| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2443 | Hmu0908 | hla1817 | rrnAC3463 | Hut0017 | Hmu2482 | HVO_2637 | Hbo2205 | Hut2779 | hla1248 | hla2207 | hla1171 |
| 662 | Hmu0908 | 2771 | 425 | 430 | 347 | 417 | 369 | 435 | 325 | 374 | 316 | 255 |
| 585 | hla1817 | 425 | 1972 | 478 | 402 | 442 | 501 | 468 | 380 | 461 | 396 | 277 |
| 1529 | rrnAC3463 | 430 | 478 | 2554 | 1413 | 1133 | 1221 | 1311 | 932 | 987 | 646 | 476 |
| 1614 | Hut0017 | 347 | 402 | 1413 | 2616 | 1259 | 1301 | 1335 | 878 | 1032 | 597 | 517 |
| 1551 | Hmu2482 | 417 | 442 | 1133 | 1259 | 2476 | 1186 | 1263 | 884 | 1150 | 639 | 498 |
| 1588 | HVO_2637 | 369 | 501 | 1221 | 1301 | 1186 | 2658 | 1425 | 819 | 1022 | 599 | 458 |
| 1679 | Hbo2205 | 435 | 468 | 1311 | 1335 | 1263 | 1425 | 2806 | 878 | 1114 | 626 | 481 |
| 1183 | Hut2779 | 325 | 380 | 932 | 878 | 884 | 819 | 878 | 2472 | 1238 | 499 | 325 |
| 1434 | hla1248 | 374 | 461 | 987 | 1032 | 1150 | 1022 | 1114 | 1238 | 2642 | 497 | 453 |
| 814 | hla2207 | 316 | 396 | 646 | 597 | 639 | 599 | 626 | 499 | 497 | 2500 | 602 |
| 725 | hla1171 | 255 | 277 | 476 | 517 | 498 | 458 | 481 | 325 | 453 | 602 | 2234 |
420 symbols consensus -------------------------------------GADSGE-----PSDTMRERAGES #oth 111222222222223332232231332333334434657573623232664333526775 Hmu0908 :::MSDESRREWVRRAITVAGTLSVRATSLGAHYLYVV:RLVVVTGVLVVVSLLDDHSWG hla1817 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::------:::::------------ rrnAC3463 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::MTT:::::::::S:::::G::AGD Hut0017 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::M:DA::DVGEDR::::::::VPA: Hmu2482 :::::::::::::::::::::::::::::::::::MPA:::DI:::::GAG::::::E:: HVO_2637 ::::::::::::::::::::::::::::::::MSNTG:PSA::::::::D::::::GTT: Hbo2205 MAPDDETNSEADGPDSKRTQPNDSSDSDTDRNRPNGS:GSND:::::::::::::::::: Hut2779 :::::::::::::::::::::::::::::::::::MPTE:TVN:::::TH::V:::SQTT hla1248 ::::::::::::::MTERTSGTASEEANEGEKAEGGEDT:D:D:::::TA::::V:::D: hla2207 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::VSVVDHYWGLRDWFPVPR:N:RF hla1171 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::------:::::------------ consensus RVKLWLLLDANRLVVAALLLGVVFVALVALGQLDPFELRAAVTSGDPVETLF-QGLLTAI #oth 455424116321443255566553654465585666557655454433331213333423 Hmu0908 S:RR:F:::G::WSI:V::T:::YAT::::IG::----VVGMSNAGF:TG:::TAIISGL hla1817 --------------------------------------ML::GPDSA:DS::SS::TAGV rrnAC3463 TRL::F::::D:WL:T:::S::LLCGILVV:L:H:KPAMTLL:R::::::::::A:I:GT Hut0017 