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6 genomes BUD1430 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC1196

HVO_2654

HVO_B0162

Hbo3765

Hmu1389

Hut0705

hla1915

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score3497 HVO_2654 hla1915 Hut0705 HVO_B0162 Hbo3765 rrnAC1196 Hmu1389
1960HVO_2654 3675 1769 1668 1771 1713 1767 1736
2682hla1915 1769 3691 2271 2445 2342 2381 2373
2665Hut0705 1668 2271 3591 2373 2389 2412 2470
2929HVO_B0162 1771 2445 2373 3692 2968 2593 2536
2856Hbo3765 1713 2342 2389 2968 3637 2560 2533
2950rrnAC1196 1767 2381 2412 2593 2560 3548 2874
2953Hmu1389 1736 2373 2470 2536 2533 2874 3538

534 symbols
consensus       -----------MSRADAV-DRA--A---------------------YDWFDSRLDLDNGR
#oth            1111111111111.5223422233212111111111111111113312.2.4.11.1424
HVO_2654        MTGTAPNDGSGDD:P::RS:GGEAGGDLPETDLTVRTHEAYPRNALF::L:Q::E::--H
hla1915         ::::::::::::::I::AV:::ES:::::::::::::::::::::::::V:::::::DAN
Hut0705         ::::::::::::::SQR::---::-::::::::::::::::::::::A:::D:::::EAE
HVO_B0162       ::::::::::::::L:RLA:::ND:GD:::::::::::::::::EA:::V:E:F:::T::
Hbo3765         ::::::::::::::V:RLEE::SD:GT:::::::::::::::::RT:N:L:::F::::::
rrnAC1196       :::::::::::::::K:::---::-::::::::::::::::::::::::::T::::E::Q
Hmu1389         :::::::::::::::KQ::---::-:::::::::::::::::::::::::::::::E::Q

consensus       TFLGKAFPAED--SFLLGEVALFCFLLLVLTGIFLGFFYEPSTSAVEYEGSVAQFQGEEM
#oth            311.....11.11......1.1.2.22.311.3..12111.113412.2.112211.212
HVO_2654        :L::::::ED:YG::::::I:::T:VI:G:::T:::LL:N:AVNS:T:::NAL:YA:T:V
hla1915         D::::::::::::::::::::::::GI::S::T::A:::::::A::::G:::::Y::Q::
Hut0705         Q:M::::::::::::::::::::S:VM::::::::::::::::TEMT:::::::::::SL
HVO_B0162       A:::::::::::::::::::::::::::::::::::M:F:::::G::::::::K:::Q:V
Hbo3765         A::::::::::::::::::::::::VM:A:::M:::M:F::::::::::::::A:::::V
rrnAC1196       ::::::::::::::::::::::::::::I:S:V:::::F:::::D:::D:::QK::::::
Hmu1389         :::::::::::::::::::::V::::::I:::V:::::::::::::Q:D:::::::::::

consensus       PEAFASVLHITYDVPFGMFIRRMHHWAAHLFVASIGLHMLRVFFTGAYRNPREPNWVVGT
#oth            .1..3...21..121....2.13.....1..1.1.1...1....1......1.1..31.1
HVO_2654        :A:::::::::::TT::::A:M::::::Y::I:A:A:::F:::::::::::H::::FI:S
hla1915         :A::K:::N::::::::::L:::::::::::::::A::::::::::::::::::::L:::
Hut0705         :A::G:::QL::::::::::::F:::::::::::::::::::::H::::::::I::::::
HVO_B0162       :::::::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3765         :::::::::::::I::::::::I:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC1196       ::::V:::::::::::::::::L:::::::::::::::::::::::::::::::::I:::
Hmu1389         ::::V:::::::T:::::::::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       GLAGLAMGAAYTGYALPFDEFAATATGIGYNLAGSIPLVGDFLAKIVFGGEFPSSA--TI
#oth            1.1411121111..1..1.1.12..12..1131411.31.2222431...3..21.111.
HVO_2654        T:LLF:LVEGFF:::::Y:N:SK:::T::FQMT:T::G::S::QSL::::A::AG:DQV:
hla1915         :::::::F::::::S::Y::::S::V:::::V:A:::I:::P::S:::::Q::T::::::
Hut0705         T::I::::::::::::::::::S::::::::I:::::IL::PI:A:::::D:::::::::
HVO_B0162       :::::S:::::::::::::::::::::::::::T::::::GVVG:AF:::::::::::::
Hbo3765         :::::::::::::::::::::::::::::::::T:::F::SVVG:V::::::::::::::
rrnAC1196       :::A:S::::::::::::::::::::S:::::TI::::L::::GQV::::::::::::::
Hmu1389         :::V::::::::::::::::::::::::::::TV:V::::::::E::::::::T::::::

