|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2469 | HVO_C0069 | Hbo3562 | hla0861 | Hut1038 | HVO_B0029 | rrnAC2929 | Hmu0396 |
1518 | HVO_C0069 | 2468 | 1579 | 1192 | 1195 | 1192 | 1149 | 1190 |
1494 | Hbo3562 | 1579 | 2504 | 1198 | 1156 | 1085 | 1065 | 1148 |
1732 | hla0861 | 1192 | 1198 | 2537 | 1369 | 1380 | 1366 | 1435 |
1823 | Hut1038 | 1195 | 1156 | 1369 | 2459 | 1419 | 1500 | 1466 |
1748 | HVO_B0029 | 1192 | 1085 | 1380 | 1419 | 2426 | 1341 | 1466 |
1704 | rrnAC2929 | 1149 | 1065 | 1366 | 1500 | 1341 | 2504 | 1559 |
1824 | Hmu0396 | 1190 | 1148 | 1435 | 1466 | 1466 | 1559 | 2502 |
335 symbols consensus -------MRFGILSTAGIGRKAVIPAIQASDHEVAAIASRDSDRARTVADELGIPRAYGS #oth 111111114..111..3.122322.113312.323.11..253..351.2332.242222 HVO_C0069 ::::::::K:::::::N::V:H:::G:KRT::::T::S::N:S:::Q::EKCD:REV:E: Hbo3562 ::::::::::::::::N::T:HFL:::KQT::::S:::::N:S::Q:::::F:::EVCD: hla0861 MTTPDSRLT::::G::::A::::V:::A::::ALG:V::::GE::ERF:E:HA:::S:D: Hut1038 ::::::::::::::::::A:S:LL:::ER:A:D:T::::::V:::E:::AD::::N:::N HVO_B0029 ::::::::M::::G:::::V:S::::V:::E::A:::::::EA::SA::::::::T:::: rrnAC2929 :::::::::::VI:::K:A:ED:::G::K:::T::::S::SR:::SE::ET:::DS:F:D Hmu0396 ::::::::E::V::::A:::ED::::::::E:A:G::::::AE:::S:::::D:D:S::: consensus YEALLADADIDAVYNPLPNGLHAEWTKRAADAGLHVLCEKPLTVDADEARALFDYCARQG #oth .121222342..1.2....2...2.232.2231211.....2121232134223213541 HVO_C0069 ::S::S:S:V:::::::::::::::::Q:VNN:R:::::::::A:T:::HN:RS:VKGTD Hbo3562 ::::V:RE::::I::::::S:::T:::::IEND::::::::S::::::::K:RATVEASD hla0861 :::::E:DE:::::V::::::::::::::::::H::::::::A:::A:::EVT:H::ER: Hut1038 :D:M::E:P::::::::::A::::::M:::::::DI:::::VA::EKQ::EM:E::D::D HVO_B0029 :::::::DSL::::I::::::::D:VRA:::R:::::::::::AS:::TA:V::::EDA: rrnAC2929 ::TMF:E::::::::::::A:::::SQ::::H::D::::::::::TAG:VD::::::K:: Hmu0396 :::::::EG::::::::::S::::::R::::H:::::::::::P::EQ::::::::D::: consensus VTLMEAFMYRFHPRTERAAEIVREELGEVRSVTARFSFALRDRPDDIRLDPDLAGGSLMD #oth 321..11..31..1.2.131113331331321313.4.6162232.1.1123.1...2.. HVO_C0069 CLV::GL::AY:::::::L:L:S:Y:S:IS::::::::H:-N:T::::::G::::::::: Hbo3562 SVV:::L::AY::::R:VH::I:NQFS:I:::::::A:L:Q::::::::QDE:D:::M:: hla0861 I::::G::::Y:::::::L:L:ER::DD::T:::T:R:P:Y:::N:V::::::::::::: Hut1038 ::::::::::::::::::::::S:DFLN:::GS:::T:S::GN::::::::::::::::: HVO_B0029 :::::::::::::L::::::L:AS:::A:V:::SN:::R:P:GA::::I::::::::V:: rrnAC2929 :::::::::Q:::::Q::RD::EN:::::HT:D:S:K:::S::-E::::::K:::::::: Hmu0396 :::::::::H::::::::R:::::::::::H:E:T:T:GMG::T:::::::A:D:::::: consensus VGCYAVSAARLFLGTPDRAYAHLVDTRDAGVDTNLSGVLEYDSGATAQISSGFDTPLTQF #oth 2.1.2.123.42..1.32211235.3113.1.14141212121.22.32411.1224324 HVO_C0069 I:Y:P:DLV:SM::::QSI:GT:::A:GC:T:::MKAIF:::::::::L::S:ES::::: Hbo3562 ::Y:P:DLT:SV::::ETV:GS:L:P::S:T::VMNALF::P:::::NV::::EST:S:: hla0861 ::::P::I::AV::::::::::TH:::::::::E:A:::::ED:RS:RVA:::::Q:V:R Hut1038 L:::T:::M:::::E:E:V::TS:::::::::SQ:T:I::FE:::::::H::::::FVES HVO_B0029 ::::::::::::::::::V::TTT::::C::::RM::::::::::::RVE:S::::E::Y rrnAC2929 ::::::::::G:::E::::F::SR:S::S::::::::::S::D:RV:S::C:::G:RRES Hmu0396 I:::::::V:NV::E:N::F::AA::Y:T:::SQ:::L:T::D:V::::T:S::::M:HE consensus YRVEAANGWLEVKDAFDTDPDQSVELTYEVDGRHVTETFDPVDHYRREVEHFADAVAAGE #oth ..13142.1221542.23242342212142..2441.21111.2.221112.12322624 HVO_C0069 :::::::::I::R:::::PK:VGATIRG:I::NSL::::::::::EK::L:::RCFDQ:T Hbo3562 :::::R::::::H:::::PT:AEM:I:G::::QSF::S:E:T::::L:I:::V:C::EHK hla0861 ::ID:T:::VA::Q::::PA:EP:::::KI::::GV::::::::::LQ::::::R::D:A Hut1038 :::::E::::AAENV:GA::N:::SIE::::::::::E:::::P:Q:::::::E::ES:S HVO_B0029 :::QTTD:R::ANP::NV::TAAA::::AT:::V:::::::T:S::::::A::R::ET:: rrnAC2929 :::::DG::::A::C:GP:H::::S:::S::::E:::::::::::QLQ::A:::TIEN:: Hmu0396 ::IMT:D:::H:PE:::VA:::::S:::Q:::QRH:::I:G::::::Q::S:::::::D: consensus TPRTDRAEAVQNMRVIDALYESADRGEPVAVD--- #oth 2.32.4412352.322.1121.2421332415232 HVO_C0069 :::::LTR:T:::ELV::IRR:DT::::I::V::: Hbo3562 Q:K::LSR:A:::HL::CIR::NG:::RIT:PEMS hla0861 R:L::GK:::AS:::::::::::AGNGS:::E::: Hut1038 :::I:E::S:R::A::::::::::::Q::SLS::: HVO_B0029 :::V::E:S:SV::T:::I::::ET:AA:EL:::: rrnAC2929 ::PI:Q::TLG::::M:::AR:::T::::D:AGPE Hmu0396 ::PV::T:T:D::A:::::::::ET:::A:::GE: