6 genomes BUD1428 7 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC3066 HVO_0067 HVO_2570 Hbo1433 Hmu2769 Hut0276 hla1812 - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	784	HVO_2570	hla1812	HVO_0067	Hbo1433	Hut0276	rrnAC3066	Hmu2769
286	HVO_2570	754	170	264	201	177	137	201
397	hla1812	170	830	346	322	301	339	321
577	HVO_0067	264	346	767	568	422	421	448
569	Hbo1433	201	322	568	762	459	473	456
559	Hut0276	177	301	422	459	762	569	522
571	rrnAC3066	137	339	421	473	569	807	544
595	Hmu2769	201	321	448	456	522	544	738

104 symbols
consensus       ------AAAEPEEPTFGETVYDEDGDRLGTVRGFDEDGFYVTTREGIAAMSIEHER-AG-
#oth            122123366354552414211222144113121222311213433143332311332213
HVO_2570        :::::M:IKT:AR::EPAQPL:DERA:WEA:----:TTAETAS:AVRPPTVV::Q:LPEK
hla1812         MSKDVG:DPDD:PI:P:::::::::QV::Q:S:YTT:::E:KIG::GS:SGDDA:TIP:Q
HVO_0067        ::::::-M:DETQ::V:M:::AA::TE::S:::::D:::F::::::L:G::V:::::::H
Hbo1433         ::::::MSG:KSIASI:T:::T::::E::::::::::::F::::::::SL:::::::::H
Hut0276         ::::::M:S::T:V:::TG::::A:NK:::::::::H::::S:DD::::L:S::LA:S::
rrnAC3066       :MADMTTNI:S::YS::Q::::::::A:::I:::::H:::::VED::ES::S::LS::::
Hmu2769         ::::::-----MGLG::::::::::Q::::I:::::R:::::LDG:M:::::::V:::::

consensus       EFGEAELMWRCWDCGEMGDL-EDLPDECPDCGAPKEDIYYWTED
#oth            32..12.1...33..111511343.23..4.1.22.411122..
HVO_2570        D::::R:V:::D::::L:S::TAF:SA::::::GR:ALF:F:::
hla1812         ::::GY:::::SE:::::::GSGM::T::E::::E:S::AVE::
HVO_0067        :::::::::::S:::::::::DE:::A::N:::ER:QL::::::
Hbo1433         :::::::::::AN::::DT::DE:::S::G:N::::EL::::::
Hut0276         IA::::::::::S:::::QI::Q::E:::S:::::::::::E::
rrnAC3066       AA::::::::::E:::::KI:::I:::::S:N:::::::::Q::
Hmu2769         :S:::::::::::::A::EI:::I:E::::::::::::::::::