::::::::::V:: HVO_0568 MVDDSPT:::RE:A:L:E:::::E:V:::::TL::L::::::Q::::::::::::::V:K Hbo0962 ::::::::::AA:IEL:QR::F::::I::::T:::L:::::::::EE:D:::::::::A: consensus SLEERGFVEVNDHVVPTTIRARPPAEVIEALSDRLEEMEPALESRFSATAREQQRFEVIK #oth 412421114111133..32.173.522245.46514342421353246646575523221 Hmu3002 A:A:::L:I:DESAT::KL:::::Q:AVD::TMH:S:F:T:V::VYDQP:ETAAG:::VH HVO_A0150 K::::NLI:ID:::Q::QL::I::::G:DN:VSQ:QTV:SQ::DL:DSESY:::K:SI:: rrnAC0172 ::AVD:::S:D::RT::V:::T::S:AFS::KRE:DTL:A:VQT:YED::A:NNT:::V: Hmu0601 R::G::L:R::::AS::::::L::::A::N:::::DSIR::::A::NE:TP:TPEIQM:: HVO_2035 :F:D::L::::::ET::::::VD::V::RR:::Q:SSL:TQ:::IHNPDPG:DR:Y:::: Hut0818 E::DQ::::::::::::K:::KR:ED:::I::N::::I:::::R:::EATSRP:::D::: Hmu0446 ::::::::D:D::::::KV:::N:S::::L:T:E:T::::::SE:H:Q:E:NL:::D:L: rrnAC2354 :::D::::::::::::::::::::E:::D::T::::::SG::D::Y::S:::P:Q:D::: hla2750 ::A::::::::::::::::::N::D:::NR:RSDVDAIR:G::E:::RVE:QTEQ::::: HVO_0568 E::S::::::::::::::::PL::M::::S::ESV:S:R::::E:YT::::D:E:::::: Hbo0962 K:QS:::::::::A:::::::Q:::D:V:S::TD::::R::::::::RA:PRSE::::V: consensus SRVTVLKRIAELIAAAESEVTLSVPASVLPEVEDELRAAVDRGVLVLLLVSGADAEPHD- #oth 125.3421164425514412724225772133434.54.121223342334355775743 Hmu3002 ASQ::ER:LERQL:R::R::FAI::SNAF:T:A:A:AD:RE::LT:YC:LA:ES::S:VA HVO_A0150 ::R:I:AQLNK::D:::::LV:AL::::::R:::S::E:RS:::FCM:::TEY:GTSSI: rrnAC0172 ::P:IV::LEQH:E::DC::I:QI::RR::DIR:P::R:RE::I::::TL:SY:RATME: Hmu0601 ::E:A::::KSA:S::RQ:LL:A::EH:F::I:S:::T:::SD:V:F::IG:M:EVDG:: HVO_2035 :KS::K::::S:VRQ::N::NV:::::L::DLAP::E:::::R::T:V:AN:HGD:AVS: Hut0818 :::::V:::N:Y:EES:QRIA::I:H:T::R:IEG:QD::E:::F:::::TD:QPD:TEF Hmu0446 ::Q:MI:::RSY::D:SN:I:::ISYEQ:::::::::::::::::AMV::T:VP:NSLE: rrnAC2354 :::::I::LT:Y:RN::R:IM::::QQY:::ISE::G:::::::::M:V::S::NLRS:: hla2750 :::::I:::RS:L:D:D::::::IA:GH:::IR:S:VE::::::::::I:::::EV:D:I HVO_0568 :::::::::G::VGR::::I:::L:YD::D:::::::::RE:::::S:V:::VE--:::: Hbo0962 :::::::::::::DR:N:::::G::Y:LVD:MA::::D::::::::::I:T:VS--:T:: consensus DLDLDG-IASVVRSWDEPMPLMLTVDQQAGIVAPSEMLTRSNSDEQAISFAQEQLVPVLV #oth 4563531414321518566.54242.55824322634365423394.2534154233524 Hmu3002 EM:DP:RY:H::::::GRP::FVVR:ALG:VL:SHG:::SRHGRGY:LA:N:NEVASGFF HVO_A0150 ---D:A:T::IIQT:SA:A:VT::::RSD::I:SADAILN:::::Y::YH:E:HI:SS:F rrnAC0172 -:::KE:::NA::IGLDGA:SL:AT:::R:F:S::T::SWDHDETN::T:T::AVAA::: Hmu0601 GSEFA::::D:::Y:G:SL::VY:::DASAMIGD:TIVSGTHT:DV:VTVSEP::SGSIL HVO_2035 EST:K::LG::::Y:ADGG:MLVC::RRH:LFS:P:FVMGRG::H:::::TEDR:S:A:: Hut0818 AAYDRP:V::A::::NV:V:V:::::GEF:::SS:::M:VA::::R:::LV::RI::T:F Hmu0446 AAAF:::::TL::T::QIT::T::::::YSVL::VD:MV::::ELR:::LV:R::::I:T