consensus       PRLYFLHVLVIPAAIAGGLALHMAILVRQKHTEAPRDDDV-------------------D
#oth            ..11.1..11..311322112..22.2......121331133332333223433334234
HVO_2654        ::MF::::FL::::LV:AIV::::V:M::::::HAPSSR-:::::::::::::::::::-
hla1915         :::F::::FL:::::::LI:V:::::::::::::Q::E::AAAGGGGGTAKTGGSAEAT:
Hut0705         ::::::::F:::IL:::::::::GL:::::::::Q:E:::KPVD:::::::SGTAEAAA:
HVO_B0162       ::::::::::::V::G:L::V:::::::::::::::::::RGLE:SRDRRPVEGSPSSDG
Hbo3765         :::::F::::::V:::IL::I:::::::::::::::N:::RGAEPPQSTRTPDAGAVSDG
rrnAC1196       ::::::::::::::::V:::V:::::I::::::::::G:::::::::::::::::::::T
Hmu1389         ::::::::::::LL:M:::::::F::::::::::::E::::::::::::::::::::::E

consensus       GGRQAVDRDDDSVVVGLPAFPNQAAVSAVVFFLTAATLSALAGFLPVHNIAEYGPNNPAG
#oth            3224422311.2111.1.11.1.21..11..11.2.1113.1.11..111.21..12.12
HVO_2654        -:EGRP:G::::::::M:L::Q:FL::TI::L:::::VAF::::F::QR::AI::AT:TS
hla1915         ::ARLI::::::::I:::::::::::::::::::M:V::L:::L:::::::Q::::D::S
Hut0705         RN:ET:::E::::::::::::::T::::::::::L:::::::::::::::::::::::::
HVO_B0162       :TE:T:S:::::::::::::::::::::::::::L:::AM::::::::::::::::::::
Hbo3765         :TET::AKE::T::::::::::::::::::::::L:::A::G::F:::::::::::::::
rrnAC1196       ::::S::E:::DIII:::::::::::::::::V::::::::::L:::::V::::::D::S
Hmu1389         T::E:I::EN:D:I:::::V:::::::::::::::::::L:::L:::::V::::::D::A

consensus       TPELIMPDWFLMWVYGFLKLLPSWMGFDV--GPIHISGEFVGGVVLPSLVFGAVAVWPFI
#oth            ..2111....1..21.2..22.22222431243322231.2..231.211131232..12
HVO_2654        ::SHVG::::F:::F:S::MM:::L:EW-::------:R:A::::V:::II:VMMI::LL
hla1915         ::S:V::::::::G::::::T::::S:::::LGV:::S:::::LF::::::V::::::::
Hut0705         ::A:::::::F::L:::::V:::SL::HL:::::E::A::L:::A::::::L::FA::::
HVO_B0162       ::::::::::::::::L::::::::::T:PLTD::V:T::::::L::T:::::::::::V
Hbo3765         :::::::::::::::::::::::::S:TIPVVGV:V:T::::::L::TV::::I::::::
rrnAC1196       ::A:::::::::::::::::::Q-IS:N:::::A::N::::::I:::G:::A:::I::::
Hmu1389         ::::::::::::::::::::::G-IAI:L:::::::NS::L::I:::G:::A:ILA::::

consensus       DRRE-PVHFTADPLDRPWQTAVGVAAVAFIMIASIAGMNNILA-RALGVSTAVVNPILTA
#oth            .243522...12111.131.11.1111411111..1..22211232.1121411213.42
HVO_2654        :NP:H::::::::::::L:::L:::::ML:IVL::D::RATV::AV::::D::LY:W:V:
hla1915         ::A:K:E:::RNY::::FP::::ILG:TLV:V::::::DV:V::EI::T::::LR:Y:I:
Hut0705         :::RDS:::::::FE::V::G::::G:V:V::::::::::L:::E:::TT:GA::LP:LL
HVO_B0162       :YHDES::::::::::::::::::::IQ::::::::::::L:G::::::G:G:::::::V
Hbo3765         :Y::N::::::S::::::::::::::IQ::::::::::::L:G::::D:G:E:::::::L
rrnAC1196       ::T:::T:::::::::A:::G::::::::::::::::::::::DQV::TT:N::::::::
Hmu1389         ::TP:E:::::::::::::::::::::::V:::::::::::::NQV:D:::S::::::A:

consensus       ALLVVP-AAFGIVTYLLLRDDDDA----------A-DGDRAGS-PEGTDDD---
#oth            12332.255214343333245443111333343323332444453344422111
HVO_2654        LTVGM:LFD:AV:YW::K:RKRRL::::::::::-:--GT::-:-------:::
hla1915         ::VL:::::A:TL::AI:GGFE:G:::SGAGGEE:TTD::PS:AT::SS:::::
Hut0705         :MI:G:I::::V:HRAIS:ERTT:::::::DTAAQP:::DRTEP::V:::E:::
HVO_B0162       ::F::::IGSAALV:RM:G:--::::::::::::-::ES:T:RV:GEAG:::::
Hbo3765         ::F::::GV::::DLPVFYQ::ST::::::::::-:E::DR--:-------:::
rrnAC1196       :::::::PI::GI:::::::GEPT:::PAQESDV:A::GSV:DE:DN:EPEGDG
Hmu1389         :::I:::TL:::A::::::E::P:TPPETDGEDV:A::GP:R:SDG:G::::::