SR:F::::VVD:SA:::GIV:AI:L::::I::FH:AGTP:LF:Q:::L:::::::::::: Hmu2482 :W::::::G:D:R:::::A:LS::::::G:S:VVGTD::::MG:S::::::::::::::: HVO_2637 :A::RA::::D:R::::AP:V:::GSV:V:::::STP::V::E:S::I:::A:::::::: Hbo2205 ::::::::::::W:I:TVP:VF:::GI:LF:H:::ES:V:::A::::I::::::AFV::T Hut2779 :IVS::::SG:::L::GI:AAMF:LVFTISTFILRP:VYQMD:E::LS:R:::STMIIV: hla1248 ::::::::R:::::::GV:TL:::::F:TVAAAFSPS:AEKIG::::ID::::STMIA:: hla2207 H:IR:T::E::::A:TGA::SFM:S::MLI:WVWT::MQRVL:ETPA:Q:IL:SS::SG: hla1171 -------------:L:LVTEI:IL:::LTV:TVWE::MERL::ETRA:Q::::NT::GG: consensus ITGVTLVVTINQLVLSQELGPLGDQRERMEGAMQFRADVEDL-VGAPVSPADPSAFLRAL #oth 2242221113223322225232443532232436224333631536253134133..443 Hmu0908 FSF:PI::SV:::TVARVV:S:DEI::Q:NSVR::::EI:AVDPA:G::SN::GP::A:: hla1817 ::LI:ISLS:::::I:RVF:TVKSLTD:LD::RELHE::AT::A:Q:S::N::::::SLI rrnAC3463 ::A::::L:L::::::::::AV:::::::N:S:::::::A:A::DT:::::E::::::S: Hut0017 :::::::L:LS:::::::Q::I:::::::::::A::R::::V:IEE:::::Q::::::S: Hmu2482 :::::::::LS:::::::::A::::Q:::D:::S::RS::SV::DSD:T:P::AS:::S: HVO_2637 ::::::::::::::::R:::::::::D::::S:R::E::A:::LD:::A:PE:::::::: Hbo2205 ::S:::::S::S::::::::S::::::::::::S:::::::D:L:V:AA:PE:::::::: Hut2779 V::T:I:::FG::I:T::N::::::F::LD:::E::DRASV::I:::C-STK::K::SDI hla1248 V::T::::::G:V::T::N::::::Q:::NDTLTV:DSIAE::T:S::-:T::A:::D:I hla2207 :LL:SI::S::SI:::HDITSVET:EN:IQ:I::::R:IGQ::TESGE::T::AS::SLM hla1171 :LF:SV:LS::TAA:A::FA::QVKLASI:DSID:QIEL:E:::EDGI:::GLQP::QYV consensus VEAISERAEALQD----------------DAAAADEDLTDRLA------NFADDIRENAD #oth 374473234624522111111111111118756636546563611111163335273634 Hmu0908 :AVVD::V:R:A:::::::::::::::::ELD:TTGPAH:TG:::::::T:VAVL:SQVA hla1817 AQTL:::VAT:RA::::::::::::::::MNESG:W:PPSEVT:::::::ALR::G:YGE rrnAC3463 :RGTT::::NT:NAV:::::::::::::::ET:L:D:::AL:S:::::::YLE:V:T::: Hut0017 :TLTRR::::VG:A:::::::::::::::V::ID:PA::EQVD::::::P:V:SVV:::: Hmu2482 :A:VGRQ:AT::-::::::::::::::::--T::::SGDEQ:R::::::S::::LLAD:: HVO_2637 A:G:AS::R:VE:TLDAGGNGDAGESDDAT:SD::S:P:T:VR::::::E::REVES::E Hbo2205 ID:VQS::ND::-::::::::::::::::A::GRELAAA::IS::::::AYVESLTSH:: Hut2779 L::T:::::LV::::::::::::::::::IDD:GN:::ARD:T::::::DLSEG:VT::Q hla1248 LV:A:::SR::RE::::::::::::::::SVRER:G:RS::I:IREDVDDL:AN:I:::: hla2207 ASV:QD::T::EA::::::::::::::::V::GS::E::RDIQ::::::EYV:E:I:TVE hla1171 I:::HSET:S:RTT::::::::::::::::GSTT::RARAN:L::::::T:::::DTRLS consensus AVADRLEGAQFGTFDVLFAALNFNYSWKIYAARRLRADHADDLTDEARAALDELIEALEL #oth 927653546644436216442353.35335553325563434233576351542544254 Hmu0908 HIQS:VT:QRQPIEEL:VPMMGD::PYNVQT::K:LE::G:::SPP::TLIE::KQLSIA hla1817 NIDSH:D-DNIQVDS::TIL:GPE:AVNLN:IQH:QNGY:ESFSEAVQ:E:QAID:L::S rrnAC3463 S:T:Q:::GT::E:::VK::::Y:::::L::G::I:EAY::E::::IDDS:A::V:T::: Hut0017 T::HN:K:S:::E:::V:S:::Y:::::L::G::I::E:D:V::EA:DD::A:::Q:::: Hmu2482 ::G:D:D:S:::::E:V::::::::AS:::E::::::--::ATG:D:GET::D:V:T:S: HVO_2637 :::G::::R:::::A::S:::DL:::::::Q:A:::RV:DA::SA:TKT::S::RD:::: Hbo2205 E:S:::::E:::::N::::::D::::::::E:::::NEFH:::SE::QD:::SV:NT:TY Hut2779 D:RTQ::T:E::::::V::::::D::::VFQVE:IVD:YE::::A:QV:L::::K:::M: hla1248 G:R:S:D::E::S:::V:::ID:D::P::GQIE:VDD::D:AF::DE::L:K::K:S:S: hla2207 PLGNQGNS:SGAE:GI:WLG:EAD:GVYMDRS:T::SVYESE:A:TFGER::D::::FQ: hla1171 QIER:IRQSDPRVSIL:LST:DYP:ARH:NVT:::K:T:G:V::ESDHES:AT:LRI:TI consensus FGPAREHFKTLYFQWELIDLSRAILYAALPALVVAGSA-LLYLD-TGLFPGSTL-GVDNL #oth 3243112311113324245..253434222323524552234634764354644213766 Hmu0908 LDLL:QYY:A::IKQA:SR:::IVG:TG:G:FLI::LTI:VFANGRP:VAHPFV:----: hla1817 IAIV:QFY::IAL:QDFAE:::M:V:TG:I:F:TTIAVT:I:REN:VSI:P::V:----- rrnAC3463 :::::::::::::::::S::::TL::V:I:::T::ITS:::F:::VQD:V:V:A:::PDA Hut0017 :::::::::::::::::::::::M:::SI:::LT:V:G:V:::::PTVLS:TL::::RTG Hmu2482 :::::::I::::::::::E:::::A:::V:::I:SAGM:I::GGQ:AVVQ::V:::::SV HVO_2637 :::::::V:::::R:::V::::TMF:::V::::ASIG::I:F::DPTTIT:A:::::S:: Hbo2205 Y:::::::::::::::::N::::M::::I:T:IISS:::I::::NL:SVT:T:A:::H:: Hut2779 Y:::::YI:::::::S::A::QV::A::V:::IL::TM::VS:::GNT:::R:F::IEHI hla1248 :::::::I:::::::T::::::Q:::::V:::::::LM::AVV::A:T:::::R::::HV hla2207 :ATGK:Y:::::YTQ:VSQ:::TL:VIS::SIL:TA:::I:AIN:SQ:L:EMWVF:LPP: hla1171 LASG::Y:T::::KR::RN::S:L:LLS::VI:FTSYV:::AM:::::::QT::P::GSR consensus LLVVAAAFAVSLLPFAVLLSYVLRIATVAKRTLSIGPFILRDT-R---D----------- #oth 6442364433334.242151222.44.233212342113146554257361111113322 Hmu0908 E:L:GL:V:AVVF::T::::F:V::::IGE::AAP:::TPVRETPSYARH::::::SRD: hla1817 PI::SLGIG:VTV:LTLFV::I::A::::RK:V:V::::PP--:-:::-::::::::::: rrnAC3463 :WLL:VTTTA:::::T::I::I:::V:IT::::A:::::::E:N::SV:V::::::DWE: Hut0017 V:::SG:V::::::::L::::::::V::T::::::::::::E:D::TH:LTADTETDRE: Hmu2482 VWL:S::TT:A:V::V:::A:::::V:::::::::::LV::::VHSGG:E::::::SEDA HVO_2637 ::T::FVV:::IA:::::A:A::::S::::::::::::V::SET::ED:L::::::DWES Hbo2205 V::::::S::::::::I:::FM:::::::::::::::::::SAN::SREI::::::EWE: Hut2779 IP:IGIS:TMT::::M:FI::IF::F:::::::A:D:L:P:QS:-:::-::::::::::: hla1248 T:::G:::::T::::LLFV:::::VL:L:::::A:::LV:::SK-:::-::::::::::: hla2207 MSF::TV:TIA:A::L::TA:M::L::::Q::AGA:::S:QQ-:-:::-::::::::::: hla1171 ::Y:NL::VIA:S:YVL:S::M::ML::S:HS:ESTV:T:KADVGLEF:Q::::::::::