|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3497 | HVO_2654 | hla1915 | Hut0705 | HVO_B0162 | Hbo3765 | rrnAC1196 | Hmu1389 |
1960 | HVO_2654 | 3675 | 1769 | 1668 | 1771 | 1713 | 1767 | 1736 |
2682 | hla1915 | 1769 | 3691 | 2271 | 2445 | 2342 | 2381 | 2373 |
2665 | Hut0705 | 1668 | 2271 | 3591 | 2373 | 2389 | 2412 | 2470 |
2929 | HVO_B0162 | 1771 | 2445 | 2373 | 3692 | 2968 | 2593 | 2536 |
2856 | Hbo3765 | 1713 | 2342 | 2389 | 2968 | 3637 | 2560 | 2533 |
2950 | rrnAC1196 | 1767 | 2381 | 2412 | 2593 | 2560 | 3548 | 2874 |
2953 | Hmu1389 | 1736 | 2373 | 2470 | 2536 | 2533 | 2874 | 3538 |
534 symbols consensus -----------MSRADAV-DRA--A---------------------YDWFDSRLDLDNGR #oth 1111111111111.5223422233212111111111111111113312.2.4.11.1424 HVO_2654 MTGTAPNDGSGDD:P::RS:GGEAGGDLPETDLTVRTHEAYPRNALF::L:Q::E::--H hla1915 ::::::::::::::I::AV:::ES:::::::::::::::::::::::::V:::::::DAN Hut0705 ::::::::::::::SQR::---::-::::::::::::::::::::::A:::D:::::EAE HVO_B0162 ::::::::::::::L:RLA:::ND:GD:::::::::::::::::EA:::V:E:F:::T:: Hbo3765 ::::::::::::::V:RLEE::SD:GT:::::::::::::::::RT:N:L:::F:::::: rrnAC1196 :::::::::::::::K:::---::-::::::::::::::::::::::::::T::::E::Q Hmu1389 :::::::::::::::KQ::---::-:::::::::::::::::::::::::::::::E::Q consensus TFLGKAFPAED--SFLLGEVALFCFLLLVLTGIFLGFFYEPSTSAVEYEGSVAQFQGEEM #oth 311.....11.11......1.1.2.22.311.3..12111.113412.2.112211.212 HVO_2654 :L::::::ED:YG::::::I:::T:VI:G:::T:::LL:N:AVNS:T:::NAL:YA:T:V hla1915 D::::::::::::::::::::::::GI::S::T::A:::::::A::::G:::::Y::Q:: Hut0705 Q:M::::::::::::::::::::S:VM::::::::::::::::TEMT:::::::::::SL HVO_B0162 A:::::::::::::::::::::::::::::::::::M:F:::::G::::::::K:::Q:V Hbo3765 A::::::::::::::::::::::::VM:A:::M:::M:F::::::::::::::A:::::V rrnAC1196 ::::::::::::::::::::::::::::I:S:V:::::F:::::D:::D:::QK:::::: Hmu1389 :::::::::::::::::::::V::::::I:::V:::::::::::::Q:D::::::::::: consensus PEAFASVLHITYDVPFGMFIRRMHHWAAHLFVASIGLHMLRVFFTGAYRNPREPNWVVGT #oth .1..3...21..121....2.13.....1..1.1.1...1....1......1.1..31.1 HVO_2654 :A:::::::::::TT::::A:M::::::Y::I:A:A:::F:::::::::::H::::FI:S hla1915 :A::K:::N::::::::::L:::::::::::::::A::::::::::::::::::::L::: Hut0705 :A::G:::QL::::::::::::F:::::::::::::::::::::H::::::::I:::::: HVO_B0162 :::::::::::::I:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo3765 :::::::::::::I::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1196 ::::V:::::::::::::::::L:::::::::::::::::::::::::::::::::I::: Hmu1389 ::::V:::::::T:::::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus GLAGLAMGAAYTGYALPFDEFAATATGIGYNLAGSIPLVGDFLAKIVFGGEFPSSA--TI #oth 1.1411121111..1..1.1.12..12..1131411.31.2222431...3..21.111. HVO_2654 T:LLF:LVEGFF:::::Y:N:SK:::T::FQMT:T::G::S::QSL::::A::AG:DQV: hla1915 :::::::F::::::S::Y::::S::V:::::V:A:::I:::P::S:::::Q::T:::::: Hut0705 T::I::::::::::::::::::S::::::::I:::::IL::PI:A:::::D::::::::: HVO_B0162 :::::S:::::::::::::::::::::::::::T::::::GVVG:AF::::::::::::: Hbo3765 :::::::::::::::::::::::::::::::::T:::F::SVVG:V:::::::::::::: rrnAC1196 :::A:S::::::::::::::::::::S:::::TI::::L::::GQV:::::::::::::: Hmu1389 :::V::::::::::::::::::::::::::::TV:V::::::::E::::::::T:::::: consensus PRLYFLHVLVIPAAIAGGLALHMAILVRQKHTEAPRDDDV-------------------D #oth ..11.1..11..311322112..22.2......121331133332333223433334234 HVO_2654 ::MF::::FL::::LV:AIV::::V:M::::::HAPSSR-:::::::::::::::::::- hla1915 :::F::::FL:::::::LI:V:::::::::::::Q::E::AAAGGGGGTAKTGGSAEAT: Hut0705 ::::::::F:::IL:::::::::GL:::::::::Q:E:::KPVD:::::::SGTAEAAA: HVO_B0162 ::::::::::::V::G:L::V:::::::::::::::::::RGLE:SRDRRPVEGSPSSDG Hbo3765 :::::F::::::V:::IL::I:::::::::::::::N:::RGAEPPQSTRTPDAGAVSDG rrnAC1196 ::::::::::::::::V:::V:::::I::::::::::G:::::::::::::::::::::T Hmu1389 ::::::::::::LL:M:::::::F::::::::::::E::::::::::::::::::::::E consensus GGRQAVDRDDDSVVVGLPAFPNQAAVSAVVFFLTAATLSALAGFLPVHNIAEYGPNNPAG #oth 3224422311.2111.1.11.1.21..11..11.2.1113.1.11..111.21..12.12 HVO_2654 -:EGRP:G::::::::M:L::Q:FL::TI::L:::::VAF::::F::QR::AI::AT:TS hla1915 ::ARLI::::::::I:::::::::::::::::::M:V::L:::L:::::::Q::::D::S Hut0705 RN:ET:::E::::::::::::::T::::::::::L::::::::::::::::::::::::: HVO_B0162 :TE:T:S:::::::::::::::::::::::::::L:::AM:::::::::::::::::::: Hbo3765 :TET::AKE::T::::::::::::::::::::::L:::A::G::F::::::::::::::: rrnAC1196 ::::S::E:::DIII:::::::::::::::::V::::::::::L:::::V::::::D::S Hmu1389 T::E:I::EN:D:I:::::V:::::::::::::::::::L:::L:::::V::::::D::A consensus TPELIMPDWFLMWVYGFLKLLPSWMGFDV--GPIHISGEFVGGVVLPSLVFGAVAVWPFI #oth ..2111....1..21.2..22.22222431243322231.2..231.211131232..12 HVO_2654 ::SHVG::::F:::F:S::MM:::L:EW-::------:R:A::::V:::II:VMMI::LL hla1915 ::S:V::::::::G::::::T::::S:::::LGV:::S:::::LF::::::V:::::::: Hut0705 ::A:::::::F::L:::::V:::SL::HL:::::E::A::L:::A::::::L::FA:::: HVO_B0162 ::::::::::::::::L::::::::::T:PLTD::V:T::::::L::T:::::::::::V Hbo3765 :::::::::::::::::::::::::S:TIPVVGV:V:T::::::L::TV::::I:::::: rrnAC1196 ::A:::::::::::::::::::Q-IS:N:::::A::N::::::I:::G:::A:::I:::: Hmu1389 ::::::::::::::::::::::G-IAI:L:::::::NS::L::I:::G:::A:ILA:::: consensus DRRE-PVHFTADPLDRPWQTAVGVAAVAFIMIASIAGMNNILA-RALGVSTAVVNPILTA #oth .243522...12111.131.11.1111411111..1..22211232.1121411213.42 HVO_2654 :NP:H::::::::::::L:::L:::::ML:IVL::D::RATV::AV::::D::LY:W:V: hla1915 ::A:K:E:::RNY::::FP::::ILG:TLV:V::::::DV:V::EI::T::::LR:Y:I: Hut0705 :::RDS:::::::FE::V::G::::G:V:V::::::::::L:::E:::TT:GA::LP:LL HVO_B0162 :YHDES::::::::::::::::::::IQ::::::::::::L:G::::::G:G:::::::V Hbo3765 :Y::N::::::S::::::::::::::IQ::::::::::::L:G::::D:G:E:::::::L rrnAC1196 ::T:::T:::::::::A:::G::::::::::::::::::::::DQV::TT:N:::::::: Hmu1389 ::TP:E:::::::::::::::::::::::V:::::::::::::NQV:D:::S::::::A: consensus ALLVVP-AAFGIVTYLLLRDDDDA----------A-DGDRAGS-PEGTDDD--- #oth 12332.255214343333245443111333343323332444453344422111 HVO_2654 LTVGM:LFD:AV:YW::K:RKRRL::::::::::-:--GT::-:-------::: hla1915 ::VL:::::A:TL::AI:GGFE:G:::SGAGGEE:TTD::PS:AT::SS::::: Hut0705 :MI:G:I::::V:HRAIS:ERTT:::::::DTAAQP:::DRTEP::V:::E::: HVO_B0162 ::F::::IGSAALV:RM:G:--::::::::::::-::ES:T:RV:GEAG::::: Hbo3765 ::F::::GV::::DLPVFYQ::ST::::::::::-:E::DR--:-------::: rrnAC1196 :::::::PI::GI:::::::GEPT:::PAQESDV:A::GSV:DE:DN:EPEGDG Hmu1389 :::I:::TL:::A::::::E::P:TPPETDGEDV:A::GP:R:SDG:G::::::