rrnAC2354 --:AS::L::::::::Q:::I:::::A:F:L:S:A::V::T:::QR::A:V:Q::::::S hla2750 :EG::::V:::::T:R:A::TL::::SA::V:::P:L:R:::T:R:::H:S::::A::I: HVO_0568 ::A::::V::L::V:H:L::T:::::SRT:LIS:G::VA::::ES:::V:::PH:G::I: Hbo0962 ::E:S::L:::A:A:E::::T::S:::E::::::T::::::::AA:::VL:::::G:::: consensus GSFLGNYWPMAEEVYVTDPDPLPATYDNFRHAVLQATLHLRAGEDLVADVDGRPTDSDED #oth 2213212.1414155274344..33157.1332242124345176362556534577454 Hmu3002 :NYVS:V:::G:QRF:AE:PT::::FEL::SG:TT:A::TT::H:V:::L:VVA:TDETA HVO_A0150 D::IA:::::G:Q:H:GSKSQ::::FTS:::::FD:::::MD:AVVT:EM:I:::Q:NAA rrnAC0172 ::Y::::::IG:::L:SR:PS:::R::M::PV:FTT::A:::::SV:::LYA:::G::D: Hmu0601 :MYFSA:::A:T:L:::::::::R:::W::Q:T:H::V:EQ::V::Y:E:E------T:S HVO_2035 :::::::::L:::IHLHE::E::::::R::::IFA::RY:KR:YT:::EIEL::A::N:A Hut0818 E:::A:F:LS:D:LS:IEAA:::Q:::S:E:::F:::::::E:TAVS:C:EAT:NEGGA: Hmu0446 :::F:::::I:A::::D::RS:::E:GC::::::D::::::DDRPISI:TAVT:CRDT:: rrnAC2354 ::::::::L::T::A::::A::::::HD::::::::::::::DH:IHVSA:V:AVQA:D: hla2750 :::::::::A:N:IATAA:A:::VE:A::::T:::V::R::V::IPRVT:G::W::R:-E HVO_0568 :::F:::::::A:A:T::::::::M:H:::::::::A:CE:::I::DVT:S::MVHT:-G Hbo0962 :::::::::::A:T:TC:L:E::::::D::::::::::RA:T:T::::H:T:::VHVENG consensus FETISGTVVEVRQGLVEPTTNDFPIENSLVVETDDG-TVSVGGQ----GAFLEDYEARAV #oth 544551313334.3324.62132241221222233414512..511111233.2223271 Hmu3002 RQFEGVPIR::::N::::VN:A:::::::::::::::L::::::ACGL:PYY:E:A::E: HVO_A0150 :::TT::I:A:K:S::R:FS::::TQE:F::::P:D::FT:::S::::K:::::F:::R: rrnAC0172 ::V:::E::D:::N::A:HNS::GF::::::D:G:S:RIT:::Y::::::::::::VKHT Hmu0601 GT:V::P:T:I::AFI:::::::TL:::FFID:G:::I:::::K:::::S:I:::QS:S: HVO_2035 :::RF::ITD:T::::K::::SI::::AFLIDDGTE:QL::::P::::::IV:P::::R: Hut0818 V::VT:R:::TN::I:D:V::E::::HT::L:::E::RTT:::H:::::::::E:A::T: Hmu0446 RQS:E:::IGTH::::::A:::::V::::::K:NNR:R:T:::P::::::M:::F::KDT rrnAC2354 TT::E:::::TK::::::E::SY:::HT:::DIG:R::::L::S:::::S::::::TD:: hla2750 PAE:::R:::SK::M::::::E::VQH:::::::::K::T:::::::::::V::I::DL: HVO_0568 PTELH:R::DI::::L::AN:S::V::AF:::::E:::Y:I::::::::::V::F::D:: Hbo0962 PSEL:::I:DI::::L::S::S::V::T::I:::::::F:I::K:::::::I::F::DT: consensus TLRAAD-------------------- #oth 53583444423222222222222211 Hmu3002 :I:D:-:::::::::::::::::::: HVO_A0150 VF:SVSDAKQG::::::::::::::: rrnAC0172 :::R:-:::::::::::::::::::: Hmu0601 M::RL:AVE::::::::::::::::: HVO_2035 ::DVVESSGQSVPELIARSDALNR:: Hut0818 K:E::::::::::::::::::::::: Hmu0446 VTLT:::::::::::::::::::::: rrnAC2354 ::SL:E:::::::::::::::::::: hla2750 RIEED:GDHEEADAGESDEADGADGV HVO_0568 EFT::E:::::::::::::::::::: Hbo0962 E::HLG::::::::::::::::::::